RuBPCase에 의한 RuBP의 탄소고정화반응에 의해 생성된 PGA는 NADH에 의해 환원되어 GAP로 변한다는 사실은 이미 잘 알려져 있다. 이때 마반응의 NADH를 분광학적으로 측정하면 반응의 진척 도를 알 수 있다. 이 환원반응은 SDS 마생용액 속 에셔 촉진됨을 관찰하였다. 대부분의 단백질이 음이온성 미생과의 강한 상호작용으로 말미암아 불활성화된다는 사설과는 달리, 이 일련의 반응은 3~4종 의 효소단백질을 포함하고 있음에도 불구하고 반응 에 대한 저해현상은 관찰할 수 없였고, 오히려 $2{\times}10^{-2}M$ 의 고농도의 미생용액 속에서는 거의 모든 NADH가 산화되었다. NADH가 물층과 미셀층 사이에 엘정한 비율로 분포되어 있어서. 미셀에 결합된 NADH가 물층과 미생층의 경계변에셔 PGA와 반응하기 때문인 것으로 판단된다. 한편 양이온성 (CTABr), 양쪽이온생 (Chaps), 비 이온성(Brij 및 Triton X-1OO)미생은 그들의 농도 가 증가함에 따라, 반응이 처음에는 급격히 증가하여 최대(NADH의 흡광도값 최소)에 이르나, 이후 감소(흡광도 증가)하다가 다시 서서히 증가하고, 이어서 다시 감소하는 경향을 보였다. 저농도의 미셀 용액 속에서의 반응성이 비교적 급속히 증가하는 것 은 미셀속에 침투되어 있는 미반응의 NADH가 Stern층에서 PGA를 환원시키기 때문인 것으로 생각된다. 이어서 반응성이 다시 완만하게 감소하는 것은 미생용액 속에서의 소수성 기질과 천수성 반응 물절의 두 분자반응의 전형적인 모형을 따르기 때문인 것으로 판단된다.
최장 공통 부분 스트링이란 주어진 두 개 이상의 스트링에서 가장 길게 일치하는 공통 부분 스트링을 계산하는 문제이다 최장 공통 부분 스트링은 스트링 프로세싱이나 생물정보학 분야에서 널리 사용되고 있는 중요한 문제이지만, 현재까지 연구된 동적 프로그래밍이나 써픽스 트리를 사용한 방법은 저장 공간을 많이 차지하므로 효율적이지 못하다 따라서 적은 저장 공간을 차지하면서도 최장 공통 부분 스트링을 빨리 구할 수 있는 알고리즘이 필요하며, 본 논문에서는 이를 위해 써픽스 배열을 도입하였다. 본 논문에서 제시한 알고리즘은 선형 시간, 공간 복잡도를 가지며, 써픽스 트리의 최하 공통 조상(LCA, Lowest Common Ancestor) 연산이나 써픽스 배열에서 사용하는 그와 비슷한 구간 최소 값 질의(RMQ, Range Minima Query)를 전혀 사용하지 않으므로 매우 효율적이다.
Yun, Il-Gu;Carastro, Lawrence A.;Poddar, Ravi;Brooke, Martin A.;May, Gary S.;Hyun, Kyung-Sook;Pyun, Kwang-Eui
ETRI Journal
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제22권1호
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pp.38-46
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2000
The extraction of model parameters for embedded passive components is crucial for designing and characterizing the performance of multichip module (MCM) substrates. In this paper, a method for optimizing the extraction of these parameters using genetic algorithms is presented. The results of this method are compared with optimization using the Levenberg-Marquardt (LM) algorithm used in the HSPICE circuit modeling tool. A set of integrated resistor structures are fabricated, and their scattering parameters are measured for a range of frequencies from 45 MHz to 5 GHz. Optimal equivalent circuit models for these structures are derived from the s-parameter measurements using each algorithm. Predicted s-parameters for the optimized equivalent circuit are then obtained from HSPICE. The difference between the measured and predicted s-parameters in the frequency range of interest is used as a measure of the accuracy of the two optimization algorithms. It is determined that the LM method is extremely dependent upon the initial starting point of the parameter search and is thus prone to become trapped in local minima. This drawback is alleviated and the accuracy of the parameter values obtained is improved using genetic algorithms.
We report here the results on N-acetyl-N'-methylamide of alanine (Ac-Ala-NHMe) calculated using the ab initio molecular orbital method with the self-consistent reaction field (SCRF) theory at the HF level with the 6-3l+G(d) basis set to investigate the conformational preference of alanine depending on the backbone torsion angles $\square$ and$\square$ in the gas phase, chloroform, and water. There are seven local minima (LM) in the gas phase and two additional LM are found in chloroform and water. These two additional LM A (an $\square$-helical structure) and F (a polyproline structure) are stabilized only in solutions. In the gas phase, the lowest LM is the conformation C with a C$\sub$7/ intramolecular hydrogen bond and the relative conformational energies range from 0.3 to 6.0 ㎉/mol. In chloroform, the lowest LM is the conformation E (an extended structure) and the relative conformational energies range from 0.7 to 4.9 ㎉/mol. In particular, we identified 14 possible transition states connecting between seven LM in the gas phase. The search for transition states probable in chloroform and water is now in progress.
We report the application of time-dependent density functional theory (TDDFT) to the calculation of potential energy profile relevant to the excited state intramolecular proton transfer (ESIPT) processes in title molecules. The TDDFT single point energy calculations along the reaction path have been performed using the CIS optimized structure in the excited state. In addition to the Stokes shifts, the transition energies including absorption, fluorescence, and 0-0 transition are estimated from the TDDFT potential energy profiles along the proton transfer coordinate. The excited state TDDFT potential energy profile of SA and 3ASA resulted in very flat function of the OH distance in the range ROH = 1.0-1.6 A, in contrast to the relatively deep single minimum function in the ground state. Furthermore, we obtained very shallow double minima in the excited state potential energy profile of SA and 3ASA in contrast to the single minimum observed in the previous work. The change of potential energy profile along the reaction path induced by the substitution of electron donating groups (-NH2 and -OCH3) at different sites has been investigated. Substitution at para position with respect to the phenolic OH group showed strong suppression of excited state proton dislocation compared with unsubstitued SA, while substitution at ortho position hardly affected the shape of the ESIPT curve. The TDDFT results are discussed in comparison with those of CASPT2 method.
In this study the electrical conductivity of excess BaO in $BaTiO_3$ was measured to investigate the relationship between defects and solubility in the temperature range of $900^{\circ}C$ to $1300^{\circ}C$ under various oxygen partial pressure. First of all, quenched $BaTiO_3$ powders of various Ba/Ti ratios were analysed by X-ray diffraction to confirm whether second phase is formed or not. As the results, we observed the solubility of BaO in the temperature range of $1200^{\circ}C$ to $1400^{\circ}C$, and it was also found that the conductivity minima move to lower $PO_2$ with increasing excess BaO within solubility limit.
2000년 11월 21일부터 23일가지 3일간 식쌍성 V65l Cas의 극심시각 관측을 수행하였다. 이 관측으로부터 총7개의 새로운 극심시각을 얻었다. 이 관측치를 포함한 V651 Cas의 광전관측 및 CCD 극심시각을 재분석하여, 김천휘와 이재우(2000)가 제안한 제3 천체에 의한 광시간 궤도를 확인하였고, 개선하였다. 최종적으로 구한 광시간 궤도의 주기, 반-진폭, 그리고 이심율은 각각 $6.^{y}3,\;0.^{d}0013$, 그리고 0.78이다. 제3 천체의 궤도경사각이 $30^{\circ}$보다 클 경우, 제3 천체의 질량은 $0.09M_{\odot}\;{\leq}\;M_3\;{\leq}\;0.20M_{\odot}$의 범위에 있다. V65l Cas 계에 상정된 제3 천체가 진실로 존재하고, 주계열성이라면, 그 제3 천체는 주계열 끝에 위치한다.
이 논문은 피하산란의 정도가 다를 것으로 예상되는 얼굴의 6개의 부위를 촬영하여 각각의 산란특성을 추출하고 렌더링에 반영하여 얼굴의 사실감 있는 표현이 가능한 방법을 제안한다. 각 부위별 산란이미지는 프로젝터로부터 피부에 입사된 단위광선이 내부 산란을 거쳐 밖으로 드러나는 모양을 여러 노출로 촬영하여 HDR 이미지로 합성하고, 비선형 최소제곱합의 해법 중 Sequential Quadratic Programming을 이용하여 광선의 입사지점을 지나는 단면이 이루는 곡선에 '가우스 함수의 선형결합'을 적합한다. 가우스 함수는 산란곡선을 잘 근사하면서 필터로서 적용이 쉬운 장점을 가진다. 우리는 최소제곱합의 해가 지역 해에 빠지는 않도록 유전알고리듬을 이용해 초기 값을 설정한다. 근사된 식의 각 가우스 항은 얼굴에 입사되는 복사조도를 렌더링한 텍스처에 가우스 필터로 적용되어 피하산란효과를 표현. 이 논문에서는 최대 12회의 가우스 필터링을 효율적으로 처리하기 위해 쿠다의 병렬처리능력를 활용하였다.
The purpose of this study is to understand the changes on species composition of the epilithic diatoms and the appearance of morphological abnormalities in the upper region of the Nakdong River where heavy metal inflow is observed. The samples were collected once a week for a month of September 2016 from selecting 7 sampling stations. The heavy metals of cadmium (Cd) and arsenic (As) were not detected during the survey period, but zinc (Zn) was detected in st.4 - st.6 with the range of $0.015{\sim}0.188mg\;L^{-1}$. Metal sensitive species such as Achnanthes convergens, Cocconeis placentula, Cocconeis placentula var. euglypta, Cocconeis placentula var. lineata showed high dominance in st.1 - st.3, st.7. However, metal tolerant species such as Nitzschia palea, Achnanthes minutissima showed high dominance in st.4 - st.6. It is concluded that heavy metal inflow directly affects the changes in species composition of epilithic diatoms. As a result of CCA, the characteristics of the sampling sites were divided into 3 groups. Group 1 was represented the non-detected Zn sites with C. placentula, C. placentula var. euglypta, C. placentula var. lineata. Group 2 was showed the detected Zn sites with Navicula minima and Nitzschia palea. Group 3 was included st.3 - st.7 on 4th week that was stabilized the community structure. Total 8 taxa of abnormal frustules observed. This occurrence of abnormal frustules reflected the temporal and quantitative indicators of heavy metal pollution, in particular, it was confirmed that genus Fragilaria, which has a high abnormality according to heavy metal pollution, can be used as an indicator species.
이 총설에서는 야누스 입자가 유체 계면에 흡착할 때, 이들 입자가 가지는 평형 배향에 대한 이론적 접근 방법을 소개하고자 한다. 구형, 타원면, 그리고 아령 모양의 야누스 입자를 모델로 하여, 입자의 모양, 젖음성, 크기가 평형 배향에 강하게 영향을 준다는 사실을 설명하겠다. 특히 야누스 타원면의 경우, 특정 조건에서 두 개의 에너지 최소점이 존재하고, 따라서 이들 입자들이 두 개의 배향(수직 배향과 기울어진 배향)을 동시에 가질 수 있음을 의미한다. 또한 입자들이 각각의 배향을 가질 확률은 두 에너지 최소점 사이의 에너지 장벽에 해당하는 방위각에 의해서 결정된다. 반대로 야누스 아령은 오로지 한 개의 배향만을 취하지만, 입자의 기하학적 그리고 화학적 비등방성과 비대칭성이 증가할수록 중간 배향을 갖게 된다. 중간 배향 상태에서 입자들은 일정 범위 내의 방위각에서 자유롭게 회전할 수 있다. 야누스 입자의 배향에 대한 연구는, 이들 입자들이 유체의 계면에 비가역으로 흡착할 때, 개별 입자들의 배향이 입자간 상호 작용, 회합 현상, 그리고 더 나아가 유변학적 성질에 직접적으로 영향을 미칠 수 있다는 점에서 그 중요성을 찾을 수 있다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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