• 제목/요약/키워드: repair domain

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Schizosaccharomyces pombe에서 SNF2에 속하는 hrp2+ 유전자의 특성 연구 (Isolation and Characterization of hrp2+ Gene Related to SNF2 Family In Yeast)

  • 최인순
    • 생명과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.192-196
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    • 2005
  • 본 연구는 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 여러 가지 DNA 절제회복 및 유전자 발현에 관여하는 SNF2/SW12유전자의 기능을 연구하기 위하여 이에 관련되는 유전자를 분리하고 그 특성을 연구하였다. SNF2 motif의 conserved sequence를 primer로 하여 중합효소 연쇄반응 (PCR) 방법으로 480 bp 크기의 DNA fragment를 분리하여, 이를 probe로 하여 효모에서 hrp2+ 유전자를 분리하였다. 분리한 hrp+ 유전자의 sequence homology를 비교한 결과 3개의 SNF2 motif를 포함하고 있었다. hrp2+ 유전자의 전사체 크기는 4.7kb임을 Northern hybridization으로 확인하였다. 분리한 유전자의 특성 연구를 위하여 Northern hybridization 으로 hrp2+ 유전자의 UV와 MMS에 대한 유도성을 조사한 결과 자외선에 대해서만 유전자의 발현이 유도되었다. 이 결과 분리한 hrp2+는 UV-inducible 유전자임을 확인하였다. 또한 분리한 유전자의 특성연구 중 하나로 hrp2+ 단백질을 분리하여 helicase activity를 측정하였다. 이 결과 분리한 hrp2+ 유전자는 전혀 helicase activity를 나타내지 않았다.

웹 기반의 도시철도 전문가시스템 개발에 관한 연구 (A Study on the Development of Web-based Expert System for Urban Transit)

  • 김현준;배철호;김성빈;이호용;김문현;서명원
    • 한국자동차공학회논문집
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    • 제13권5호
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    • pp.163-170
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    • 2005
  • Urban transit is a complex system that is combined electrically and mechanically, it is necessary to construct maintenance system for securing safety accompanying high-speed driving and maintaining promptly. Expert system is a computer program which uses numerical or non-numerical domain-specific knowledge to solve problems. In this research, we intend to develop the expert system which diagnose failure causes quickly and display measures. For the development of expert system, standardization of failure code classification system and creation of BOM(Bill Of Materials) have been first performed. Through the analysis of failure history and maintenance manuals, knowledge base has been constructed. Also, for retrieving the procedure of failure diagnosis and repair linking with the knowledge base, we have built RBR(Rule Based Reasoning) engine by pattern matching technique and CBR(Case Based Reasoning) engine by similarity search method. This system has been developed based on web to maximize the accessibility.

Protein Expression of Mouse Uterus in Post-Implantation

  • Kim, Hong-Rye;Han, Rong-Xun;Kim, Myung-Youn;Diao, Yunfei;Park, Chang-Sik;Jin, Dong-Il
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제33권4호
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    • pp.237-242
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    • 2009
  • Pregnancy is a unique event in which a fetus develops in the uterus despite being genetically and immunologically different from the mother, and the underlying mechanisms remain poorly understood. To analyze the differential gene expression profiles in nonpregnant and 7 days post coitus (dpc) pregnant uterus of mice, we performed a global proteomic study by 2-D gel electrophoresis (2-DE) and MALDI-TOF-MS. The uterine proteins were separated using 2-DE, Approximately 1,000 spots were detected on staining with Coomassie brilliant blue. An image analysis using Melanie III (Swiss Institute for Bioinformatics) was performed to detect variations in protein spots between pregnant and nonpregnant uterus. Twenty-one spots were identified as differentially expressed proteins, of which 10 were up-regulated proteins such as alpha-fetoprotein, chloride intracellular channel 1, transgelin, heat-shock protein beta-1, and carbonic anhydrase II, while 11 were down-regulated proteins such as X-box binding protein, glutathione S-transferase omega 1, olfactory receptor Olfr204, and metalloproteinase-disintegrin domain containing protein TECADAM. Most of the identified proteins appeared to be related with catabolism, cell growth, metabolism, regulation, cell protection, protein repair, or protection. Our results uncovered key proteins of mouse uterus involved in pregnancy.

Comparison of various structural damage tracking techniques based on experimental data

  • Huang, Hongwei;Yang, Jann N.;Zhou, Li
    • Smart Structures and Systems
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    • 제6권9호
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    • pp.1057-1077
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    • 2010
  • An early detection of structural damages is critical for the decision making of repair and replacement maintenance in order to guarantee a specified structural reliability. Consequently, the structural damage detection, based on vibration data measured from the structural health monitoring (SHM) system, has received considerable attention recently. The traditional time-domain analysis techniques, such as the least square estimation (LSE) method and the extended Kalman filter (EKF) approach, require that all the external excitations (inputs) be available, which may not be the case for some SHM systems. Recently, these two approaches have been extended to cover the general case where some of the external excitations (inputs) are not measured, referred to as the adaptive LSE with unknown inputs (ALSE-UI) and the adaptive EKF with unknown inputs (AEKF-UI). Also, new analysis methods, referred to as the adaptive sequential non-linear least-square estimation with unknown inputs and unknown outputs (ASNLSE-UI-UO) and the adaptive quadratic sum-squares error with unknown inputs (AQSSE-UI), have been proposed for the damage tracking of structures when some of the acceleration responses are not measured and the external excitations are not available. In this paper, these newly proposed analysis methods will be compared in terms of accuracy, convergence and efficiency, for damage identification of structures based on experimental data obtained through a series of laboratory tests using a scaled 3-story building model with white noise excitations. The capability of the ALSE-UI, AEKF-UI, ASNLSE-UI-UO and AQSSE-UI approaches in tracking the structural damages will be demonstrated and compared.

소형 고정익기의 신호기반 조종면 고장진단 알고리즘 (Signal-based Fault Diagnosis Algorithm of Control Surfaces of Small Fixed-wing Aircraft)

  • 김지환;구윤성;이형철
    • 한국항공우주학회지
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    • 제40권12호
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    • pp.1040-1047
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    • 2012
  • 본 논문에서는 소형 고정익기의 고장 발생시기와 부품 교체시기를 예측하여 유지보수 비용을 절감하고 정비 효율을 높이기 위하여 ANPSD와 PCA, 그리고 GC 방법을 이용하여 조종면의 고장에 대하여 이를 검출하고 위치와 정도를 분리하는 알고리즘을 제안하였다. 이때 ANPSD는 주파수 영역에서의 진동 분석을, PCA는 ANPSD의 중요 정보 추출을, GC는 고장 검출 및 분리 시의 오류 최소화를 위하여 사용되었다. 또한 모형 항공기에 가속도 센서를 부착하여 정상인 경우와 힌지 고장이 발생한 경우에 대하여 실제로 측정한 결과에 이와 같은 알고리즘을 적용한 결과 해당 알고리즘이 고장을 검출하고 분리하는 데에 적합함을 보였으며 제안된 알고리즘을 적용할 경우에 발생 가능한 문제들에 대하여 이를 완화할 수 있는 대응책을 함께 제시하였다.

모바일 서비스관리를 위한 정책정의언어 (Policy Definition Language for Service Management in Mobile Environment)

  • 안성욱;류성열
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제16D권4호
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    • pp.561-570
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    • 2009
  • 모바일 환경에서 유지보수의 효율적인 관리를 위해서는 서비스를 정책으로 관리하기 위한 시스템 구조와 정책정의언어가 필요하다. 본 연구는 IETF의 정책 프레임웍 중에 정책 실행자인 PEP 구조를 정의하고, PEP 구조하에서 수행될 수 있는 정책정의언어를 제안한다. 제안한 정책정의언어는 문헌자료와 모바일 특성을 기반으로 하여 요구사항을 도출하고, 3단계 접근 방법으로 정책정보모델을 설계하여 정책정의언어로 정의하였다. 3단계 접근 방법은 정책이 적용될 범위를 결정하는 정책도메인, 정책 적용 및 제어하는 종류를 구분하는 정책규칙, 정책 구조를 문맥화하는 정책문법으로 구성된다. 제안한 정책정의언어의 효율성을 검증하기 위하여 시나리오를 정책정의언어로 정의하여 정책 도구를 이용하여 검증하였고, 타 정책정의언어들과 비교 분석하여 확장성을 입증하였다.

The Study of Trnascriptional Regulated Gene, $hrp^{2+}$, in Yeast

  • Choi, In-Soon
    • Journal of Life Science
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    • 제11권2호
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    • pp.111-115
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    • 2001
  • This study was designed to clone the SNF2/SW12 helicase-related genes from the fission yeast Schizosaccha-romyces pombe and thereafter to elucidate the common functions of the proteins in this family. The $hrp^{2+}$gene was cloned by polymerase chain reaction amplification using degenerative primers from conserved SNF2 motifs within the ERCC6 gene, which encodes a protein involved in DNA excision repair. Like other SNF2/SW12 family proteins, the deduced amino acid sequence of Hrp2 contains DNA-dependent ATPase/7 helicase domains as well as the chromodomain and the DNA binding domain. This configuration is similar to that of mCHD1 (mouse chromo-ATPase/helicase-DNA-dinding protein 1), suggesting that Hrp2 is a S. pombe homolog of mCHD1, which is thought to function in altering the chromatin structure to control the gene expression. To characterize the function of Hrp2, 4 Uracil-Hrp2 fusion protein, it was purified near homogeneity by affinity chromatography on $Ni^{2+}$-NTA agarose, DEAE-Sepharose ion exchange arid Sephacryl S-200 gel filtration chromatographies. The purified fusion protein exhibited DNA-dependent ATPase activity, which was stimulated by both double-stranded and single-stranded DNA. To determine the steady-state level of $hrp^{2+}$ transcripts during growth, cells were cultured in medium and collected at every 2hr to prepare total RNAs. The northern blot analysis showed that the level of $hrp^{2+}$ transcripts reached its maximum before the cells entered the exponential growth phase and then decreased gradually, This result implies that Hrp2 may be required at early stages of cell growth.h.

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이온화 방사선 및 염화수은(II)에 의한 자궁경부암 세포의 DNA 손상 평가 (Evaluation of DNA Damage by Mercury Chloride (II) and Ionizing Radiation in HeLa Cells)

  • 우현정;김지향;안토니나 체불스카바실레프스카;김진규
    • 환경생물
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    • 제24권1호
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    • pp.46-52
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    • 2006
  • 세포에 미치는 염화수은(II)과 이온화 방사선의 영향과 수은 처리 전 후 방사선 조사 시 그 상호 작용에 관해 알아보고자 본 연구를 수행하였다. 염화수은(II)의 독성정도를 알아보기 위하여 사람의 자궁암 세포에 농도별로 염화수은(II)을 처리하였다. 세포의 생존율은 3가지 농도(1,0. 1,0. $0.01\;{\mu}M$)모두에서 유의하게 감소하였으며 이미 $0.1\;{\mu}M$에서 약 73%의 생존율이 감소하는 것으로 나타났다. 염화수은(II)과 방사선의 단독처리 시 DNA의 손상 정도에 비해 복합처리 시의 DNA손상 정도가 $2\sim4$배 정도 확연히 높아짐을 볼 수 있었다. 특히 방사선 후 수은 처리군은 DNA손상의 정도가 다른 처리군에 비하여 높게 나타났는데 이는 이미 기존의 보문에서 밝혀진 바와 같이 수은의 DNA수복에 관련되어 있는 Fpg protein에 미치는 영향 때문으로 사료된다. 이미 방사선에 의해 산화적 손상을 입은 DNA의 수복 기작을 수은이 방해하여 좀 더 높은 손상을 가져오는 것을 확인할 수 있었다.

암 치료 표적으로써 유비퀴틴 접합 효소 UBE2의 기능 (The Role of Ubiquitin-conjugating Enzymes as Therapeutic Targets in Cancer)

  • 우선민;권택규
    • 생명과학회지
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    • 제33권6호
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    • pp.523-529
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    • 2023
  • 유비퀴틴-프로테아좀 시스템은 E1-E2-E3 효소의 작용으로 단백질 안정성을 조절하며 이를 통해 진핵 세포 내 광범위한 과정을 조절한다. 특히 DNA 수리, 세포 주기, 전이, 혈관형성 및 사멸과 같은 종양의 생장 과정에서 주요한 역할을 하는데 이 과정에서 유비퀴틴 접합 효소인 UBE2는 활성화된 유비퀴틴을 타깃 단백질에 이동시켜주는 중간 매개체 역할을 한다. UBE2는 인간에게서 40개가 존재하며 이는 촉매 도메인의 확장 유무에 따라 4개의 그룹으로 분류된다. 최근 UBE2의 타깃 단백질의 특정 위치를 인식하는 기질 특이성에 대한 연구가 증가하는 추세이다. 특히 암에서 발현이 높은 UBE2는 암 환자의 나쁜 예후와 상관관계가 있어 종양 형성에서 UBE2의 중요성이 강조되고 있다. 본 총설에서는 암에서 UBE2의 역할에 대한 최신 연구 결과 및 동향에 대해 기술하였다. 또한 UBE2에 관한 기초 지식 및 분자적 메커니즘을 제공함으로써 궁극적으로는 UBE2가 종양 치료의 새로운 타깃이 될 수 있음을 시사한다.