Yun, Saekil;Lee, Young-Ran;Giri, Sib Sankar;Kim, Hyoun Joong;Chi, Cheng;Kim, Sang Guen;Kim, Sang Wha;Jun, Jin Woo;Park, Se Chang
대한수의학회지
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제57권1호
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pp.67-69
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2017
In the present study, Aeromonas (A.) hydrophila was isolated from a captive-bred adult freshwater stingray (Potamotrygon motoro) reared at a commercial aquarium in Korea. The stingray had bites on its fins, hemorrhages on the ventral part, and congested internal organs. A bacterium was isolated from kidney and subsequently identified as A. hydrophila. Based on phylogenetic analysis results, the isolate in the present study (SNUAh-LA1) was most closely related to A. hydrophila AH10 (China) and A. hydrophila AKR1 (Korea). It is most likely that the pathogen infection resulted from Potamotrygon motoro cohabiting with ricefish (Oryzias latipes).
For several days, there was a series of mortalities of chub mackerel (Scomber japonicus) that were reared for public exhibition in a private aquarium in Seoul, Korea. As part of the diagnosis of the dead fish, a bacterial isolate from the kidney was cultured, identified, and confirmed to be Vibrio (V.) harveyi using Vitek System 2 and 16S rRNA gene sequencing. Phylogenetic analysis was also performed by the neighbor-joining method. As a result, the V. harveyi isolated from chub mackerels of a private aquarium in Korea, called as SNUVh-LW1, was clustered in the same group with V. harveyi ATCC33843.
RAD6 in yeast mediates postreplication DNA repair and is responsible for DNA-damage induced mutations. RAD6 encodes ubiquitin-conjugating enzyme that is well conserved among eukaryotic organisms. However, the molecular targets and consequences of their ubiquitination by Rad6 have remained elusive. In Aspergillus nidulans, a RAD6 homolog has been isolated and shown to be an allele of uvs). We screened a CDNA library to isolate UVSJ-interacting proteins by the yeast two-hybrid system. JIPA was identified as an interactor of UVSJ. Their interaction was confirmed in vitro by a GST-pull down assay. JIPA was also able to interact with mutant UVSJ proteins, UVSJl and the active site cysteine mutant UVSJ-C88A. The N- and the C-terminal regions of UVSJ required for the interaction with UVSH, a RAD18 homolog of yeast which physically interacts with Rad6, were not necessary for the JIPA and UVSJ interactions. About 1.4 kb jipA transcript was detected in Northern analysis and its amount was not significantly increased in response to DNA-damaging agents. A genomic DNA clone of the jipA gene was isolated from a chromosome I specific genomic library by PCR-sib selection. Sequence determination of genomic and cDNA of jipA revealed an ORF of 893 bp interrupted by 2 introns, encoding a putative polypeptide of 262 amino acids. JIPA has 33% amino acid sequence identity to TIP41 of Saccharomyces cerevisiae which negatively regulates the TOR signaling pathway.
질적 형질에 대한 유전적 연관성 분석은 크게 두 가지로 구분 할 수 있는데, 모형 기반분석과 그렇지 않은 모형 무관 분석 방법이다. 복합질병의 경우 멘델의 유전법칙을 잘 따르지 않기 때문에 모형 기반 분석 방법을 사용하는 것보다 모형 무관 분석 방법을 사용하는 것이 효율적이라고 알려져 있다. 이러한 모형 무관 분석 방법 중 이환 형제 쌍 자료를 이용한 분석 방법은 형제 쌍 간의 유전적 일치 비율을 기준으로 공유하고 있는 대립유전자의 분포를 이용하는 것으로 크게 proportion test, mean test, minmax test로 구분 할 수 있다. 본 연구에서는 형제집단자료로 확장된 경우, 유전 형식에 상관없이 로버스트한 방법으로 알려진 minmax test에 형제 쌍의 가중치를 고려할 수 있는 방법들 즉, 동일 가중 방법, Suarez의 방법, Hodge의 방법, Sham 등의 방법을 적용하여 그 성능을 비교하였다. 모의실험 자료를 이용하여 비교한 결과 표식유전자의 빈도, 형질의 유전 형식, 형제수에 상관없이 Suarez의 방법이 가장 검정력이 높은 방법으로 드러났다. 또한, 동일 가중 방법을 제외하고는 표식유전자의 빈도가 높아질수록, 형제수가 많아질수록 더 높은 검정력을 보였고, 이러한 현상은 우성 유전 형식을 가정한 자료에서 더욱 두드러지게 나타났다.
In 2004, Jorgensen and coworkers proposed the MUC4 gene as a candidate gene of enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) F4ab/ac receptor in piglets and a mutation of $G{\rightarrow}C$ in intron 7 of MUC4 was identified to be associated with the ETEC F4ab/ac adhesion phenotypes. In this study, we used 310 piglets of three breeds (Landrace, Large White and Chinese Songliao Black) to analyze the relationship between this mutation and the F4ab/ac adhesion phenotype. The results show that the genotypes at this site and the ETEC F4ab/ac adhesion phenotypes were not completely consistent, although they are very strongly associated. Among the individuals with genotype CC, which was identified as a resistant genotype to F4ab/ac adhesion, only 72.1% (124/172) were non-adhesive to ETEC F4ab and 77.9% (134/172) were non-adhesive to ETEC F4ac infections. This suggests that this mutation may not be the causative mutation for ETEC F4ab/ac adhesion, rather, the actual causative mutation may be in another gene closely linked to MUC4, or at aother site within the MUC4 gene. Our results also suggest that the receptors of F4ab and F4ac may be determined by two different but closely linked loci. In order to screen other genes related to F4ab/ac adhesion in piglets, the mRNA profiles from six full sib piglets, of which three were adhesive to ETEC F4ab/ac and three non-adhesive, were analyzed by suppression subtractive hybridization (SSH). One up-regulated gene, Ep-CAM, was selected for further analysis based on its role in the intestinal epithelial cells adhesion. Using real-time RT-PCR, we found that the Ep-CAM gene was significantly up-regulated in the piglets adhesive to F4ab/ac. It was mapped to SSC3q11-q14 by radiation hybrid mapping.
This study was carried out to examine a molecular marker system for parentage test in Jeju Black cattle (JBC). Based on the preliminarily studies, we finally selected for construction of a novel genetic marker system for molecular traceability, identity test, breed certification, and parentage test in JBC and its related industrial populations. The genetic marker system had eight MS markers, five indel markers, and two single nucleotide polymorphisms (SNPs; g.G299T and g.del310G) within MC1R gene which is critical to verify the breed specific genotypes for coat color of JBC differing from those of exotic black cattle breeds such as Holstein and Angus. The results showed lower level of a combined non-exclusion probability for second parent (NE-P2) of $4.1202{\times}10^{-4}$ than those previously recommended by International Society of Animal Genetics (ISAG) of $5.000{\times}10^{-4}$ for parentage, and a combined non-exclusion probability for sib identity (NE-SI) of $2.679{\times}10^{-5}$. Parentage analysis has been successfully identified the JBC offspring in the indigenous population and cattle farms used the certified AI semens for production using the JBC-derived offspring for commercial beef. This combined molecular marker system will be helpful to supply genetic information for parentage test and traceability and to develop the molecular breeding system for improvement of animal productivity in JBC population.
본 연구는 난용종 순종계의 특정 집단의 주요 경제형질에 대한 단기 산란검정기록을 이용하여 유전적 개량량을 추정하기 위해 수행하였다. 통계분석에 이용된 자료는 단관 백색 레그혼종 F, K 계통에 대한 1986년부터 1991년까지 6세대간 선발결과의 기록으로서 주요 선발형질은 270일령 산란수, 시산일령, 270일령 난중 및 체중으로 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 각 계통별 평균능력을 보면 시산일령은 매 세대당 1.94일(K) 1.32일(F)씩 감소되었고 체중은 15.39(K), 16.5g(F)씩 감소되었다. 난중은 0.09(K), -0.05g(F)씩 증가되었고 산란수는 0.56(K), -0.78(F)의 증가를 보였다. 2. 조사형질 모두의 예상 선발차에 대한 실현 선발차의 비율이 세대경과에 따라 유의하게 감소되지 않았다. 3. 분산성분에 의한 유전모수는 시산일령이 평균 0.28(F), 0.40(K), 270일령 체중이 0.29(F), 0.39(K), 산란수 (270일)가 0.25(F), 0.29(K), 270일령 난중이 0.51(F), 0.48(K)으로 추정되었다. 4. 세대당 유전적 개량은 F, K 계통 모두 일정한 경향치를 보이지 않았고 시산일령이 -2.46(F), -1.94(K), 산란수 2.01(F), 2.25(K), 270일령 난중이 0.54(F), 0.64(K)으로 추정되었다.
The Tongcheng pig breed is a famous Chinese indigenous breed. The Ministry of Agriculture of China has filed it as 1 of 19 national key conservation breeds selected from more than 100 Chinese indigenous pig breeds in 2000. In order to improve the reproductive performance, it has been intensively selected to increase the litter size for about 10 years. The population randomly sampled from conservation nucleus of eight families in the Tongcheng pigs was genotyped for identification of their estrogen receptor locus polymorphisms with the PCR-RFLPs method. Only AB heterozygotes and BB homozygotes were detected, and $X^2$ test demonstrated that the locus was in disequilibrium at a significant level (p<0.05). In the present paper, the litter sizes in different parities were regarded as different traits. Holistic status of other unspecific and unidentified genes was estimated by using the statistical methods. Coefficients of kurtosis and skewness showed that the litter size still presented segregating characteristic in the 2nd, 5th, 7th, 8th and 9th parities. Analysis of homogeneity of variance between families confirmed the results for the 5th, 7th and 8th parities. The heritability of litter size for the 1st to 10th parities was estimated with paternal half-sib model and individual estimated breeding values (EBVs) were evaluated by a single trait animal model as well. We found that the averages of EBVs for litter size in each parity did not differ significantly between genotypes, despite the significant difference for original phenotype records in the 3rd, 4th and 5th parities (p<0.05 or p<0.01). The results may be explained by the deduction that the polymorphisms of ESR locus are no longer the important genetic base of litter size variation when the frequency of allele B accumulated in the experience of selection procedure, and further conferring that there exist special genes associated with litter size in the recent Tongcheng pigs population can be made.
스마트시티가 제공하는 도시서비스에 의해 발생하는 도시공간과 도시활동의 긍정적 변화는 단순히 정보통신기술로 인한 물리적 환경의 조성 때문에 이루어지는 것이 아니라 시민들과 민간영역의 협력과 참여체계가 핵심사항이라 할 수 있다. 이에 본 연구는 공공분야와 민간분야의 수평적 협력체계인 스마트 거버넌스의 구조와 역할에 대한 사례분석 및 문헌연구를 통해 스마트시티가 지향하는 '보다 스마트한 도시'로의 발전을 위한 거버넌스 역할에 대한 평가요인을 도출하고 요인별 활성화 방안을 제시하고자 한다. 이를 위해 우리나라 국토교통부에 등록된 11개 분야 228개 스마트서비스를 대상으로 공간위계별 스마트서비스의 공간적 서비스분포와 서비스의 내용적 특성을 분석하였다. 더불어 미국 미네소타주 두 도시인 Minneapolis-St. Paul권의 광역권에 형성된 공간정보협력체 형식의 거버넌스인 MetroGIS에 대한 사례분석을 통해 거버넌스의 생성과정과 조직구조, 하위 조직의 역할과 상호관계 등을 살펴보았다. 분석결과 스마트 커뮤니티의 활성화를 위해서는 우선적으로 공공분야의 지원 체계 구축이 요구되며 커뮤니티 내부 및 외부와의 소통체계나 협력체계의 고도화, 그리고 커뮤니티가 거버넌스 형태로 진화하기 위한 재정적 안정성 확보를 통해 지속가능한 모델을 정립하는 것이 필요한 것으로 나타났다.
RGB 조건에서 하나의 픽셀은 255의 세제곱 개 이상의 색상을 표현할 수 있다. 현재까지의 컴퓨터 비전 연구는 조류에서 나타나는 다양한 깃털색 표현형에 대해 세밀히 분석하여 종을 구분하였지만, GWAS에 이용될 목적을 위해 다양하게 유전되는 색상을 단순화하지 못하였다고 판단된다. 본 연구는 연산오계(YO)와 백색레그혼(WL) 상호역교배 F2 집단을 이용하였으며 이미지 양자화를 통하여 이미지의 크기를 줄이고 저장을 용이하게 하였으며 깃털색의 원인 유전자 탐색을 위한 기초 자료를 제공하기 위하여 육안으로 결정하였던 다양한 깃털색을 단순화하였다. 특히, GWAS 연구에 필요한 수치화된 표현형을 제시하였다는 측면에서 가치가 있다고 판단된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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