Park, Gyu-Nam;Kim, Hye-Ran;An, Dong-Jun;Chae, Hee-Sun;Chang, Kyung-Soo
Biomedical Science Letters
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v.23
no.2
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pp.64-72
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2017
The formation of brown colonies due to phenol oxidase activity on classic agar media containing natural material extracts of Helianthus annuus or on medium containing L-3,4-dihydroxyphenylalanine has been used to identify Cryptococcus species complex. In this study, various natural materials were used to develop a modified medium and to identify five major serotypes of Cryptococcus species complex. Serotypes A, D, and A/D were pigmented on medium using Perilla frutescens var. japonica Hara (PerJ agar) after a three-day incubation. Serotypes B and C were pigmented on PerJ agar after four- and five-day incubations, respectively. Growth time and pigmentation of the five serotypes occurred more rapidly on PerJ agar than on the other media. In addition, colony morphology, size, and pigmentation were specific by serotype. In conclusion, PerJ agar should be used in clinic settings to identify Cryptococcus species complex and its serotypes rapidly.
In fermentation of dairy products, bifidobacteria is used in conjunction with other lactic acid bacteria, such as L. acidophilus, L. bulgaricus and S. thermophilus, rendering the enumeration of bifidobacteria difficult. In order to develop optimum conditions for selective enumeration of bifidobacteria, we examined MIC of several antibiotics against various bifidobacteria and other lactic acid bacteria. The growth of L. acidophilus, L. bulgaricus and S. thermophilus were inhibited by lithium chloride at the concentration of less than 4 mg/ml, whereas growth inhibition of bifidobacteria occurred at concentrations over 6-10 mg/ml. Tetracycline and chloramphenicol were also found to selectively inhibit growth of other lactic acid bacteria at the concentration of 1-3 $\mu$g/ml. Addition of 6 mg/ml lithium chloride, 1 $\mu$g/ml, tetracycline or 3 $\mu$g/ml chloramphenicol to medium was found to be optimal for selective enumeration of bifidobacteria. By using these three inhibitory chemicals in the TPY medium, higher number of bifidobacteria were selectively isolated than with NPNL agar and LP agar.
To evaluate the recovery rates to increase toxigenic C. difficile, the selective enrichment broth culture methods were compared with commonly used cytotoxin assays and toxigenic culture. First, the enrichment culture, using the selective medium broth for 2 to 5 days, was performed and then, toxigenic C. difficile was confirmed by C. difficile toxin gene-specific PCR after being cultured on C. difficile selective agar. The sensitivity of C. difficile from the enrichment culture (100%) was higher than that of C. difficile selective agar culture (93.8%), while positive predictive values (PPV) were low; 72.7% (16/22) and 88.2% (15/17). PPV of the enrichment culture are not high. Recently, combinations of C. difficile selective agar culture, C. difficile A & B assays, glutamate dehydrogenase, and nucleic acid amplification method are widely used. The enrichment culture was disadvantageous in PPV, turn-around time, and cost. So, what we performed is not considered as a common method of diagnosis of C. difficile-associated diarrhea.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.40
no.7
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pp.1025-1031
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2011
The objective of this study was to compare the performances of conventional microbiological media used in isolation of Shigella spp. from foods. Total of six selective media, including MacConkey agar (MAC), Salmonella Shigella agar (SSA), desoxycholate citrate agar (DCA), xylose lysine desoxycholate agar (XLD), hektoen enteric agar (HEA), and CHROMagar, were tested. MAC showed almost the same colony numbers as compared to tryptic soy agar (TSA) while DCA showed significantly lower colony numbers when cultivated Shigella spp. was counted in each medium. In a food recovery test with beef, pork and shrimp, S. sonnei recovered well on CHROMagar (p<0.05). With lettuce and cabbage, S. sonnei displayed significantly significant recovery (p<0.05) on SSA in comparison with other selective media. Heat-injured cells recovered well on MAC and SSA. In a specificity test using Enterobacteriaceae strains, HEA was identified as having the highest specificity among the tested media. However, Morganella spp. could not be differentiated from Shigella spp. on any of the tested selective media. Shigella spp. precluded the possibility of isolation from foods by a single 'best' selective medium. Consequently, a combination of complementary selective media or selection of appropriate media according to cell conditions must be considered for comprehensive isolation.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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v.20
no.1
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pp.7-12
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2010
To determine the optimal isolation conditions of the entomopathogenic fungi from soil, we compared their growth characteristics with non-entomopathogenic fungi on agar media containing various concentrations of cooper (II) chloride ($CuCl_2$) or dodine. The result showed that dodine medium is more selective, and the optimal concentration of dodine is determined with $50{\mu}g$/ml. We could isolate several putative entomopathogenic fungi from soil using this, and identify them using ITS analysis. As a result, 64% fungi were identified as typical entomopathogenic fungi. This selective medium may be useful to the rapid and simple isolation of entomopathogenic fungi from soil.
We surveyed the distribution of Listeria spp in intestinal contents of slaughtered cattle from Daegu between March and October 2003. Fourteen Listeria spp were isolated from a total of 100 samples. Two samples contained only L innocua and other six samples contained both L monocytogenes and L innocua. Of the 99 samples positive to esculin reaction in Fraser broth, Listeria spp were isolated only from $8\%$ of the samples. Three selective plating medium were examined for detection of Listeria species including Enhanced hemolysis agar, Oxford agar and Palcam agar, It was found that Enhanced hemolysis agar was more effective than Oxford agar and Palcam agar, and that L monocytogenes needed 48 hour growth to give positive reaction.
Various pretreatment procedures and selective media were applied to assess the optimal conditions for the isolation of rare actinomycetes from soil. Pretreatment of wet-heating for 15 min at 70$^{\circ}C$ and phenol treatment of soil suspension were the most effective methods for the isolation of these microorganisms. Hair hydrolysate vitamin agar (HHVA) was the most suitable medium for the recovery of rare actinomycetes. Thirty-five rare actinomycete strains were chosen using selective isolation approaches, then morphological and chemical properties of the isolates were determined. The isolates belonged to one of the following genus, Micromonospora, Microbispora, Actinoplanes and Streptosporangium.
To develop a selective medium for the isolation and the detection of leuconostocs from the various samples including fermented vegetables, ten strains of leuconostocs and seven strains of lactobacilli were tested for their sensitivity to various antibiotics. The basal-medium containing 5 ${\mu}g/ml$ of novobiocin inhibited the growth of lactobacilli completely, but not that of leuconostocs. On the basis of this result, a new selective medium was developed and to be named NLS medium. This medium contains 1% Tryptone (Difco), 0.1% Yeast Extract (Difco), 2% sucrose, 0.1% Beef Extract (BBL), 0.5% sodium acetate, 0.2% ammonium sulfate, 0.01% magnesium sulfate, 0.2% dipotassium phosphate, 0.05% sorbic acid, 75 ppm sodium azide (Sigma), 0.1% (vol/vol) Tween 80, 30 ${\mu}g/ml$ of Vancomycin (Sigma), 5${\mu}g/ml$ of Novobiocin (Sigma), 0.5${\mu}g/ml$ of cysteine HCI, and 1.5% Agar (Difco). All of the eighty six isolates obtained from some foodstuffs were identified as members of the genus Leuconostoc. Comparative counts with the MRS, PES, LUSM, and NLS medium indicated that the recovery percent was lower than other selective media. Therefore, this result suggested that NLS medium was suitable for the isolation of leuconostocs, but not for counting or enumerating.
Proceedings of the Korean Society of Plant Pathology Conference
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2003.10a
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pp.92.2-93
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2003
Severe soybean-sprout rot was found at the mass productive factory in 2000 and 2001 and it caused 10-20% loss of the production. Pythium sp. was isolated almost 90% by potato dextrose agar from rotted root and hypocotylsof the sprouts. And the pathogencity tests using test tubes with 2% water agar and small containers (30 ${\times}$ 30 ${\times}$ 50 cm, WxLxH) cultivation were shown a similar rot on roots and hypocotyls. The fungal mycelium grew rapidly on the water agar and it prevented the seed germination. Density of the Pythium sp. in the recycled water system at the factory was periodically measured using a selective medium, corn meal agar with Pimaricin 10 mg, Rifampicin 10 mg, Ampicillin 100 mg per 1 liter in order to check the contamination of recycled water. After fitering step using 5 and 1 ml in the recycled system was applied and it was effectively controlled Pythium rot. The daily yield of sprout was stable and the occurrenceof Pythium in the recycled water was much less after filtering. The fungal isolates were identified as Pythium deliense Meurs based on various mycological characteristics on corn meal agar and sucrose-asparagine bentgrass leaf culture medium. P. deliens oogonia were spherical, smooth, 19-23 urn in diameter, and their stalk bending toward antheridia. Antheridia were straw hat-shaped, curred club-shaped, therminal or intercalary, monoclinous, occasionally diclinous, 12∼15 ${\times}$ 8∼11 um, 1(∼2) per oogonium.
A semiselective agar medium (XCO) was developed for the isolation of bacterial blight pathogen, Xanthomonas campestris pv. oryzae, from rice seed. The medium contained yeast extract 1.0 g, peptone 2.0 g, sucrose 5.0 g, sodium glutamate 1.0 g, FeSO4.7H2O 0.05 g, Fe.EDTA 1 mg, cephalexin 20 mg, Evan blue (0.1%) 1.5 ml, bromcresol purple (0.1%) 2.5ml, cycloheximide 100 mg and agar 15.0 g per liter. Colonies of X. c. pv. oryzae were 4~5 mm in diameter, smooth, round, blue (darker center) and convex after 6 days incubation at 28$^{\circ}C$. The recovery of 6 isolates of X. c. pv. oryzae on the XOC medium ranged from 81% to 120% (mean 98.2%) in comparison to Wakimoto's medium. The number of saprophytic bacteria from 10 rice seed lots on XCO medium was reduced to 70.4% of that on Wakimoto's medium. The recovery of X. c. pv. oryzae added to rice seed on XOC medium ranged from 67% to 87% (mean 75.6%) of that on Wakimoto's medium.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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