• 한국식품영양과학회지
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• 제30권1호
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• pp.193-195
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• 2001

A radiation-resistant bacterium was isolated from gamma irradiated dried laver (Porphyra tenera) and its microbiological characteristics were examined. As a result of resistance test to gamma irradiation, the isolate was survived $10^{3}$ CFU/mL even at 30 kGy and significant shoulder line zone was shown until 20 kGy. The $D_{10}$ value was 11.27 kGy. The isolate was gram-positive, non-motile coccus and catalase-positive. n culture, the red-pigmented smooth colony was observed. The biochemical test in API (analytical profile index) system showed that the isolate fermented glucose and fructose as the carbon source. Therefore, a radiation-resistant bacterium isolated from laver was potentially identified as Micrococcus roseus sp.

• 방사선산업학회지
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• 제4권3호
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• pp.289-295
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• 2010

The bacterium Deinococcus radiodurans is one of the most resistant organisms to the effects of ionizing radiation and other DNA-damaging agents. In this study, distributions of 10 ddr (DNA damage response) genes were investigated in 8 species of Deinococcus by polymerase chain reaction (PCR). We have compared the sequences of ddr genes of D. radiodurans, D. geothermalis and D. deserti, and selected primers which are suitable for the detection of ddr in different species of Deinococcus. A sequence homology search and PCR assay showed that ddrO, which encodes a global regulator of the radiation-desiccation response, was most well conserved in the Deinococcus lineage.

• 한국식품과학회지
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• 제45권2호
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• pp.248-251
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• 2013

김에 존재하는 M. roseus는 비병원성 세균이나 사람이 면역력이 떨어지게되면 질병을 일으킬 수 있는 균주로서 열처리를 통해서도 쉽게 사멸되지 않고 특히 10 kGy의 감마선 조사에서도 1 log, 40 kGy의 조사선량에서 1 log CFU/mL 이상의 생존율을 나타내는 방사선 저항 세균이다. 이러한 방사선 저항 세균인 M. roseus를 광펄스 살균을 통해 살균 가능성을 알아보았다. M. roseus는 빛의 세기가 증가함에 따라 사멸율이 증가하는 경향을 나타냈으며, 1,000 V의 빛의 세기에서 3분 처리 후에 6.4 log의 감소효과를 보였고 tailing 현상을 보이지 않았다. 빛의 세기와 처리시간을 같이 한 조건에서는 단위 시간동안 펄스 수가 높을수록 살균율이 높아졌으며, 10 pps에서는 2분의 처리로 모든 균이 사멸하였다. 또한 광원과 시료사이의 거리는 가까울수록 사멸율이 증가하는 경향을 보였다. 이러한 연구 결과로 볼 때 광펄스 살균이 향후 김의 위생적 처리의 방법의 하나로 가능성이 있을 것으로 예측된다.

• 미생물학회지
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• 제27권3호
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• pp.297-303
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• 1989

Attempts to isolate the naturally occurring ultra-violet resistant bacteria from environmental sources were made. The isolates, designated No.29, 100, and 107, among numbers of bacterial isolates revealed a remarkable resistance to UV ray, whose degree of resistance in dose/response kinetics was comparable to that of an endospore-former, Bacillus subtilis. In a range of 100-300 $Jm^{-2}$/min of UV irradiation, the isolates exhibited 500-1000 fold resistance compated with E. coli. The isolated appeared to possiss cell-bound pigment of organge or crimson-red. The isolate 29 is spherical in pairs or tetrads, whereas the isolates 100 and 107 are rod. All are Gram-gositive bacteria and seemed to be non-endospore-bearer. A number of biochemical studies pursued on the isolates suggested that they are quite different to each other. Electron microscopic examination and the physiological characters of the isolate 29 suggested that this UV resistant spherical bacterium might be one species of Deinococcus, probably Deinococus radiophilus. Since there is no documents on UV resistant, Gram-positive, non-sporeformer bacillus so far, the isolates 100 and 107 might be turned out as new kinds of UV resistant bacteria occurring in nature by further investigation.

• 미생물학회지
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• 제54권1호
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• pp.84-86
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• 2018

이 연구에서는 5 kGy 의 감마선에 조사된 토양으로부터 분리된 Deinococcus puniceus $DY1^T$의 완전한 게놈서열을 분석하였다. 이 균주는 UVC 와 감마선에 대한 저항성을 보였으며, PacBio RS II platform 을 통해 시퀀싱을 진행하였다. 해당유전체의 분석결과 G + C 함량이 62.5%인 2,971,983 bp 크기의 원형 염색체를 확인하였으며, 해당 염색체는 2,617 개의 코딩 서열과 2,762 개의 유전자 그리고 88 개의 위유전자를 포함하고 있다.

• 미생물학회지
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• 제54권1호
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• pp.87-89
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• 2018

Flavisolibacter tropicus $LCS9^T$은 한국 중서부에 위치한 서천 국립생태원 에코리움 내 열대관 토양에서 분리되었다. 이 연구에서 G + C 함량이 41.5%인 5,940,863 bp 의 원형 염색체로 구성된 Flavisolibacter tropicus $LCS9^T$ 의 완전한 게놈서열을 분석하였다. 이 완전한 게놈서열은 5,075 개의 유전자, 337개의 위유전자 그리고 59 개의 rRNA 유전자를 포함하고 있다. 유전체 특징은 감마선 및 UVC 에 대응하는 주요 효소를 포함하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제21권6호
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• pp.574-581
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• 2011

A Gram-positive bacterium was isolated from the saline soils of Jangpura (U.P.), India, and showed high-level of radiation-resistant property and survived upto 12.5 kGy dose of gamma radiation. The 16S rDNA sequence of this strain was examined, identified as Bacillus sp. strain HKG 112, and was submitted to the NCBI GenBank (Accession No. GQ925432). The mechanism of radiation resistance and gene level expression were examined by proteomic analysis of whole-cell extract. Two proteins, 38 kDa and 86.5 kDa excised from SDS-PAGE, which showed more significant changes after radiation exposure, were identified by MALDI-TOF as being flagellin and S-layer protein, respectively. Twenty selected 2-DE protein spots from the crude extracts of Bacillus sp. HKG 112, excised from 2- DE, were identified by liquid chromatography mass spectrometry (LC-MS) out of which 16 spots showed significant changes after radiation exposure and might be responsible for the radiation resistance property. Our results suggest that the different responses of some genes under radiation for the expression of radiation-dependent proteins could contribute to a physiological advantage and would be a significant initial step towards a fullsystem understanding of the radiation stress protection mechanisms of bacteria in different environments.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권12호
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• pp.1637-1646
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• 2010

The bacterium Deinococcus radiodurans is one of the most resistant organisms to ionizing radiation and other DNA-damaging agents. Although, at present, 30 Deinococcus species have been identified, the whole-genome sequences of most species remain unknown, with the exception of D. radiodurans (DRD), D. geothermalis, and D. deserti. In this study, comparative genomic hybridization (CGH) microarray analysis of three Deinococcus species, D. radiopugnans (DRP), D. proteolyticus (DPL), and D. radiophilus (DRPH), was performed using oligonucleotide arrays based on DRD. Approximately 28%, 14%, and 15% of 3,128 open reading frames (ORFs) of DRD were absent in the genomes of DRP, DPL, and DRPH, respectively. In addition, 162 DRD ORFs were absent in all three species. The absence of 17 randomly selected ORFs was confirmed by a Southern blot. Functional classification showed that the absent genes spanned a variety of functional categories: some genes involved in amino acid biosynthesis, cell envelope, cellular processes, central intermediary metabolism, and DNA metabolism were not present in any of the three deinococcal species tested. Finally, comparative genomic data showed that 120 genes were Deinococcus-specific, not the 230 reported previously. Specifically, ddrD, ddrO, and ddrH genes, previously identified as Deinococcus-specific, were not present in DRP, DPL, or DRPH, suggesting that only a portion of ddr genes are shared by all members of the genus Deinococcus.

• 미생물학회지
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• 제46권3호
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• pp.308-312
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• 2010

대표적인 중호열성 방사선저항성 미생물인 Deinococcus geothermalis에는 다른 Deinococcus 속과 비교해 당대사 작용에 관여하는 유전자가 풍부하게 존재하는 특징이 있다. 본 연구에서는 D. geothermalis를 이용하여 xylan의 최적 분해조건을 확인하였고, beechwood xylan, birchwood xylan 및 oat spelt xylan의 최종 분해산물을 HPLC를 이용하여 분석하였다. 기질의 종류에 따른 당화율을 비교한 결과 beechwood xylan, birchwood xylan 그리고 oat spelt xylan 순서로 당화율이 높게 나타났다. D. geothermalis를 이용한 xylan의 최적 분해조건인 $40^{\circ}C$, pH 8.0 그리고 마그네슘 이온을 첨가하였을 때 당화율이 7.5배 증가하였다. Beechwood xylan과 birchwood xylan의 최종 분해산물은 xylose, xylobios, xylotriose, xylotetraose, xylopentaose, 그리고 xylohexalose였으며, xylose의 함량이 가장 높았다. 또한 oat seplt xylan의 최종 분해산물은 xylose, xylopentaose 그리고 xylohexalose가 생성되었다. Xylan의 효율적인 당화를 위하여 전처리 방법으로서 방사선조사를 하였고, 방사선조사 후 D. geothermalis에 의한 beechwood xylan, birchwood xylan 그리고 oat spelt xylan의 당화율이 증가하였다. 본 연구를 통하여 D. geothermalis 및 방사선을 이용한 전처리 방법이 xylooligosaccharides를 생산하는데 유용함을 확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제44권3호
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• pp.169-177
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• 2008

대표적인 방사선저항성 미생물인 Deinococcus radiodurans의 구리이온($CuCl_2,250{\mu}M$)에 대한 발현체 분석을 DNA microarray를 이용하여 수행하였다. 총 3,187개의 open reading frame중 70개의 유전자 발현이 2배 이상증가(64개) 또는 감소(6개)하였다. 이들 중 흥미롭게도 철이온 흡수 관련 유전자들로 추정되는 두 개 operon ($DRB0014{\sim}DRB0017$과 $DRB0121{\sim}DRB0125$)의 발현이 가장 높게 증가하였다. 두 operon의 첫 번째 유전자인 DRB0014와DRB0125의 발현을 실시간 정략 PCR을 이용하여 분석한 결과, 두 유전자 모두 구리 이온($CuCl_2,250{\mu}M$) 또는 철이온 킬레이트화합물(2,2'-dipyridyl, $ 250{\mu}M$)을 첨가하였을 경우 발현이 10배 이상 증가하였으나 철이온($FeCl_3,250{\mu}M$) 또는 구리 이온 킬레이트화합물(bathocuproine disulphonate, $250{\mu}M$)이 존재할 때에는 발현이 변화하지 않았다. 따라서 D. radiodurans의 구리 대사는 철 흡수 시스템과 관련이 있는 것으로 추정된다. 그러나 DRB0014와DRB0125의 변이는D. radiodurans의 구리 저항성 및 방사선 저항성에 큰 영향을 미치지 않는 것으로 관찰되었다.