FosB (FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog B) 유전자는 사람의 19번 염색체에 위치하고 있으며 약 43 KD의 단백질을 코딩하며, 발생 및 분화과정, 개체 유지, 발병 진행 등을 조절한다고 알려져 왔다. 본 연구에서는 바이오 마커 등의 가능성이 있다고 보고된 FosB 유전자의 프로모터를 클로닝하여 활성도를 분석하고자 하였다. FosB genomic DNA 서열을 확인한 결과, TSS upstream 방향의 약 1 Kb 안쪽 부위에 FosB 유전자 발현을 위한 중요한 요소들이 있을 것으로 추정하였고, 따라서 FosB genomic DNA의 upstream -1,555 부위부터 exon 1의 +73까지 부위에 대한 PCR 증폭을 수행하였다. 또한 클로닝 성공을 높이기 위하여 일차로 $TA-1^{st}FosBp$ plasmid를 얻은 후, 다시 $TA-1^{st}FosBp$ plasmid를 template로 Kpn1과 Nhe1 제한 효소 절단부위를 프라이머에 삽입한 후 제작하여 2차 PCR을 수행하였으며, $TA-2^{nd}FosBp$ 플라스미드를 제작한 후 제한 효소로 절단하여 pGL3-luc vector로 subcloning하였다. 제작된 pGL3-FosBp-luc를 이용하여 항암제에 대한 활성도를 분석하고자 A549 사람 폐암세포주에 pGL3-FosBp-luc 플라스미드를 transfection 한 후 luciferase 활성도 분석을 수행하였다. Luciferase 활성도 증가는 doxorubicin, taxol 등을 처리한 후 단백질 발현 양상과 비교 하였을 때도 일치되는 결과를 얻을 수 있었다. 그러므로 FosB프로모터 클로닝은 향후 유전자 발현 연구, 마커분석 등에 유용할 것으로 사료된다.
Military camera equipment has a problem that observability is inferior due to various shaking factors. In this paper, we propose an image stabilization algorithm considering performance and execution time to solve this problem and implemented it in Zynq SoC. We stabilized both the simple shaking in the fixed observation position and the sudden shaking in the moving observation position. The feature of the input image is extracted by the Sobel edge algorithm, the subblock with the large edge data is selected, and the motion vector, which is the compensation reference, is calculated through template matching using the 3-step search algorithm of the region of interest. In addition, the proposed algorithm can distinguish the shaking caused by the simple shaking and the movement by using the Kalman filter, and the stabilized image can be obtained by minimizing the loss of image information. To demonstrate the effectiveness of the proposed algorithm, experiments on various images were performed. In comparison, PSNR is improved in the range of 2.6725~3.1629 (dB) and image loss is reduced from 41% to 15%. On the other hand, we implemented the hardware-software integrated design using HLS of Xilinx SDSoC tool and confirmed that it operates at 32 fps on the Zynq board, and realized SoC that operates with real-time processing.
유전자변형 장미 개발에 이용된 형질전환 벡터 pSPB130을 검출할 있는 duplex PCR이 개발되었다. 유전자변형 장미를 검출하기 위해 anthocyanin synthase($ANS$)가 장미 내 재유전자로 PCR 검사법에 이용하였다. 107bp의 PCR 산물을 얻을 수 있는 RHANS-KF/KR primer가 ANS 유전자를 증폭시키는데 이용되었고, 이것을 이용하여 9개의 다른 식물에 대해서 PCR한 결과 장미에서만 특이적인 증폭산물이 확인되었다. GMRH-KF/KR primer가 형질전환 벡터 pSPB130에 삽입된 35S promoter와 flavonoid 3',5'-hydroxylase($F3^{\prime}5^{\prime}H$) 사이의 염기서열을 확인할 수 있도록 제작되었다. 본 연구에서 개발된 duplex PCR의 검정한계치는 약 0.5%이며, 이러한 duplex PCR이 우리나라 미승인 유전자변형 장미를 모니터링 하는데 유용하게 사용될 수 있을 것이다.
Objectives: In order to identify the anti-inflammatory and analgesic properties of Salvia miltiorrhiza (Dan-Sam), widely used in Korean traditional medicine, an in vitro screening system was designed using pGL3, a luciferase reporter vector, and the tumor necrosis factor (TNF)-${\alpha}$ and cyclooxygenase (COX)-2 as target genes. Methods: The promoter regions of each gene were generated by PCR using the human chromosome as template DNA, and inserted into pGL3 vector with Kpn I and Hind III. The final construct was transfected into human myelomonocytic leukemia cells (U-937) that could be differentiated and activated by phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) or lipopolysaccharide (LPS). Using this system, the anti-inflammatory and analgesic effects of several herbal extracts regarded to have the medicinal effects of diminishing body heat and complementing Qi were tested. The chemicals PD98059 and berberine chloride were used as controls of the transcriptional inhibitors of TNF-${\alpha}$ and COX-2, respectively. Results: Salvia miltiorrhiza (Dan-Sam) demonstrated significant decrease of TNF-${\alpha}$ and COX-2 mRNA in the in vitro assay system. In MTT assay, Salvia miltiorrhiza (Dan-Sam) did not significantly inhibit the survival and proliferation of human myelomonocytic leukemia cells (U-937). Conclusions: Salvia miltiorrhiza (Dan-Sam) was found to exhibit the significant medicinal properties of anti-inflammatory and analgesic effects.
Three cDNA fragments located within NS5 region of HCV were synthesized by RT using viral RNA extracted from blood sample of Korean patient as a template. The cDNAs were amplified by PCR, cloned into the T-vector, and the nucleotide sequences were determined. Comparative analysis of the nucleotide and amino acid sequence of NS5 cDNAs showed that it is closely related with HCV type 1b. The cloned NS5 cDNA showed 91-94% homology at the nucleotide sequence level and 96-98% homology at the amino acid sequence level with several strains of the HCV type 1b. The NS5 cDNAs were subcloned into E. coli expression vectors to construct pRSETA5-1, pTHAN5-1, pRSETC5-2, pRSETBB1, pRESTCB1 and pRSETB-H3. Expression of the NS5 proteins was achieved by inducing the promoter with isopropyl-thio-${\beta}$-D-galactoside (IPTG) and confirmed by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The NS5 proteins were immunoreactive against sera from Korean hepatitis C patients in Western blot analysis. Among the recombinant NS5 proteins, pRSETAS-1 plasmid derived protein, coded from aa2022 to aa2521 of HCV polyprotein, showed the strongest immunoreactivity against sera from Korean hepatitis C patients in immunoblot analysis. These results suggest that NS5 proteins would be useful as an antigen for detection of antibody against HCV in the blood samples.
2005년 전북 고참에서 채집한 옥수수 이병주로부터 벼검은줄오갈병 바이러스를 동정하였다. 이들 이병주로부터 게놈 dsRNA를 추출하여 polyacrylamide gel 전기영동으로 게놈 패턴을 분석 하였다. 전기영동 결과 이미 알려진 10개의 분절게놈을 확인하였으며 채집지역별 isolate에서 게놈 dsRNA이동도의 차이를 확인하였다. 추출된 dsRNA를 주형으로 하여 S10의 full-length 특이 primer를 사용하여 RT-PCR한 결과 1,801의 예상되는 band를 확인하여 RBSDV로 동정하였다. S10을 pGEM-T vector에 크로닝하여 염기서열 분석 결과 1,801nt, 559aa로 구성되어 있었다. 이는 벼에 발생하는 RBSDV S10의 크기와 동일하였으며 상동성 분석결과 18개 염기에서 변이가 확인되어 99%의 상동성을 나타내었다.
다양한 얼굴 포즈 검출 및 인식은 매우 어려운 문제로서, 이는 특징 공간상의 다양한 포즈의 분포가 정면 영상에 비해 매우 흩어져있고 복잡하기 때문이다. 이에 본 논문에서는 기존의 얼굴 인식 방법들이 제한 사항으로 두었던 입력 영상의 다양한 포즈 및 표정에 강인한 얼굴 인식 시스템을 제안하였다. 제안한 방법은 먼저, TLS 모델을 사용하여 얼굴 영역을 검출한 뒤, 얼굴의 구성요소를 통하여 얼굴 포즈를 추정한다. 추정된 얼굴 포즈는 3차원 X-Y-Z축으로 분해되는데, 두 번째 과정에서는 추정된 벡터를 통하여 만들어진 가변 템플릿과 3D CAN/DIDE모델을 이용하여 얼굴을 정합한다 마지막으로 정합된 얼굴은 분석된 포즈와 표정에 의하여 얼굴 인식에 적합한 정면의 정규화 된 얼굴로 변환된다. 실험을 통하여 얼굴 검출 모델의 사용과 포즈 추정 방법의 타당성을 보였으며, 포즈 및 표정 정규화를 통하여 인식률이 향상됨을 확인하였다.
전자해도는 종이해도를 전자화한 공식 디지털 해도로서 선박의 안전항해를 위한 필수 데이터이나 전자해도의 특수한 엔코딩 포맷으로 접근이나 조작이 용이하지 못하다. 본 연구에서는 전자해도의 접근과 서비스를 보다 용이하게 하기 위한 전자해도 SVG(Scalar Vector Graphic) 변환 연구를 수행하였다. SVG는 인터넷 브라우징 환경에서 지도의 서비스를 위한 벡터 그래픽 포맷으로서 복잡한 GIS 매핑 시스템 및 클라이언트의 특별 시스템이 요구되지 않는다. 전자해도를 SVG를 변환함으로서 활용 방안은 다음과 같다. 첫째, SVG는 벡터 그래픽의 장점으로 인해 공간 검색이 용이하며, 둘째로 특정 GIS 시스템 없이 고 품질의 벡터 그래픽 및 주제도 작성이 가능하다. 셋째로 해상교통 정보와 연계된 SVG 정보 서비스는 템플릿으로 활용될 수 있으며 다양한 해상교통 정보와 결합된 새로운 정보 서비스가 가능해진다. 전자해도의 SVG 변환 기술 개발로 해양지리정보 표현에 많은 활용이 예상된다.
선박 안전항해를 위한 필수 데이터인 전자해도는 종이해도를 전자화한 공인 디지털 해도로서 IEC 8211이라는 특정 엔코딩 방식을 취하기 때문에 사용자의 조작이 어려운 특징이 있다. 본 연구에서는 전자해도의 조작과 응용서비스를 용이하게 하기 위한 전자해도 SVG(Scalar Vector Graphic) 변환연구를 수행하였다. SVG는 웹 환경에서 지도 서비스를 위 한 벡터 그래픽으로서 GIS 매핑시스템이나 고도의 기술이 요구되지 않는다. 전자해도를 SVG로 변환함으로서 첫째, 공간 검색이 용이하며, 둘째로 특정 GIS 시스템 없이 고 품질의 벡터 그래픽 및 주제도 작성이 가능하며, 셋째로 해상교통 정 보와 연계된 SVG 정보 서비스는 템플릿으로 활용되어 다양한 해상교통 정보와 결합된 새로운 정보 서비스가 가능해진다. 전자해도의 SVG 변환 기술 개발로 해양지리정보 표현에 많은 활용이 예상된다.
Chukeatirote, Ekachai;Maharachchikumbura, Sajeewa S.N.;Wongkham, Shannaphimon;Sysouphanthong, Phongeun;Phookamsak, Rungtiwa;Hyde, Kevin D.
Mycobiology
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제40권2호
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pp.107-110
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2012
Genes encoding the cellobiohydrolase enzyme (CBHI), designated as cbhI, were isolated from the basidiomycetes Auricularia fuscosuccinea, Pleurotus giganteus, P. eryngii, P. ostreatus, and P. sajor-caju. Initially, the fungal genomic DNA was extracted using a modified cetyltrimethyl ammonium bromide (CTAB) protocol and used as a DNA template. The cbhI genes were then amplified and cloned using the pGEM-T Easy Vector Systems. The sizes of these PCR amplicons were between 700~800 bp. The DNA sequences obtained were similar showing high identity to the cbhI gene family. These cbhI genes were partial consisting of three coding regions and two introns. The deduced amino acid sequences exhibited significant similarity to those of fungal CBHI enzymes belonging to glycosyl hydrolase family 7.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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