Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
/
2004.04b
/
pp.286-288
/
2004
PPI(Protein-Protein Interaction) 데이터는 생물체 내에서 서로 상호작용하는 단백질(protein)들에 대한 정보이다. 단백질 상호작용은 실제 생체 내에서 어떠한 작용이 일어나게 하는 원인이므로, 많은 생물학자들이 관심을 가지고 연구하고 있으며, 그 결과로 몇몇 데이터베이스가 만들어졌다. 이런 데이터베이스들은 다른 연구자들을 위해 데이터를 공개하고 있지만, 대부분의 데이터베이스가 탭으로 분리된 텍스트 형태로 제공한다. 하지만, 텍스트 형태의 데이터는 사람이 직관적으로 인지할 수 없기 때문에, PPI 데이터를 분석하기 쉬운 그래프 형태로 보여주는 프로그램이 필요하다. 그리고 아직 기능을 모르는 단백질이 많으므로 이를 예측하는 프로그램도 필요하다 본 논문에서는 LEDA를 이용하여 PPI 데이터를 그래프 형태로 표현하며, 이 그래프에 그래프 이론을 적용하여 단백질의 기능을 예측하는 프로그램인 Proteinca에 대해 서술한다.
Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
/
2012.04a
/
pp.923-925
/
2012
대용량 고차원의 생물학 데이터가 매우 빠른 속도로 생산되는 현재, 단순히 고전적인 알고리즘들로는 풀 수 없는 문제들을 맞이하게 되었다. 이러한 문제들의 경우 시스템 생물학의 관점으로 다양한 생물 데이터의 융합을 통하여 접근할 경우 효율적으로 Computational Infeasibility(계산 불가능)를 해결함은 물론 그 해석 및 새로운 정보 획득에 매우 유리하다. 인간 DNA의 고차원 SNP 정보들의 군집화 및 질병 발현 패턴 분석은 그 조합의 수가 입력 데이터의 차원수에 따라 지수적(Exponentially)으로 증가하지만 PPI(단백질 상호작용) 네트워크 정보에 결합하여 필요한 중요부위를 선택적으로 이용할 경우 효율적으로 필요 SNP들의 선택 및 이로 인한 공간 축소가 가능하다.
Journal of the Korean Society of Laryngology, Phoniatrics and Logopedics
/
v.19
no.2
/
pp.128-132
/
2008
Background: Laryngeal contact granuloma is an inflammatory hypertrophic granulation tissue arising at around the vocal process of arytenoid cartilage. Various approaches are currently used for the treatment, but a solid guideline has not been established. Objectives: We aimed to compare the each treatment modality in the hope of suggesting a guideline for the successful management of laryngeal contact granuloma. Method: Eighty-seven treatment cases of 56 patients were analyzed. Cases having recent intubation history were excluded from the study. All patients received vocal hygiene education. Proton pump inhibitors (PPI, N = 33) or H2 receptor antagonists ($H_{2}RA$, N =26) were used as a first-line treatment. Among the non-responders to $H_{2}RA$, 11 cases received PPI as a second-line therapy. Eight cases received botulinum toxin injection and 9 cases had laryngomicrosurgical removal. Results: As an initial therapy, response rate to PPI and $H_{2}RA$ was 60.6% and 38.5% respectively, which was not statistically different (p=0.091). Response rate of PPI as the second-line therapy was 36.3% (p=0.162 when compared to that of first-line PPI therapy). Response rate of Botulinum toxin injection was 75%. All cases of surgical removal recurred in a relatively short period (mean 1.9months). Conclusion: In patients having laryngeal contact granuloma, combined therapy with vocal hygiene education and PPI medication would provide more than 60% of therapeutic response. Botulinum toxin injection is highly effective even in non-responders to antireflux therapy. The only indications of surgery are to resolve diagnostic doubt or to treat acute airway compromise.
Shin, Won Sik;Park, Taehyo;Ahn, Taebong;Chun, HeeDong
Journal of the Korean GEO-environmental Society
/
v.2
no.1
/
pp.103-114
/
2001
Sorption studies were conducted to determine if slow sorption fraction is observed in recent1y deposited organic matter by studying wetland soils explicitly. Sorption characteristics of hydrophobic organic compounds (chlorobenzene and phenanthrene) in recently deposited freshwater marsh soils were determined using a batch sorption procedure. Relative indicators of organic matter age were assessed using several techniques including the ratio of elemental oxygen to carbon in the organic matter. Slow sorption characteristics for both surface marsh soil (top 0-2 cm, <5 years old) and deeper marsh soil (below 10-cm, >20 years old) were compared against relatively older PPI (Petro Processors, Inc. Superfund site) and BM (Bayou Manchac) soils to investigate whether soil age can cause differences in sorption of organic compounds in wetland soils. Increases in sorption non-linearity of slow sorption model parameters (increase in KF and decrease in N) explain the existence of slow sorption fraction. The results of slow sorption model indicates the presence of a sizable slow sorption fraction; 25.4 - 26.3% (chlorobenzene) and 1.4 - 1.9% (phenanthrene) of the sorbed mass in wetland soils and 40.0 - 55.93% (chlorobenzene) and 2.9 - 3.19% (phenanthrene) of the sorbed mass in PPI and BM soils, respectively. The slow sorption fraction increased in the order of surface < deeper < PPI < BM soil indicating that size of the slow sorption fraction increases with soil organic matter age.
With explosively growing PPI databases, the computational approach for a prediction and configuration of PPI network has been a big stream in the bioinformatics area. Recent researches gradually consider physicochemical properties of proteins and support high resolution results with integration of experimental results. With regard to current research trend, it is very close future to complete a PPI network configuration of each organism. However, direct applying the PPI network to real field is complicated problem because PPI network is only a set of co-expressive proteins or gene products, and its network link means simple physical binding rather than in-depth knowledge of biological process. In this paper, we suggest a protein functional flow model which is a directed network based on a protein functions' relation of signaling transduction pathway. The vertex of the suggested model is a molecular function annotated by gene ontology, and the relations among the vertex are considered as edges. Thus, it is easy to trace a specific function's transition, and it can be a constraint to extract a meaningful sub-path from whole PPI network. To evaluate the model, 11 functional flow models of Homo sapiens were built from KEGG, and Cronbach's alpha values were measured (alpha=0.67). Among 1023 functional flows, 765 functional flows showed 0.6 or higher alpha values.
This study investigated gender differences in contribution of antisocial personality and affective empathy to psychopathy. Two hundred fifteen college students (male, 118; female,97) completed three measures including the PPI-R(Psychopathic Personality Inventory-Revised), the PAI-ANT(Personality Assessment Inventory-Antisocial Features), and the EETS (Emotional Empathy Tendency Scale). According to the results, the mean scores of PPI-R and EETS in male group were higher than in female group. Antisocial features were positively associated with psychopathy in both male and female groups and negatively with affective empathy. Males showed that the scores of affective empathy were negatively associated with those of antisocial features and psychopath. Females showed that the scores of affective empathy were negatively associated with those of antisocial personality and psychopathy but the correlation was significant only with the scores of antisocial behavior (ANT-A). To scrutinize the differences between male and female groups, the scores on the PAI and EETS were compared between 30% upper and 30% lower groups based on the scores of the PPI-R. According to the results, the upper group of the scores on the PPI had higher scores on the PAI and lower scores on the EETS. The differences of the scores on the EETS between high-psychopathy and low-Psychopathy groups were bigger in male group than in female group. Explanations and implications of the results were discussed and the directions of the future studies were suggested.
The fact that long-term use of proton pump inhibitors (PPIs) aggravates corpus atrophic gastritis in patients with Helicobacter pylori infection has been proven clinically and experimentally. Corpus atrophic gastritis is a known risk factor for gastric cancer. Therefore, gastric neoplasia might be associated with the long-term use of PPIs. One of the causes of worsening corpus atrophic gastritis, leading to the development of adenocarcinoma, might be bacterial overgrowth under conditions of hypochlorhydria. The production of potentially carcinogenic N-nitrosocompounds by nitrosating organisms under conditions of hypochlorhydria might be associated with carcinogenesis. Interactions between bile acids, pH, and H. pylori might also contribute to carcinogenicity, especially in patients with gastro-esophageal reflux disease (GERD). The concentration of soluble bile acids, which have bactericidal or chemorepellent properties toward H. pylori, in gastric contents is considerably higher in patients undergoing continuous PPI therapy than in healthy individuals with normal acid production. Under these circumstances, H. pylori might colonize the stomach body rather than the pyloric antrum. Hypergastrinemia induced by PPI administration might promote the development of gastric cancer. Because the main cause of corpus atrophic gastritis is H. pylori infection, and not PPI administration, H. pylori infection should be eradicated before starting long-term PPI therapy.
Purpose: Proton-pump inhibitors (PPIs) are frequently used to treat gastroesophageal reflux disease (GERD) in children, but recent evidence suggests a potential association between PPI treatment and some types of infections. The aim of this study was to assess the effectiveness of Lactobacillus rhamnosus GG (LGG) for the prevention of gastrointestinal and respiratory tract infections in children with GERD treated with PPI (omeprazol). Methods: Children younger than 5 years with GERD were assigned by a computer-generated list to receive LGG (109 colony-forming units) or placebo, twice daily, concomitantly with PPI treatment for 4-6 weeks; they were followed up for 12 weeks after therapy. The primary outcome measures were the percentage of children with a minimum of one episode of respiratory tract infection and the percentage of children with a minimum of one episode of gastrointestinal infection during the study. Results: Of 61 randomized children, 59 patients (LGG n=30; placebo n=29, mean age 11.3 months) were analyzed. There was no significant difference found between the LGG and placebo groups, either for the proportion of children with at least one respiratory tract infection (22/30 vs. 25/29, respectively; relative risk [RR] 0.85, 95% confidence interval [CI] 0.66-1.10) or for the proportion of children with at least one gastrointestinal infection (9/30 vs. 9/29, respectively; RR 0.97, 95% CI 0.45-2.09). Conclusion: LGG was not effective in the prevention of infectious complications in children with GERD receiving PPI. Caution is needed in interpreting these results, as the study was terminated early due to slow subject recruitment.
Kim, Pil-Hwan;Jin, Mei-Hua;Kim, Young-Jin;Jeong, Hyo-Min;Chung, Han-Shik
Proceedings of the SAREK Conference
/
2008.11a
/
pp.618-623
/
2008
To enhancement heat transfer performance, the metallic foam as heat exchanger was studied rapidly. This was attributed to its high surface area to volume ratio as well as intensive flow mixing by tortuous flow passages. So the experimental study about the heat transfer characteristic of metallic foam is presented in this paper. The material in this experiment was used as FeCrAl which has density of 10 ppi, 20 ppi and 30 ppi respectively. And the results show the heat transfer is rise with permeability Reynolds number increase and the pressure drop metallic foam was increased with the ppi increase.
Kwon, Young-Hun;Hong, Du-Ho;Kim, Chang-Yup;Kim, Yong-Ik;Shin, Young-Soo;Yim, Jun
Journal of Preventive Medicine and Public Health
/
v.34
no.4
/
pp.347-353
/
2001
Objectives : To determine the impacts of Diagnosis-Related Groups/Prospective Payment System (DRG/PPS) on the quality of care in cases of Cesarean section and to describe the policy implications for the early stabilization of DRG/PPS in Korea. Methods : Data was collected from the medical records of 380 patients who had undergone Cesarean sections in 40 hospitals participating in the DRG/PPS Demonstration Program since 1999. Cesarean sections were peformed in 122 patients of the FFS(Fee-For-Service) group and 258 patients of the DRG/PPS group. Measurements of quality used included essential tests of pre- and post-operation, and the PPI(Physician Performance Index) score. The PPI was developed by two obstetricians. Results : Univariate analysis demonstrated significant differences in PPI scores according to the payment systems. With respect to the mean of PPI scores, a higher score was found in the DRG/PPS group than in the FFS group. However, the adjusted effect did not show significant differences between the FFS group and the DRG/PPS group. Conclusion : This study suggested that the problem of poor quality may not be related to the implementation of DRG/PPS in Cesarean section. However, this study did not consider the validity and reliability of the process measurement, and it did not exclude the possibility of data emission in medical records.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.