• Journal of Animal Science and Technology
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• 제62권2호
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• pp.239-246
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• 2020

Microorganism residing in the gut has been known to have important roles in the animal body. Microbes and host microenvironment are highly related with host's health including energy metabolism and immune system. Moreover, it reported that gut microbiome is correlated with diseases like obesity in human and dogs. There have been many studies to identify and characterize microbes and their genes in human body. However, there was little information of microbiome in companion animals. Here, we investigated microbiota communities in feaces from twenty - four Beagles (aged 2 years old) and analyzed the taxonomy profile using metagenomics to study the difference among gut microbiome based on body condition score (BCS). gDNA was isolated from feaces, sequenced and clustered. Taxonomy profiling was performed based on the NCBI database. BCS was evaluated once a week according to the description provided by World Small Animal Veterinary Association. Firmicutes phylum was the most abundant followed by Bacteroidetes, Fusobacteria, Proteobacteria and Actinobacteria. That main microbiota in gut were differently distributed based on the BCS. Fusobacteria has been known to be associated with colon cancer in human. Interestingly, Fusobacteria was in the third level from the top in healthy dog's gut microbiome. In addition, Fusobacteria was especially higher in overweight dogs which had 6 scales of BCS. Species Fusobacterium perfoetens was also more abundant when dogs were in BCS 6. It implied that F. perfoetens would be positively related with overweight in dogs. These finding would contribute to further studies of gut microbiome and their functions to improve dog's diets and health condition.

• Journal of Plant Biology
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• 제4권1호
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• pp.1-7
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• 1961

분류학에서 이종으로 취급되고 있는 Forsythia속의 종간교잡을 실시하여 화주장의 분리비, 양화주간의 수정양식, $F_1$의 임성, ♀♂성 기타 분류학상의 제문제제를 구명한바 그 요지는 다음과 같다. (1) 화주장은 L:S=1:1로 분리한다. (2) 이종간의 적, 부적법수분인데도 양친 L, S의 수정양식은 일 일반형예식물 동일종내의 2형화와 전혀 동일하다. (3) $F_1$의 L, S간의 수정양식도 일반형예식물과 동일하다. (4) 종간교잡은 잘되고 $F_1$의 임성도 이상없다. (5) 교잡제일식의 형태, 생리적변이는 심하다. (6) S주도 적법수분에서는 임성이 양호하고 Forsythia가 ♀, ♂ 이주라는 것은 잘못이다. (7) $F_1$에는 영양생장 및 생식기관이 빈약한 왜형이 나타난다. (8) 본실험에 사용한 두종은 이종이라기보다 동일종내의 이화형개체라고 하는 것이 타당하다.

• 식물분류학회지
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• 제47권4호
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• pp.328-335
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• 2017

<향약채취월령>을 비롯하여 우리나라 고전 본초서에 나오는 진교는 지금까지 큰잎용담, 진범, 그리고 쥐꼬리망초 등으로 알려져 왔다. 관점에 따라 서로 다른 실체를 인정해온 것이다. 그러나 중국 고전 본초서와 우리나라 고전 본초서를 검토한 결과 중국 고전 본초서에 나오는 진교는 국내에는 분포하지 않은 큰잎 용담 또는 소박골로 파악되었다. 현대 중국 식물학 관련 문헌에서는 진교를 큰잎용담으로 간주하고 있다. 우리나라 고전 문헌에 나오는 진교는 진범 또는 쥐꼬리망초로 간주되었으나, 우리나라에는 진교가 분포하지 않은 것으로 파악되었다. 식물명 진범은 진교의 이체자명을 잘못 읽은 것으로, 중국 고전과 우리나라 고전에 나오는 진교와는 무관한 것으로 파악되었다. 그럼에도 불구하고 현재 많은 식물학 문헌에서 진범이라는 식물명을 사용하고 있다. 따라서 국명 역시 학명과 마찬가지로 국명 역시 "명칭 사용의 안정성"을 고려하여 진범이라는 국명을 사용할 것으로 제안한다.

• 한국균학회지
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• 제17권2호
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• pp.76-81
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• 1989

Fusarium oxysporum은 하나의 종내에 많은 formae speciales(분화종)과 races 등이 분화되어 있다. 그 중에서 10균주에 대하여 균사 내에서의 영양핵의 분열상을 찾아 Giemsa staining 용액으로 염색하여 그들의 염색체 수를 비교 관찰하였다. 균주에 따라 염색체 수에 차이가 있었으며 2균주(F. oxysporum f. sp. lycoperici, F. oxysporum Kangnung D2)는 n=4, 2균주(F. oxysporum S Sachun 3, F. oxysporum S Kohung 2)는 n=5, 5균주(F. oxysporum S Kohung 3, F. oxysporum CS Hongchun D16, F. oxysporum S Bosung 5, F. oxysporum S Sunchun 4, F. oxysporum S Haenam 4)는 n= 7개를 관찰할 수 있었고 Australia의 Sydney 대학에서 분양받은 F. oxysporum 14-39는 n=8개로 전체로 보아 4-8개의 염색체를 관찰할 수 있었다. 본인의 앞서 본문의 결과와 종합하여 고찰할 때 F. oxysporum의 기본염색체 수는 반수체가 4개로 추론되며 여기에서부터 여러가지 요인으로 인하여 diploidy, aneuploidy가 되어 다양한 염색체 수를 가진 것으로 사료된다.

• ALGAE
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• 제28권2호
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• pp.173-183
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• 2013

Sodium hypochlorite (NaOCl) is widely used to disinfect seawater in power plant cooling systems in order to reduce biofouling, and in ballast water treatment systems to prevent transport of exotic marine species. While the toxicity of NaOCl is expected to increase by ongoing ocean acidification, and many experimental studies have shown how algal calcification, photosynthesis and growth respond to ocean acidification, no studies have investigated the relationship between NaOCl toxicity and increased $CO_2$. Therefore, we investigated whether the impacts of NaOCl on survival, chlorophyll a (Chl-a), and effective quantum yield in three marine phytoplankton belonging to different taxonomic classes are increased under high $CO_2$ levels. Our results show that all biological parameters of the three species decreased under increasing NaOCl concentration, but increasing $CO_2$ concentration alone (from 450 to 715 ${\mu}atm$) had no effect on any of these parameters in the organisms. However, due to the synergistic effects between NaOCl and $CO_2$, the survival and Chl-a content in two of the species, Thalassiosira eccentrica and Heterosigma akashiwo, were significantly reduced under high $CO_2$ when NaOCl was also elevated. The results show that combined exposure to high $CO_2$ and NaOCl results in increasing toxicity of NaOCl in some marine phytoplankton. Consequently, greater caution with use of NaOCl will be required, as its use is widespread in coastal waters.

• Mass Spectrometry Letters
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• 제13권4호
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• pp.166-176
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• 2022

Banana peels are also widely used as bio-adsorbent in the removal of chemicals contaminants and heavy metals from water and soil. GC-MS plays an essential role in the phytochemical analysis and chemo taxonomic studies of medicinal plants containing biologically active components. Intrinsically, with the use of the flame ionization detector and the electron capture detector which have very high sensitivities, Gas chromatography can quantitatively determine materials present at very low concentrations and most important application is in pollution studies. In the present study banana peels were used as bio-adsorbent to remediate the heavy metal contaminated water taken from three different stations located around the industrial belts of Ranipet, Tamilnadu, India. The AAS analysis of the samples shows a decrement of chromium concentration of 98.93%, 96.16% and 96.5% in Station 1, 2 and 3 respectively which proves the efficiency of the powdered peels of Musa paradisiaca. The GC-MS analysis of the control and treated peels of Musa paradisiaca reveals the presence of phytochemicals like Acetic Acid, 1-Methylethyl Ester, DL-Glyceraldehyde Dimer, N-Hexadecanoic Acid, 3-Decyn-2-Ol, 26-Hydroxy, Cholesterol, Ergost-25-Ene-3,5,6,12-Tetrol, (3.Beta.,5.Alpha.,6.Beta.,12.Beta.)-, 1-Methylene-2b-Hydroxymethyl-3, and 3-Dimethyl-4b-(3-Methylbut-2-Enyl)-Cyclohexane in the control banana peels. The banana peels which were used for the treatment reveals the changes and alteration of the phytochemicals. It is concluded that the alteration in phytochemicals of the experimental banana peels were due to adsorption of chromium heavy metal from the sample.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제51권1호
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• pp.109-123
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• 2023

Preterm birth (PTB) is defined as giving birth prior to the 37th week of pregnancy and is a major cause of infant mortality. Studies have indicated that the vaginal microbiota's composition and its dysbiosis, particularly during pregnancy, may play a major role in PTB. While previous research work concentrated on well-studied microorganisms such as Lactobacillus, Prevotella, Gardnerella, various other microbes, and their significance in the vaginal microbiota's stability remain unknown. Moreover, current studies have focused primarily on the relative abundances of the microbes found, without considering their interactions with other members of the vaginal microbiota. In this work, we developed a novel computational approach and performed taxonomic classification of vaginal microbiota samples stratified longitudinally (Term/PTB) to observe compositional disparities and find underexamined microbes that may be contributing to PTB. Furthermore, we carried out a correlational analysis to build a microbial co-interaction network and investigated the functional implications of the genes present in both Term and PTB samples. The co-occurrence network revealed that Lactobacillus acts in solidarity to maintain the stability of the vaginal microbiota and did not have strong co-interactions with any of the other microbes. Similarly, microbes with strong interactions with Atopobium, a well-known marker microbe of PTB, were also observed. Additionally, several genes such as PTXA, FANCM, GPX, and DUSP were found to be playing an important role in the occurrence of PTB. This study provides a novel conceptual framework revealing distinct vaginal microbiota signatures that could be potential therapeutic targets for the prevention of PTB.

• 한국해양학회지:바다
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• 제21권4호
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• pp.158-170
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• 2016

국내 연안에서 하계에 출현하는 Alexandrium 속 와편모류의 종 다양성 연구를 위해, 2013년 7월부터 10월까지 19개 정점에서 해수 시료를 채취하였고, 이 가운데 4개 지역에서 Alexandrium 속의 와편모류가 확인되었다. 해당 4개 해수 시료에 단세포/단세포사 분리법을 적용하여, 총 22 종류의 Alexandrium 단종배양체를 확립하였다. 이 가운데 4종류의 Alexandrium 단종배양체에 대한 형태학 및 유전학적 특성을 분석한 결과, 각각 A. catenella, A. affine, A. fraterculus 및 Alexandrium sp.(strain WEB-Alex-01)인 것으로 확인되었다. 우리나라 연안에서 일반적으로 Alexandrium이 춘계 또는 추계의 중수온기에 주로 출현하는 것으로 알려진 바와는 대조적으로, 다양한 Alexandrium 종들이 하계에도 출현함을 확인하였다. 미동정 Alexandrium sp.(strain WEB-Alex-01) 종주는 국내 최초 보고 종으로서, 이 단종배양체에 대한 분류, 생리, 생태, 독성 등에 관한 추가적인 연구가 필요하다.

• Applied Microscopy
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• 제32권4호
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• pp.345-360
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• 2002

한국산 돌나물과 식물 4개 속 22종 23개 표본의 화분을 광학 및 주사전자현미경으로 관찰한 결과 발아구연의 유무, 과립상 돌기의 유무는 속간의 유연 관계를, 유선상 돌기의 모양은 Sedum속내 분류군의 한계를 설정하는데 유용한 정보를 제공하였다. 한국산 돌나물과의 화분립 모양은 소립-중립이고, 세잎꿩의비름이 가장 작고 섬꿩의비름이 가장 컸으며, 화분의 극면상립은 원형이며, 적도면상은 약장구형-장구형, 발아구는 3 공구형이었다. 표면 무늬는 유선상이었고, Hylotelephium, Meterostachys, Orostachys는 발아구연과 표면에 과립상 돌기를 가진 분류군으로 기존의 분자적, 형태학적 결과와 마찬가지로 위 분류 군들이 매우 유연 관계가 깊은 군임을 지지한다. 유집분석 결과, Sedum속은 유선상 돌기 상면이 둥근 군과 평평한 군으로 나누어지고, 유선상 돌기 상면이 둥근 군 중에서 표면에 과립상 돌기를 가진 군인 섬기린초, 애기기린초와 과립상 돌기를 가지지 않은 군으로 뚜렷하게 나누어진다. 또한 Sedum속에 속하는 종들이 여러개의 유집으로 흩어져 있어 Sedum속을 세분화할 필요가 있다고 한 기존의 연구 결과와도 일치하고 있다. 종간의 유연 관계에 있어서도 Aizoon아속 내 기린초와 애기기린초는 유일하게 과립상 돌기가 표면에 존재하고 있어 이들이 매우 가까운 유연 관계임을 시사하고 있으며, Sedum아속에 포함시켰던 S. polytrichoides 가 Meterostachys, Hylotelephium, Orostachys속 종과 유집 되고 있어 본 종의 분류학적 위치가 재고되어야 할 것으로 생각된다. 정동진에서 채집된 O. malacophyllus의 경우, 현재까지 한국에 보고된 동일종의 집단과 형태적으로 차이가 있을 뿐 아니라 화분 형태적으로도 뚜렷한 차이가 있어 두 집단이 서로 다른 종일 가능성이 있다 고 판단된다.

• Ocean and Polar Research
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• 제39권1호
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• pp.13-21
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• 2017

Temporal changes in the number of zooplankton species are important information for understanding basic characteristics and species diversity in marine ecosystems. The aim of the present study was to estimate the optimal monitoring frequency (OMF) to guarantee and predict the minimum number of species occurrences for studies concerning marine ecosystems. The OMF is estimated using the temporal number of zooplankton species through bi-weekly monitoring of zooplankton species data according to operational taxonomic units in the Tongyoung coastal sea. The optimal model comprises two terms, a constant (optimal mean) and a cosine function with a one-year period. The confidence interval (CI) range of the model with monitoring frequency was estimated using a bootstrap method. The CI range was used as a reference to estimate the optimal monitoring frequency. In general, the minimum monitoring frequency (numbers per year) directly depends on the target (acceptable) estimation error. When the acceptable error (range of the CI) increases, the monitoring frequency decreases because the large acceptable error signals a rough estimation. If the acceptable error (unit: number value) of the number of the zooplankton species is set to 3, the minimum monitoring frequency (times per year) is 24. The residual distribution of the model followed a normal distribution. This model can be applied for the estimation of the minimal monitoring frequency that satisfies the target error bounds, as this model provides an estimation of the error of the zooplankton species numbers with monitoring frequencies.