• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제39권4호
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• pp.218-247
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• 2023

In our ongoing efforts to explore the species diversity of the harpacticoid fauna in Korea, we present findings on four newly identified species from family Tegastidae Sars, 1904. Although this family is frequently encountered in phytal communities, the diversity of tegastid copepod species within Korean waters largely remains to be elucidated. Drawing from our collections of tegastid harpacticoids from Chuja-do and Geomun-do Islands, we provide morphological descriptions for Tegastes lobus sp. nov., T. tresetosus sp. nov., T. pilosus sp. nov., and Syngastes acutus sp. nov., and propose their taxonomic relationships in relation to other species within the genus. Finally, we update the list of tegastid harpacticoids found in Korea and provide a key for identifying the six confirmed species from this region.

• 식물분류학회지
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• 제42권4호
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• pp.282-293
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• 2012

한국산 초롱꽃과 8속 28분류군과 외군 2분류군 등 총 30분류군에 대한 계통유연관계를 알아보기 위하여 엽록체 DNA의 atpB, atpB-rbcL, atpF-H, matK, rbcL, rpl16, rpoC1 그리고 trnL-F 지역의 염기서열 분석을 실시하였다. 8개 유전자 지역의 염기서열 자료를 융합하여 분석한 결과 도라지속과 더덕속이 가장 기부에 분계조를 형성하였고 애기도라지속과 초롱꽃속은 각각 독립적으로 유집되었다. 홍노도라지속과 영아자속은 잔대속-금강초롱꽃속 분계조를 위한 자매군을 형성하였으며, 금강초롱꽃속은 잔대속의 모시대절과 분계조를 형성하였고 잔대속은 크게 하나의 군을 형성하였다. 본 연구에서 다룬 엽록체 DNA 8개 지역의 염기서열 자료에 기초한 한국산 초롱꽃과의 계통분석 결과, 속 수준에서의 구분은 가능하였으나 절 또는 계열 등 잔대속 내에서의 일부 분류계급은 형태 형질에 의한 분류체계와 일치하지 않았다.

• ALGAE
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• 제30권3호
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• pp.217-222
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• 2015

Pythium species (Pythiales, Oomycetes) are well known as the algal pathogen that causes red rot disease in Pyropia / Porphyra species (Bangiales, Rhodophyta). Accurate species identification of the pathogen is important to finding a scientific solution for the disease and to clarify the host-parasite relationship. In Korea, only Pythium porphyrae has been reported from Pyropia species, with identifications based on culture and genetic analysis of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region. Recent fungal DNA barcoding studies have shown the low taxonomic resolution of the ITS region and suggested the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene as an alternative molecular marker to identify Pythium species. In this study, we applied an analysis of both the ITS and cox1 regions to clarify the taxonomic relationships of Korean Pythium species. From the results, the two closely related Pythium species (P. chondricola and P. porphyrae) showed the same ITS sequence, while the cox1 marker successfully discriminated P. chondricola from P. porphyrae. This is the first report of the presence of P. chondricola from the infected blade of Pyropia yezoensis in Asia. This finding of the algal pathogen provides important information for identifying and determining the distribution of Pythium species. Further studies are also needed to confirm whether P. chondricola and P. porphyrae are coexisting as algal pathogens of Pyropia species in Korea.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제23권10호
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• pp.1347-1356
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• 2013

Tricholoma matsutake, an ectomycorrhiza that has mutual relationships with the rootlet of Pinus denisflora, forms a fruiting body that serves as a valuable food in Asia. However, the artificial culture of this fungus has not been successful. Soil fungi, including T. matsutake, coexist with many other microorganisms and plants; therefore, complex microbial communities have an influence on the fruiting body formation of T. matsutake. Here, we report on the structures of fungal communities associated with the fairy ring of T. matsutake through the pyrosequencing method. Soil samples were collected inside the fairy ring zone, in the fairy ring zone, and outside the fairy ring zone. A total of 37,125 sequencing reads were obtained and 728 to 1,962 operational taxonomic units (OTUs) were observed in the sampling zones. The fairy ring zone had the lowest OTUs and the lowest fungal diversity of all sampling zones. The number of OTUs and fungal taxa inside and outside the fairy ring zone was, respectively, about 2 times and 1.5 times higher than the fairy ring. Taxonomic analysis showed that each sampling zone has different fungal communities. In particular, out of 209 genera total, 6 genera in the fairy ring zone, such as Hemimycena, were uniquely present and 31 genera, such as Mycena, Boletopsis, and Repetophragma, were specifically absent. The results of metagenomic analysis based on the pyrosequencing indicate a decrease of fungal communities in the fairy ring zone and changes of fungal communities depending on the fairy ring growth of T. matsutake.

• 식물분류학회지
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• 제42권1호
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• pp.1-12
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• 2012

본 연구에서는 한국산 갈퀴덩굴속(Galium L.) 18 분류군에 대하여 줄기, 잎, 꽃, 열매 등의 외부형태학적 33개의 형질에 대하여 분계분석을 실시하였다. 외부형태학적 형질을 이용한 분계분석 결과 얻어진 계통도에서 갈퀴덩굴속은 외군과 분리되어 단계통을 형성하였으며, 크게 2개의 그룹으로 구별되었다. Sect. Cymogaliae과 Sect. Leptogalium의 분류군들은 다계통군으로 확인되었으며, 나머지 절은 단계통으로 확인되었다. 한국산 갈퀴덩굴속의 속내 분류에서는 줄기의 형태와 화피편의 수, 윤생엽의 수 등은 절을 구별하는데 유용한 형질로 인식되었다. 특히, 화피편 정단이 굽어지거나 편평한 형태는 속내 절 분류에 중요한 형질로 인식되었다. 또한, 절내 분류군간의 구별에는 줄기의 털의 형태, 잎의 형태, 화피편의 색, 화서, 엽두의 모양, 열매 표피면의 털의 형태 등이 유용한 식별형질이었다. 기존의 분류 동정에 이용되었던 종자표면의 털의 형태는 속내 분류에 중요한 인식 형질이였으며 특히, 윤생엽의 수, 잎의 형태는 종 분류에 중요한 것으로 나타났다. 본 연구에서 측정한 33개의 형태 형질 중 31개의 형질은 한국산 갈퀴덩굴속 식물의 유연관계를 파악하고 절(section) 분류 및 종 분류에 유용한 것으로 확인되었다.

• 식물분류학회지
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• 제45권2호
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• pp.114-135
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• 2015

관중속 홍지네족제비고사리아속에 속하는 분류군들은 형태적으로 변이가 심하여, 분류군의 한계 해석에 대한 견해 차이가 심하다. 본 연구에서는 한반도산 홍지네족제비고사리아속의 분류군들을 대상으로 외부형태학적 식별 형질을 검토하여 분류군들의 한계 및 유연관계를 파악하고 각 분류군들의 분류학적 실체를 규명하고자 하였다. 그 결과 엽신, 우편 및 소우편 선단부의 형태, 인편의 형태 및 색, 포막의 위치 등이 본아속에 속하는 한반도산 분류군들을 구분하는 데 유용한 것으로 나타났다. 본 연구 결과와 기존의 결과를 종합하여 한반도산 관중속 홍지네족제비고사리아속을 12종 1변종의 13분류군으로 정리하였으며, 이들 분류군에 대한 기재 및 종 검색표를 제시하였다. 본 연구에서 제시한 기재는 야외 관찰 결과 및 전세계 주요 표본관에 소장된 1,000여점의 표본에 근거하여 작성하였다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제58권4호
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• pp.343-371
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• 2020

Echinostoma flukes armed with 37 collar spines on their head collar are called as 37-collar-spined Echinostoma spp. (group) or 'Echinostoma revolutum group'. At least 56 nominal species have been described in this group. However, many of them were morphologically close to and difficult to distinguish from the other, thus synonymized with the others. However, some of the synonymies were disagreed by other researchers, and taxonomic debates have been continued. Fortunately, recent development of molecular techniques, in particular, sequencing of the mitochondrial (nad1 and cox1) and nuclear genes (ITS region; ITS1-5.8S-ITS2), has enabled us to obtain highly useful data on phylogenetic relationships of these 37-collar-spined Echinostoma spp. Thus, 16 different species are currently acknowledged to be valid worldwide, which include E. revolutum, E. bolschewense, E. caproni, E. cinetorchis, E. deserticum, E. lindoense, E. luisreyi, E. mekongi, E. miyagawai, E. nasincovae, E. novaezealandense, E. paraensei, E. paraulum, E. robustum, E. trivolvis, and Echinostoma sp. IG of Georgieva et al., 2013. The validity of the other 10 species is retained until further evaluation, including molecular analyses; E. acuticauda, E. barbosai, E. chloephagae, E. echinatum, E. jurini, E. nudicaudatum, E. parvocirrus, E. pinnicaudatum, E. ralli, and E. rodriguesi. In this review, the history of discovery and taxonomic debates on these 26 valid or validity-retained species are briefly reviewed.

• Journal of Plant Biology
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• 제27권2호
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• pp.61-72
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• 1984

The concept of natural grouping of plant designated as the "Amentiferous" is no longer given serious credence, and many of the families included in this grouping have been dispersed in diverse order. Because a review of taxonomic treatments of amentiferous taxa reveals diverse classifications, it has become necessary to investigate new characteristics and attempt to determine the significance of these characteristics in terms of amentiferous taxonomy. Protein analyses by isoelectrofocusing(IEF) and rocket immunoelectrophoresis(RIE) have proved to be useful in the delicitation of Quercus taxa using pollen extracts from selected taxa. When Quercus pollen extracts were separated by electrophoresis based on their isoelectric points in a stable pH gradient and substrates for estrase activity were stained, ten bands were revealed between pH 5-14. Within Lepidobalanus grouping, a great diversity in the pollen protein zymograms was observed with some segregation corresponding to the designated taxonomic sections. Two taxa of Cyclobalanopsis produced a zymogram that is somewhat similar to taxa included within the section Prinus of Lepidobalanus, and less similar to taxa within the section Cerris of the same subgenus. Three tested taxa of the Cerris are in the similar zymogram each other, being segregable from the taxa of Prinus. Quantitative and qualitative analyses for serological relationships within and among th Quercus were also employed. To calculate the degree of protein similarity, total rocket heights obtained from RIE provided an index of serological correspondence(SC). It is reconfirmed that the Quercus is distantly separated from the Fagus according to SC. Comparative data from rocket number and SC in the tested taxa of Quercus also indicate that Lepidobalanus is separable from Cyclobalanopsis. Within the Lepidobalanus Q. acutissima and Q. acutissima x variabilis are almost homogeneors and distinguishable from the other tested taxa of same subgenus. Although the number of taxa tested has been limited, the overall serological evidence best reflects the classification proposed by Redher(1940) and Melchior (1964), having the genus Quercus subdivided into three subgunera: Erythrobalanus, Lepidobalanus, and Cyclobalanopsis.alanopsis.

• Applied Microscopy
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• 제32권4호
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• pp.345-360
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• 2002

한국산 돌나물과 식물 4개 속 22종 23개 표본의 화분을 광학 및 주사전자현미경으로 관찰한 결과 발아구연의 유무, 과립상 돌기의 유무는 속간의 유연 관계를, 유선상 돌기의 모양은 Sedum속내 분류군의 한계를 설정하는데 유용한 정보를 제공하였다. 한국산 돌나물과의 화분립 모양은 소립-중립이고, 세잎꿩의비름이 가장 작고 섬꿩의비름이 가장 컸으며, 화분의 극면상립은 원형이며, 적도면상은 약장구형-장구형, 발아구는 3 공구형이었다. 표면 무늬는 유선상이었고, Hylotelephium, Meterostachys, Orostachys는 발아구연과 표면에 과립상 돌기를 가진 분류군으로 기존의 분자적, 형태학적 결과와 마찬가지로 위 분류 군들이 매우 유연 관계가 깊은 군임을 지지한다. 유집분석 결과, Sedum속은 유선상 돌기 상면이 둥근 군과 평평한 군으로 나누어지고, 유선상 돌기 상면이 둥근 군 중에서 표면에 과립상 돌기를 가진 군인 섬기린초, 애기기린초와 과립상 돌기를 가지지 않은 군으로 뚜렷하게 나누어진다. 또한 Sedum속에 속하는 종들이 여러개의 유집으로 흩어져 있어 Sedum속을 세분화할 필요가 있다고 한 기존의 연구 결과와도 일치하고 있다. 종간의 유연 관계에 있어서도 Aizoon아속 내 기린초와 애기기린초는 유일하게 과립상 돌기가 표면에 존재하고 있어 이들이 매우 가까운 유연 관계임을 시사하고 있으며, Sedum아속에 포함시켰던 S. polytrichoides 가 Meterostachys, Hylotelephium, Orostachys속 종과 유집 되고 있어 본 종의 분류학적 위치가 재고되어야 할 것으로 생각된다. 정동진에서 채집된 O. malacophyllus의 경우, 현재까지 한국에 보고된 동일종의 집단과 형태적으로 차이가 있을 뿐 아니라 화분 형태적으로도 뚜렷한 차이가 있어 두 집단이 서로 다른 종일 가능성이 있다 고 판단된다.

• 식물분류학회지
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• 제37권4호
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• pp.477-502
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• 2007

본 연구에서는 Aconitum alboviolaceum Kom. complex에 속하는 6종 중 한국산 4종(A. alboviolaceum, A. longecassidatum, A. pseudolaeve, A. quelpaertense)을 대상으로 형 태 및 주성분분석(Principal Components Analysis)과 엽록체 DNA psbA-trnH IGS, trnL intron 및 tmL-trnF IGS 구간의 분석을 통해 각 분류군의 타당성을 검토하고 그 한계 및 분류학적 위치를 명확히 설정하고자 하였다. 형태분석 결과, 기존에 보고되었던 주요 식별형질에서 형태변이가 종 및 개체군 수준에서 복잡한 형태로 나타났으며 주성분분석 결과 각 분류군들은 종 및 개체군 수준에서 유집 되지 않고 연속적으로 혼합된 양상을 보였다. 염기서열 분석 결과, l0개의 염기치환과 3개의 indel이 관찰되었고, 이를 통해 얻어진 neighbor-joining tree에서 나타난 4개의 그룹은 종 및 개체군을 반영하지 않았다. 따라서, 본 연구에서는 complex 내 분류군들에 관한 기존의 형태형질에 근거한 분류체계를 지지하지 않으며, 이들 분류군 간의 분류체계에 대한 재고가 필요하다고 본다.