• 제목/요약/키워드: region truncation

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The protein truncation caused by fusion of PEP-1 peptide and protective roles of transduced PEP-1-MsrA in skin cells

  • Lee, Tae-Hyung;Choi, Seung-Hee;Kim, Hwa-Young
    • BMB Reports
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    • 제44권4호
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    • pp.256-261
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    • 2011
  • PEP-1 peptide has been used for transduction of native protein into mammalian cells. This work describes the findings that the fusion of PEP-1 to target proteins led to protein truncation likely in a non-protein-specific manner. Approximately 75% of PEP-1-MsrA fusion protein was truncated in the N-terminal region of MsrA between Lys-27 and Val-28 during expression in Escherichia coli and purification. This large protein truncation was also observed in another PEP-1 fused protein, PEP-1-MsrB2, in the N-terminal region of MsrB2. The full-length PEP-1-MsrA protein was rapidly transduced into keratinocyte cells within 15 min. The transduced PEP-1-MsrA was functionally active and could protect skin cells against oxidative stress- and ultraviolet radiation-induced cell death. Collectively, our data demonstrated the protective roles of MsrA in skin cells and, moreover, may raise a concern of protein truncation caused by fusion of PEP-1 about the general use of this peptide for protein transduction.

개선된 남한지역의 GRS80 중력지오이드 모델 (KGM93) (Improved GRS80 Gravimetric Geoid in the South Korea Region (KGM93))

  • 조규전;이영진;조봉환
    • 한국측량학회지
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    • 제12권1호
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    • pp.61-68
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    • 1994
  • Stokes 적분에 의하여 지오이드고를 산정하는 문제에서 경계영역의 외곽에 대한 영향을 무시하게 되면 절단오차가 발생한다. 이 논문에서는 남한지역에 대하여 개선된 GRS80 중력 지오이드모델 KGM93(Korean Gravimetric geoid Model 1993)을 제시하였다. 이 모델은 GEM-72 등의 위성중력과 지상중력을 조합시켜 산정하였으며 경계영역을 $\psi_0=30^\circ$로 하고 프리에어 지오이드에 절단오차를 보정하였다. 연구결과에서는 제시된 KGM93-C의 정확도가 약 1 미터 수준에 있음을 보여준다.

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Damage detection using finite element model updating with an improved optimization algorithm

  • Xu, Yalan;Qian, Yu;Song, Gangbing;Guo, Kongming
    • Steel and Composite Structures
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    • 제19권1호
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    • pp.191-208
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    • 2015
  • The sensitivity-based finite element model updating method has received increasing attention in damage detection of structures based on measured modal parameters. Finding an optimization technique with high efficiency and fast convergence is one of the key issues for model updating-based damage detection. A new simple and computationally efficient optimization algorithm is proposed and applied to damage detection by using finite element model updating. The proposed method combines the Gauss-Newton method with region truncation of each iterative step, in which not only the constraints are introduced instead of penalty functions, but also the searching steps are restricted in a controlled region. The developed algorithm is illustrated by a numerically simulated 25-bar truss structure, and the results have been compared and verified with those obtained from the trust region method. In order to investigate the reliability of the proposed method in damage detection of structures, the influence of the uncertainties coming from measured modal parameters on the statistical characteristics of detection result is investigated by Monte-Carlo simulation, and the probability of damage detection is estimated using the probabilistic method.

Adaptive Truncation technique for Constrained Multi-Objective Optimization

  • Zhang, Lei;Bi, Xiaojun;Wang, Yanjiao
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제13권11호
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    • pp.5489-5511
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    • 2019
  • The performance of evolutionary algorithms can be seriously weakened when constraints limit the feasible region of the search space. In this paper we present a constrained multi-objective optimization algorithm based on adaptive ε-truncation (ε-T-CMOA) to further improve distribution and convergence of the obtained solutions. First of all, as a novel constraint handling technique, ε-truncation technique keeps an effective balance between feasible solutions and infeasible solutions by permitting some excellent infeasible solutions with good objective value and low constraint violation to take part in the evolution, so diversity is improved, and convergence is also coordinated. Next, an exponential variation is introduced after differential mutation and crossover to boost the local exploitation ability. At last, the improved crowding density method only selects some Pareto solutions and near solutions to join in calculation, thus it can evaluate the distribution more accurately. The comparative results with other state-of-the-art algorithms show that ε-T-CMOA is more diverse than the other algorithms and it gains better in terms of convergence in some extent.

PET/CT 검사에서 확대된 표시시야가 표준섭취계수에 미치는 영향 평가 (The Evaluation of the Difference of the SUV Caused by DFOV Change in PET/CT)

  • 곽인석;이혁;최성욱;석재동
    • 핵의학기술
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    • 제15권2호
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    • pp.13-20
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    • 2011
  • PET/CT 검사에서 제한적인 CT (Computed Tomography)의 FOV (Field of View)는 PET 영상의 DFOV (Display FOV) 바깥부위에서 영상 잘림 현상 (truncation artifact)에 의한 오류를 유발할 수 있다. 본 논문에서는 영상 재구성 시 확대된 DFOV를 적용함에 따라 PET영상에서 표준섭취계수 (Standardization Uptake Value, SUV)의 차이를 측정하여 영상에 미치는 정도를 비교 평가하고 그 유용성을 알아보고자 하였다. 5.3 kBq/mL의 $^{18}F$(FDG)를 주입한 NEMA 1994 PET 모형을 FOV의 중앙에 위치하고 영상을 획득하고, 동일모형을 FOV의 바깥부분으로 위치를 변경하여 truncation 현상이 발생하도록 한 뒤 같은 방법을 적용하여 영상을 획득하였다. 각 실험을 통해 얻어진 데이터는 동일한 방법을 적용하여 영상을 재구성 하였으며, DFOV는 50 cm와 70 cm로 변경하여 각각 적용하였다. 그리고 방출영상에 관심영역을 설정하고 최대섭취계수($_{max}SUV$)를 비교 하였으며 육안적인 이상유무도 함께 확인하였다. 임상영상은 모형실험에서와 같이 truncation 현상이 발생한 환자군을 선정한 후 해당 환자의 방출영상에서 간(Liver) 부위에 관심영역을 설정하고 모형실험에서와 같이 영상 재구성 시 DFOV 변화에 따른 표준섭취계수의 차이를 비교 하였다. 모형을 FOV 내 중심에 위치시키고 시행한 실험에서 DFOV 증가에 따라 화소의 크기는 3.91 mm에서 5.47 mm로 증가하였고, 관심영역의 $_{max}SUV$는 각각 1.49에서 1.35로 나타나 확대된 DFOV 적용시 9.39%의 감소를 보였다. 모형을 FOV의 바깥부분으로 이동시킨 후 얻은 영상의 경우 $_{max}SUV$가 1.30에서 1.20로 7.69% 감소하였다. DFOV 확대로 인하여 추가적으로 나타난 부위에서의 $_{max}SUV$는 1.51이었고, truncation 현상이 발생한 부위를 기준으로 안쪽과 바깥쪽 부위의 $_{max}SUV$차이는 25.9%로 바깥쪽에서 높은 결과를 보였다. 임상영상의 확대된 DFOV를 적용한 경우 $_{max}SUV$ 3.38에서 3.13으로 7.39% 감소하였다. 확대된 DFOV를 적용할 경우에서의 $_{max}SUV$ 감소 현상은 화소 크기의 증가로 인해 화소 간 잡음 (Pixel to Pixel Noise)이 낮아져 발생하는 저평가 정도의 범위를 벗어나지 않았으며 확대된 부위의 영상에서 육안적 확인 시 선형인공산물 등의 이상이 발견되지 않아 truncation 현상 없는 영상을 얻을 수 있다는 점에서는 임상적 적용이 유용하다고 할 수 있다. 그러나 실제 환자에게 확대된 DFOV를 적용할 경우에는 영상면 전체에서 정량적 결과가 저평가 되는 것을 감안하여야 하며, 특히 확대되어 추가로 나타난 부위에서의 정량적 결과가 높게 나타날 수 있다는 점에 유의하여 적용해야 할 것이다.

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전산유체역학을 이용한 유도무기 선두부 절단 비율에 대한 공력해석 (Aerodynamic Analysis Based on the Truncation Ratio of Guided-Weapon Nose Using CFD)

  • 정기연;강동기;이대연;노경호
    • 한국항공우주학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.245-255
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    • 2019
  • 본 논문에서는 유도무기의 선두부 형상 절단 비율에 따라서 달라지는 공력특성에 대해 전산유체역학을 이용하여 분석하였다. 해석을 수행하는 형상은 유도무기 동체만 있으며 직경대 길이비는 10.7이다. 선두부 형상은 세 가지를 선택했으며 구형, 25% 절단, 50% 절단형을 비교하였다. 유도무기 동체의 정확한 해석을 위해서 NASA의 풍동시험 데이터를 이용하여 격자 구성법과 해석 기법을 선택하고 검증하였다. 선두부 세 가지 형상에 대해서 비행마하수에 대해 항력을 분석한 결과 절단과 구형이 6~20% 정도 차이 났으며, 동체의 선두부와 기저부의 압력분포를 통해 특성을 분석하였다.

Time harmonic analysis of dam-foundation systems by perfectly matched layers

  • Khazaee, Adib;Lotfi, Vahid
    • Structural Engineering and Mechanics
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    • 제50권3호
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    • pp.349-364
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    • 2014
  • Perfectly matched layers are employed in time harmonic analysis of dam-foundation systems. The Lysmer boundary condition at the truncation boundary of the PML region has been incorporated in the formulation of the dam-foundation FE model (including PML). The PML medium is defined in a way that the formulation of the system can be transformed into time domain. Numerical experiments show that applying Lysmer boundary conditions at the truncation boundary of the PML area reduces the computational cost and make the PML approach a more efficient technique for the analysis of dam-foundation systems.

Receptor Cytoplasmic 영역에 의존하는 EGF의 고친화성 결합 (Dependence of High Affinity Binding of Epidermal Growth Factor on Receptor Cytoplasmic Domain)

  • 강용호
    • KSBB Journal
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    • 제7권3호
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    • pp.201-208
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    • 1992
  • 일부의 EGF receptor 에는 EGF 가 세포표면에서 receptor 와 결합할 때 보다 높은 친화력(high affinity)을 보이고 있는데 그 이유를 설명하기 위해서 EGF receptor 의 cytoplasmic 영역을 절단하여 EGF 와의 친화력을 측정하였다. Scatchard plot 의 결과 1022 아미노산 이하로 절단된 receptor 는 high affinity 특성을 상실하였다. Triton X-100로 세포막을 제거하여 cytoskeleton 이 EGF receptor 의 구조에 미치는 영향을 조사한 결과 cytoskeleton과 결합한 receptor 보다 EGF 에 대해서 더 높은 친화력을 보였다. 따라서 cytoskeleton 이 high affinity EGF receptor 를 형성하는데 영향을 미치고 receptor 와 cytoskeleton 의 가능한 결합부위는 1022-1186 아미노산 사이인 것 같다.

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A New Tailored Sinc Pulse and Its Use for Multiband Pulse Design

  • Park, Jinil;Park, Jang-Yeon
    • Investigative Magnetic Resonance Imaging
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    • 제20권1호
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    • pp.27-35
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    • 2016
  • Purpose: Among RF pulses, a sinc pulse is typically used for slice selection due to its frequency-selective feature. When a sinc pulse is implemented in practice, it needs to be apodized to avoid truncation artifacts at the expense of broadening the transition region of the excited-band profile. Here a sinc pulse tailored by a new apodization function is proposed that produces a sharper transition region with well suppression of truncation artifacts in comparison with conventional tailored sinc pulses. A multiband pulse designed using this newly apodized sinc pulse is also suggested inheriting the better performance of the newly apodized sinc pulse. Materials and Methods: A new apodization function is introduced to taper a sinc pulse, playing a role to slightly shift the first zero-crossing of a tailored sinc pulse from the peak of the main lobe and thereby producing a narrower bandwidth as well as a sharper pass-band in the excitation profile. The newly apodized sinc pulse was also utilized to design a multiband pulse which inherits the performance of its constituent. Performances of the proposed sinc pulse and the multiband pulse generated with it were demonstrated by Bloch simulation and phantom imaging. Results: In both simulations and experiments, the newly apodized sinc pulse yielded a narrower bandwidth and a sharper transition of the pass-band profile with a desirable degree of side-lobe suppression than the commonly used Hanning-windowed sinc pulse. The multiband pulse designed using the newly apodized sinc pulse also showed the better performance in multi-slice excitation than the one designed with the Hanning-windowed sinc pulse. Conclusion: The new tailored sinc pulse proposed here provides a better performance in slice (or slab) selection than conventional tailored sinc pulses. Thanks to the availability of analytical expression, it can also be utilized for multiband pulse design with great flexibility and readiness in implementation, transferring its better performance.

폐루프시스템의 성능을 보장하는 이산제어기 차수축소 (Discrete controller order reduction with the closed-loop performance guaranteed)

  • 오도창;정은태;박홍배
    • 전자공학회논문지S
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    • 제34S권3호
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    • pp.24-32
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    • 1997
  • This paper is on a discrete controller order reduction with the closed-loop stability and performance guaranteed. to achieve this, after finding the solutionsof two lyapunov inequalities and balancing the full order controller system, we find the reudced order controlers using the balanced truncation (BT) and the balanced singular perturbation approximation (BSPA). When the solutions of the two lyapunov inequalities exist, it is shown that the resulting controllers guarantee the closed-loop stability, and .inf.-norm error bounds are derived for the closed-loop performance region for the BT and in low frequency region for the BSPA. Finally, a numerical example is given to illustrate the validity of the proposed method.

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