The success of genome-wide association studies (GWASs) has enabled us to improve risk assessment and provide novel genetic variants for diagnosis, prevention, and treatment. However, most variants discovered by GWASs have been reported to have very small effect sizes on complex human diseases, which has been a big hurdle in building risk prediction models. Recently, many statistical approaches based on penalized regression have been developed to solve the "large p and small n" problem. In this report, we evaluated the performance of several statistical methods for predicting a binary trait: stepwise logistic regression (SLR), least absolute shrinkage and selection operator (LASSO), and Elastic-Net (EN). We first built a prediction model by combining variable selection and prediction methods for type 2 diabetes using Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 5.0 from the Korean Association Resource project. We assessed the risk prediction performance using area under the receiver operating characteristic curve (AUC) for the internal and external validation datasets. In the internal validation, SLR-LASSO and SLR-EN tended to yield more accurate predictions than other combinations. During the external validation, the SLR-SLR and SLR-EN combinations achieved the highest AUC of 0.726. We propose these combinations as a potentially powerful risk prediction model for type 2 diabetes.
Journal of The Korean Society of Integrative Medicine
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v.2
no.3
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pp.1-7
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2014
Purpose : The purpose of this study was to evaluate the influence of Lowenstein Occupational Therapy Cognitive Assessment(LOTCA) and Activities of Daily Living(ADL) by CogPack program in elderly with Alzheimer's dementia. Method : The subjects of this study, elderly diagnosed with Alzheimer's dementia, 8 patients were picked up, who were agreed with this research. Cognitive training for 6 weeks, which consisted of 3 times per week, 30 min of memory, attention and performance with cogpack program. Cognitive and ADL measured by LOTCA and FIM. The SPSS Ver. 14.0 statistical program was used for data processing. The significance level for statistical inspection was set as 0.05. Result : In comparison of LOTCA was significantly correlated in the pre and post test but FIM was not significantly correlated in the pre and post test. Conclusion : Therefore, the CogPack program is useful to improve the LOTCA in elderly with Alzheimer's dementia.
Communications for Statistical Applications and Methods
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v.17
no.5
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pp.745-753
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2010
Compared to the U.S. Government Accountability Office(GAO) and the U.K. National Audit Office(NAO), the Board of Audit and Inspection of Korea(BAI) has not laid a rather solid system for effective assessment and judgment on the reliability of computer-processed data used as audit evidence in its public auditing activities. Accordingly, based on the experiences of GAO and NAO, this study suggests criteria and methods as the key elements of the methodological framework for assessing the reliability of information system data. Then, the usefulness and effectiveness of the criteria and techniques for assessing data reliability were tested and proved by applying to the analysis of allotment for mandatory disabled employment data that have been computer-processed and managed by the Korea Employment Agency for the Disabled(KEAD).
Journal of the Korea Fashion and Costume Design Association
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v.6
no.2
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pp.21-33
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2004
The purpose of this study was to provide information on how to improve both the satisfaction and the current sizing system for the school uniform focused on middle and high school girls' students. For the satisfaction of their school uniform, there were statistical significance by the academic year in jacket design, blouse color, and skirt design in the case of middle school girls'. On the other hand, high school girls' evaluation of school uniform was significantly different in jacket color, jacket design, blouse color, textile of blouse, skirt color, and skirt design by the academic year. For the assessment of wearing motion, there was no significant difference by the grade in both middle school and high school girls'. However, it was shown more frequency of discomfort than that of comfort. For the evaluation of sizing fitness, the breadth of sleeve in jacket and the width of blouse were statistical significance in middle school girls' by the grade while the width of jacket, he breadth of sleeve in jacket, the length of blouse, the width of blouse and length of sleeve in blouse were different in high school students by the grade.
Gorabi, Vahid Seddighi;Nikkhoo, Bahram;Faraji, Obeidollah;Mohammadkhani, Mona;Mirzaee, Sattar;Rasouli, Mohammad Aziz;Afkhamzadeh, Abdorrahim
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.61
no.4
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pp.129-131
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2018
Purpose: The association between hypercalciuria and febrile convulsion is controversial. The present study aimed to investigate the statistical association between hypercalciuria and childhood febrile convulsions. Methods: Overall, 160 children aged 6 months to 5 years, including 80 children with febrile convulsion and 80 febrile children without convulsion (comparison group), were recruited. All laboratory tests, including 24-hour urine calcium, were undertaken in an academic clinical laboratory. Results: Forty-five children of the febrile convulsion group (60%) and 30 of the comparison group (40%) had hypercalciuria. There was a significant difference between the 2 groups (P=0.02). Conclusion: Our results indicated that there is a statistical association between convulsion and hypercalciuria in children. Since we found this association with a cross-sectional assessment, further studies, especially prospective and controlled designs, are needed.
In this study, earthquake loads are investigated statistically and compared with the nominal earthquake loads calculated according to the Turkish Earthquake Code, namely: "Specifications for Structures to be Built in Earthquake Areas". For this purpose, the "actual" mean load values estimated from statistical methods and the nominal load values computed according the Seismic Code are compared, with respect to some variations in the basic parameters, such as the importance factor, building height, site coefficient, seismic zone and seismic load reduction factor. In addition to the data compiled from different regions of Turkey, the published data and information in the foreign literature are also used in the determination of the earthquake load statistics. Although the dead and live loads acting on a structure are independent of the geographical location of the structure, environmental loads, such as earthquake loads are highly dependent on the location of the structure. Accordingly, for the assessment of statistical parameters associated with earthquake loads, twelve different locations which can represent the different seismic zones of Turkey as accurately as possible are chosen. As a result of the code calibration procedure considered in this study, it is observed that the load values obtained from the Turkish Seismic Code may overestimate or underestimate the actual seismic loads in some of the seismic zones.
Background: In the maxillofacial region, giant cell granulomas occur in 2 clinical forms, central and peripheral. Despite histopathological similarity between these 2 forms totally different clinical behaviors have been reported. The present study was undertaken to compare mast cell and vascular concentrations in these pathologic lesions. Materials and Methods: In this cross-sectional descriptive study, 20 pathological samples of central giant cell granuloma (CGCG) and 20 samples of peripheral giant cell granuloma (PGCG) were selected and examined through toluidine blue staining for mast cell assessment and immunohistochemical staining by VEGEF antibody for comparing the number of mast cells. T-test, chi-squared test and backward multivariate linear regression were used for statistical analysis using SPSS 20. Statistical significance was set at P<0.05. Results: This study showed significantly greater VEGF expression and mast cell concentrations in CGCG compared to PGCG cases. Also there was a significant correlation between VEGF expression and the concentration of mast cells. No relation was found between age, sex and site of the lesion and concentration of mast cells or VEGF expression. Conclusions: It is feasible that higher concentrations of mast cells in CGCG versus PGCG samples might lead to more aggressive clinical behavior via vascular proliferation and angiogenesis. However, other biologic mechanisms should be considered in this situation.
Objectives: To evaluate the performance of models to predict AMI patients death using severity adjustment measures in Korea. Methods: Medical records of 861 patients treated by AMI in 7 general hospitals during 1996 and 1997 were reviewed by trained nurses. We measured the severity of patients by APACHE III, MedisGroups, CSI and DS. Using each severity method a predictive mortality for each patient was calculated from a logistic regression model including the severity score. The statistical performance of each severity method model was evaluated by using c-statistics and R2. For each hospital, z scores compared actual and expected mortality rates. Results: The overall in-hospital mortality was 14.5%, ranged from 10.0% to 22.2%. The distributions of severity scores for each method was significantly different by hospitals. The four severity-adjusted models to predict AMI patients death varied in their statistical performance for discrimination power of patients death. Order of Severity-adjusted mortality rates and z scores by four severity measures was different. Conclusion: Severity-adjusted mortality rates of AMI patients might be applied as an indicator for hospital performance evaluation in Korea. Because different severity methods frequently produce different impressions about relative hospital performance, more studies has to be done to use it as quality indicator and more attention should be paid to select appropriate severity measures.
As pointed out in the OECD BEMUSE Program, when a high computation time is taken to obtain the relevant output values of a complex physical model (or code), the number of statistical samples that must be evaluated through it is a critical factor for the sampling-based uncertainty analysis. Two alternative methods have been utilized to avoid the problem associated with the size of these statistical samples: one is based on Wilks' formula, which is based on simple random sampling, and the other is based on the conventional nonlinear regression approach. While both approaches provide a useful means for drawing conclusions on the resultant uncertainty with a limited number of code runs, there are also some unique corresponding limitations. For example, a conclusion based on the Wilks' formula can be highly affected by the sampled values themselves, while the conventional regression approach requires an a priori estimate on the functional forms of a regression model. The main objective of this paper is to assess the feasibility of the ACE-RSM approach as a complementary method to the Wilks' formula and the conventional regression-based uncertainty analysis. This feasibility was assessed through a practical application of the ACE-RSM approach to the LOFT L2-5 LBLOCA PCT uncertainty analysis, which was implemented as a part of the OECD BEMUSE Phase III program.
Objectives: To provide theoretical basis for the classification of medicinal moxibustion(藥灸劑) in Health Insurance Medical Benefit in Korea through investigating trend of judicial precedents on indirect moxibustion and usage of medicinal moxibustion in "Donguibogam". Methods: We analyzed statistical data of moxibustion from Health Insurance Review & Assessment Service and National Health Insurance Statistical Yearbook. We investigated major judicial precedents on indirect moxibustion to find out some trend and we searched the usages of medicinal moxibustion in "ZhenJiuDaCheng" and "Donguibogam". Results: According to recent judicial precedents, indirect moxibustion with equipment is no loner regarded as Korean Medical Procedure. In composition of 'Oriental Health Treatment', amount for acupuncture has gradually decreased instead, amount for moxibustion has increased steadily for 5 years. Medicinal moxibustion(藥灸劑) is often used as a form of indirect medicinal moxibustion with moxa in "Donguibogam". Argyi Folium, Moschus, Natrii Chloridium, Radix Preparata, Realgar and Olibanum are most frequently used for medicinal moxibustion in "Donguibogam". Medicinal moxibustions are composed of simple prescription or herb-pair or multiple prescription in "Donguibogam". Conclusions: In Health Insurance Medical Benefit in Korea, under the division of moxibustion, direct medicinal moxibustion and indirect medicinal moxibustion should be classified in addition.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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