• 제목/요약/키워드: subtractive

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Identification and Screening of Gene(s) Related to Susceptibility to Enterotoxigenic Escherichia coli F4ab/ac in Piglets

  • Li, Hejun;Li, Yuhua;Qiu, Xiaotian;Niu, Xiaoyan;Liu, Yang;Zhang, Qin
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권4호
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    • pp.489-493
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    • 2008
  • In 2004, Jorgensen and coworkers proposed the MUC4 gene as a candidate gene of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) F4ab/ac receptor in piglets and a mutation of $G{\rightarrow}C$ in intron 7 of MUC4 was identified to be associated with the ETEC F4ab/ac adhesion phenotypes. In this study, we used 310 piglets of three breeds (Landrace, Large White and Chinese Songliao Black) to analyze the relationship between this mutation and the F4ab/ac adhesion phenotype. The results show that the genotypes at this site and the ETEC F4ab/ac adhesion phenotypes were not completely consistent, although they are very strongly associated. Among the individuals with genotype CC, which was identified as a resistant genotype to F4ab/ac adhesion, only 72.1% (124/172) were non-adhesive to ETEC F4ab and 77.9% (134/172) were non-adhesive to ETEC F4ac infections. This suggests that this mutation may not be the causative mutation for ETEC F4ab/ac adhesion, rather, the actual causative mutation may be in another gene closely linked to MUC4, or at aother site within the MUC4 gene. Our results also suggest that the receptors of F4ab and F4ac may be determined by two different but closely linked loci. In order to screen other genes related to F4ab/ac adhesion in piglets, the mRNA profiles from six full sib piglets, of which three were adhesive to ETEC F4ab/ac and three non-adhesive, were analyzed by suppression subtractive hybridization (SSH). One up-regulated gene, Ep-CAM, was selected for further analysis based on its role in the intestinal epithelial cells adhesion. Using real-time RT-PCR, we found that the Ep-CAM gene was significantly up-regulated in the piglets adhesive to F4ab/ac. It was mapped to SSC3q11-q14 by radiation hybrid mapping.

첨단 제조기술 기반으로 제작된 치과용 모형의 정확도에 관한 연구 (Accuracy of dental model based on the state-of-the-art manufacturing technique)

  • 김재홍
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제21권11호
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    • pp.693-700
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    • 2020
  • 본 연구의 목적은 전통적인 인상채득방식으로 제작된 석고모형과 구강 디지털 인상법을 이용하여 제작된 폴리우레탄 모형의 각 계측지점을 비교함으로써 첨단 제조기술로 제작된 모형의 정확성을 검증하는 것이다. 유치악 아크릴릭 구강모형을 선정하여 기존에 사용하던 방식의 석고모형과 최신경향의 방식으로 모형을 각 10개씩 제작하였다. 계측지점은 총 6곳을 지정한 후, 2인의 검사자가 2회로 나누어 버니어 캘리퍼스를 이용하여 측정하였다. 제작방법에 따른 모형의 각 계측치의 평균, 표준편차, 계측치 차이의 평균 등의 기술 통계량으로 제시하였고, 정확성 검정을 위해 윌콕슨 부호순위 검정을 시행하였으며, 검사자 내, 검사자 간, 제작방법 간의 신뢰성 분석은 급내 상관계수 분석과 측정오차를 구하였다. 실험결과 신뢰성은 급내 상관계수의 범위는 0.76에서 0.99의 값이 나타나 높은 신뢰도를 보였으며, 모형 제작방법에 따른 정확성은 모든 계측지점 간의 거리를 비교하였을 때 폴리우레탄 모형이 작게 계측되었으며 0.09~0.20mm의 범위로 선행연구의 결과에 의해 임상적으로 오차범위를 허용할 수 있는 것으로 나타났다. 구강 디지털 인상법의 사용으로 제작된 모형은 임상적으로 적절한 것으로 판단되지만, 향후 보다 정밀하고 사용하기 편리한 치과용 모형을 제작하기 위한 연구들이 추가적으로 이루어져야 할 것이며, 다양한 임상 데이터를 활용한 평가가 이루어져야 할 것으로 사료된다.

WCDMA 시스템에서 Hybrid Interference Cancellation 기법을 적용한 다중사용자 검파기의 성능분석 (Performance Analysis of the Multi-User Detector Employing a Hybrid Interference Cancellation Scheme in a WCDMA System)

  • 서정욱;오창헌;장은영;조성준
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제6권2호
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    • pp.221-227
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    • 2002
  • 본 논문에서는 3GPP(3rd Generation Partnership Project) 비동기(asynchronous) WCDMA(Wide-band CDMA) 시스템에 HIC(Hybrid Interference Cancellation) 기법의 MUD (Multi-User Detector)를 적용하여 Rayleigh 페이딩 채널에서 BER (Bit Error Rate) 성능을 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 구하였다. 이 결과를 감산형 간섭제거기법의 대표적인 방식인 SIC(Successive Interference Cancellation) 기법, PIC(Parallel Interference Cancellation) 기법의 BER(Bit Error Rate) 성능과 비교 분석하였다. 분석한 결과, 전송률이 높은 사용자들은 PIC 기법이나 HIC 기법을 사용하여 간섭을 제거하는 것이 효과적이고, 전송률 이 낮은 사용자들은 SIC 기법이나 HIC 기법을 사용하는 게 효과적이라는 것을 알 수 있었다. 또한, 전송률에 의존하지 않고 모든 사용자의 성능을 고루 만족시키기 위해서는 HIC 구조를 사용하는 것이 효과적이었다. 그 이유로서는 페이딩 채널상의 이유에서 또는 원하는 서비스를 만족시키기 위해서 사용자가 전력을 높일지라도 HIC 기법에서는 전단에 사용하는 SIC에 의해 전력이 낮은 사용자들의 성능을 보장해주고 후단에 사용하는 PIC에 의해 SIC 과정에서 전력이 센 사용자가 받는, 전력이 약한 사용자로부터의 간섭이 효과적으로 제거되기 때문이다.

볼락(Sebastes inermis)의 성장단계별 차등발현 유전자 탐색 (Investigation of Growth Stage Related Genes in Dark-banded Rockfish Sebastes inermis)

  • 장요순
    • 한국어류학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.21-29
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    • 2011
  • 볼락의 성장단계에 따른 차등발현 유전자를 탐색하기 위하여 6개월령 및 18개월령 근육조직을 사용하여 subtracted cDNA library를 제작하였고, 각각의 연령에서 발현량 차이를 나타낸 202개의 cDNA 단편을 확보하였으며, 발현량 차이가 뚜렷한 32개의 cDNA 클론은 성장단계별 특이발현 후 보유전자로 선발하여 염기서열을 분석하였다. Myosin, adenylate kinase, calsequestrin, dystrobrevin beta, diphosphate kinase 유전자는 6개월령 근육조직에서 발현량이 많았으며, desmin, TGFBR2 (transforming growth factor-beta receptor), creatine kinase (muscle type), cathepsin D 유전자는 18개월령 근육조직에서 발현량이 많았다. 볼락의 성장초기와 성장절정기에서 차등발현 양상을 나타낸 유전자는 6, 18, 30, 42개월령 근육조직에서 연령 증가에 따른 발현양상을 분석하였으며, dystrobrevin beta와 diphosphate kinase-Z1은 6개월령 이후에는 발현량이 급격히 감소하여 18개월령, 30개월령 및 42개월령에서는 발현량이 극히 적었으며, creatine kinase (muscle type)와 cathepsin D 유전자는 연령 이 증가함에 따라 발현량이 증가되어 18개월령 이후, 30개월령과 42개월령 근육조직에서도 발현량이 많았다. 이와 같이 성장단계에 따른 차등발현 유전자를 탐색하고 연령 증가에 따른 발현양상을 비교 분석한 결과로부터 본 연구에서는 어류의 성장 초기단계 근육조직에서는 근육수축 관련 유전자가 많이 발현되고, 성장 절정기에는 근육 내 에너지 양 조절 관련 유전자가 많이 발현되는 것을 확인하였다.

PDLs22 재조합 단백질의 합성과 평가 (Synthesis and evaluation of PDLs22 recombinant protein)

  • 이경연;최용석;이유진;배현숙;김흥중;조광희;장현선;박주철
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제37권1호
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    • pp.35-44
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    • 2007
  • Periodontal ligament (PDL) is the connective tissue located between the tooth root and alveolar bone. In a previous study, PDLs22 was isolated as a PDL-specific gene by using subtractive hybrid-ization between cultured PDL fibroblasts and gingival fibroblasts. It was also suggested that PDLs22 plays important roles in the development, differentiation and maintenance of periodontal tissues. However, little is known about functional study of PDLs22 using recombinant protein in PDL fibroblast differentiation and periodontium formation. In this study, in order to produce the PDLs22 recombinat protein, PDLs22 expression vector were constructed and expressed its protein in various host cell and temperature conditions. The results were as follows: 1. PDLs22 protein was not strongly expressed In the induction system using pRSET-PDLs22 construct. 2. When the BL21(DE3) pLysS was used as a expression host, PDLS22 protein was strongly ex-pressed in the induction system using pHCEIIBNd-PDLs22 construct. 3. The PDLs22 protein was recognized at a molecular weight of 28 kDa in western blots. 4. Almost of the expressed PDLs22 protein was not soluble and observed like as inclusion body. 5. The protein solubility was not improved after modification of induction time and temperature during PDLs22 protein production. In this study, the system for the PDLs22 protein production was connstructed. However, the re-results suggest that further studies will be needed to produce the considerable amount of PDLs22 re-combinat protein, which can use for the periodontal regeneration.

The Expression of Genes Related to Egg Production in the Liver of Taiwan Country Chickens

  • Ding, S.T.;Ko, Y.H.;Ou, B.R.;Wang, P.H.;Chen, C.L.;Huang, M.C.;Lee, Y.P.;Lin, E.C.;Chen, C.F.;Lin, H.W.;Cheng, Winston Teng Kuei
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권1호
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    • pp.19-24
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    • 2008
  • The purpose of this study was to detect expression of genes related to egg production in Taiwan Country chickens by suppression subtractive hybridization. Liver samples of mRNA extraction from two Taiwan Country chicken strains (L2 and B), originated from the same population but with very distinct egg production rates after long-term selection for egg and meat production respectively. Two-way subtraction was performed. The hepatic cDNA from the low egg production chickens (B) was subtracted from the hepatic cDNA from the high egg production strain (L2). The reversed subtraction (L2 from B) was also performed. The resulting differentially expressed gene fragments were cloned and sequenced. We sequenced 288 clones from the forward subtraction and 96 clones from the reverse subtraction. These genes were subjected to further screening to confirm the differential expression between the two genetic breeds of chickens. The apolipoprotein B (apoB) was expressed to a greater extent in the liver of the L2 than in the B line chickens. The 5-aminoimidazole- 4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase (PURH) was expressed to a greater extent in the liver of the B than in the L2 strain chickens. We demonstrated that both apoB and PURH were more highly expressed in the liver than that in other tissues (muscle, ovary, and oviduct) in laying Taiwan Country chickens. Taken together, these data suggest that after the selection for egg production, expression of apoB and PURH genes were also changed. Whether the changed expression of these genes is directly related to egg production is not known, but these two genes may be useful markers for egg laying performance in Taiwan Country chickens.

이중철심을 이용한 병렬연결된 자기결합형 초전도한류기의 전류제한 및 회복특성 (Current Limiting and Recovery Characteristics of Two Magnetically Coupled Type SFCL with Two Coils Connected in Parallel Using Dual Iron Cores)

  • 고석철;임성훈
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제17권5호
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    • pp.717-722
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    • 2016
  • 본 논문은 고장발생 초기 고장전류의 크기에 따라 피크전류제한 기능을 갖도록 하나의 철심에 기존 1차 코일과 2차 코일이 병렬로 연결된 초전도 소자 1과 추가적인 철심을 사용하여 3차 권선에 초전도 소자 2가 연결된 자기결합형 초전도한류기를 제안하였다. 이중 철심을 이용하여 코일 1과 코일 2간 병렬로 연결한 자기결합형 초전도한류기가 고장발생시 피크전류를 초전도 소자 1만이 분담하는 것을 확인할 수 있었다. 그 이유는 초기 사고전류의 순간적인 요소가 커서 초전도 소자 1이 ?치되어 작동하였으나, 코일 3에 흐르는 전류가 임계전류를 초과하지 않았고, 이로 인해 초전도 소자 2가 ?치되어 작동하지 않았기 때문이다. 사고 시 피크전류를 순차적인 초전도 소자로 제한하기 위해서는 코일 1이 낮은 자기인덕턴스 값을 갖고 있으면서도 코일 2보다 코일 3이 보다 높은 자기인덕턴스 값을 갖도록 설계해야 할 것이다. 또한, 고장 발생 초기 사고전류의 크기를 결정하는 고장조건 중의 하나인 1차 코일과 2차 코일간의 권선비가 0.25일 때 두 SFCL의 전류제한 및 회복특성에 대한 검증을 선로단락실험을 통해 분석되었다. 이 단락실험의 분석결과, 가극결선인 경우가 감극결선한 경우보다도 전류제한 및 회복특성이 더욱 우수함을 확인할 수 있었다.

선형분석 기반의 심방세동 분류를 위한 불규칙 RR 간격의 최적값 검출 (Optimal Value Detection of Irregular RR Interval for Atrial Fibrillation Classification based on Linear Analysis)

  • 조익성;정종혁;조영창;권혁숭
    • 한국정보통신학회논문지
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    • 제18권10호
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    • pp.2551-2561
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    • 2014
  • 심방세동 검출을 위한 기존 연구방법으로는 비선형 분석법과 주파수 분석법 등을 들 수 있지만 시간 영역 알고리즘에 비해 연산이 복잡하고 불규칙한 리듬 검출에 필요한 일반적 규칙을 제공하지 못한다. 이를 위해 본 연구에서는 선형 분석 기반의 심방세동 분류를 위한 불규칙 RR 간격의 최적값 검출 방법을 제안하였다. 이를 위해 먼저 전처리과정과 차감 기법을 통해 R파를 검출하였다. 이후 불규칙 RR 간격의 세그먼트 길이에 대한 범위를 설정하고 정규화 절대 편차와 절대치와 같은 선형 분석상의 심방세동 분류를 위한 최적값을 검출하였다. 제안된 알고리즘의 타당성 평가를 위해 MIT-BIH 부정맥과 심방세동 데이터베이스를 이용하여 RR 간격의 세그먼트 길이와 최적값에 대한 심방세동 분류율을 각각 비교 실험하였다. 성능 평가 결과, RR 간격과 연속하는 RR 간격 차에 대한 최적값은 ${\alpha}=0.75$, ${\beta}=1.4$, ${\gamma}=300ms$ 일 때 제일 높은 성능을 나타나는 것을 확인할 수 있었다.

적층가공을 이용한 임시의치 제작 및 기존방식의 임시의치와의 비교 증례 (Fabrication of additive manufacturing interim denture and comparison with conventional interim denture: A case report)

  • 김현아;임현필;강현;양홍서;박상원;윤귀덕
    • 대한치과보철학회지
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    • 제57권4호
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    • pp.483-489
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    • 2019
  • 디지털치의학의 발달과 함께 computer-aided design and computer-aided manufacturing (CAD/CAM)을 이용한 3D 제작산업이 최근 급격한 성장을 하고 있다. 디지털 방식을 이용한 의치 제작 또한 최근의 디지털치의학 기술의 발전으로 증가하는 추세에 있다. CAD/CAM 제작방법은 크게 두가지 타입으로 나눌 수 있다: 절삭가공, 적층가공, 밀링과 같은 절삭가공은 블록 형태의 재료를 깎아 제조하는 기술을 토대로 하며, 3D printing과 같은 적층가공은 재료를 적층 방식으로 쌓아 올려 제조하는 기술을 토대로 한다. 적층가공은 밀링이 어려운 복잡한 구조의 제작에 적용할 수 있다. 본 증례에서, 적층가공방법이 레진상 총의치 제작에 이용되었다. 디지털방식을 적용한 의치의 사용기간동안 기능적, 심미적으로 만족할 만한 결과를 보여주었다.

누에 중장유래 생체방어 관련 유전자 개발 연구 (A Study on the Development of an Immune Related Genes from Midgut of Silkworm)

  • 최광호;구태원;김성렬;박승원;김성완;강석우
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제50권2호
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    • pp.140-144
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    • 2012
  • 본 연구는 누에 중장으로부터 면역 관련 유전자를 대량 발굴하고 발현 특성을 분석함으로서 곤충 유래 신기능성 의약품 개발을 위한 유전자 소재를 발굴하고자 하였다. 우선 곤충병원성 섭식에 의한 누에 품종에 따른 중장 면역원으로서 적성 병원성 세균인 X. nematophila 등을 선발하고 누에 천연 면역인자의 발굴을 위해 최적 감염 조건을 설정하였다. 감염된 누에 중장 mRNA를 순수 분리하여 subtraction cDNA 유전자은행 1종씩 제작하고, subtractive differential display hybridization 방법에 의해 누에 중장 면역관련 유전인자를 선발하였다. 선발된 유전자의 정보 분석 결과, 세포 내 다양한 생물학적 기능을 수행하는 것으로 알려진 ribosomal protein L5 mRNA 등 면역 관련 유전자 9종을 선발하였다. 본 연구에서 선발된 누에 천연 면역 관련 인자는 신기능성 의약품 소재로 개발하기 위해서는 기능분석 연구가 지속되어야 할 것으로 사료된다.