• Journal of Plant Biology
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• 제37권2호
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• pp.167-173
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• 1994

Poly(A)+ RNA was selected from Canavalia lineata root nodule RNA through oligo(dT) cellulose column and used for construction of a cDNA library using λgt10-EcoRI arms. The size of the library was 7.2$\times$105 pfu/mL. A full length leghemoglobin (Lb) cDNA clone, pCILb1(687 bp) isolated with soybean Lb probe, contained one open reading frame (ORF) of 447 bp with 54 bp plus 186 bp at 5' and 3' untranslated region, respectively. A consensus sequence of plant translation start region (AAAATGGG) was found at 5' untranslated region, and two polyadenylation-related sequence (AATAAA, AATAAG) and a conserved motif between them (gACTTGTT) were found upstream of poly(A)+ tail consisted of 13 (A)s at 3' untranslated region. The ORF encoded a polypeptide consisted of 149 amino acids with a molecular weight of 16.2 kD. Deduced amino acid sequences showed high degree of homology values with those of other Lbs ranging from 66% (Casuarina glauca) to 85% (Glycine max).

• 생명과학회지
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• 제9권4호
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• pp.341-347
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• 1999

Insects use chitinolytic enzyme to digest chitin in the exoskelton during the molting process. We have isolated and sequenced a chitinase-encoding cDNA from the silkworm, Bombyx mandarina, compared its sequenced with genes encoding chitinolytic enzymes from other sources. The insert DNA in the clone is 2,675 nucleotides long with an open reading frame of 1,695 uncletides that encodes a protein of 565 amino acids with a molecuar weight of 63.4 kDa. The 3' -untranslated region of 889 nucleotides is AT-rich and contains two putative polyadenylation signals. The N-terminal sequence of the encoded protein contains numerous hydrophobic residues characteristic of a leader peptide. The amino acid alignment revealed that the endo-$\beta$-N-acetylglucosaminidase had 83% and 97% homology with M. sexta and B. mori, respectively. The deduced amino acid had two highly conserved region at the amino acid residues 97-111 and 139-148 that were related to the existing chitinase.

• 약학회지
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• 제49권3호
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• pp.205-211
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• 2005

The 3' UTR (3' untranslated region) plays important roles in controlling gene expression through regulating 3' polyadenylation, mRNA export, subcellular localization, translational efficiency, and mRNA stability. Changes in the 3' UTR sequence in an expressed transcript can result in functional changes of the genes that are expressed in pathological conditions compared with those genes expressed in normal physiologic conditions. A genome-wide survey of 3' UTR variation was performed for the genes expressed during hematopoietic differentiation from CD34+ stem/progenitor cells to CD 15 + myeloid progenitor cells. Wide-spread differential usage of the 3' UTR was observed from the genes expressed during this cellular transition. This study implies that the 3' UTR can be a highly coordinated region for post-transcriptional regulation of the function of expressed genes.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권1호
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• pp.83-86
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• 2014

Poly(A) polymerase (PAP) play an essential role for maturation of mRNA by adding the adenylate residues at the 3' end. PAP functions are regulated through protein-protein interaction at its C-terminal region. In this study, cyclophilin A (CypA), a member of the peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family, was identified as a partner protein interacting with the C-terminal region PAP. The interaction between PAP and CypA was inhibited by the immunosuppressive drug cyclosporine A. Deletion analysis revealed that the N-terminal 56 residues of CypA are sufficient for the interaction with PAP. Interestingly, we observed that PAP and CypA colocalize in the nucleus during SDF-1-induced chemotaxis, implying that CypA could be involved in the regulation of polyadenylation by PAP in the chemotactic cells.

• 한국식물학회:학술대회논문집
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• 한국식물학회 1987년도 식물생명공학 심포지움 논문집 Proceedings of Symposia on Plant Biotechnology
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• pp.19-49
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• 1987

Recent development of recombinant DNA techniques such as gene cloning and DNA sequencing has led to understanding of genetic information coded on plant genes and their application to crop improvements. Nuclear genes so far isolated and characterized at the molecular level from various plants are those involved mainly in photosynthesis, nitrogen fixation, seed development and defensive responses to environmental stresses. Most of plant genes contain intervening sequences (introns) flanked with GT and AG, as it typical of animal genes. The 5' flanking regions of plant gene revealed the presence of promoter elements such as TATAAA and CCAAT, which have been identified at animal genes to be involved in transcrip- tion initiation. The 3' untranslated regions include a sequence similar to AATAAA whcih functions as a polyadenylation signal in other eukaryotic genes. Furthermore, enhancer-type sequences were found at the 5' flanking regions of various plant genes. This indicates that the structure of plant genes is very similar to animal genes and mechanisms governing the synthesis and processing of mRNAs may be identical in higher eukaryotes. However, genes expression studies involving transformation revealed their differ ences within plants and between plant and animal systems.

• 한국식물학회:학술대회논문집
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• 한국식물학회 1987년도 식물생명공학 심포지움 논문집 Proceedings of Symposia on Plant Biotechnology
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• pp.357-389
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• 1987

In an attempt to clarify the physiological functions of individual isoperoxidases, we have studied enzymatic and immunological properties as well as cellular distribution of isoperoxidases from tobacco callus and Korean radish. The gene expression patterns of isoperoxidases in shoot and non-shoot-forming tobbaco callus were also examined by rabbit reticulocyte lysatein vitro translation system. These results indicate that fraction of translatable poly(A)-isoperoxidase mRNA was increased considerably in shoots. At the present time, at least 6-7 isoperoxidases could be detected from the translation mixture of total cellular RNA, among which only one cell wall localized anodic isoperoxidase (named A3) mRNA was bimorphic mRNA. These data suggest the possible regulation of peroxidase activity during shoot formation by altering the polyadenylation state of mRNA. In case of Korean radish seedlings, poly(A)- peroxidase mRNA were also increased depending upon aging.

• 한국가축번식학회지
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• 제20권4호
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• pp.453-458
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• 1997

형질전환 동물의 후손에서 transgene은 멘델의 법칙에 따라 유전된다고 일반적으로 인식되어져 왔다. 따라서 본 연구에서는 transgene이 이러한 인식과 일치하는지를 여러 세대를 통하여 확인하고 후손에서 어떻게 유전되는지를 연구하기 위하여 형질전환 생쥐를 생산하여 본 연구의 모델로 삼았다. 수정된 생쥐의 embryo에 DNA를 microinjection하는 방법으로 MMTV-LTR (long terminal repeat), bovine ($\alpha$s1-casein cDNA, 그리고 SV 40 splicing과 polyadenylation site 등의 sequence를 포함한 3.0Kb의 DNA가 주입되었다. 여기에서 태어난 새끼는 dot blot과 Southern blot에 의하여 transgene의 존재여부가 확인되어 founder line이 만들어졌다. 그들의 자손은 PCR에 의해서 transgene이 유전되는지를 확인하였다. F0의 72마리 새끼중에서 4마리의 Founder가 transgene을 가지고 있었다(5.6%). F0에서 F1으로의 유전(transmission)은 각각 33.3, 7.7, 0, 62.5%이었다. Transgene은 F1에서 F2로 각각 63.6, 5.9, 68.8% 유전되었고, F2에서 F3로 각각 85.7, 0, 88.2% 유전되었다. 따라서 본 연구 모델에 의하면 transgene은 멘델의 법칙을 따르는 경우와 deletion이 되는 경우로 각각 관찰되었다.

• 생명과학회지
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• 제26권9호
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• pp.1097-1104
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• 2016

차세대 염기서열 분석기술의 발달로 대량의 전사수준의 단위체들이 발견되었는데, 이것들 중 대부분의 전사체들은 비암호화 RNA들이다. 이들 중 긴 비암호화 RNA (lncRNA)들은 200개 이상의 뉴클레오티드를 가지며 단백질로 번역이 되지 않는 기능적 RNA 분자들이다. 식물의 lncRNA들은 RNA Pol II, Pol III, Pol IV, Pol V에 의해 전사체가 만들어지고, 전사 후 이들 lncRNA들은 추가적인 splicing과 polyadenylation 과정이 일어난다. 식물의 lncRNA들은 그 발현수준이 매우 낮고, 조직 특이적으로 발현 되지만, 이들 lncRNA들은 외부자극에 의해 강한 발현이 유도된다. 환경스트레스를 포함한 각기 다른 외부자극에 의해 많은 식물 lncRNA들의 발현이 유도되었기 때문에 이들 lncRNA들은 식물의 다양한 생물학적 기능과 식물의 생장발달 과정에 있어 새로운 조절 인자로 고려되고 있다. 특히 후성유전학적인 유전자 억제, 크로마틴 변형, 타겟모방, 광형태형성, 단백질 재배치, 환경스트레스 반응, 병원균 감염등에 관련하여 기능을 한다. 또한 어떤 lncRNA들은 short RNA들의 전구체로 역할도 한다. 최근 식물에서 많은 lncRNA들이 분리 동정되었지만, 이들 lncRNA들의 생리학적인 기능에 대한 현재의 이해는 여전히 제한적이고, 이들의 세부적인 조절 메커니즘 연구는 지속적으로 이루어져야 할 것이다. 이 총설에서는 식물 lncRNA들의 생합성 및 조절 메커니즘과 현재까지 밝혀진 분자수준에서의 중요한 기능들을 요약 정리하였다.

• 미생물학회지
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• 제27권1호
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• pp.1-9
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• 1989

SV40 바이러스가 원숭이 세포(CVIP)에 감염한 후기에 생기는 poly A(-) 19S RNA의 5'끝과 splicing 유형을 알아보기 위하여 primer extension 및 그 변형방법을 행하였다. 이 RNA의 5' 끝은 SV40 후가 RNA들이 가장 많이 사용하는 cap 자리 인 잔기 325 위치임이 밝혀졌다. 또한 splicing 유형도 세포질의 polyA(+)인 19S RNA와 같은 잔기 373에서 잔기 5581까지의 intron이 제거된 형태이었다. Sl 뉴클리아제에 의한 분석결과 이 RNA의 3' 끝은 polyadenylation 위치로부터 상위로 약11kb에 걸쳐 다양하게 존재함을 알았다. 정상적인 cap 자리와 splicing 형태를 지닌 이 RNA가 왜 핵에 축적되는지의 이유를 조사하였다. 이 RNA상에 사용되지 못한채로 남아있는 3' splice 부위가 핵내 편재를 유발했는지의 여부를 알아보기 위하여, 3' splice 부위를 결손시킨 돌연변이 SV 40 pNA를 세포에 도입시켰다.. 그 결과 3'splice 자리가 없는 RNA는 세포질에 많이 축적됨을 관찰하였다. 이 결손 RNA의 세포질내 축적은 결손으로 인해 RNA의 안정성이 증가함으로써 비롯된 것이 아니라는 것을 actinomycin D 추적실험을 통해 밝혔다. 따라서 정상적인 19S spliced RNA가 세포질로 이동되는 과정을 방해하는 것은 사용되지 않은 3' splice 부위에 형성된 pre-splicing 복합체 때문인 것으로 여겨진다.

• 한국동물학회지
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• 제39권1호
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• pp.115-121
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• 1996

임신중기에서 발기에 이르는 흰쥐의 태반에서 Placental Lactogen I (PL-I), II 그리고 Pit-1 의 유전자 발현 변화를 Northern blot hybridization으로 조사하였다. 그 결과, 임신시기에 따라 PL-I과 PL-II의 mRNA 양과 크기에 변화가 나타났다. 이들 유전자 발현에 미치는 에스트로겐의 영향을 조사하기 위하여, 임신 14일째 쥐의 난소를 제거하고(OVX), 이후 매일 에스트로겐을 투여한 후 (OVX+E), 임신 18일째 태반을 회수하여 PL-I, II 그리고 Pit-1의 유전자 발현을 Northern blot hybridization으로 조사하였다. OVX 군의 경우, PL-I의 mRNA 크기는 1 kb에서 1.3 kb로 PL-II의 mRNA는 0.6kb에서 1 kb로 변화하였다. OVX+E 군에서는 PL-I과 PL-II의 mRNA가 정상대조군과 같은 상태로 환원하였다. 정상대조군에 비하여 OVX와 OVX+E 군에서 PL-I과 PL-II의 mRNA 크기에는 영향을 미치지 못한 반면, mRNA 양은 난소제거시 감소하였다가, 에스트로겐을 투여하면, 부분적으로 회복되는 경향을 보였다. 이러한 본 실험의결과는 에스트로겐이 PL-I과 PL-II의 RNA splicing이나 polyadenylation 등을 포함한 유전자 발현에 영향을 미치며, Pit-1이 이 과정에 개입하는 것을 시사하는 것이다.