• 제목/요약/키워드: profiling.

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Application of metabolic profiling for biomarker discovery

  • Hwang, Geum-Sook
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 2007년도 Proceedings of The Convention
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    • pp.19-27
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    • 2007
  • An important potential of metabolomics-based approach is the possibility to develop fingerprints of diseases or cellular responses to classes of compounds with known common biological effect. Such fingerprints have the potential to allow classification of disease states or compounds, to provide mechanistic information on cellular perturbations and pathways and to identify biomarkers specific for disease severity and drug efficacy. Metabolic profiles of biological fluids contain a vast array of endogenous metabolites. Changes in those profiles resulting from perturbations of the system can be observed using analytical techniques, such as NMR and MS. $^1H$ NMR was used to generate a molecular fingerprint of serum or urinary sample, and then pattern recognition technique was applied to identity molecular signatures associated with the specific diseases or drug efficiency. Several metabolites that differentiate disease samples from the control were thoroughly characterized by NMR spectroscopy. We investigated the metabolic changes in human normal and clinical samples using $^1H$ NMR. Spectral data were applied to targeted profiling and spectral binning method, and then multivariate statistical data analysis (MVDA) was used to examine in detail the modulation of small molecule candidate biomarkers. We show that targeted profiling produces robust models, generates accurate metabolite concentration data, and provides data that can be used to help understand metabolic differences between healthy and disease population. Such metabolic signatures could provide diagnostic markers for a disease state or biomarkers for drug response phenotypes.

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전자상거래 개인화 추천을 위한 상품 카테고리 중립적 사용자 프로파일링 (Cross-Product Category User Profiling for E-Commerce Personalized Recommendation)

  • 박수환;이홍주;조남재;김종우
    • Asia pacific journal of information systems
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    • 제16권3호
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    • pp.159-176
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    • 2006
  • Collaborative filtering is one of the popular techniques for personalized recommendation in e-commerce. In collaborative filtering, user profiles are usually managed per product category in order to reduce data sparsity. Product diversification of Internet storefronts and multiple product category sales of e-commerce portals require cross-product category usage of user profiles in order to overcome the cold start problem of collaborative filtering. In this paper, we study the feasibility of cross-product category usage of user profiles, and suggest a method to improve recommendation performance of cross-product category user profiling. First, we investigate whether user profiles on a product category can be used to recommend products in other product categories. Furthermore, a way of utilizing user profiles selectively is suggested to increase recommendation performance of cross-product category user profiling. The feasibility of cross-product category user profiling and the usefulness of the proposed method are tested with real click stream data of an Internet storefront which sells multiple product categories including books, music CDs, and DVDs. The experiment results show that user profiles on a product category can be used to recommend products in other product categories. Also, the selective usage of user profiles based on correlations between subcategories of two product categories provides better performance than the whole usage of user profiles.

Reflow Profiling The Benefits of Implementing a Ramp-to-Spike Profile

  • AIM
    • 한국마이크로전자및패키징학회:학술대회논문집
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    • 한국마이크로전자및패키징학회 2000년도 Proceedings of 5th International Joint Symposium on Microeletronics and Packaging
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    • pp.17-17
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    • 2000
  • The issue of reflow profiling continues to be a complex topic. The pains often associated with profiling can be reduced greatly if certain guidelines are followed and if there is a strong understanding of the variables that can be encountered during the reflow process. This paper shall discuss the appropriate guidelines and trouble shooting methods for reflow profiling, and in particular shall focus upon the benefits of implementing the linear ramp-to-spike profile. Delta T(T) is defined as the variation of temperature found on an assembly during the reflow process. Too large of a T can result in soldering defects, so to combat T a Ramp-Soak-Spike(RSS) reflow profile often is utilized. However, when using a newer-style reflow oven, the T often is minimized or eliminated, thus, the soak zone of the reflow profile becomes an unnecessary step. Because of this, the implementation of a linear Ramp-To-Spike(RTS) reflow profile should be considered. Benefits such as reduced energy costs, reduced solder defects, increased efficiency, improved wetting, and a simplification of the reflow profile process may be experienced when using the RTS profile. Included in this paper are the suggested process parameters for setting up the RSS and RTS profiles and the chemical and metallurgical reactions that occur at each set point of these profiles. The paper concludes with a discussion and pictures of several profile-related defects. Each of these defects is described, analyzed, and instructions are given for troublshooting these defects.

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인용 이미지 구축자 프로파일링을 이용한 국내 여성학 분야 연구 전선 분석 (Analyzing the Research Fronts of Women's Studies in Korea Using Citation Image Makers Profiling)

  • 김조아;이재윤
    • 정보관리학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.201-225
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    • 2016
  • 학제적 분야의 연구 전선을 분석하는 새로운 기법으로 인용 이미지 구축자 프로파일링 기법을 제안하였다. 인용 이미지 구축자 프로파일링은 해당 문헌을 인용한 문헌의 표제어를 단서로 사용하여 문헌 간의 주제관계를 파악하는 방법이다. 이 연구에서는 시험적으로 국내 여성학 연구를 대상으로 인용 이미지 구축자 프로파일링 기법을 적용하여 연구 전선과 주요 연구 주제를 파악해보았다. 분석 대상은 KCI의 2015년 기준 여성학분야 인용빈도 10회 이상에 해당하는 핵심문헌 집합이다. 여성학 분야에 문헌동시인용 기법을 적용한 결과 인용 데이터 부족 때문에 어려움이 있었던 반면에, 인용 이미지 구축자 프로파일링 기법을 적용한 결과 성공적으로 2개 대분야 및 6개 소분야를 파악할 수 있었다. 이 연구에서 제안한 인용 이미지 구축자 프로파일링 기법은 학제적 연구분야의 동향을 파악하는데 기여할 수 있을 것으로 기대된다.

스미싱 범죄 프로파일링 모델 설계 (Designing SMS Phishing Profiling Model)

  • 정영호;이국헌;이상진
    • 정보보호학회논문지
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    • 제25권2호
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    • pp.293-302
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    • 2015
  • 스미싱 범죄 피해 사례에서 수집할 수 있는 공격정보들을 이용하여, 범죄수사에 사용하는 프로파일링 기법을 응용한 스미싱 범죄 프로파일링 모델을 제안한다. 기존에 수사기관에서는 apk 파일의 해시를 이용한 시그니처 분석과 코드 내 삽입된 C&C IP 분석방법을 사용하였으나, 시그니처의 다변화와 코드 난독화로 인해 그 활용도가 낮아졌다. 실제 수사기관에 접수된 169건의 피해사례의 분석을 통해, apk 파일 내 인증서 파일 일련번호의 재사용이 151건(89%), 퍼미션 파일의 재사용은 136건(80%)에 달한다는 점에 착안, 인증서 파일의 일련번호와 퍼미션 파일의 해시를 중심으로 한 스미싱 프로파일링 모델을 설계하여 범죄를 군집화하여 기존의 해시 기반 군집화 방법을 보완하였고, 코드 유사도 검증을 통하여 추가로 신뢰성을 확보하였다.

Ethyl Acetate와 Methanol을 이용한 블루베리 추출물 대사체 분석 (Metabolomic Analysis of Ethyl Acetate and Methanol Extracts of Blueberry)

  • 조영희;김수경;권다애;이홍진;최형균;어중혁
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.419-424
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    • 2014
  • 본 연구에서는 LC-MS/MS를 이용한 블루베리의 methanol과 ethyl acetate 추출 분획에 존재하는 대사체의 분석을 통해 효율적인 대사체 profiling의 가능성을 탐색하였다. LC-MS/MS에서 검출되는 대사체를 통계 처리한 결과, methanol 추출 분획에서는 5-O-feruloylquinic acid, malvidin hexoside, malvidin-3-arabinoside, petunidin-3-arabinoside, delphinidin hexoside, delphinidin, petunidin hexoside와 같은 안토시아닌 계열의 화합물들이 존재하였고, ethyl acetate 분획에서는 chlorogenic acid, chlorogenic acid dimer, 6,8-di-C-arabinopyranosylluteolin, luteolin과 같은 플라보노이드 계열의 화합물이 검출되었다. 본 연구는 기존 연구와 달리 대사체학 기법을 이용한 블루베리 추출물 전체 대사물질의 profiling을 시도한 최초의 연구로서 블루베리에 함유된 유용 성분의 스크리닝 등 향후 응용 연구에 유용한 기반으로 이용될 수 있을 것으로 기대된다.

Evaluation of MALDI Biotyping for Rapid Subspecies Identification of Carbapenemase-Producing Bacteria via Protein Profiling

  • Somboro, Anou M.;Tiwari, Dileep;Shobo, Adeola;Bester, Linda A.;Kruger, Hendrik G.;Govender, Thavendran;Essack, Sabiha Y.
    • Mass Spectrometry Letters
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    • 제5권4호
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    • pp.110-114
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    • 2014
  • The method of direct mass spectrometry profiling is reliable and reproducible for the rapid identification of clinical isolates of bacteria and fungi. This is the first study evaluating the approach of MALDI-TOF mass spectrometry profiling for rapid identification of carbapenemase-resistant enterobacteriaceae (CRE). Proof of concept was achieved by the discrimination of CRE using MALDI Biotyper MS based on the protein. This profiling appears promising by the visual observation of consistent unique peaks, albeit low intensity, that could be picked up from the mean spectra (MSP) method. The Biotyper MSP creation and identification methods needed to be optimized to provide significantly improved differences in scores to allow for subspecies identification with and without carbapenemases. These spectra were subjected to visual peak picking and in all cases; there were pertinent differences in the presence or absence of potential biomarker peaks to differentiate isolates. We also evaluated this method for potential discrimination between different carbapenemases bacteria, utilizing the same strategy. Based on our data and pending further investigation in other CREs, MALDI-TOF MS has potential as a diagnostic tool for the rapid identification of even closely related carbapenemases but would require a paradigm shift in which Biotyper suppliers enable more flexible software control of mass spectral profiling methods.

교육 프로파일링을 활용한 학생 맞춤형 다차원 분석 시스템 (Student-oriented Multi-dimensional Analysis System using Educational Profiling)

  • 김기봉;신현승
    • 디지털융복합연구
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    • 제14권6호
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    • pp.263-270
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    • 2016
  • 본 논문에서는 교육 분야에 프로파일링을 활용하여 교사가 전문적인 통계 지식을 가지고 있지 않아도 운영이 가능한 성적 맞춤형 통계 분석 시스템을 개발하고자 한다. 이를 위해 프로파일링에 대한 기술을 교육 분야에 융합하여 학생 맞춤형 다차원 분석 시스템을 구축하기 위한 필요 요소들(프로파일링, 빈도/교차/기간별/이항/다항 분석)에 대해 살펴보았다. 실제 교육 프로파일링을 활용한 학생 맞춤형 다차원 분석 시스템을 구축하기 위한 전체 구성도와 구축 상황에 대해 언급하고, 각 통계적 방법을 적용한 알고리즘에 대한 구현 결과를 보였으며, 기존에 존재하는 시스템들과의 차별성과 우월성에 대해 설명하였다. 제안된 기술을 기반으로 시스템이 구축되면 수각자의 요구와 능력의 차이를 고려하여 정확한 목표 및 기준을 명확하게 함으로써, 공교육 만족도 제고를 통해 선행학습 및 사교육비 절감의 효과와 학생 개인의 능력과 적성에 맞는 자기 주도적 학습 실현이 가능하다.

식물 대사체 연구의 진보 (Advances in Plant Metabolomics)

  • 김석원;정회일;유장렬
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제33권3호
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    • pp.161-169
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    • 2006
  • 식물대사체학은 식물세포, 조직, 기관, 혹은 개체수준에서 주어진 시간과 조건에서 발견되는 모든 대사물질을 밝히고, 시간의 경과 혹은 조건의 변화에 따른 metabolic profiling의 변화를 연구하는 식물학 분야이다. 식물대사체학은 생물에 대한 전체론적 접근을 위한 가장 최근에 발달된 omics분야의 하나로서 일종의 시스템 생물학이다. 전체론적 접근과 이해를 위해서 대사체학은 metabolic profiling의 계량화학 혹은 다변량분석 방법을 자주 사용한다. 식물학분야에서 대사체학은 애기장대나 벼와 같은 모델식물에 tag를 도입하여 형질전환시킨 돌연변이체에 대해 DNA microarray와 함께 사용하여 유전자의 기능을 밝히는데 유용하게 사용된다. 본 총설에서는 식물대사체학의 기본 개념과 1H NMR 혹은 FTIR으로 얻은 metabolic profiling의 다변량분석에 대한 실용적인 사용법을 소개하고자 하였다.

약제비 제외가 의원의 진료비 효율성 순위에 영향을 미치는가? (Does Omission of Pharmacy Cost Affect Cost-Efficiency Rankings in Medical Clinics?)

  • 강희정;홍재석
    • 보건행정학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.45-57
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    • 2010
  • Background : If different cost efficiency indexes were informed to the same clinic depending on the inclusion or exclusion of pharmacy cost, it may impair the reliability of provider-profiling system. This study aimed to investigate whether the omission of pharmacy cost affects cost-efficiency rankings in medical clinics. Methods : Data for ambulatory care cost at 23,112 medical clinics were collected from the claims database, which was constructed after review by the Health Insurance Review and Assessment Service (HIRA) of Korea in April 2007. We calculated two types of cost efficiency indexes by inclusion or exclusion of pharmacy cost for a medical clinic. The agreement between the decile rankings of the two indexes was also assessed using the weighted kappa statistic of Landis and Koch. Results : When the cost efficiency index for total cost including pharmacy cost was compared with the index for total cost excluding it, the agreement between the two indexes was only 55%. The agreements between the two indexes were relatively low within specialties which have larger pharmacy volume of total cost and lower correlation between total cost with or without pharmacy cost included than the average level of all the specialties. Conclusion : These results suggest that the omission of pharmacy cost may result in contradictory outcomes that may be confusing to a medical institution and may impair the reliability of provider-profiling systems. It is very important to standardize profiling criteria for the reliability of provider profiling system.