• 한국생물공학회:학술대회논문집
• /
• 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
• /
• pp.409-411
• /
• 2003

한국의 서해안과 남해안 47개소의 해수와 mud 시료로부터 광합성세균으로 유추되는 13개의 균주를 분리하였고, agar-shake tube method와 RAPD-PCR을 이용하여 4종의 서로 다른 균주를 순수분리 하였다. 이들 4종의 균주 중 폐수분해능이 우수한 균주를 선정하여, 형태학적, 배양적, 생화학적 특성 및 16S rRNA sequencing에 의한 동정을 실시하였고, 그 결과 purple, non-sulfur bacteria의 Rhodobacter 속에 가장 근접하여, Rhodobacter sp. EGH-24로 명명하였다. Rhodobacter sp. EGH-24가 생산하는 carotenoid 색소는 spheroidene(group 2)이였고, bacteriochlorophyll a를 가지고 있었으며, PHB를 생산하는 것으로 확인되었다.

• 한국균학회지
• /
• 제27권4호통권91호
• /
• pp.256-273
• /
• 1999

ATCC(American Type Culture Collection)에서 분양 받은 2균주를 포함하여 1989년부터 1995년 사이에 국내 11개 장소에서 채집된 번데기동충하초(Cordyceps militaris) 72균주를 대상으로 기주적 지리적 근연관계에 따른 균주간 변이도를 관찰하고자 균사체의 배양적 특징 및 불완전세대 관찰과 DNA 분석에 의해 분류동정을 행하였다. 균사의 배양특성을 조사한 결과 균사의 자라는 모양, 속도, 색택 등에 있어서 균주간에 차이가 나타남이 관찰되었다. 번데기동충하초의 불완전 세대를 관찰한 결과 분생자경이 분지하며 윤생으로 형성되는 Verticillium속으로 동정되었으며 포자의 모양은 구형을 띠는 것으로 나타나 형태적으로는 각 균주간의 별 다른 차이를 발견할 수 없었다. 공시균주 중 인공자실체 형성이 우수하였던 두 균주(C18, C738)를 선택하여 단포자분리를 행하였으며 여기서 분리된 단포자균주 56균주와 공시균주 72균주를 대상으로 RAPD를 행하였다. RAPD에서 나타난 균주간 변이도를 NTSYS program을 사용하여 UPGMA 분석방법으로 phonogram을 작성한 결과 단포자 균주내의 평균 유전적 거리는 0.207로 나타났으며 단포자 분리를 행하였던 두 균주에 따라 각각 A그룹(C18)과 B그룹(C738)으로 나누어짐이 확인되었다. 두 그룹의 평균 유전적 거리는 각각 0.150(A group)과 0.163(B group)으로 나타났으며 그룹간 평균 유전적 거리는 0.221로 나타났다. 공시균주간에는 크게 그룹으로 나누어지는 경향이 관찰되지 않았으며 이들의 평균 유전적 거리는 0.330으로 나타나 본 실험에서 사용된 번데기동충하초(C. militaris)의 균주 간에는 33%의 유전적 변이가 있음이 확인되었다.고, SF4와 LF4는 처리군 중에 유의적으로 가장 낮은 값을 나타내었다. 총균수와 젖산균수의 변화는 용존 $CO_{2}$함량 변화와 유사한 경향을 나타내었다. SF4, LF4, SF15는 관능검사 결과 발효가 지연되어 풋내와 짠맛이 높게 평가되었고 탄산미는 낮게 평가되었다. LF25는 관능검사 결과 다른 처리군에 비해 신맛과 이취가 유의적으로 높게 평가되었다. $15^{\circ}C$에서 24시간 발효시킨 나박김치 (LF15)와 $25^{\circ}C$에서 12시간 발효시킨 나박김치(SF25)는 탄산미와 관계가 있는 용존 $CO_{2}$함량이 저장 12일까지 지속적으로 증가하였으며, 관능검사 결과 저장 기간 동안 다른 처리군에 비해 풋내와 이취가 적으면서 탄산미가 높게 평가되어 $15^{\circ}C$에서 24시간 발효(LF15)와 $25^{\circ}C$에서 12시간 발효(SF25)가 적합한 초기 발효 조건으로 생각된다. 이러한 연구 결과를 통해 물김치류인 동치미나 열무 물김치도 초기 발효 조건에 따라 이화학적, 미생물학적 및 관능적 특성에 많은 차이가 있을 것이므로 이에 대한 연구가 필요하다고 사료된다.화점에서 시판되고 있는 계란 총 446개에 대해서도 동일한 절차와 방법으로 조사하였던바, 재래시장에서 구입했던 계란의 난각부분(Egg-shell)에서만 가금티푸스(fowl Typhoid)의 병원체인 S. gallinarum이 1주$(0.2\%)$만이 분리되었고, 기타 세균으로서는 대장균군이 역시 난각에서 가장 높은 빈도로 분리되었고, 난황(Yolk)에서는 극히 낮은 수준의 세균오염도를 보였다. 다양한 동물종유래 S. aureus

• 한국균학회지
• /
• 제37권1호
• /
• pp.28-32
• /
• 2009

본 연구의 목적은 식용 및 약용버섯인 아위(阿魏)버섯(Pleurotus ferulae) 균주와 느타리버섯속(Pleurotus spp.) 종간의 유전적 유연관계를 이해하는 것이었다. RAPD 분석결과 이들 버섯 종들은 유사도 80% 수준에서 7개의 그룹으로 분류되었다. 노랑느타리(P. cornucopiae), 사철 2호(P. florida), 여름 2호(P. sajor-caju)는 각각의 그룹으로 분류 되었고, 큰느타리 균주인 26060과 P. fuscus var. ferulae 균주인 26065은 같은 그룹으로 분류되었다. 4개의 느타리 균주는 흑평을 제외한 수한 1호, 원형 1호, 춘추 1호가 한그룹을 형성하였고, 아위버섯 균주 중 일본설이를 제외한 박달, 아위, 천산 1호, 아위예산 균주가 하나의 그룹을 형성하였다. 아위버섯 균주인 일본설이는 느타리 균주인 흑평과 같은 그룹에 속하였다.

• 한국자원식물학회지
• /
• 제13권2호
• /
• pp.104-110
• /
• 2000

가시오갈피 및 오갈피의 수집종 간의 유연관계를 구명하기 위하여 RAPD 분석을 한 결과 10개의 primer를 선발하였으며 G+C의 수가 모두 60%이상이었다. 10개의 primer를 사용하여 얻을 수 있는 총 밴드 수는 106개 였으며 이중 monomorphic한 밴드는 17.9%에 해당하는 19개였으며 나머지 87개는 polymorphic한 것으로 나타났다. 10개의 primer를 사용하여 얻은 106개의 밴드를 각각 하나의 형질(character)로 보아 이를 유연관계를 분석한 결과 영월 수집종과 일본종 및 지리산 오갈피와 서울오갈피를 포함하는 군(Group I )과 국내종과 러시아종, 중국종을 포함하는 군(Group II)으로 나뉘어졌으며 genetic distance값의 평균은 0.61이었다. Group I으로 분류된 북해도 가시오갈피는 국내의 각 수집지역의 가시오갈피나 러시아 가시오갈피와 원연의 관계인 것으로 나타났으며 2군에 포함된 수집 지역종 간의 원연 관계 중 춘천 수집종은 국내의 다른 지역인 잠곡이나 태기산 오대산 등과 비교하여 러시아 산이나 중국산에 대하여 더 근연의 관계를 나타내었다.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제49권2호
• /
• pp.239-248
• /
• 2021

The emergence of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii has partly increased treatment failure and patient mortality. Class D β-lactamases is an important mechanism of resistance to beta-lactam antibiotics in this species. This study aimed to investigate the relationship between the presence oxacillinase gene and genetic fingerprints of A. baumannii isolates from the intensive care unit of an Egyptian tertiary care hospital. One hundred and twenty A. baumannii clinical isolates were collected. Multiplex PCR was performed to detect genes encoding oxacillinases (OXA-23, OXA-24, OXA-51, OXA-58 and OXA-143). Molecular typing of all collected isolates was performed using random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR assay. Out of 120 examined isolates, 92, 88 and 84% were resistant to ertapenem, imipenem and meropenem, respectively. The species-specific, commonly present OXA-51 gene was found in all isolates while OXA-23 showed a high prevalence of 88% of isolates. OXA-24 and OXA-143 genes were detected in 3% and 1% of isolates, respectively. No OXA-58 gene was detected. Five clusters consisting of 19 genotypes were detected using RAPD-PCR. Genotype A was the most prevalent, it was observed in 62% of the isolates followed by genotype B (12%). These results revealed that genotypes A and B are common in the hospital. Results also demonstrate that RAPD-PCR is a rapid and reliable method for studying the clonal similarity among A. baumannii isolated from different clinical specimens.

• 원예과학기술지
• /
• 제28권5호
• /
• pp.828-835
• /
• 2010

사과 품종을 구분하는 일반적인 방법은 형태적인 특성 평가를 근거로 하지만 유전적으로 밀접하게 연관되어 있는 품종들은 형태적 형질에 의해 품종을 구별하기는 불가능하다. 본 연구는 사과 국내 육성 품종을 정확히 판별할 수 있는 DNA 마커를 개발하고자 수행하였다. 국내육성과 도입 사과 31품종으로부터 30종의 임의 프라이머를 이용한 RAPD 분석을 통해 품종 간 다형성을 나타내는 마커 83종을 얻었다. SCAR 마커로 전환하기 위해 52종의 RAPD 단편들을 클로닝 및 염기서열 분석을 하였고 이들 중에서 17종의 SCAR 마커가 클로닝된 RAPD 단편과 동일한 크기의 단일 밴드가 증폭되었다. SCAR 마커 중 6종(AN11_433, AN08_566, A408_592, AK17_653, AO04_711, AO04_779와 AW15_368, AN11_433, A408_592, AK17_653, AO04_711, AO04_779, 또 는 AL1_427, AN11_433, AN08_566, A408_592, AK17_653, AO04_779) 또는 7종의(AL1_427, AN11_433, AN08_566, A408_592, AK17_653, AM16_708, AO04_779와 A330_424, AN11_433, AG14_502, AN08_566, A408_592, AK17_653, AO04_779 또는 A330_424, AN11_433, AK14_564, A408_592, AK17_653, AM16_708, AT14_789) 조합을 이용하여 국내 육성 16품종의 판별이 가능하였다. 따라서 17종의 SCAR 마커를 적용하여 총 31품종의 국내 육성 또는 도입품종의 구분이 가능하였으며 이들 SCAR 마커는 금후 사과 국내 육성 품종 판별을 위해 효과적으로 이용될 수 있을 것으로 판단되었다.

• Applied Biological Chemistry
• /
• 제49권3호
• /
• pp.186-191
• /
• 2006

본 연구는 전기적 세포융합방법인 electrofusion을 이용하여 우량균주의 육성을 목적으로 S. cerevisiae KCTC7904와 Z. rouxii KCTC7966 간의 전기융합을 실시하였고, 융합주의 내당성과 내염성을 확인하였으며, 융합주의 선별방법을 연구하였다. 또한 융합주의 유전안정성과 RAPD-PCR 분석을 통한 융합여부의 직접적인 증거를 확인하고자 실험하였다. S. cerevisiae KCTC7904와 Z. rouxii KCTC 7966를 각각 $12{\sim}36$시간 배양하여 분리 세척한 다음 1.5% 2-mercaptoethanol로 20분간 전 처리하여 lyticase(200 U/ml)로 $30^{\circ}C$에서 최종적으로 $60{\sim}90$분간 처리했을 때, 91% 이상의 원형질체를 얻을 수 있었다. 얻어진 원형질체를 $1.0{\sim}1.2\;M$ sorbitol 용액으로 세척 한 다음 각각 1 : 1의 비율로 혼합하여 1.5 MHz/50 pV의 고주파를 가하였을때 paired protoplast가 형성되었으며, 615 $V/256\;{\mu}sec$의 고전압을 가한 결과 약 25% 정도의 융합체를 얻을 수 있었다. 선별된 융합주의 내당성과 내염성을 각각의 모균주와 비교하여 실험한 결과 50%의 glucose와 15%의 NaCl을 함유한 배지에서 모두 생육이 가능하여 각각의 균주 특성을 가지고 있음을 확인하였고, 또한 융합주를 $4^{\circ}C$에서 5개월간 보관했을 때 약 28%정도가 모균주로 복귀되었지만, 72%의 융합안정성을 나타내므로 비교적 안정한 상태를 확인할 수 있었다. 융합의 진위 여부를 증명하기 위해 유전적인 분석방법인 RAPD-PCR 법을 사용하여 실험한 결과 각각의 균주가 agarose gel 상에서 보인 band의 패턴이 융합주에서도 모두 보여짐을 확인하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제7권3호
• /
• pp.161-166
• /
• 1997

Nuclei were isolated from the protoplasts of Trichoderma harzianum T95 and treated with colchicine, a polyploid inducer. The nuclei were transferred into the protoplast of multi-auxotrophic Gliocladium virens G88 which cannot grow in minimal medium. The protoplast of G. virens G88 carrying the transferred nuclei were regenerated in a regeneration minimal medium containing $17{\mu}g/ml$ of chloroneb as a haploid inducer. Six intergeneric hybrids between G. virens and T. harzianum were isolated from the regeneration minimal medium. The hybrids could be classified into three types according to morphology, those with an isozyme pattern, those with an protein band and those with an randomly amplified polymorphic DNA(RAPD) pattern produced by random primers and repetitive sequences. The first group was identified to be a haploid recombinant, the second group a heterokaryon, and the third appeared to be petite.

• 아시안잔디학회지
• /
• 제11권1호
• /
• pp.73-85
• /
• 1997

Although zoysia grass (Zoysia spp.) has a lot of excellent chracteristics as warm-season grass, it have been limited in use due to slow establishment, low seed production, poor shade tolerance and other factors. Breeding trials have been continued from 1900's, much attentions have been paid especially in U.S.A., Korea and Japan recently. In U.S.A., more than 24 varieties had been evaluated at National Turfgrass Evaluation Program(NTEP) from 1991 to 1995 and some were regsistered as commercial. After the 6th International Turfgrass Research Conference at Japan in 1989, Japan Turfgrass In-corporation (JTI) sponsored by private companies and government carried out breeding programs for pest, salt, and shade tolerant and herbicide resistant varieties. JTI also has been trying to im-prove vigor and breed evergreen zoysia Korean breeders collected germplasms since 1960's. After USDA breeders came to Korean penesula in 1982, Korean breeders joined with USDA zoysia breeding project for several years. Many interspecific hybrids and natural selected varieties were breeded that period both in U.S.A and Korea. Breeding objectives were to extend green color period, improve leaf quality and density, and better leaf color at dormant stage. Since 1990's, zoysia grass breeding trials are getting more diverse in many points such as random amplified polymorphic DNA (RAPD) assay for ecotype identification. The objectives of this study are to evaluate germplasms in Korea, and also review the present status and future prospect in zoysia grass breeding in the world.

• Archives of Pharmacal Research
• /
• 제28권7호
• /
• pp.854-858
• /
• 2005

A Lactobacillus isolate was collected from the feces of a healthy Korean individual and named as Lactobacillus ruminus SPM0211. It was further characterized by subjecting it to an antibiotic resistance test and genetic analysis. In the antibiotic resistance test, all tested Lactobacillus spp. were classified as 'high resistance' for multiple antibiotics, such as isoniazid, ethambutol, cycloserine, and vancomycin. L. ruminus SPM0211 was classified as 'high resistance' for streptomycin also, while the other tested Lactobacillus spp. were classified as low resistance. This suggests that the antimicrobial spectra may be a good indicator in the discrimination of this strain among the tested Lactobacillus spp. In a polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (PCR-RAPD) analysis using the Microbial Uniprimer kit, L. ruminus SPM0211, and L. suebicus were clustered as a group with a 74.3% similarity level, suggesting that these two species are genetically related. Thus, our data suggest that the PCR-RADP method using the Microbial Uniprimer kit may be valuable in discriminating L. ruminus SPM0211 from other Lactobacillus spp.