• 제목/요약/키워드: sequence labelling

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방사성요오드화반응-IV,V보-과산화수소를 이용한 요오드표지 합성법의 검토 (Radioiodination-IV & V-Study on the radioiodination of organic compounds by a hydrogen peroxide procedure)

  • 김유선;김태영
    • 대한화학회지
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    • 제14권2호
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    • pp.169-177
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    • 1970
  • A study was made on the radioiodination of organic compounds in presence of hydrogen peroxide both in aqueous and organic solvent systems. In case of the reaction of rosebengal, Hippuran, and 5-iodo-uracil the aqueous reaction system could give high labelling yield within a relatively short reaction time. Labelling yield of average 50% could be obtained within 30 minutes of reaction sequence. In cases of organic solvent systems (D.M.S.O., D.M.F., and Dioxane) the solvent system of D.M.S.O. could give better yield for neutral organic compounds, where as D.M.F. and Dioxane gave better labelling result for acidic materials. Especially, o-iodobenzoic acid, o-iodotoluene, and pentachlorophenol could be labelled better in organic solvent system.

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Sonchus Yellow Net Virus에 감염된 Nicotiana edwardsonii 잎으로부터의 바이러스 단백질의 혈청학적 분석 (Serological Analysis of Sonchus Yellow Net Virus Proteins in Infected Nicotiana edwardsonii Leaf Tissues)

  • 최태진
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권3호
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    • pp.229-239
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    • 1998
  • Antibodies were raised against fusion proteins of the N-terminus and a region containing the GDNQ (Gly-Asp-Asn-Gln) polymerase motif of the L (polymerase) protein of sonchus yellow net virus (SYNV). Immunoblot analyses using these antibodies revealed the presence of the L protein in purified SYNV preparations and in nuclear extracts from infected tobacco. The serological analyses and detection in a polyacrylamide gels suggested that the L protein is present in at least a 20 fold lower abundance than the G, N, M1 and M2 proteins, and has size corresponding to a molecular weight of over 200 kDa as predicted from nucleotide sequence data. Electron microscopy with gold-labelled antibodies was used to localize the N, M2, and G proteins of SYNV in thin sections of infected tissue. When sections of SYNV-infected tissue were treated with antisera against total SYNV proteins and N protein, gold label could be detected in both the viroplasms and in virus particles. With the anti-M2 protein antiserum, the gold label was strongly localized in the viroplasms but only limited labelling of the virus particle sonly. Limited labelling of the L protein was observed in the viroplasms and the virus particles, presumably because of the low abundance of L protein in the tissues.

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Bi-directional LSTM-CNN-CRF를 이용한 한국어 개체명 인식 시스템 (Korean Entity Recognition System using Bi-directional LSTM-CNN-CRF)

  • 이동엽;임희석
    • 한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리)
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    • 한국정보과학회언어공학연구회 2017년도 제29회 한글 및 한국어 정보처리 학술대회
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    • pp.327-329
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    • 2017
  • 개체명 인식(Named Entity Recognition) 시스템은 문서에서 인명(PS), 지명(LC), 단체명(OG)과 같은 개체명을 가지는 단어나 어구를 해당 개체명으로 인식하는 시스템이다. 개체명 인식 시스템을 개발하기 위해 딥러닝 기반의 워드 임베딩(word embedding) 자질과 문장의 형태적 특징 및 기구축 사전(lexicon) 기반의 자질 구성 방법을 제안하고, bi-directional LSTM, CNN, CRF과 같은 모델을 이용하여 구성된 자질을 학습하는 방법을 제안한다. 실험 데이터는 2017 국어 정보시스템 경진대회에서 제공한 2016klpNER 데이터를 이용하였다. 실험은 전체 4258 문장 중 학습 데이터 3406 문장, 검증 데이터 426 문장, 테스트 데이터 426 문장으로 데이터를 나누어 실험을 진행하였다. 실험 결과 본 연구에서 제안하는 모델은 BIO 태깅 방식의 개체 청크 단위 성능 평가 결과 98.9%의 테스트 정확도(test accuracy)와 89.4%의 f1-score를 나타냈다.

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Bi-directional LSTM-CNN-CRF를 이용한 한국어 개체명 인식 시스템 (Korean Entity Recognition System using Bi-directional LSTM-CNN-CRF)

  • 이동엽;임희석
    • 한국어정보학회:학술대회논문집
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    • 한국어정보학회 2017년도 제29회 한글및한국어정보처리학술대회
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    • pp.327-329
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    • 2017
  • 개체명 인식(Named Entity Recognition) 시스템은 문서에서 인명(PS), 지명(LC), 단체명(OG)과 같은 개체명을 가지는 단어나 어구를 해당 개체명으로 인식하는 시스템이다. 개체명 인식 시스템을 개발하기 위해 딥러닝 기반의 워드 임베딩(word embedding) 자질과 문장의 형태적 특징 및 기구축 사전(lexicon) 기반의 자질 구성 방법을 제안하고, bi-directional LSTM, CNN, CRF과 같은 모델을 이용하여 구성된 자질을 학습하는 방법을 제안한다. 실험 데이터는 2017 국어 정보시스템 경진대회에서 제공한 2016klpNER 데이터를 이용하였다. 실험은 전체 4258 문장 중 학습 데이터 3406 문장, 검증 데이터 426 문장, 테스트 데이터 426 문장으로 데이터를 나누어 실험을 진행하였다. 실험 결과 본 연구에서 제안하는 모델은 BIO 태깅 방식의 개체 청크 단위 성능 평가 결과 98.9%의 테스트 정확도(test accuracy)와 89.4%의 f1-score를 나타냈다.

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Nuclear polyhedrosis virus의 polyhedrin 아미노산 및 polyhedrin gene 염기서열 분석 (The amino acid analysis of polyhedrin and DNA sequence of ployhedrin gene in nuclear polyhedrosis virus)

  • 이근광
    • 한국어병학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.37-46
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    • 1995
  • H. cunea nuclear polyhedrosis virus (HcNPV) 의 polyhedrin 아미노산 및 polyhedrin gene 의 염기서열을 분석하였다. Polyhedrin 은 SDS-PAGE 상에서 3개의 polypeptide band 가 나타났고 주요 polypeptide 는 약 25 Kd 의 분자량을 갖고 있었다. 또한 polyhedrin 은 17 개의 다른 아미노산으로 구성되어 있었다. HcNPV DNA를 EcoRI 효소로 절단하여 $\alpha^{32}P$로 labelling 된 Autographa californica (AcNPV) polyhedrin gene cDNA 의 probe DNA를 이용하여 hybridization 한 결과 polyhedrin gene은 EcoRI 절편들중 H 절편에 양성반응을 나타냈다. 또한 polyhedrin gene 을 포함하고 있는 EcoRI-H 절편을 pUC8 벡터에 cloning한 다음 이를 hPE-H라고 이름하였다. HcNPV genome DNA 의 promoter 부위를 sequence한 결과 TATA box의 염기배열은 polyhedrin gene 전사 개시위치로부터 위쪽으로 -79 bp 의 5' flanking 부위에서 발견되었다. polyhedrin gene 내 CAAT box는 TATA box 측면 염기 배열에서 나타나지 않았고, 4개의 tandem repeat 5'-CTAATAT-3' 와 5'-TAAATAA-3'의 염기는 polyhedrin gene내 전이 개시 위치로 부터 위쪽으로 -141 과 -108 bp 또는 -83 bp 부위에 존재하였으며, 다른 하나는 전이 개시위치로 부터 아래쪽으로 -52 bp 부위에서 발견되었다. 그리고 polyhedrin gene 내 전이 개시위치로 부터 위쪽으로 -141 bp 부위는 다량의 AT (78%) 염기가 존재하였다. 또한 polyhedrin 의 개시 coding region 은 ATG 였고 종결 coding region은 TAA 였다.

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꽃양배추로의 프로타제 저해제 II와 $\beta$-Glucuronidase 융합 유전자의 도입 및 발현 (Transfer and Expression of a Tomato Inhibitor II and $\beta$-Glucuronidae Fusion Gene in Flowering Cabbage, Brassica oleracea var. acephala DC.)

  • 김창길;정재동;안진흥;김경민
    • 식물조직배양학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.37-43
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    • 1998
  • 꽃양배추 '은배' 종자를 무균 파종한 후 6일째된 하배축 조직을 BA 1㎎/L, sucrose 30㎎/L한천 8 g/L가 첨가된 MS 재분화배지에 1일간 전처리한 다음, PI promoter-GUS 융합 유전자가 도입된 Agrobacterium tumefaciens LBA 4404와 2일간 동일조성의 MS 액체배지에서 공동배양하여 carbenicillin 500 ㎎/L와 kanamycin 20 ㎎/L가 첨가된 MS 재분화배지로 옮겨 주었을 때 가장 많은 형질전환체를 얻을 수 있었다. PCR 분석결과, PI promoter-GUS 융합 유전자가 형질전환체의 게놈상에 삽입되어 있음을 확인하였다. Southern 분석결과, ECL-labelling된 PI promoter-GUS 융합 유전자 probe의 coding sequence와 동일한 것으로 판단되는 약 366bp 위치에서 밴드를 확인할 수 있었다. 그러나 형질 전환되지 않은 식물체에서는 이들 밴드를 확인할 수 없었다. 조직내 GUS 유전자의 활성은 잎부위에서부터 시작하여 엽병과 줄기의 관다발을 중심으로 나타났으며 상처의 정도가 심할수록 높은 편이었고 그 범위도 넓었다.

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효과적인 다중 차량 추적을 위한 객체 특징 추출 및 매칭 (Object Feature Extraction and Matching for Effective Multiple Vehicles Tracking)

  • 조두형;이석룡
    • 정보처리학회논문지:소프트웨어 및 데이터공학
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    • 제2권11호
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    • pp.789-794
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    • 2013
  • 차량 추적 시스템(vehicle tracking system)은 교통 흐름 파악, 차량 감시, 사고 감지 등을 통하여 교통 정체에 따른 차량의 이동 경로를 유도할 수 있고, 교통사고를 사전에 방지할 수 있게 하는 시스템이다. 효과적인 차량 추적을 위해서는 먼저 연속된 영상 내의 각 객체의 특징 값을 추출하여 영상 내에 존재하는 차량 객체를 인지할 수 있어야 한다. 다음으로, 검출된 다중 객체에 대하여 영상 간 객체 매칭을 통해 연속된 프레임에 걸쳐 출현하는 동일한 차량을 인식함으로써 각 차량의 움직임을 추적할 수 있다. 본 논문에서는 차 영상의 이진화 및 레이블링(labeling)을 통하여 객체를 검출하고, 검출한 객체의 최소 외접 직사각형(minimum bounding rectangle: MBR)의 중심 좌표와 이 MBR의 가로, 세로 방향에 대한 라인(line)별 1D FFT(fast Fourier transform) 변환 결과의 평균 계수 값을 계산하여 객체의 특징 값을 구한다. 다음으로, 연속된 프레임에 걸쳐 출현하는 객체들 중 유사도가 가장 높은 객체 쌍을 동일한 객체로 인식하여 객체를 추적하는 방법을 제안한다. 실험 결과, 제안한 방법은 객체의 기하학적 특성에 기초한 기존 방법들에 비하여 정확한 추적이 가능함을 보여주었다.

깊이 카메라를 이용한 움직임 추정 방법 (Motion Estimation Method by Using Depth Camera)

  • 권순각;김성우
    • 방송공학회논문지
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    • 제17권4호
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    • pp.676-683
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    • 2012
  • 동영상 부호화에서 움직임 추정은 구현 복잡도에 가장 크게 영향을 미친다. 본 논문에서는 깊이 카메라와 색상 카메라를 동시에 이용하여 움직임 추정의 복잡도를 줄이는 방법을 제안한다. 깊이 카메라로부터 얻어진 거리 정보로 동영상내 객체 정보를 얻고, 비슷한 거리에 있는 화소들을 그룹화하여 동일한 객체로 라벨링을 수행한다. 라벨링된 현재 및 참조 화면내에서 움직임 추정 블록을 세부분(배경, 객체내부, 경계)의 탐색영역으로 구분하여 적응적으로 판단한다. 현재 블록이 객체내부영역이면 참조 화면에서 객체내부영역에만 움직임 추정을 탐색하고, 배경영역이면 블록은 참조 화면에서 배경영역에만 탐색한다. 모의실험을 바탕으로 전역탐색방법에 비하여 제안된 방법은 움직임 추정 차신호가 동일하게 유지되면서 탐색 복잡도가 크게 줄어듬을 확인할 수 있다.