• 대한임상검사과학회지
• /
• 제47권3호
• /
• pp.105-111
• /
• 2015

2013년 12월 말, 에볼라 바이러스는 서아프리카에서 발발했다. 기니를 시작으로 라이베리아, 시에라리온으로 빠르게 퍼지게 되었다. 에볼라 바이러스(자이르형 에볼라 바이러스)는 외피, 비분절, 음성단일가닥 RNA바이러스이다. 에볼라 바이러스는 인수공통 전염병이다. 바이러스는 처음 감염된 야생동물과 접촉 한 후, 혈액, 땀, 소변, 정액, 모유 등의 체액과의 직접적인 접촉을 통해 사람 대 사람으로 전염된다. 그러나 공기로 전염되지는 않는다. 잠복기는 2~21일이다. 에볼라 바이러스는 내피세포, 단핵 식세포, 간세포를 감염시킨다. 감염 후 바이러스가 숙주의 면역 시스템을 회피하기 위해 여러 메커니즘을 사용한다. 이것은 혈관, 간 등의 내부 조직 및 기관에 막대한 피해를 주어 죽음에 이르게 한다. RNA 바이러스에 대한 대부분의 실험은 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)라 기술에 의존한다. 이 방법은 매우 민감하지만 숙련된 과학자, 전원 공급 장치 요구하며 비싸다. 스트립 분석기법(효소면역분석법, ELISA)은 에볼라 바이러스 항원 또는 항체를 검출한다. 이 기법은 저렴하며, 전기, 냉장 장치가 필요하지 않다. 실험적인 치료 및 백신 개발에 관한 지속적인 노력에도 불구하고, 에볼라 바이러스 질환은 현재 치료법에 제한이 있다. 그러므로 신속하고 정확한 진단이 환자관리, 감염예방, 관리대책에 있어서 매우 중요하다.

• Pediatric Infection and Vaccine
• /
• 제24권2호
• /
• pp.87-94
• /
• 2017

목적: 상기도 감염인 소아에게 항생제를 처방하는 것은 아직도 많은 진료실에서 이루어지고 있다. 이 연구는 역전사 중합효소연쇄반응 검사로 호흡기 바이러스가 확인된 이후에도 항생제를 사용한 소아 환자들의 임상적 특징을 조사하고자 하였다. 방법: 2013년 1월부터 2014년 11월에 고신대학교 복음병원 소아청소년과에 상기도 감염으로 입원한 환자 중 역전사 중합효소연쇄반응을 시행한 환자들을 대상으로 후향적 의무기록 분석을 통해 평가하였다. 결과: 상기도 감염으로 진단받은 393명 중 전체 환자 연령의 중앙값은 23개월이었다. 입원 당시 항생제를 처방받은 환자(79명, 20.1%)와 항생제를 처방받지 않은 환자들의 임상적 요인을 비교할 때, 중이염 또는 부비동염의 동반, 높은 고감도 C-반응단백질의 수치가 항생제 처방과 의미 있게 관련 있었다(P<0.001). 입원하여 항생제를 사용하던 중 역전사 중합효소연쇄반응 방법으로 호흡기 바이러스가 확인되었지만, 항생제를 계속 사용한 환자는 44명 중 28명(63.6%)이었다. 항생제를 계속 사용한 환자는 항생제를 중단한 환자와 비교할 때 중이염 동반 비율이 유의하게 높았다(75% vs. 25%, P=0.002). 결론: 본 연구에서 상기도 감염의 원인이 바이러스임을 확인된 소아 환자에게서도 항생제를 지속한 주된 이유는 중이염이 동반되었기 때문이었다. 중이염을 정확하게 진단하고 그 중 항생제가 꼭 필요한 경우를 가려낸다면 소아 상기도 감염에서 불필요한 항생제 사용을 줄이는 데 도움이 될 것으로 생각된다.

• Journal of Plant Biotechnology
• /
• 제34권4호
• /
• pp.293-298
• /
• 2007

Robinia pseudoacacia var. umbraculifera, commonly called umbrella black locust were regenerated after co-cultivation of internode segments with Agrobacterium tumefaciens which included yeast cadmium factor 1 (YCF 1) gene. The tolerance to cadmium and lead for plants can be increased by the YCF1 gene expression. Moreover, the recent studies have shown that YCF1 gene transgenic plants increase the accumulation of cadmium and lead into plant vacuoles. The effect of plant growth regulator such as 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D), ${\alpha}$-naphthaleneacetic acid (NAA), 6-benzyladenine (BA), and thidiazuron (TDZ) were studied to evaluate the propagation of plants through internode explants. The efficient induction of multiple adventitious shoots and callus were observed on a medium supplemented with 0.1 mg/L TDZ + 0.2 mg/L BA. To induce shoot elongation and rooting, regenerated shoots were transferred into basal MS medium without any plant growth regulator. Successful Agrobacterium tumefaciens mediated transformation was obtained by 20 min vacuum-infiltration with $50{\mu}M$ acetosyringone on the optimal multiple shoot induction medium with 30 mg/L hygromycin and 300 mg/L cefotaxime. To confirm the integration and expression of transgene, Polymerase Chain Reaction (PCR) and Reverse Transcriptase PCR (RT-PCR) were performed with specific primers. The frequency of transformation was approximately 18.94%. This study can be used to genetic engineering of phytoremediator.

• 한국어병학회지
• /
• 제31권2호
• /
• pp.71-79
• /
• 2018

2015년 2월부터 2018년 8월까지 총 1,253 마리의 자연산 명태 (Gadus chalcogrammus)를 강원도 고성 아야진항 근해에서 정치망을 사용하여 포획한 후, 바이러스 (viral hemorrhagic septicemia virus, VHSV; nervous necrosis virus, NNV; marine birnavirus, MABV) 모니터링을 RT-PCR법으로 수행하였다. One-step PCR법으로 비장시료 및 뇌시료에서는 대상 바이러스가 모두 검출되지 않았으며, 일부 시료를 two-step PCR법으로 검사한 결과 VHSV는 19.7% (36/183)의 비장시료에서 검출되었다. 또한, NNV는 4.4% (8/183)의 비장시료, 1.2% (3/259)의 뇌시료에서 검출되었다. 검출된 바이러스의 계통분석 결과, 기존의 국내에서 분리되는 바이러스의 유전형에 각각 속하는 것으로 나타났다 (Genotype IVa, RGNNV genotype). 바이러스의 분리를 시도하지 않아 검출된 바이러스의 활성은 알 수 없지만, 모든 양성 시료가 two-step PCR법으로 검출되었으므로 매우 낮을 것으로 추측된다.

• 대한바이러스학회지
• /
• 제29권4호
• /
• pp.271-281
• /
• 1999

The nested polymerase chain reaction (PCR) assay was used to determine the sequences of reverse transcriptase (RT) codons 41, 67, 70, 210, 215 and 219 of human immunodeficiency virus-1 (HIV-1) pol gene. Template DNA was obtained from uncultured peripheral blood mononuclear cells from 27 Korean HIV-1 infected patients treated with ZDV and Korean red ginseng. The second PCRs were done for 2 separated regions (RT codons $13{\sim}98$ and $152{\sim}259$) with $5\;{\mu}l$ of the first PCR productNucleotide sequences were determined by direct sequencing. In the 27 patients, CD4+ cell count decreased from $230{\pm}117/{\mu}l$ to $152{\pm}162/{\mu}l$ for $46{\pm}26$ months (Mo), and actual duration of ZDV intake was $72{\pm}16$ Mo. In the 16 patients who had been treated with ZDV therapy ${\ge}25$ Mo, the incidences of 70R, 215F/Y, and 41L were 61%, 28% and 22%, respectively and those of 67N, 210W and 219Q were 17%. The incidences of 215F/Y were 6.7% for group ${\le}12$ Mo treatment, 22.7% for group with 13 to 24 Mo, and 27.8% for group ${\ge}25$ Mo. There was no mutation in 9 patients. It might be associated with the interruption of ZDV therapy for more than 6 months in 6 patients. This study shows that the detection of mutation could be useful prognostic marker with other clinical and virological data, and very low mutation rate is dectected compared to overseas reports.

• 대한소아치과학회지
• /
• 제37권3호
• /
• pp.275-287
• /
• 2010

치아 우식증은 범발성 질환이고 이에 대한 생체반응은 단순하지 않으며 질병 과정과 숙주의 활성 모두를 반영하는 복합적인 반응이다. 이러한 반응을 이해하기 위해서는 질병의 세포학적, 분자학적인 면을 이해하는 것이 필수적이다. 이에 본 연구는 임상적으로 건강한 치아와 우식이 진행된 치아로부터 얻어진 치수 안의 유전자 발현을 규명하고 우식 병소에서 일어나는 치유 및 재생에 관계되는 분자와 면역 세포들 사이의 분자 생화학적 상호작용을 규명하기 위해서 우식치아와 건전치아의 치수를 이용하여 cDNA 미세배열(microarray) 분석과 역전사효소 중합효소 연쇄반응 (RT-PCR) 분석, 그리고 면역화학염색법 (immunohistochemistry)을 시행하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. cDNA 미세배열 분석 결과, 건전치아군인 대조군에서는 143개의 유전자가, 우식치아군인 실험군에서는 377개의 유전자가 1.6배이상 발현되었다. 2. 역전사효소 중합효소 연쇄반응 분석에서 14개의 유전자를 선택하였고 cDNA 미세배열 분석결과와 동일한 결과를 확인하였다. 3. TGF-${\beta}1$의 면역조직화학적 관찰 결과, 건전치에 비해 우식치의 상아모세포와 치수에서 특히 강하게 발현되었다.

• Childhood Kidney Diseases
• /
• 제17권2호
• /
• pp.79-85
• /
• 2013

목적: 단백뇨 질환의 실험모델인 puromycin aminonucleoside (PAN)에서 관찰할 수 있는 족세포의 병리학적 이상에 있어서 P-cadherin의 변화를 생체 외 족세포 배양실험을 통하여 알아보고자 하였다. 방법: PAN에 의한 족세포의 P-cadherin의 변화를 생체 외 배양실험을 통해 알아보고자 백서 사구체 상피세포(GEpC)를 배양하여 다양한 농도의 PAN을 투여하여 confocal 현미경을 통하여 P-cadherin의 분포를 관찰하였고, Western blotting 과 RT-PCR을 사용하여 P-cadherin 발현의 변화를 관찰하였다. 결과: 외곽세포질에 분포하는 P-cadherin은 단일세포 혹은 응집환경에서 PAN의 농도가 올라갈수록 내부로 응집되는 현상를 볼 수 있었다. Western 분석에서, P-cadherin 단백양은 PAN에 농도-의존적으로, 특히, 고농도인 50 mg/mL에서 24시간과 48시간이 노출 조건에서 각각 21.9% (P< 0.05)와 31.9% (P<0.01)의 의미 있는 감소소견을 보였다. RT-PCR에서도 48시간에서 50 mg/mL PAN을 첨가한 조건에서 23.5%의 의미 있는 감소를 보였다(P<0.05). 결론: PAN은 족세포에서 P-cadherin을 세포막으로부터 내부로의 응집을 유발하고, P-cadherin mRNA의 발현 감소와 단백수준에서 양의 감소를 초래함으로서, 단백뇨의 발생에 기여할 것이라 사료된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제23권1호
• /
• pp.7-12
• /
• 2010

The full-length cDNA of the porcine peroxisomal ${\Delta}^3$,${\Delta}^2$-enoyl-CoA isomerase (PECI) gene encodes a monofunctional peroxisomal ${\Delta}^3$,${\Delta}^2$-enoyl-CoA isomerase. Cloning and sequencing of the porcine PECI cDNA revealed the presence of an 1185-base pair open reading frame predicted to encode a 394-amino acid protein by the 5'rapid amplification of cDNA ends (5'RACE) and EST sequences. The porcine PECI gene was expressed in seven tissues (heart, liver, spleen, lung, kidney, skeletal muscle, fat) which was revealed by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). The porcine PECI was mapped to SSC71/2 p11-13 using the somatic cell hybrid panel (SCHP) and the radiation hybrid panel (RH) (LOD score 12.84). The data showed that PECI was closely linked to marker S0383. A C/T single nucleotide polymorphism in PECI exon 10 (3'UTR) was detected as a PvuII PCR-RFLP. Association analysis in our experimental pig population showed that different genotypes of PECI gene were significantly associated with the Average Backfat thickness (ABF) (p<0.05) and Buttock backfat thickness (p<0.01).

• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
• /
• 제27권6호
• /
• pp.535-542
• /
• 2001

The purpose of this study was to examine the mRNA levels of TNF-${\alpha}$ and IL-6 in the cell lines of normal oral keratocyte and oral squamous cell carcinoma. Total RNA was extracted from these cell lines, observed under UV light, developed by radiographic films of PCR products via reverse transcriptase polymerase chain reaction(RT-PCR) amplication, and measured with densitometer. Each mRNA level of these cell lines divided by ${\beta}$-actin mRNA level was compared to that of normal control group. The results were as follows: 1. Higher mRNA expression of TNF-${\alpha}$ than IL-6 in the normal oral epithelial cell line. 2. In general, expression of mRNA of IL-6 appeared 3-4 times more in tumor cell lines than in control group. 3. mRNA expression of TNF-${\alpha}$ showed variable expression in tumor cell lines, unlike normal cell line. 4. There are no special connections between differentiation of oral cancer cell lines and mRNA expression of TNF-${\alpha}$ and IL-6. From the above results, expression of mRNA of IL-6 in the cell lines of squamous cell carcinoma used in this study has higher than the normal oral epithelial cell line, but there are no relationship between the differentiation of oral cancer cell lines and the expression of mRNA of TNF-${\alpha}$ and IL-6.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제19권7호
• /
• pp.931-937
• /
• 2006

The full-length cDNA of the porcine SMPX gene was obtained by the rapid amplification of cDNA ends (RACE). The nucleotide sequences and the predicted protein sequences share high sequence identity with both human and mouse. The promoter of SMPX was sequenced and then analyzed to find the promoter binding sites. The reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) revealed that SMPX has a high level of expression in heart and skeletal muscle, a very low expression in lung and spleen and no expression in liver, kidney, fat and brain. Moreover, SMPX has a differential expression level in skeletal muscle, the expression in 65-day embryos being higher than other stages. The porcine SMPX was mapped to SSCXp24 by using a somatic cell hybrid panel (SCHP) and was found closely linked to SW1903 using the radiation hybrid panel IMpRH. An A/G single nucleotide polymorphism (PCR-RFLP) in the 3'-untranslated region (3'-UTR) was detected in eight breeds. The analysis of allele frequency distribution showed that introduced pig breeds (Duroc and Large White) have a higher frequency of allele A while in the Chinese indigenous pig breeds (Qingping pig, Lantang pig, YushanBlack pig, Large Black-White pig, Small Meishan) have a higher frequencies of allele G. The association analysis using an experimental population (188 pigs), which included two cross-bred groups and three pure-blood groups, suggested that the SNP genotype was associated with intramuscular fat content.