• 제목/요약/키워드: reaction intermediate analogues

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Selective Ring-opening Fluorination of Epoxide: An Efficient Synthesis of 2'-C-Fluoro-2'-C-methyl Carbocyclic Nucleosides

  • Liu, Lian-Jin;Kim, Si-Wouk;Lee, Won-Jae;Hong, Joon-Hee
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권12호
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    • pp.2989-2992
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    • 2009
  • An efficient synthetic route of novel 2′(${\alpha}$)-C-fluoro-2′(${\beta}$)-C-methyl carbocyclic nucleoside analogues is described. The key fluorinated intermediate 7 was prepared from the epoxide intermediate 5 via selective ring-opening of epoxide. Coupling of 7 with nucleosidic bases under the Mitsunobu reactions followed by deprotection afforded the target carbocyclic nucleoside analogues. The synthesized compounds were evaluated as inhibitors of the hepatitis C virus (HCV) in Huh-7 cell line in vitro.

Synthesis and Antiviral Activity Evaluation of 5',5'-Difluoro-2'-methylapiosyl Nucleoside Phosphonic Acid Analogs

  • Hong, Joon Hee
    • 통합자연과학논문집
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    • 제8권3호
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    • pp.153-163
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    • 2015
  • Racemic synthesis of novel 5',5'-difluoro-2'-methyl-apiose nucleoside phosphonic acid analogs was achieved as potent antiviral agents. Phosphonation was performed by direct displacement of triflate intermediate with diethyl (lithiodifluoromethyl) phosphonate to give the corresponding (${\alpha},{\alpha}$-difluoroalkyl) phosphonate. Condensation successfully proceeded from a glycosyl donor with persilylated bases to yield the nucleoside phosphonate analogs. Deprotection of diethyl phosphonates provided the target nucleoside analogs. An antiviral evaluation of the synthesized compounds against various viruses such as HIV, HSV-1, HSV-2 and HCMV revealed that the pyrimidine analogs (cytosine, uracil, and thymine) have weak anti-HIV or HCMV activity.

Semiempirical Molecular Orbital Calculations of the Substituent Effects on Acylations of 3-Cephem Analogues

  • Chang Moon-Ho;Koh Hun-Yeong;Lee Jung-Chull;Lee Yoon Sup
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제15권6호
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    • pp.453-455
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    • 1994
  • Semiempirical MO calculations are applied to estimate the substituent effects on acylations of the nonfused N-vinyl-2-amino $\beta-lactams$ having frameworks analogous to 3-cephems. The stabilization energy for the reaction intermediate of the nucleophilic attack by the hydroxide ion is selected as the reactivity index and calculated by AM1 and PM3 methods for the model $\beta-lactams$ with substituents at the C1 and N-vinyl terminal positions. The reactivities are larger for -SH connected to the C1 and strong $\pi-acceptors$ at the N-vinyl terminal implying the large reactivity for known active cephalosporins. Quantum chemical calculation of stabilization energy could be useful in correlating antibiotic activities of many compounds obtained as derivatives of a lead compound.

식물 치사관련 유전자를 이용하는 신규 제초제 작용점 탐색 및 조절물질 개발동향 (A prognosis discovering lethal-related genes in plants for target identification and inhibitor design)

  • 황인택;이동희;최정섭;김태준;김범태;박유신;조광연
    • 농약과학회지
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    • 제5권3호
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    • pp.1-11
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    • 2001
  • 신규 제초제 작용점의 발굴은 유전체학과 조합화학 등 새로운 기술이 등장하여 그 가능성이 높아지고 있다. 대략 $10^{30}$에서 $10^{50}$여 개의 화학물질의 합성이 가능하고 50,000여 개의 식물 유전자 지도가 완성되어 이들의 조합으로 새로운 제초제의 작용점 발굴 가능성이 높아지게 될 것이다. 즉, 고등식물이 가지고 있는 50,000여 개의 유전자 가운데 0.1%, 1.0% 또는 10%가 신규 작용점이 된다면 50, 500, 5000개의 신규 작용점을 발견할 수 있는 것이다. 신규 제초제의 개발을 위해서는 target enzyme의 선택과 결정, 저해제의 설계, 작용점까지 도달하는 과정, 대사적인 운명 등 여러가지 요인들이 검토되어야 한다. 이러한 과정에서 가장 중요한 것은 확실한 작용점의 선택에 있다. 또한 다양한 생화학적 정보를 통하여 작용점/효소의 저해로부터 고사에 이르는 과정을 이해함은 물론 보다 강력한 저해제의 합성과 살초과정을 이해할 수 있어야 할 것이다. 그 동안에는 이미 알려진 작용점을 대상으로 신규 화합물을 합성하거나 유도체를 개발하는 것이 대부분이었지만 최근에는 antisense 기법 등을 활용하여 새로운 치사관련 작용점을 찾아내는데 잠재력과 가능성을 확대시켜주고 있다. 새로운 치사관련 작용점을 발굴한 후에는 대상효소의 화학적, 생화학적 기능과 단백질의 구조를 분석하여 강력한 저해제를 설계하는데 활용하게 될 것이다. 치사관련 돌연변이체와 antisense 기법을 활용하고, 식물 생리학적 반응을 기초로 하여 리드화합물을 탐색하는 것은 새로운 접근방식이며 농약 화학적 특성을 갖는 효소 저해제들의 합성은 크게 6가지로 할 수 있다. 공통특이시얀 기질 유사체 합성, affinity labels, 자살기질체, 반응중간산물, 그리고 extraneous site inhibitors 등을 들 수 있다. 이와 같은 방법으로 후보화합물이 선발된다 하여도 실제식물에 처리하여 흡수, 이행, 대사 등에 관한 시험이 반드시 이루어져야 새로운 제초제를 탄생시킬 수 있다. 또한 약물의 전달과정과 무독화작용을 통하여 pro-herbicide에 대한 연구를 진행하게 될 것이며, 마지막으로 잡초와 작물간의 선택성이 고려되어야 효소 측이적 접근방식에 의한 신규 선택성 제초제의 개발이 성공할 수 있는 것이다.

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Aminolysis of Benzyl 2-Pyridyl Thionocarbonate and t-Butyl 2-Pyridyl Thionocarbonate: Effects of Nonleaving Groups on Reactivity and Reaction Mechanism

  • Kim, Min-Young;Lee, Jae-In;Um, Ik-Hwan
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권4호
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    • pp.1115-1119
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    • 2013
  • A kinetic study is reported for nucleophilic substitution reactions of benzyl 2-pyridyl thionocarbonate (5b) and t-butyl 2-pyridyl thionocarbonate (6b) with a series of alicyclic secondary amines in $H_2O$ at $25.0^{\circ}C$. General-base catalysis, which has often been reported to occur for aminolysis of esters possessing a C=S electrophilic center, is absent for the reactions of 5b and 6b. The Br${\o}$nsted-type plots for the reactions of 5b and 6b are linear with ${\beta}_{nuc}$ = 0.29 and 0.43, respectively, indicating that the reactions of 5b proceed through a stepwise mechanism with formation of a zwitterionic tetrahedral intermediate ($T^{\pm}$) being the rate-determining step while those of 6b proceed through a concerted mechanism. The reactivity of 5b and 6b is similar to that of their oxygen analogues (i.e., benzyl 2-pyridyl carbonate 5a and t-butyl 2-pyridyl carbonate 6a, respectively), indicating that the effect of modification of the electrophilic center from C=O to C=S (i.e., from 5a to 5b and from 6a to 6b) on reactivity is insignificant. In contrast, 6b is much less reactive than 5b, indicating that the replacement of the $PhCH_2$ in 5b by the t-Bu in 6b results in a significant decrease in reactivity as well as a change in the reaction mechanism (i.e., from a stepwise mechanism to a concerted pathway). It has been concluded that the contrasting reactivity and reaction mechanism for the reactions of 5b and 6b are not due to the electronic effects of $PhCH_2$ and t-Bu but are caused by the large steric hindrance exerted by the bulky t-Bu in 6b.

체내 안정형 HSV1-tk (Herpes Simplex Virus Type-1 Thymidine Kinase) 영상용 IVDU 유도체의 합성 (The Synthesis of the Stable IVDU Derivative for Imaging HSV-1 TK Expression)

  • 김은정;최태현;안순혁;김병수;박현;천기정;이학준;안광일
    • Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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    • 제43권5호
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    • pp.478-486
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    • 2009
  • 목적: 화합물이 가지는 항바이러스 및 항암 작용으로 인하여 5-iododeoxyuridine 유도체들에 관한 연구는 매우 광범위하게 이루어져왔다. 방사 요오드가 치환된 이들 화합물에 대한 연구의 주요 목표는 체내 및 체외 평가 시 효과적 일뿐만 아니라, 보다 안정한 화합물을 개발하는 것이다. 본 연구를 통해, 다양한 방사성의약품의 중간체로도 이용되어질 수 있는 carbocyclic radioiododeoxyuridineanalogue (ddIVDU)를 합성하여 생물학적 평가를 수행하고자 하였다. 대상 및 방법: 목표 화합물의 합성은 Pd(0)-촉매 결합 반응, LAH 환원반응, hetero Diels-Alder 반응을 주요 반응으로 하여 수행하였다$(Sch\;3)^{10-12}$. 합성된 화합물의 생물학적 평가를 위해 MCA와 MCA-tk 세포에 다양한 농도의 GCV와 carbocyclic ddIVDV를 처리하여 MTS 법을 이용해 세포독성을 보았고, [$^{125}I$]carbocyclic ddIVDU를 이용해 MCA와 MCA-tk 세포에서 HSV1-tk에 의한 선택적 섭취를 비교 평가 하였다. 결과: Carbocyclic ddIVDU 및 요오드 도입을 위한 전구물질의 합성을 cyclopentadiene을 출발 물질로 하여 높은 수율에 의해 수행하였다. 방사요오드를 이용한 동위원소 도입 반응은 각각, 80% 이상의 방사표지 수율 및 95 % 이상의 방사 화학적 순도를 나타내었다. 세포독성 결과 MCA-tk 세포에서 carbodyclic ddIVDU는 GCV에 비해 세포독성이 작았고, MCA에서는 유사한 세포 독성을 보였다. [$^{125}I$]carbocyclic ddIVDU는 MCA-tk 세포에서 uptake는 8시간째까지 계속 증가하는 양상을 보였으며, MCA세포에서 uptake는 4시간째까지 일정하게 유지되다가 8시간째 급격히 증가하였다. [$^{125}I$]carbocyclic ddIVDU의 uptake는 MCA보다 MCA-tk에서 약 2-5배 정도 높은 결과를 보였다. 결론: 진행되어진 생물학적 결과로부터 이 유도체는 체내 평가 시 매우 안정할 뿐만 아니라, GCV에 비해 독성이 덜하고, HSV1-tk cell에 선택적임을 보여준다. 따라서 신규 화합물인 carbocyclic ddIVDU는 HSV1-tk를 영상화하는데 유용하게 이용되어질 수 있을 것이다.