• 생물환경조절학회지
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• 제17권1호
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• pp.9-13
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• 2008

본 연구는 고추냉이 수경재배시 유리온실내 무차광, 10, 30, 70% 차광률이 고추냉이 생육 및 광합성 특성에 미치는 영향을 조사하였다. 광도가 증가할수록 엽록소 형광특성 ETR은 함께 증가하였으며, 무차광, 10%, 30%차광간의 차이가 없었으나, 70%차광 처리구는 다른 처리구에 비해 현저히 낮게 나타났다. Yield와 qP는 광도 증가와 함께 감소하였으며, 70% 차광 처리구에서 감소폭이 컸다. 광합성과 기공전도도는 10%차광에서 가장 높았으며, 증산율은 무차광 처리구에서 가장 낮게 나타났다. 고추냉이 엽면적과 생장량은 10%차광에서 가장 높았으며, 엽수는 무차광에서 가장 많고 차광률이 증가할수록 감소하였다. 엽장, 엽폭은 무차광, 10-30% 차광간에 유의적인 차이가 없었으나, 엽병장은 무차광에서 유의적으로 감소하였다. 뿌리의 생장은 70% 차광을 제외하고 처리간에 큰 차이가 없었다. 70% 차광에서 고추냉이 잎과 뿌리의 생장이 현저히 감소하였다 고추냉이를 11월에 정식하여 순환식 담액수경 방식으로 5개월간 재배한 결과 시설내의 차광률은 엽중, 엽병중, 엽면적과 광합성 특성 등을 고려할 때 10% 차광($700{\mu}molm^{-2}s^{-1}$)이 잎 생산에 적합하였다.

• Molecules and Cells
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• 제41권3호
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• pp.224-233
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• 2018

Primary cilia are solitary, non-motile, axonemal microtubule-based antenna-like organelles that project from the plasma membrane of most mammalian cells and are implicated in transducing hedgehog signals during development. It was recently proposed that aberrant SHH signaling may be implicated in the progression of idiopathic pulmonary fibrosis (IPF). However, the distribution and role of primary cilia in IPF remains unclear. Here, we clearly observed the primary cilia in alveolar epithelial cells, fibroblasts, and endothelial cells of human normal lung tissue. Then, we investigated the distribution of primary cilia in human IPF tissue samples using immunofluorescence. Tissues from six IPF cases showed an increase in the number of primary cilia in alveolar cells and fibroblasts. In addition, we observed an increase in ciliogenesis related genes such as IFT20 and IFT88 in IPF. Since major components of the SHH signaling pathway are known to be localized in primary cilia, we quantified the mRNA expression of the SHH signaling components using qRT-PCR in both IPF and control lung. mRNA levels of SHH, the coreceptor SMO, and the transcription factors GLI1 and GLI2 were upregulated in IPF compared with control. Furthermore, the nuclear localization of GLI1 was observed mainly in alveolar epithelia and fibroblasts. In addition, we showed that defective KIF3A-mediated ciliary loss in human type II alveolar epithelial cell lines leads to disruption of SHH signaling. These results indicate that a significant increase in the number of primary cilia in IPF contributes to the upregulation of SHH signals.

• 생명과학회지
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• 제14권5호
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• pp.847-854
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• 2004

알러지는 복합적인 유전적, 환경적 요인에 의해 발병하는 질환이다. 선진국에서 알러지 질환의 수가 증가함에 따라 알러지에 대한 관심이 증가하고 있으며 이에 대한 유전적인 원인에 대한 관심도 증가하고 있다. 알러지에는 천식, 아토피, 비염을 포함한 알러지에 관련된 유전자와 염색체 부위가 밝혀지고 있다. 하지만 이들에 대한 평가 및 확인이 제대로 진행되지 않는 상황이다. 본 연구팀은 알러지를 일으키는 유전적인 요인을 찾고자 하였다. 과학영재학교 138명을 대상으로 하였고 이들 중 약 30%가 천식, 아토피, 비염과 같은 알러지 질환을 앓고 있었다. 본 연구팀은 지금까지 보고된 연구 결과들을 토대로 알러지에 관련된 유전자를 찾았으며 그중 알러지를 일으키는데 관여하는 IL-4와 IL-4Ra를 후보 유전자로 선정하였다. 지금까지 발표된 보고들은 SNP의 발견과 그리고 하나 혹은 두개의 SNP에 초점을 맞추어 발표한 반면, 본 연구팀은 알러지와 관련하여 발표된 IL-4와 IL-4Ra의 SNP를 종합적으로 분석하고자 하였다 과학영재학교 학생들 96명을 머리카락 샘플을 확보하고 이 것으로 9개 의 SNP를 선정 하여 염기서열 분석 및 MALDI-TOF을 이용한 유전자 분석을 진행하였다. 각각의 SNP에 대해 알러지를 가지고 있는 그룹과 정상 그룹간의 약간의 차이들은 있었지만 이것이 알러지를 가지고 있는 사람과 정상인과의 구분을 시켜줄 수 있을 정도는 아니었다. 이러한 결과는 현재 한국에서 널리 행하여지고 있는 유전자 검사에 대한 재고가 필요함을 시사한다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제15권7호
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• pp.957-962
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• 2002

In July, three trials were conducted to evaluate the best sponge type and optimum PMSG dose to be administered to sheep under the Jordanian Badia (arid) conditions. In trial 1, three flocks (n=77, n=18 and n=47 for flocks 1, 2 and 3, respectively) were administered with 40 mg fluorogestone acetate (FGA) intravaginal sponges for 12 days before receiving 600 IU of PMSG at the time of sponge removal. In trial 2, 95 ewes were assigned to 4 groups to receive 300 (n=25), 450 (n=27), 600 (n=22) or 750 (n=21) IU of PMSG following a 12 d FGA 40 mg sponge insertion period. In trial 3, 60 ewes were assigned to 3 groups (n=20) to receive either FGA 30 mg, FGA 40 mg or medroxyprogesterone acetate (MAP) 60 mg intravaginal sponges all followed by an administration of 600 IU of PMSG at sponge removal. In all trials, rams were isolated 1 day before sponge insertion and were allowed back with the ewes at sponge removal. Estrual responses and lambing data were collected. The effects of treatment, milking status and face color on estrual responses and lambing data were examined. In trial 1, greater first cycle conception rate (p<0.05), twinning rate (p<0.01) and the number of lambs born/served ewe (p<0.01) were observed in flock 2 compared with flocks 1 and 3. Neither face color nor milking status had any influence on the measured parameters (p>0.05). Despite low lambing rate in trial 2, ewes receiving 600 IU of PMSG had greater (p<0.05) number of lambs born/served ewe compared with ewes receiving 450 IU of PMSG. Regardless of PMSG dose, intervals to detected estrus occurred 10 h earlier (p<0.01) in dry than lactating ewes. Similar to trial 2, lambing rate was depressed in trial 3. The expression of estrus was advanced (p<0.05) in ewes receiving MAP 60 mg sponges compared with those receiving FGA 30 and FGA 40 mg sponges (42$\pm$3.1, 49$\pm$3.1 and 49$\pm$3.1 h post sponge removal in ewes receiving MAP 60 mg, FGA 30 mg and FGA 40 mg sponges, respectively). Other parameters were not influenced (p>0.05) by sponge type, milking status and face color. Data show that a 600 IU dose of PMSG tends to give the best lambing results. In addition, results indicate that the use 60 mg MAP sponges for estrus synchronization may be more appropriate under the Jordanian Badia conditions during late seasonal anestrus.

• 대한토목학회논문집
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• 제31권5B호
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• pp.405-414
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• 2011

본 연구에서는 유역에서 관측되는 강우량과 유출량의 시계열 자료를 바탕으로 최근 시계열 예측 및 시스템 제어 분야에서 성공적으로 적용되고 있는 적응형 네트워크 기반 퍼지추론 시스템(ANFIS)을 갑천 유역에 적용하여 시유출량을 모델링하였다. 입력구조, 소속함수 종류와 개수 등을 다양하게 변화시켜 ANFIS 모형을 학습하고, 평균제곱근오차(RMSE), 평균첨두유량오차(PE) 및 평균첨두시간오차(TE)를 이용하여 ANFIS의 유출해석에 대한 적용성을 평가하였다. 현재시간의 시유출량 Q(t)에 대한 ANFIS의 적용성은 우수한 것으로 평가되었으며, ANFIS 모형은 관측유출량을 적절히 모의하였다. 입력구조가 다른 입력모형을 구성하여 최대 8시간까지 ANFIS의 유출예측 적용성을 평가하였다. 예측시간 증가에 따라서 ANFIS의 유출예측 정확도는 감소하여 예측시간 4시간 이상의 시유출량에 대한 ANFIS의 유출예측 적용성은 제한적이었다. ANFIS는 입력과 출력 자료들만 이용하므로 물리기반 모형에 비교하여 모형구축이 비교적 손쉽기 때문에 홍수 유출모델링에 ANFIS을 유용하게 적용할 수 있을 것으로 판단된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제31권10호
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• pp.1581-1590
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• 2018

Objective: The aim of this study was to clone alternative splicing isoforms of pig myoneurin (MYNN), predict the structure and function of coding protein, and study temporal and spatial expression characteristics of each transcript. Methods: Alternative splice isoforms of MYNN were identified using RNA sequencing (RNA-seq) and cloning techniques. Quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) was employed to detect expression patterns in 11 tissues of Large White (LW) and Mashen (MS) pigs, and to study developmental expression patterns in cerebellum (CE), stomach (ST), and longissimus dorsi (LD). Results: The results showed that MYNN had two alternatively spliced isoforms, MYNN-1 (GenBank accession number: KY470829) and MYNN-2 (GenBank accession number: KY670835). MYNN-1 coding sequence (CDS) is composed of 1,830 bp encoding 609 AA, whereas MYNN-2 CDS is composed of 1,746 bp encoding 581 AA. MYNN-2 was 84 bp less than MYNN-1 and lacked the sixth exon. MYNN-2 was found to have one $C_2H_2$ type zinc finger protein domain less than MYNN-1. Two variants were ubiquitously expressed in all pig tissues, and there were significant differences in expression of different tissues (p<0.05; p<0.01). The expression of MYNN-1 was significantly higher than that of MYNN-2 in almost tissues (p<0.05; p<0.01), which testified that MYNN-1 is the main variant. The expression of two isoforms decreased gradually with increase of age in ST and CE of MS pig, whereas increased gradually in LW pig. In LD, the expression of two isoforms increased first and then decreased with increase of age in MS pig, and decreased gradually in LW pig. Conclusion: Two transcripts of pig MYNN were successfully cloned and MYNN-1 was main variant. MYNN was highly expressed in ST, CE, and LD, and their expression was regular. We speculated that MYNN plays important roles in digestion/absorption and skeletal muscle growth, whereas the specific mechanisms require further elucidation.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제18권10호
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• pp.707-716
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• 2017

디스플레이 기기들이 고도화 되면서, 사용자의 목적에 부합하는 영상이 요구되어져 가고 있다. 따라서, 3D 디스플레이에서 필요하게 되는 깊이 정보가 요구될 때 디스플레이 기기들은 객체 기반의 영상 정보를 제공 할 수 있어야 한다. 따라서, 본 논문에서 깊이 정보 생성을 위한 히스토그램 기반의 영상분할 알고리즘을 제안한다. 기존의 K 군집 알고리즘에서 군집의 수를 파라미터화 하여, 영상에 적응적으로 군집 수를 결정할 수 없게 되는 한계를 지닌다. 또한, k 군집 알고리즘이 지니고 있던 지역 최소점에 빠져 영상 분할에 있어 과분할을 야기하는 지역 최소점에 빠지게 되는 경향이 있다. 반면에, 제안하는 알고리즘은 분할해야할 군집 선정에서 계산량을 고려하여 적응적으로 선택 가능할 수 있게 하는 히스토그램 기반의 알고리즘을 설계하여 적응적으로 선택 가능하게 하였다. 기존 알고리즘이 가지고 있었던 지역 최소점에 빠지지 않도록 방지하게 하여 결과 영상에서 객체 기반의 결과를 보여줄 수 있도록 설계 했다. 이 후 연결요소 알고리즘을 통해 과분할 요소를 제거했다. 따라서, 제안하는 알고리즘은 객체 기반의 깊이 정보 결과를 보여 줄 뿐만 아니라, 벤치마크 방법에 비해 확률 랜드 인덱스, 분할 커버링 측면에서도 각각 벤치마크 방법에 비해 0.017, 0.051으로 향상된 결과치를 보여준다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제32권4호
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• pp.321-328
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• 2016

We examined the effects of temperature on acquisition of Potato virus Y-O (PVY-O), Potato virus A (PVA), and Potato leafroll virus (PLRV) by Myzus persicae by performing transmission tests with aphids that acquired each virus at different temperatures. Infection by PVY-O/PVA and PLRV increased with increasing plant temperature in Nicotiana benthamiana and Physalis floridana, respectively, after being transmitted by aphids that acquired them within a temperature range of $10-20^{\circ}C$. However, infection rates subsequently decreased. Direct qRT-PCR of RNA extracted from a single aphid showed that PLRV infection increased in the $10-20^{\circ}C$ range, but this trend also declined shortly thereafter. We examined the effect of temperature on establishment of virus infection. The greatest number of plants became infected when N. benthamiana was held at $20^{\circ}C$ after inoculation with PVY-O or PVA. The largest number of P. floridana plants became infected with PLRV when the plants were maintained at $25^{\circ}C$. PLRV levels were highest in P. floridana kept at $20-25^{\circ}C$. These results indicate that the optimum temperatures for proliferation of PVY-O/PVA and PLRV differed. Western blot analysis showed that accumulations of PVY-O and PVA coat proteins (CPs) were lower at $10^{\circ}C$ or $15^{\circ}C$ than at $20^{\circ}C$ during early infection. However, accumulation increased over time. At $25^{\circ}C$ or $30^{\circ}C$, the CPs of both viruses accumulated during early infection but disappeared as time passed. Our results suggest that symptom attenuation and reduction of PVY-O and PVA CP accumulation at higher temperatures appear to be attributable to increased RNA silencing.

• 한국해양학회지:바다
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• 제6권3호
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• pp.190-200
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• 2001

인천 동춘동 척전 갯벌 저서동물의 군집구조를 알아보기 위하여 3개의 정점을 대상으로 1990년 9월부터 1992년 7월까지 2개년동안 격월별로 현장조사를 실시하였다. 조사 기간 중 총 111종, 평균 708.1 개체/$m^2$와 214.9 gWWt/$m^2$의 저서동물이 채집되었다. 출현 종 수와 개체수에 있어서는 환형동물의 다모류가, 생물량에 있어서는 연체동물과 극피동물이 대표적인 분류군이었다. 조위에 따른 저서동물의 출현 경향은 종 수와 개체수는 갯벌의 하부로 갈수록 뚜렷하게 증가하는 결과를 보였고, 생물량은 갯벌의 중부에서 가장 높았다. 척전 갯벌의 집괴분석 결과에 의하면, 3개의 정점군과 4개의 종군으로 구분할 수 있었다. 정점군은 조위에 따라 상부, 중부 그리고 하부 정점 그룹으로 나뉘었고, 종군은 다음과 같았다: 1) 중하부 광역분포 종군으로 Heteromastus filifomis-Mactra veneriformis-Solen strictus-Ilyoplax finggi 군집, 2) 상부 분포 종군으로 Nephtys chemulpoensis-Macrophthalmus gaponicus 군집, 3) 중부 분포 종군으로 Glycera subaenea-Decorifer matusimana-Tritodynamia 군집 ,4)하부 분포 종군으로 Nephtys polybranchia-Borniopsis tsurumaru-Asthenognathus inaequipes-Protankyra bidentata 군집으로 구분되었다.

• Genomics & Informatics
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• 제9권4호
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• pp.152-160
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• 2011

Hypertension is the major factor of most death and high blood pressure (BP) can lead to stroke, myocardial infarction and cardiac failure. Moreover, hypertension is strongly correlated with body mass index (BMI). Although the exact causes of hypertension are still unclear, some of genetic loci were discovered from genome-wide association study (GWAS). Therefore, it is essential to study genetic variation for finding more genetic factor affecting hypertension. The purpose of our study is to conduct a CNV association study for hypertension-related traits, BP and BMI, in Korean individuals. We identified 2,206 CNV regions from 3,274 community-based Korean participants using the Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 platform and performed a logistic regression analysis of CNVs with two hypertension-related traits, BP and BMI. Moreover, the 4,692 participants in an independent cohort were selected for respective replication analyses. GWAS of CNV identified two loci encompassing previously known hypertension-related genes: LPA (lipoprotein) on 6q26, and JAK2 (Janus kinase 2) on 9p24, with suggestive p-values (0.0334 for LPA and 0.0305 for JAK2 ). These two positive findings, however, were not evaluated in the replication stage. Our result confirmed the conclusion of CNV study from the WTCCC suggesting weak association with common diseases. This is the first study of CNV association study with BP and BMI in Korean population and it provides a state of CNV association study with common human diseases using SNP array.