• Title/Summary/Keyword: soil borne fungi

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토양병원균(土壤病原菌) 길항성(拮抗性) Streptomyces sp. A-2 활성물질(活性物質)의 특성(特性)에 관한 연구(硏究) (Studies on Characterization of Active Substances from Antagonistic Streptomyces sp. A-2 Strain against Soil-borne Phytopathogen)

  • 박경수;류진창
    • 한국토양비료학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.401-406
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    • 1992
  • 우리나라 28개 지역(地域) 논밭 토양에서 수집한 시료에서 방선균(放線菌) 108주를 분리하고, 고추역병균, 참깨역병균 및 채소입고병균에 종합적으로 항균력을 갖는 Streptomyces sp. A-2를 선발하여 그 활성물질(活性物質)의 특성을 조사한 결과는 다음과 같다. 1. G.Y.B., $M\ddot{u}eller$, B.H.I., Czapek 등의 배지중에서 길항성(拮抗性)의 효과가 가장 잘 이전되는 배지는 G.Y.B. 및 B.H.I. 배지이었고, 주(主) 활성물질(活性物質)은 에칠아세테이트로 이전(移轉)되는 군과 수층(水層)에 잔존하는 군으로 구분되었으며 이들 물질은 열(熱)과 압력(壓力)에 매우 강한 결태형태(結台形態)를 보였다. 2. 길항성(拮抗性) Streptomyces sp. A-2에 의해 배양된 여액의 pH를 3이나 12로 조정하여 길항물질을 추출하여 3개 식물병원균에 대한 길항력 검정을 실시한 결과 pH를 달리한 추출법에서 별다른 차이점이 없었다. 이들 분획의 UV 스펙트럼은 폴리엔 길항활성의 마크로라이드의 그것과 유사하였으므로 폴리엔계 항생제가 이 균주의 길항성에 관련하는 주(主) 물질(物質)이라고 추정되었다.

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Effect of Sodium Chloride (NaCl) on the Mycelial Growth and Ascospore Germination of Rhizina undulata, the Root Rot Fungus of Coniferous Trees

  • Lee, Sun Keun;Lee, Dong Hyeon;Lee, Kyoung-Tae;Park, Yong Bae;Seo, Sang-Tae;Lee, Jong Kyu
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제31권4호
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    • pp.312-316
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    • 2015
  • Rhizina undulata, the causal agent of Rhizina root rot, is a soil-borne fungus occurring on coniferous trees. The destruction of coastal forests caused by R. undulata infection has been mainly associated with bonfires at camping sites. However, Rhizina root rot was observed in the western coastal forests without fire. It was hypothesized that Rhizina root rot in this area might be closely related to the soil salinity, which can facilitate the growth and survival of R. undulata. So, the variation in sodium chloride (NaCl) resistance among isolates of Rhizina undulata was compared using liquid media containing different concentrations of NaCl ranging from 0 mM to 300 mM. Our results showed that, albeit of no growth at a higher concentration of NaCl (300 mM), most of R. undulata isolates were capable of germinating and grew at up to 100 mM, indicating that NaCl resistance varies among R. undulata isolates. It was further found that isolates from coastal areas seemed to be more tolerant to NaCl than those further away the coast. We demonstrated that R. undulata could be possible to survive in coastal areas, but was lower NaCl tolerance than other fungi.

밤나무 근권토양에서 분리한 Ilyonectria radicicola 균주의 인삼에 대한 병원성 및 유전적 분석 (Pathgenicity on Ginseng and Sequence Assays of Ilyonectria radicicola Isolated from Chestnut Rhizosphere Soils)

  • 서문원;송정영;김선익;오상근;김홍기
    • 한국약용작물학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.302-307
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    • 2018
  • Background: A soil-borne pathogenic fungus, Ilyonectria radicicola (Cylindrocarpon destructans) causes root rot on ginseng (Panax ginseng C. A. Meyer) and is known to attack many other plants. The Nectria/Neonectria radicicola complex has been renamed as the I. radicicola complex after analysis of its multi-gene relatedness and morphological characteristics. The fungi in this complex have been reclassified into 16 species under the genus Ilyonectria based on characteristics analysis Methods and Results: To obtain useful data from the Korean ginseng root rot, I. radicicola was isolated from the rhizosphere soils of the chestnut tree. They were identified through a pathogenicity test and a survey of the morphological features. The existence of I. radicicola in soil samples was confirmed by PCR detections using nested PCR with species-specific primer sets. These were subsequenctly isolated on semi-selective media from PCR-positive soils. Genetic analysis of the I. radicicola complex containing these pathogens was done by comparing the DNA sequences of the histone h3 region. These isolates originating from the rhizosphere soils of chestnut constituted a clade with other closely related species or I. radicicola isolates originating from ginseng or other host plants, respectively. Additionally, the pathogenicity tests to analyze the characteristics of these I. radicicola isolates revealed that they caused weakly virulent root rot on ginseng. Conclusions: This is the first study reporting that I. radicicola isolates from chestnut rhizosphere soils can attack ginseng plant in Korea. Thus, these results are expected to provide informations in the selection of suitable fields for ginseng cultivation.

콩종자(種子)에서 검출(檢出)된 Mycoflora와 그 병원성(病原性) (Seed Mycofloras of Soybeans(Glycine max) and their Pathogenic Importance)

  • 박종성;유승헌;인무성;노태홍
    • 농업과학연구
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    • 제10권2호
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    • pp.263-268
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    • 1983
  • 1. 충남(忠南) 각지(各地)에서 수집(收集)한 28개(個) 콩종자(種子) sample을 blotter법(法)으로 조사(調査)하였던 바 21종(種)의 균류(菌類)가 검출(檢出)되었고, 특히 부생균(腐生菌)인 Alternaria alternata, Aspergillus spp., Penicillium spp. 등(等)과, 자주빛무늬병균(病菌) (Cercospora kikuchii) 및 Fusarium spp. 이 많이 검출(檢出)되었다. 2. 자주빛무늬가 있는 종자(種子)에서는 무늬가 없는 종자(種子)에 비(比)하여 C. kikuchii가 많이 검출(檢出)되었고 반면(反面)에 Aspergillus spp.나 Penicillium spp.와 같은 부생균(腐生菌)의 오염율(汚染率)과 Phomopsis sp. 및 Fusarium 균(菌)의 이병율(罹病率)이 낮았다. 3. 병원성실험(病原性實驗) 결과(結果) Cercospora kikuchii, Colletotrichum dematium, Fusarium moniliforme, F. oxysporum, F. semitectum, Phomopsls sp.는 병원성(病原性)을 나타내었으나, F. equiseti와 F. solani는 병원성(病原性)이 없었다.

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Medicago truncatula in Interaction with Fusarium and Rhizoctonia Phytopathogenic Fungi: Fungal Aggressiveness, Plant Response Biodiversity and Character Heritability Indices

  • Batnini, Marwa;Haddoudi, Imen;Taamali, Wael;Djebali, Naceur;Badri, Mounawer;Mrabet, Moncef;Mhadhbi, Haythem
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제37권4호
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    • pp.315-328
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    • 2021
  • Fusarium and Rhizoctonia genera are important pathogens of many field crops worldwide. They are constantly evolving and expanding their host range. Selecting resistant cultivars is an effective strategy to break their infection cycles. To this end, we screened a collection of Medicago truncatula accessions against Fusarium oxysporum, Fusarium solani, and Rhizoctonia solani strains isolated from different plant species. Despite the small collection, a biodiversity in the disease response of M. truncatula accessions ranging from resistant phenotypes to highly susceptible ones was observed. A17 showed relative resistance to all fungal strains with the lowest disease incidence and ratings while TN1.11 was among the susceptible accessions. As an initiation of the characterization of resistance mechanisms, the antioxidant enzymes' activities, at the early stages of infections, were compared between these contrasting accessions. Our results showed an increment of the antioxidant activities within A17 plants in leaves and roots. We also analyzed the responses of a population of recombinant inbred lines derived from the crossing of A17 and TN1.11 to the infection with the same fungal strains. The broad-sense heritability of measured traits ranged from 0.87 to 0.95, from 0.72 to 0.96, and from 0.14 to 0.85 under control, F. oxysporum, and R. solani conditions, respectively. This high estimated heritability underlines the importance of further molecular analysis of the observed resistance to identify selection markers that could be incorporated into a breeding program and thus improving soil-borne pathogens resistance in crops.

Identification and classification of pathogenic Fusarium isolates from cultivated Korean cucurbit plants

  • Walftor Bin Dumin;You-Kyoung Han;Jong-Han Park;Yeoung-Seuk Bae;Chang-Gi Back
    • 농업과학연구
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    • 제49권1호
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    • pp.121-128
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    • 2022
  • Fusarium wilt disease caused by Fusarium species is a major problem affecting cultivated cucurbit plants worldwide. Fusarium species are well-known soil-borne pathogenic fungi that cause Fusarium wilt disease in several cucurbit plants. In this study, we aimed to identify and classify pathogenic Fusarium species from cultivated Korean cucurbit plants, specifically watermelon and cucumber. Thirty-six Fusarium isolates from different regions of Korea were obtained from the National Institute of Horticulture and Herbal Science Germplasm collection. Each isolate was morphologically and molecularly identified using an internal transcribed spacer of ribosomal DNA, elongation factor-1α, and the beta-tubulin gene marker sequence. Fusarium species that infect the cucurbit plant family could be divided into three groups: Fusarium oxysporum (F. oxysporum), Fusarium solani (F. solani), and Fusarium equiseti (F. equieti). Among the 36 isolates examined, six were non-pathogenic (F. equiseti: 15-127, F. oxysporum: 14-129, 17-557, 17-559, 18-369, F. solani: 12-155), whereas 30 isolates were pathogenic. Five of the F. solani isolates (11-117, 14-130, 17-554, 17-555, 17-556) were found to be highly pathogenic to both watermelon and cucumber plants, posing a great threat to cucurbit production in Korea. The identification of several isolates of F. equiseti and F. oxysporum, which are both highly pathogenic to bottle gourd, may indicate waning resistance to Fusarium species infection.

토양병의 발병억제 기작과 그 실용성 -길항성 Trichoderma spp.의 분리, 동정 및 근권내 활동- (Suppressive Mechanism of Soil-borne Disease Development and its Practical Application -Isolation and Identification of Species of Trichoderma Antagonistic to Soil diseases and its activities in the Rhizosphere-)

  • 김성일;심재욱;신현성;최혜정;이민웅
    • 한국균학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.337-346
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    • 1992
  • 길항균 Trichoderma spp.가 입고병 및 식물토양병 방제에 효과적이었으므로 T. hamatum strain Tr-5와 Rhizoctonia solani 사이의 토양근권내의 상호작용을 구명하고, 생물학적 방제로서의 활용성을 알고저 기초적인 실험을 하였다. 길항성이 우수한 Trichoderma spp.의 토양내 분포비를 구명하고저 채집한 토양시료에서 길항균과 토양 미생물의 분포를 조사하였다. 전세균, 전진균, 방선균 및 Trichodema spp.의 분포비는 65%, 8.8%, 25.9% 및 0.28%로 세균이 많고 Trichoderma spp.의 분리비는 가장 적었다. Trichoderma spp.를 분리하여 동정한 결과 T. koninggii, T. pseudokoninggii, T. aureoviride, T. hamatum 및 T. viride의 5종이 동정되었고, 이중 균주 Tr-5인 T. hamatum을 공시하여 균기생성여부를 관찰한 결과 R. solani에 대한 기생성을 관찰하였으며 효소적으로 균사가 용균되어 파괴됨을 관찰하였다. Trichoderma spp.의 토양내 발아력을 조사한 결과 자연토양에서 Trichoderma spp. 모든 종은 $1.7{\sim}7.3$ 이내의 발아력을 나타내었고, 살균토양에서는 90% 이상의 포자발아력을 나타내어 자연토양에서 Trichoderma 정균현상이 관찰되었다. 길항력이 있는 T. koninggii, T. pseudokoninggii, T. hamatum 및 T. viride 등 4균주의 토양근권내 완두뿌리 근권점유율실험에서 4종 균주 모두는 토양깊이 1cm 범위까지는 점유율이 크게 나타났으나 $2{\sim}3\;cm$에 서는 분포수가 감소하였고 4 cm 이하에서는 뿌리 점유분포수가 크게 감소하였다. 인삼근을 심은 폿트실험에서 Fusarium solani, Cylindrocarpon destructans, Rhizoctonia solani균의 단독처리구에 비해 길항력이 있는 T. hamatum Tr-5 처리구에서는 근부현상이 감소하였다.

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Brukholderia sp. MP-1 에서의 페놀화합물의 분리와 항균활성의 측정 (Isolation and In Vitro Antimicrobial Activity of Low Molecular Phenolic Compounds from Burkholderia sp. MP-1)

  • 마오 쏘피에;김영덕;이승제;김용웅;김인선;심재한;박노동;김길용
    • 한국토양비료학회지
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    • 제39권4호
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    • pp.195-203
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    • 2006
  • 길항미생물 MP-1은 여러 종의 곰팡이와 효모 및 음식물을 부패시키는 세균 (그람양성 및 음성) 에 대하여 항균활성을 보였다. MP-1의 16S rRNA gene 염기서열은 기존에 밝혀진 Brukholderia sp.의 염기서열과 99-100% 유사하였다. 배양액으로부터의 항균물질은 에틸아세테이트 (EtOAc)를 사용하여 분리하였으며 EtOAc에 용해된 산성 분획은 silica gel, Sephadex LH-20, ODS 컬럼크로마토 그래피 및 HPLC를 사용하여서 정제를 실시 하였다. 최종적으로 Gas chromatographic-mass 스펙트럼을 통한 분석을 통하여 4 종의 항균 활성을 나타내는 물질은 phenylacetic acid, hydrocinnamic acid, 4-hydroxyphenylacetic acid 및 4-hydroxyphenylacetate methyl ester로 확인 되었다. 각각의 항균 활성물질들의 미생물에 대한 최소저해농도(MIC)는 $250{\sim}2500ug\;ml^{-1}$ 인 것으로 나타났다. 또한 6 mm paper disc 에서의 1mg (건물중) 산성 분획의 항균활성은 같은 비율로 혼합한 표준혼합용액 보다 더 효과적인 것으로 나타났다.

참깨 토양전염성병(土壤傳染性病)의 생물학적방제(生物學的防除) (Biological Control of Sesame Soil-born Disease by Antifungal Microorganisms)

  • 신관철;임길조;유승헌;박종성
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.229-237
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    • 1987
  • 참깨토양전염병해(土壤博染病害)의 생물학적(生物學的) 방제법(防除法)을 구명(究明)하기 위하여 참깨근권토양(根圈土壤)에서 Bacillus spp., Streptomyces spp., Trichoderma spp. 등을 분리(分離)하여 항균성(抗菌性)이 강(强)한 균주(菌株)를 선발(選拔)하고 참깨에 처리(處理)하여 입고병방제(立枯病防除)의 효과(效果) 및 참깨 생육(生育)에 미치는 영향(影響)을 조사(調査)하였다. 1. 참깨근권토양(根圈土壤)에서 분리(分離)한 Bacillus spp. 중(中) 26%가 F. oxysporum과 R. solani에 항균성(抗菌性)을 나타내었다. 그 중(中) B. subtilis와 B. polymyxa가 중요한 종(種)이었다. 2. 참깨근권토양(根圈土壤)에서 분리(分離)한 Streptomyces는 F oxysporum의 균사(菌絲)와 포자(胞子)의 세포벽(細胞壁)을 분해(分解)하고 대형분생포자(大型分生胞子)와 후막포자(厚膜胞子)의 형성(形成)을 현저(顯著)히 감소(減)少시켰다. 3. 참깨경작지(耕作地)에서 분리(分離)한 Trichoderma spp.의 84%가 oxysporum에 60%가 F. oxysporum과 R. solani에 동시(同時)에 항균성(抗菌性)을 보였다. 4. 분리(分離)된 Trichoderma spp. 중(中) 항균성(抗菌性)이 강(强)한 T. viride TV-192를 F. oxysporum과 함께 처리(處理)한 결과(結果) 입고병(立枯病)의 발생율(發生率)이 현저(顯著)히 감소(減少)하였다. 5. T. viride는 볏짚, 보리짚, 톱밥등 유기태영양원(有機態營養源)에서 F. oxysporum보다 생장(生長)이 빨랐다. F. oxysporum은 톱밥에서는 거의 생장(生長)하지 못하였다. 6. 밀기울, 밀기울+톱밥배지(培地)에 T. viride를 배양(培養)하여 토양(土壤)에 첨가(添加)한 결과(結果), F oxysprum에 의한 입고병(立枯病)을 현저히 감소시켰으나 T. viride의 밀도(密度)가 높을 때 참깨의 종자발아(種子發芽)와 묘(苗)의 생장(生長)이 저해(沮害)되고 다수(多數)의 묘(苗)가 사멸(死滅)하였다. 7. Trichoderma spp.에 의(依)한 참깨 종자발아(種子發芽) 및 묘생장(苗生長) 억제(抑制)의 영향(影響)은 분리균주(分離菌株)에 따라 큰 차이를 보였고 Trichoderma viride 토양처리시(土壤處理時) 건전묘(健全苗)는 무처리(無處理)보다 생장(生長)이 촉진(促進)되었다.

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국화에 발생하는 반쪽시들음병균 Verticillium dahliae 검출용 등온 증폭법 개발 (Development of a Loop-mediated Isothermal Amplification Detection Assay for Verticillium dahliae Infection in Chrysanthemum)

  • 백창기;박미정;한경숙;박종한
    • 한국균학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.437-441
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    • 2019
  • 국화에 발생하는 반쪽시들음병은 Veriticillium dahliae에 의해 발생하는 진균병으로 국화 재배농가에 상당한 경제적 손실을 야기한다. 일반 식물병원균을 동정하는 방법으로는 병원균을 진단하기까지 상당한 시간이 소요된다. 본 연구에서는V. dahliae를 신속하고 특이적으로 진단하기 위하여 등온증폭기술 (Loop-mediated isothermal amplification, LAMP)을 적용한 검출법을 개발하였다. 이 방법은 반쪽시들음병균의 cellulose-growth-specific protein partial mRNA 유전자 염기서열을 이용하여 4개의 특이 프라이머 세트를 제작하였다. 최적 반응조건 및 시간은 60℃ 내외의 온도조건에서 60분 이내에서 가장 효율이 좋은 것으로 나타났다. 이 등온증폭 검출법은 4종의 토양전염성 병원균과 기주식물의 DNA에는 반응하지 않았다. 따라서 반쪽시들음병균 등온증폭법을 활용한다면 병원균의 감염 유무를 조기에 신속하게 진단할 수 있고, 반쪽시들음병을 효율적으로 모니터링하고 방제할 수 있을 것으로 기대한다.