• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제25권1호
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• pp.211-218
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• 2014

Qu et. al. (2000) proposed the quadratic inference functions (QIF) method to marginal model analysis of longitudinal data to improve the generalized estimating equations (GEE). It yields a substantial improvement in efficiency for the estimators of regression parameters when the working correlation is misspecified. But for the longitudinal data with time-dependent covariates, when the implicit full covariates conditional mean (FCCM) assumption is violated, the QIF can not provide more consistent and efficient estimator than GEE (Cho and Dashnyam, 2013). Lai and Small (2007) divided time-dependent covariates into three types and proposed generalized method of moment (GMM) for longitudinal data with time-dependent covariates. They showed that their GMM type II and GMM moment selection methods can be more ecient than GEE with independence working correlation (GEE-ind) in the case of type II time-dependent covariates. We develop upgraded QIF method for type II time-dependent covariates. We show that this upgraded QIF method can provide substantial gains in efficiency over QIF and GEE-ind in the case of type II time-dependent covariates.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제24권4호
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• pp.877-883
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• 2013

The quadratic inference functions (QIF) method proposed by Qu et al. (2000) and the generalized method of moments (GMM) for marginal regression analysis of longitudinal data with time-dependent covariates proposed by Lai and Small (2007) both are the methods based on generalized method of moment (GMM) introduced by Hansen (1982) and both use generalized estimating equations (GEE). Lai and Small (2007) divided time-dependent covariates into three types such as: Type I, Type II and Type III. In this paper, we compared these methods in the case of Type II and Type III in which full covariates conditional mean assumption (FCCM) is violated and interested in whether they can improve the results of GEE with independence working correlation. We show that in the marginal regression model with Type II time-dependent covariates, GMM Type II of Lai and Small (2007) provides more ecient result than QIF and for the Type III time-dependent covariates, QIF with independence working correlation and GMM Type III methods provide the same results. Our simulation study showed the same results.

• Journal of Gastric Cancer
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• 제15권4호
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• pp.238-245
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• 2015

Purpose: This study aimed to identify time-dependent prognostic factors and demonstrate the time-dependent effects of important prognostic factors in patients with advanced gastric cancer (AGC). Materials and Methods: We retrospectively evaluated 3,653 patients with AGC who underwent curative standard gastrectomy between 1991 and 2005 at the Korea Cancer Center Hospital. Multivariate survival analysis with Cox proportional hazards regression was used in the analysis. A non-proportionality test based on the Schoenfeld residuals (also known as partial residuals) was performed, and scaled Schoenfeld residuals were plotted over time for each covariate. Results: The multivariate analysis revealed that sex, depth of invasion, metastatic lymph node (LN) ratio, tumor size, and chemotherapy were time-dependent covariates violating the proportional hazards assumption. The prognostic effects (i.e., log of hazard ratio [LHR]) of the time-dependent covariates changed over time during follow-up, and the effects generally diminished with low slope (e.g., depth of invasion and tumor size), with gentle slope (e.g., metastatic LN ratio), or with steep slope (e.g., chemotherapy). Meanwhile, the LHR functions of some covariates (e.g., sex) crossed the zero reference line from positive (i.e., bad prognosis) to negative (i.e., good prognosis). Conclusions: The time-dependent effects of the prognostic factors of AGC are clearly demonstrated in this study. We can suggest that time-dependent effects are not an uncommon phenomenon among prognostic factors of AGC.

• Communications for Statistical Applications and Methods
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• 제31권4호
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• pp.365-375
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• 2024

Diverse methods to evaluate the prediction model of a time to event have been proposed in the context of right censored data where all subjects are subject to be susceptible. A time-dependent AUC (area under curve) measures the predictive ability of a marker based on case group and control one which are varying over time. When a substantial portion of subjects are event-free, a population consists of a susceptible group and a cured one. An uncertain curability of censored subjects makes it difficult to define both case group and control one. In this paper, our goal is to propose a time-dependent AUC for a cure rate model when a censoring distribution is related with covariates. A class of inverse probability of censoring weighted (IPCW) AUC estimators is proposed to adjust the possible sampling bias. We evaluate the finite sample performance of the suggested methods with diverse simulation schemes and the application to the melanoma dataset is presented to compare with other methods.

• 응용통계연구
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• 제35권1호
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• pp.35-47
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• 2022

Receiver operating characteristic (ROC) 곡선은 이항 반응 자료에 대한 마커의 분류 예측력을 측정하기 위해 널리 적용되어왔으며 최근에는 생존 분석에서도 매우 중요한 역할을 하고 있다. 여러 가지 유형의 중도 절단과 원인 불명 등 다양한 종류의 결측 자료를 포함한 생존 자료 분석에서 마커의 사건 발생 여부에 대한 예측력을 판단하기 위해 기존의 통계량을 확장하였다. 생존 분석 자료는 각 시점에서의 사건 발생 여부로 이해할 수 있으며, 따라서 시점마다 ROC 곡선과 AUC를 구할 수 있다. 본 논문에서는 우중도 절단과 경쟁 위험 모형하에서 사용되는 다양한 방법론과 관련 R 패키지를 소개하고 각 방법의 특성을 설명하고 비교하였으며 이를 검토하기 위해 간단한 모의실험을 시행하였다. 또한, 프랑스에서 수집된 치매 자료의 마커 분석을 시행하였다.

• Management Science and Financial Engineering
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• 제12권2호
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• pp.19-35
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• 2006

We use the hierarchical Bayesian approach to describe the transition probabilities of a binary nonhomogeneous Markov chain. The Markov chain is used for describing the transition behavior of emotionally disturbed children in a treatment program. The effects of covariates on transition probabilities are assessed using a logit link function. To describe the time evolution of transition probabilities, we consider two modeling strategies. The first strategy is based on the concept of exchangeabiligy, whereas the second one is based on a first order Markov property. The deviance information criterion (DIC) measure is used to compare models with two different time dependent structures. The inferences are made using the Markov chain Monte Carlo technique. The developed methodology is applied to some real data.

• 한국수자원학회논문집
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• 제42권6호
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• pp.445-455
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• 2009

본 논문에서는 연구대상 지역의 150 mm 주철 상수관로의 첫 번째 파손으로부터 일곱 번째 파손사건에 대한 비례 위험모형을 구축하였다. 모형의 구축과정에서 공변수의 위험률에 대한 비례위험 가정을 검사하여 이를 위배할 경우 시간종속형 공변수로 모형화하였다. 그 결과 첫 번째 파손에 대해서는 관로의 제원 및 연결 방식과 급수인구가, 그리고 두 번째 파손 사건에 대해서는 급수인구의 영향이 시간에 따라 변하는 것으로 나타났다. 각 생존시간군의 기저위험률에 대한 분석으로부터 첫 번째와 두 번째 파손에 대해서는 대체적으로 파손 위험률이 시간에 따라 계속해서 증가하는 것으로 나타났으며, 세 번째 파손으로부터 일곱번째 파손사건에 대해서는 파손 위험률이 감소하다가 시간이 지나면 증가하는 욕조 모양으로 추정되었다. 또한 시간과 파손횟수에 따른 기저위험률의 변화 및 각 생존시간군의 중간생존시간으로부터 연구대상 상수관로들은 파손횟수가 증가할수록 전반적인 관로의 상태가 악화되는 것으로 판단된다. 추정된 공변수의 회귀계수와 위험비율을 이용하여 관로파손에 미치는 인자와 그 시간적 영향에 대하여 분석하였으며, 구축된 모형의 이탈잔차를 이용하여 모형의 적합도를 검증하였다.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제28권2호
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• pp.349-359
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• 2017

본 논문에서는 미국 국립암연구소의 SEER 프로그램에서 제공하는 우측 대장암 3기 자료에 Cox 비례위험모형을 적합하여 생존분석을 하였다. 우측 대장암 3기 환자의 사망률에 유의한 영향을 미치는 공변량들을 파악하고, 관심있는 공변량들을 가진 환자의 생존율을 추정하였다. Schoenfeld 잔차를 기반한 검정과 Schoenfeld 잔차 도표, $log[-log\{{\hat{S}}(t)\}]$ 도표를 이용하여 분석에 사용된 공변량들이 비례위험 가정을 만족함을 확인하였다. 적합된 Cox 비례위험모형의 타당성을 검증하기 위해 10-fold 교차 검증을 이용하여 calibration 도표와 시간에 의존하는 ROC 곡선 아래 면적을 계산하였다. 이를 통해 적합된 Cox 비례위험모형의 타당성을 확인하였다.

• 응용통계연구
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• 제21권2호
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• pp.291-299
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• 2008

동일 개체가 여러 시점에서 반복되어 측정될 때, 측정값들 간에 종속성을 예상할 수 있다. 본 논문은 한 개체의 이가 반응변수가 g개 시점에서 관측될 때, 종속적인 g개 이 가변수들의 다변량 분포로부터 각 시점에서의 주변분포의 동질성을 파악하기 위한 로짓모형을 제시하고 자료분석 방법을 제공하고자 한다. 모형과 관련된 가정으로 반복측정이 행해지는 g개 시점은 각기 서로 다른 요인 또는 공변량의 결합수준들로 구성된다고 가정한다. 또한, 모형에서 고려된 처치들이 반복측정에 기인하는 서로 다른 크기의 실험 단위들에 행해질 때 모수들을 추정하기 위한 방법으로 가중최소제곱법을 다루고 있다. 여기서 가중최소제곱법은 반응변수들의 종속성으로 인한 공분산 구조에 근거한 모형내 모수들의 효과를 효율적으로 추론하기 위해 이용된다. 제시된 모형은 주변로짓을 이용함으로써 단순히 주변확률분포의 동질성에 대한 검정뿐만 아니라 모형의 타당성 및 요인들의 수준변화에 따른 효과를 파악하기 위한 효과적인 모형임을 보여준다.

• Journal of Preventive Medicine and Public Health
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• 제54권6호
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• pp.395-403
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• 2021

Objectives: Previous studies have shown that participation in social activities (SA) can prevent cognitive decline (CD) and that living arrangements (LA) can affect cognitive function. This study aimed to evaluate the effects of SA and LA on CD, as well as their interactions, using longitudinal data. Methods: Data were used from the 2006-2018 Korean Longitudinal Study for Aging, which followed 10 254 adults older than 45 years over a 12-year period. CD was defined as a ≥4-point score decrease in the Mini-Mental Status Exam over 2 years. We developed an extended Cox proportional hazards model for time-dependent covariates to estimate the hazard ratio (HR) of CD in 4 groups: (1) socially active and living with others, (2) socially active and living alone, (3) socially inactive and living with others (SILO), and (4) socially inactive and living alone (SILA). The model was stratified by gender and adjusted for important confounders. Results: The HR of CD was significantly higher in the SILO group in men (HR,1.36; 95% confidence interval [CI], 1.08 to 1.78) and in the SILA group in women (HR, 1.72; 95% CI, 1.08 to 2.75). However, the interaction term for gender was not significant. Conclusions: Among socially inactive elderly adults, the HR of CD was elevated in men who lived with others and in women who lived alone, although the interaction term for gender was not significant. Socially inactive men who live with others and socially inactive women who live alone are particularly encouraged to participate in SA to prevent CD.