• 제목/요약/키워드: the sequence of contents

검색결과 433건 처리시간 0.045초

한국산 방사무의김 (Porphyra yezoensis)의 핵 18S rDNA 염기서열 분석 (Sequence Analysis of Nuclear 18S rDNA from the Seaweed Porphyra yezoensis (Rhodophyta) in Korea)

  • ;김명숙;최재석;조지영;진형주;홍용기
    • 한국수산과학회지
    • /
    • 제35권6호
    • /
    • pp.633-638
    • /
    • 2002
  • Nuclear 18S ribosomal RNA gene (185 rDNA) from the aquaculturable seaweed Porphya yezoensis (Bangiales, Rhodophyta) was amplified using the polymerase chain reaction and its sequence was analysed. Complete 185 rDNA has an 1823 bp exon and a 514 bp intron. The G+ C contents of exon and intron were $48\%$ and $51.4\%$, respectively. The exon sequence showed $99.5\%$ homology to the GenBank accession number AB013177 of the Japanese p. yezoensis. The intron region that was inserted upstream between 568 and 1083 showed $93.4\%$ homology to the AB013177.

한국산 참김 (Porphya tenera)의 핵 18S rDNA염기서열 분석 (Sequence Analysis of Nuclear 18S rDNA from Porphya tenera (Rhodophyta) in Korea)

  • ;김명숙;최재석;조지영;진덕희;홍용기
    • 한국수산과학회지
    • /
    • 제36권1호
    • /
    • pp.35-38
    • /
    • 2003
  • Nuclear 18S ribosomal RNA gene (185 rDNA) from the aquaculturable seaweed Porphya tenera (Bangiales, Rhodophyta) was amplified using the polymerase chain reaction and its sequence was analysed. Complete 185 rDNA has an 1,822 bp exon and a 510 bp intron. The G+C contents of exon and intron were $48.68\%\;and\;54,90\%,$ respectively. The exon sequence showed $99.6\%$ homology to the GebBank accession number AB029880 of the Japanese P. tenera. The intron region that is inserted upstream between 568 and 1,079 showed $43.6\%$ homology to the AB029880.

적외선 사진을 이용한 문서작성 순서에 관한 분석 (Analysis on Sequence of document processing by using Digital Infrared Photography)

  • 김유진
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국콘텐츠학회 2011년도 춘계 종합학술대회 논문집
    • /
    • pp.447-448
    • /
    • 2011
  • 오래전부터 적외선은 문서감정 분야에서 사용했으나, 대부분 필기구의 분광반사 차이를 이용한 문서의 위변조에 집중되었을 뿐, 문서를 작성한 필기구들의 사용 순서에 대한 분석에는 이용하지 않았다. 문서작성의 순서를 분석하기 위해서는 보통 현미경으로 필적을 확대하여 분석하지만, 상황에 따라 분명치 않은 경우도 있다. 따라서 본 연구에서는 필기구들의 분광반사 차이를 이용하여 필기구들이 겹친 영역을 분석함으로서 문서작성에 사용한 필기구들의 사용 순서를 쉽게 판단할 수 있는 방법을 제안하고 있다. 이 방법은 필기구 사용 순서에 따라 법적인 해석에 대한 논쟁이 있을 수 있는 보험계약서 등에 적용이 가능할 것으로 기대한다.

  • PDF

Apache Spark을 이용한 병렬 DNA 시퀀스 지역 정렬 기법 구현 (Implementation of Parallel Local Alignment Method for DNA Sequence using Apache Spark)

  • 김보성;김진수;최도진;김상수;송석일
    • 한국콘텐츠학회논문지
    • /
    • 제16권10호
    • /
    • pp.608-616
    • /
    • 2016
  • Smith-Waterman(SW) 알고리즘은 DNA 시퀀스 분석에서 중요한 연산 중 하나인 지역 정렬을 처리하는 알고리즘이다. SW 알고리즘은 동적 프로그래밍 방법으로 최적의 결과를 도출할 수 있지만 수행시간이 매우 길다는 문제가 있다. 이를 해결하기 위해서 다수의 노드를 이용한 병렬 분산 처리 기반의 SW 알고리즘이 제안되었다. Apache Spark을 기반으로 하는 병렬 분산 DNA 처리 프레임워크인 ADAM에서도 SW 알고리즘을 병렬로 처리하고 있다. 하지만, ADAM의 SW 알고리즘은 Smith-Waterman 이 동적프로그래밍 기법이라는 특성을 고려하지 않고 있어 최대의 성능을 얻지 못하고 있다. 이 논문에서는 ADAM의 병렬 SW 알고리즘을 개선한다. 제안하는 병렬 SW 기법은 두 단계에 걸쳐 실행된다. 첫 번째 단계에서는 지역정렬 대상인 DNA 시퀀스를 다수의 파티션(partition)으로 분할하고 분할된 각 파티션에 대해서 SW 알고리즘을 병렬로 수행한다. 두 번째 단계에서는 파티션 각각에 대해서 독립적으로 SW를 적용함으로써 발생하는 오류를 보완하는 과정을 역시 병렬로 수행한다. 제안하는 병렬 SW 알고리즘은 ADAM을 기반으로 구현하고 기존 ADAM의 SW와 비교를 통해서 성능을 입증한다. 성능 평가 결과 제안하는 병렬 SW 알고리즘이 기존의 SW에 비해서 2배 이상의 좋은 성능을 내는 것을 확인하였다.

Sequence Variation in Superoxide Dismutase Gene of Toxoplasma gondii among Various Isolates from Different Hosts and Geographical Regions

  • Wang, Shuai;Cao, Aiping;Li, Xun;Zhao, Qunli;Liu, Yuan;Cong, Hua;He, Shenyi;Zhou, Huaiyu
    • Parasites, Hosts and Diseases
    • /
    • 제53권3호
    • /
    • pp.253-258
    • /
    • 2015
  • Toxoplasma gondii, an obligate intracellular protozoan parasite of the phylum Apicomplexa, can infect all warm-blooded vertebrates, including humans, livestock, and marine mammals. The aim of this study was to investigate whether superoxide dismutase (SOD) of T. gondii can be used as a new marker for genetic study or a potential vaccine candidate. The partial genome region of the SOD gene was amplified and sequenced from 10 different T. gondii isolates from different parts of the world, and all the sequences were examined by PCR-RFLP, sequence analysis, and phylogenetic reconstruction. The results showed that partial SOD gene sequences ranged from 1,702 bp to 1,712 bp and A + T contents varied from 50.1% to 51.1% among all examined isolates. Sequence alignment analysis identified total 43 variable nucleotide positions, and these results showed that 97.5% sequence similarity of SOD gene among all examined isolates. Phylogenetic analysis revealed that these SOD sequences were not an effective molecular marker for differential identification of T. gondii strains. The research demonstrated existence of low sequence variation in the SOD gene among T. gondii strains of different genotypes from different hosts and geographical regions.

콩잎 밑 콩잎 요리의 이소플라본 함량 및 항산화 관련 성분들의 비교 (Contents of Isoflavones and Antioxidative Related Compounds in Soybean Leaf, Soybean Leaf Jangachi, and Soybean Leaf Kimchi)

  • 류승희;이혜숙;이영순;문갑순
    • 한국식품조리과학회지
    • /
    • 제21권4호
    • /
    • pp.433-439
    • /
    • 2005
  • Soybean is an important plant as it is the source of protein and oil as well as various phytochemicals that are related with biological activity. Over the past decades, scientists have conducted considerable research on the physiological properties of soybeans, especially isoflavones, which are the characteristic components in soybeans. However, there is no research on the properties or the bio-functionality of soybean leaf. Jangachi and kimchi are two of the traditional special dishes of Gyungsang Province in Korea which we made from soybean leaves. Depending on the recipe, green or yellow soybean leaves are used for the preparation of these two side dishes. We compared the antioxidative activity and measured the contents of isoflavones, total phenol, chlorophylls, carotenoids, and vitamin C in the ingredients (green and yellow soybean leaf) and the final side dishes (jangachi and kimchi). We Int report that isoflavones were contained in soybean leaf and that jangachi had the highest isoflavone contents among the samples. Yellow soybean leaf contained higher isoflavones than green soybean lear and kimchi. From the TEAC assay results, the sequence or antioxidative activities was yellow soybean leaf > soybean leaf jangachi > green soybean leaf > soybean leaf kimchi. The sequence was the same with total phenol contents, indicating that antioxidative activity is highly related with total phenol level. Chlorophylls, carotenoids and vitamin C existed abundantly in green soybean leaf. In conclusion, soybean leaf could be a good material for health due to the presence of isoflavones and the other useful antioxidants mentioned above.

Blackbox and Scenario-Based Testing of Online Games Using Game Description Language

  • Cho, Chang-Sik;Lee, Dong-Chun;Sohn, Kang-Min;Park, Chang-Joon;Kang, Ji-Hoon
    • ETRI Journal
    • /
    • 제33권3호
    • /
    • pp.470-473
    • /
    • 2011
  • In this letter, we propose blackbox and scenario-based testing of multiplayer online games as well as simple load testing. Game testing is done from outside the source code, and the access to the source code is not required to testers because the game logic is described with a game description language and virtual game map. Instead of using a subset of the main game client for the test client, only game packet protocols and the sequence of packets are analyzed for new game testing. In addition, complex and various scenarios can be tested through combining defined actions. Scenario-based testing helps testers mimic real testing environments instead of doing simple load testing and improves the productivity of game testing.

목적 지향 대화를 위한 효율적 질의 의도 분석에 관한 연구 (Effective Text Question Analysis for Goal-oriented Dialogue)

  • 김학동;고명현;임헌영;이유림;지민규;김원일
    • 방송공학회논문지
    • /
    • 제24권1호
    • /
    • pp.48-57
    • /
    • 2019
  • 본 연구는 목적 지향 대화 시스템 내에서 단일 한국어 텍스트 형식의 질문으로부터 질의자의 의도를 파악하는 것을 목적으로 한다. 목적 지향 대화 시스템은 텍스트 또는 음성을 통한 사용자의 특수한 요구를 만족시켜주는 대화 시스템을 의미한다. 의도 분석 과정은 답변 생성에 앞서 사용자의 질의 의도를 파악하는 단계로, 목적 지향 대화 시스템 전체의 성능에 큰 영향을 준다. 생활화학제품이라는 특정 분야에 제안 모델을 사용하였고, 해당 분야와 관련된 한국어 텍스트 데이터를 이용하였다. 특정 분야에 독립적이며 범용적인 의도를 의미하는 화행과, 특정 분야에 종속적인 의도를 의미하는 개념열로 나누어 분석한다. 화행과 개념열을 분석하기 위하여 단어 임베딩 모델, 합성곱 신경망을 이용한 분류 방법을 제안한다. 단어 임베딩 모델을 통하여 단어의 의미정보를 추상화하고, 추상화된 단어의 의미정보를 기반으로 합성곱 신경망을 통하여 개념열 및 화행 분류를 수행한다.

Pre-Equalization Techniques for Mitigating Rain Attenuation Channels in a Broadband Fixed Wireless Uplink System

  • Lee, Yeon-Woo;Cho, Choon-Geun;Hur, Kyeong;Cho, Kwang-Moon;Alsusa, Emad
    • International Journal of Contents
    • /
    • 제2권4호
    • /
    • pp.19-24
    • /
    • 2006
  • In this paper, the performance of pre-equalization technique which can be applicable for the B-WLL uplink is evaluated and compared to post-equalization technique under three kinds of rain attenuation channels such as rain, intermittent light rain and thundershower. The BER performance comparisons of two algorithms (LMS and RLS) are investigated in the context of channel models and the length of training sequence. From the simulation results, it is shown that the post-equalization outperforms only at quite good channel conditions such as AWGN, while the pre-equalization can guarantee better BER performance at every channel conditions, especially performance gain increases as the severity of channel increases. It is concluded that the pre-equalizer using LMS algorithm is preferable at delay-tolerant situation where the complexity of algorithm is not a strict factor, while one using RLS is suitable for fast burst transmission with a relatively short training sequence.

  • PDF

이산화된 텐트맵의 설계 (Design of Discretized Tent Map)

  • 백승재;박진수
    • 한국콘텐츠학회논문지
    • /
    • 제8권4호
    • /
    • pp.86-91
    • /
    • 2008
  • 본 논문에서는 혼돈함수들 중 하나인 텐트함수의 변환을 수행하는 이산화된 8비트 텐트맵의 설계 절차를 보이기 위해서, 먼저 이산화 텐트맵의 진리표를 작성하였고, 진리표를 통해 구해진 간략화된 부울대수에 따라, 배타적 논리합 게이트만을 사용하여 이산화 맵을 실제 하드웨어로 구현하였다. 제안된 텐트맵 회로는 혼돈맵의 혼돈 특성에 따라8비트 유한 정밀도와 주기 8의 상태들을 발생시키는 궤환회로로 구성되었으며, 설계된 회로도를 제시하였다. 이산화된 텐트맵은 스트림 암호시스템의 키스트림 발생회로에서 혼돈 2진 순서들을 발생시키는데 새롭게 사용될 것이다.