• 한국버섯학회지
• /
• 제14권4호
• /
• pp.211-214
• /
• 2016

'건이'는 2012년 전남농업기술원에서 육성한 털목이 품종으로 2009년 JNM-Mi-21008과 JNM-Mi-21014의 단포자 교배를 통하여 2010년 1차 선발하였다. 2011년부터 2012년까지 특성 및 생산력 검정을 실시한 결과 갓색이 연갈색으로 우수하고 병해충에 강한 계통번호 JNMMI249를 우수균주로 선발하였고 이 계통을 2013년 '건이'라는 이름으로 품종보호출원하여 2016년 등록하였다(제109호: 2016. 6.9.). 건이의 갓은 연갈색으로 매끈하여 기호성이 높으며 씹힘성이 좋고 식이섬유 함량이 높다. 원균배양에 알맞은 배지는 MCM, 맥아, PDA배지이다. 톱밥 봉지재배시 자실체 특성으로 갓색은 연갈색이며 유효경수는 39개/0.9 kg로 많았고 갓 직경 6.9 cm, 갓 폭 8.7 cm로 갓 크기는 작은 경향이다. 배양기간은 $20^{\circ}C$에서 40~54일이며 발이 및 생육기간은 20일로 기존품종보다 다소 긴 편이며 수량은 0.9 kg 봉지당 291 g 정도이다. 또한 병해충에 강하며 2차 균사발생, 부패 등 불량환경조건에서도 우수한 경향을 보였다. 교배모본 및 대조구와의 대치선이 형성되었으며 RAPD를 이용한 유전적 다형성 검정 결과 모균주와 유의적 구별성을 보였다. 또한 식이섬유 함량이 높고 씹힘성이 우수한 특성을 갖고 있는 것으로 나타났다.

• 원예과학기술지
• /
• 제28권4호
• /
• pp.638-647
• /
• 2010

RAPD와 ITS 염기서열 분석을 통하여 $Ligularia$ 속 식물 5종류의 유연관계를 밝혔다. RAPD 분석에서는 총 196개의 random primer를 사용하여 밴드수가 많고 선명한 63개의 primer를 선발하였다. 다형성을 나타낸 밴드는 141개(31.8%)이었으며, 증폭된 크기는 0.2-1.6kb로 다양하였다. 유집 분석 결과, 유사도 값은 0.54-0.95의 범위로 나타났고, 0.77을 기준으로 크게 5그룹으로 나누었다. ITS 영역의 염기서열 분석 결과, ITS 1과 ITS 2 지역은 각각 248-256bp와, 220-222bp로 구성되어 있으며, 5.8S 부분은 164bp로 나타났다. ITS 1과 ITS 2 지역의 총 478개의 염기 중 49(10.2%)군데에서 변이가 있었으며, 구아닌(G)과 시토신(C)의 비율은 ITS 1 지역에서 49.4%, ITS 2에서는 53.5%로 나타났다. 염기서열 분석결과 5종류는 단계통을 형성하였으며, 갯취는 군외군으로 부터 가장 먼저 분계조를 형성하였다. 한대리곰취와 어리곤달비는 79%의 지지율을 가지고 유집되었으며, 곰취와 곤달비도 함께 유집되었지만 지지도는 52%로 낮았다. 이상의 결과에서 두 데이터는 일치하는 결과를 보였지만 한 대리 곰취의 분류학적 위치는 RAPD와 ITS 분석결과가 일치하지 않았다.

• 한국작물학회지
• /
• 제56권4호
• /
• pp.322-328
• /
• 2011

우리나라에서 수집한 재래종 조 26계통들에 대하여 9개의 AFLP primer조합을 사용하여 유전적 다양성 및 계통유연관계를 분석한 결과는 다음과 같다. 1. 분석에 이용한 9개의 AFLP primer조합들은 국내에서 수집한 조 26계통들에서 총 170개의 DNA단편을 나타내었고, 이중에서 145개의 단편(85.3%)들은 다형성을 나타내었다. 9개의 AFLP primer조합들에서 측정된 유전적 다양성 값(Hs)은 1.84에서 6.80의 범위로 나타나, 평균 3.85값을 나타내었다. 강원지역에서 수집한 조 계통(Group 1)들은 평균 3.39의 유전적 다양성 값을 나타내었고, 경기도 등 타 지역에서 수집한 조 계통들(Group 2)은 평균 2.99의 유전적 다양성 값을 나타내었다. 2. 국내에서 수집된 재래종 조 26계통들은 유전적 유사성 73% 수준에서 크게 두 개의 그룹으로 구분되었다. Group I은 유전적 유사성 76.8% 수준에서 강원도에서 수집한 13계통들과 경기도에서 수집한 1계통을 포함하고 있었으며, Group II는 유전적 유사성 78.9% 수준에서 강원도에서 수집한 2계통들과 타 지역에서 수집한 10계통들을 포함하고 있었다. 본 연구결과는 우리나라에서 수집한 재래종 조 계통들에 대한 유전적 다양성 및 계통유연관계 이해 그리고 이들 자원의 수집 및 보존 등에 유용한 정보를 제공할 것으로 기대된다.

• 한국가축번식학회지
• /
• 제23권3호
• /
• pp.213-220
• /
• 1999

산자수는 돼지의 번식능력에 있어 경제적 형질 중 중요한 요인으로 작용하고 있다. 최근 IGF-Ⅰ이 임신유지와 태아의 성장발달에 역할을 하는 것은 보고되어 있으나 산자수에 따른 혈청 IGF-Ⅰ연구는 부족한 상태이다. 그러므로 본 연구는 돼지의 산자수 그룹에 따른 혈청 IGF-I 농도 및 산자수에 관여하는 ER 유전자 다형성 분석을 통해 혈청 IGF-Ⅰ 농도에 대한 조사를 하고자 한다. 혈청은 산자수 높은 그룹과 낮은 그룹의 임신 45일부터 105령일 까지 모아 RIA로 IGF-Ⅰ의 농도를 측정하였으며 측정결과 두 그룹간에 유의적인 차이는 보이지 않았으나 점차적으로 떨어지는 경향을 보여 주었다. 또한 ER 유전자 다형성 분석에 따른 혈청내 IGF-Ⅰ농도는 산자수 낮은 그룹을 나타내는 단편의 IGF-Ⅰ농도가 높게 나타내는 단편에 IGF-Ⅰ농도보다 높게 나타났다. 따라서 본 연구를 통해 돼지의 내분비 물질 중 혈청내 IGF-Ⅰ이 돼지의 산자수와는 관련이 없으나 ER의 발현을 동시에 관찰한다면 돼지 산자수률 예측할 수 있다는 가능성을 제시할 수 있으며, 돼지의 번식기관 중 배란율에 관여하는 난소의 IGF-Ⅰ발현양상 등의 연구가 추후 진행될 필요가 있다고 사료된다.

• 한국약용작물학회지
• /
• 제7권2호
• /
• pp.94-100
• /
• 1999

라벤다의 기내배양을 통한 대량증식의 가능성을 알아보기 위하여 식물체 부위별 절편, 생장 조절물질 및 배지가 캘러스 유지 및 유식물체의 분화에 미치는 영향과 기내증식 개체의 변이에 대해 조사하였다. 캘러스 유도는 잎 절편을 이용한 2, 4-D 1 mg/l 와 NAA 2 mg/l 의 단독 또는 BAP 0.05 mg/l 와의 조합 처리 조건에서 양호하였다. 신초의 분화에는 경정을 이용한 BAP $2{\sim}4\;mg/l$ 단독 또는 BAP 4 mg/l +NAA 0.2 mg/l 조합 처리가 가장 양호하였다. $B_{5}$ 배지에 BAP 0.5 mg/l 와 NAA 0.01 mg/l 가 조합 첨가되었을 때 신초의 증식이 9.1배로 높게 나타났다. 분화된 신초의 뿌리 형성은 NAA $0.1{\sim}1\;mg/l$ 와 IAA 1 mg/l 에서 양호하였다. 기내에서 증식된 유식물체는 peatmoss:vermiculite:perlitc (1:1:1, v/v/v) 혼합 상토에서 90% 이상의 높은 활착율과 양호한 생육을 보였다. 재분화 식물체의 RAPD 분석 결과 primer OPA14에서 하나의 변이 band가 나타났다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제14권1호
• /
• pp.91-96
• /
• 2013

Background: p53 alterations have been implicated in the development of many cancers, such as gastric cancer, but there is no evidence of p53 intron alterations in gastritis lesions. The aim of this study was to investigate the p53 intron alterations in gastritis along with p53 and mismatch repair protein expression and microsatellite status. Materials and Methods: PCR-sequencing was conducted for introns 2-7 on DNA extracted from 97 paired samples of gastritis lesions and normal adjacent tissue. Abnormal accumulation of p53 and mismatch repair proteins was investigated using immunohistochemistry. In addition, microsatellite status was evaluated with reference to five mononucleotide markers. Results: Gastritis cases included 41 males and 56 females in the age range of 15-83 years, 87.6% being H.pylori positive. IVS2+38, IVS3ins16 and IVS7+72 were the most polymorphic sites. Their minor allele frequency values were as follows: 0.38, 0.21 and 0.06, respectively. Samples with GG genotype at IVS2+38 and CT at IVS7+72 had no insertion. Moreover, most of the stable samples (91.9 %) had a G allele at IVS2+38. All of the samples were IHC negative for p53 protein, microsatellite stable and expressed mismatch repair proteins. p53 alterations were prominent in the H. Pylori+ group, but without statistical significance. Conclusions: According to our results, some p53 polymorphisms such as IVS2+38, IVS3ins16 and IVS7+72, because of their correlations together or with microsatellite status may contribute to gastritis development. However, so far effects on p53 expression and function remain unclear. Therefore, a comprehensive survey is needed to delineate their biological significance.

• Journal of Genetic Medicine
• /
• 제5권1호
• /
• pp.41-46
• /
• 2008

목 적 : 취약 X 증후군(fragile X syndrome)은 FMR1 유전자의 5' 비해독부위에 있는 CGG 3염기 반복의 확장에 의해 발생되는 유전성 질환이다. 방 법 : 본 연구에서는 임상 소견과 핵형분석에서 취약 X 증후군으로 진단 받은 여아 환자와 그 부모를 대상으로 Abbott Molecular Fragile X PCR Kit를 이용하여 CGG 3염기 영역을 PCR로 증폭하여 normal, premutation, full mutation의 CGG 반복의 유형을 확인하였으며, premutation과 normal allele의 경우에는 정확한 CGG 반복수를 분석하였다. 결 과 : 환자는 30회와 >200회의 CGG 3염기가 반복된 FMR1 대립유전자를 갖고 있는 것으로 확인되어 취약 X 증후군으로 진단되었다. 또한 환자의 어머니에서 30과 98회의 반복 allele을 확인함으로써, 이 환자의 full mutation allele은 모계의 premutation allele로부터 유래한 것임을 알 수 있었다. 결 론 : Abbott Molecular Fragile X PCR Kit를 사용한 진단방법은, 취약 X 증후군환자의 경우에서 통상적으로 시행되고 있는 PCR, MS-PCR, Southern blotting을 병행하는 방법에 비해 신속하고 정확한 분자유전학적 진단이 가능한 유용한 방법이라 생각된다.

• 식물병연구
• /
• 제22권4호
• /
• pp.276-283
• /
• 2016

2013년부터 2016년까지 P. syringae pv. actinidiae에 의한 궤양병에 감염된 것으로 확인된 과수원수는 202개였는데, Psa2가 73개 과수원에서 검출되었고 Psa3는 129개 과수원에서 검출되었다. 2015년에 비해 2016년 Psa2에 감염된 과수원은 거의 증가하지 않았지만 Psa3에 감염된 과수원은 두 배 가량 증가했다. 우리나라에서 재배하고 있는 키위 품종들 중에서 일부 토종다래를 제외한 모든 키위 품종들에서 Psa3가 검출되어 아직까지 Psa3에 저항성인 품종은 없다는 것이 확인되었다. 조사된 품종들 중에서 골드키위 품종인 Hort16A와 제시골드와 레드키위 품종인 홍양이 Psa3에 가장 감수성이었다. 경남지역에서 역학조사와 RAPD 분석 결과 2014년 홍양 과수원에서 최초 Psa3에 의한 궤양병은 중국에서 수입한 Psa3에 오염된 꽃가루에 의해 발생했고, 2016년 경남 사천과 고성 지역의 과수원들에서 궤양병의 대발생은 홍양 과수원으로부터 근처 제시골드와 헤이워드 과수원으로 2차감염에 의한 Psa3의 급속한 확산 때문으로 추정된다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제15권18호
• /
• pp.7589-7595
• /
• 2014

Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (APEX1) is a multifunctional protein which plays a central role in the BER pathway. APEX1 gene being highly polymorphic in cancer patients and has been indicated to have a contributive role in Apurinic/apyrimidinic (AP) site accumulation in DNA and consequently an increased risk of cancer development. In this case-control study, all exons of the APEX1 gene and its exon/intron boundaries were amplified in 530 breast cancer patients and 395 matched healthy controls and then analyzed by single-stranded conformational polymorphism followed by sequencing. Sequence analysis revealed fourteen heterozygous mutations, seven 5'UTR, one 3'UTR, two intronic and four missense. Among identified mutations one 5'UTR (rs41561214), one 3'UTR (rs17112002) and one missense mutation (Ser129Arg, Mahjabeen et al., 2013) had already been reported while the remaining eleven mutations. Six novel mutations (g.20923366T>G, g.20923435G>A, g.20923462G>A, g.20923516G>A, 20923539G>A, g.20923529C>T) were observed in 5'UTR region, two (g.20923585T>G, g.20923589T>G) in intron1 and three missense (Glu101Lys, Ala121Pro, Ser123Trp) in exon 4. Frequencues of 5'UTR mutations; g.20923366T>G, g.20923435G>A and 3'UTR (rs17112002) were calculated as 0.13, 0.1 and 0.1 respectively. Whereas, the frequency of missense mutations Glu101Lys, Ser123Trp and Ser129Arg was calculated as 0.05. A significant association was observed between APEX1 mutations and increased breast cancer by ~9 fold (OR=8.68, 95%CI=2.64 to 28.5) with g.20923435G>A (5'UTR), ~13 fold (OR= 12.6, 95%CI=3.01 to 53.0) with g.20923539G>A (5'UTR) and~5 fold increase with three missense mutations [Glu101Lys (OR=4.82, 95%CI=1.97 to 11.80), Ser123Trp (OR=4.62, 95%CI=1.7 to 12.19), Ser129Arg (OR=4.86, 95%CI=1.43 to 16.53)]. The incidence of observed mutations was found higher in patients with family history and with early menopause. In conclusion, our study demonstrates a significant association between germ line APEX1 mutations and breast cancer patients in the Pakistani population.

• 원예과학기술지
• /
• 제32권4호
• /
• pp.525-534
• /
• 2014

Microsatellite 표지를 이용하여 국내에서 시판되고 있는 멜론 58품종의 식별과 멜론 육종 계통 '10H08'을 이용하여 $F_1$ 종자 순도를 평가하였다. 412개의 microsatellite 표지 중 다형성 정도가 높은 29개는 품종 그룹 내에서도 다양한 유전 변이를 나타내었으며 분자표지의 유전자형에 의해 모든 품종을 식별할 수 있었다. Microsatellite 표지의 대립유전자를 이용하여 멜론 58품종에 대한 계통도를 작성하였을 때 멜론의 형태적 특성과 일치하면서 2개의 대그룹으로 구분되었다. $F_1$ 종자의 순도 검정에 microsatellite 표지를 활용하기 위하여 29개의 표지를 '10H08' 계통의 양친에 대하여 검정하였을 때 5개의 프라이머가 다형성을 보였으며, 이 중 한 개의 프라이머 'CMGAN12'는 양친간에 뚜렷한 다형성 밴드를 나타내었다. 이 프라이머를 192개의 $F_1$ 종자에 대하여 검정하였을 때 자식주로 보이는 개체가 분석된 종자 내에서 명확하게 구분되었다. 본 연구 결과에서 선정된 멜론 품종 식별용 microsatellite 표지는 멜론 품종의 지문화뿐만 아니라 $F_1$ 종자의 순도 검정이 가능하여 종자회사에서 매우 유용하게 활용될 수 있는 것으로 나타났다.