• 한국미생물·생명공학회지
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• 제11권1호
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• pp.75-79
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• 1983

Bocillus subtilis를 유전공학의 숙주 세포로서 이용하기 위해서는 우선 적당한 vector의 개발이 요구된다. Oxytetracycline의 항생물질을 생산하는 방사선균인 Streptomyces rimosuf IFO 0014로 부터 oxytetracycline-resistant plasmid DNA를 pH 9.0의 phenol-buffer system으로 추출하여 B.subtilis KPM 60[St $r^{R}$-mutant of RM 125 (leu A8, arg 15, hsr $M^{-}$, hsm $M^{-}$)] 1균주에 형질전환시키면서 이 plasmid DNA가 표현되게 하였다. 이때 형질전환의 조건으로서 KPM60을 growth medium에서 3시간, competence medium에서는 30분내지 60분간 그리고 DNA와는 20분동안 접촉시킴으로서 가장 높은 빈도로 형질전환이 일어났다. (대개 $10^{-4}$ 빈도 이상) 또 recipient cell의 competence화에는 oH7.5에서 그리고 형질전환에는 2$0^{\circ}C$에서 최적상태를 보였다.

• 대한수의학회지
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• 제48권4호
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• pp.441-449
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• 2008

The genus Lactobacillus is the largest of the genera included in lactic acid bacteria and is associated with mucosal membranes of human and animal. Only a few Lactobacillus plasmid-encoded functions have been discovered and used. In this study, a novel plasmid (pILR091) was isolated from a wild L. reuteri isolated from pig and described the characteristics of its replicons, genetic organization, and relationship with other plasmids. After digestion of the plasmid, pILR091, with SalI, plasmid DNA was cloned into the pQE-30Xa vector and sequenced. The complete sequence was confirmed by the sequencing of PCR products and analyzed with the Genbank database. The isolate copy number and stability were determined by quantitative-PCR. The complete sequence of L. reuteri contained 7,185 nucleotides with 39% G-C content and one cut site by two enzymes, SalI and HindIII. The similar ori sequence of the pC194- rolling circle replication family (TTTATATTGAT) was located 63 bp upstream of the protein replication sequence, ORF 1. Total of five ORFs was identified and the coding sequence represented 4,966 nucleotides (70.4%). ORF1 of pILR091 had a low similarity with the sequence of pTE44. Other ORFs also showed low homology and E-values. The average G-C content of pILR091 was 39%, similar with that of genomic DNA. The copy number of pILR091 was determined at approximately 24 to 25 molecules per genomic DNA. These results suggested that pILR091 might be a good candidate to construct a new vector, which could be used for cloning and expression of foreign genes in lactobacilli.

• 한국수산과학회지
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• 제20권1호
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• pp.57-62
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• 1987

온도감수성 대장균 M5248 균주에 있어서의 plasmid $pPL-\lambda$와 pAS1을 $30^{\circ}C$에서 형질전환 시킬 때의 조건을 조사한 바 배양시간에 있어서는 균주의 대수 증식기 중반인 2시간 30분 배양시, 즉 cell농도는 $4.5\times10^7\;cells/ml$이며 파장 590nm에서의 흡광도가 0.45 일 때 plasmid $pPL-\lambda$와 pAS1 모두 형질전환율은 $2.4\times10^6$과 $1.5\times10^{-6}$로서 가장 높았다. 그리 고 competent cell $200{\mu}l(9\times10^{-6}cell)$에 대하여 plasmid 농도가 $6.4{\mu}g/ml$ 형질전환율이 $4.4\times10^{-6}$로서 높게 나타났으며 이때 calcium chloride만으로 처리한 것 보다 calcium chloride와 thymidine을 혼합하여 처리했을 때 2배 정도 더 많은 transformant를 유도하였다. Ampicillin 내성유전자는 LB배지를 첨가하여 $30^{\circ}C$에서 2시간 동안 배양했을 때 그 형질이 표현되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권2호
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• pp.211-218
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• 2023

A cryptic plasmid (pTH32) was characterized from Tetragenococcus halophilus 32, an isolate from jeotgal, Korean traditional fermented seafood. pTH32 is 3,198 bp in size with G+C content of 35.84%, and contains 4 open reading frames (ORFs). orf1 and orf2 are 456 bp and 273 bp in size, respectively, and their translation products showed 65.16% and 69.35% similarities with RepB family plasmid replication initiators, respectively, suggesting the rolling-circle replication (RCR) mode of pTH32. orf3 and orf4 encodes putative hypothetical protein of 186 and 76 amino acids, respectively. A novel Tetragenococcus-Escherichia coli shuttle vector, pMJ32E (7.3 kb, Em^r), was constructed by ligation of pTH32 with pBluescript II KS(+) and an erythromycin resistance gene (ErmC). pMJ32E successfully replicated in Enterococcus faecalis 29212 and T. halophilus 31 but not in other LAB species. A pepA gene, encoding aminopeptidase A (PepA) from T. halophilus CY54, was successfully expressed in T. halophilus 31 using pMJ32E. The transformant (TF) showed higher PepA activity (49.8 U/mg protein) than T. halophilus 31 cell (control). When T. halophilus 31 TF was subculturd in MRS broth without antibiotic at 48 h intervals, 53.8% of cells retained pMJ32E after 96 h, and only 2.4% of cells retained pMJ32E after 14 days, supporting the RCR mode of pTH32. pMJ32E could be useful for the genetic engineering of Tetragenococcus and Enterococcus species.

• 생명과학회지
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• 제15권4호
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• pp.566-571
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• 2005

담수 식물 수초의 근계에 부착하는 미생물 중 중금속에 높은 저항성을 가지는 균을 분리하고 이들 중 Enterobacter cloaceae K41를 대상으로 생육최적조건을 검토한 결과는 LB배지에 $1\%$ yeast extract, $1\%$ lactose, $1\%$ NaCl, pH7.0, 최적 온도는 $37^{\circ}C$, 24시간 진탕배양 이었으며 중금속 첨가 시에는 침전을 막기 위하여 Nutrient 배지로 대체하였다. 이 분리균주와 표준균주인 Enterobacter cloaceae KCTC2519를 대상으로 중금속인 구리와 카드뮴이온에 대한 최소생육저지농도(MIC)를 비교한 결과 분리균주인 E. cloacear K41은 구리는 150 ppm, 카드뮴은 50 ppm농도까지 생육이 확인되었으나 표준균주는 구리 50ppm에서 생육이 확인되었으나 카르뮴이나 두 혼합 중금속에서는 확인되지 않는 차이를 나타내었다. 두 균주를 대상으로 유전적 성상을 비교한 결과 분리균주에선 plasmid가 검출되었으나 표준균주에는 없었다. 그리고 분리균주에서 6.4Kb 절편의 plasmid를 분리하여 구리, 카드뮴의 중금속에 민감한 균주인 E, coli $DH5{\alpha}$에 형질전환 시켜 생육에 영향을 미치는 정도를 비교하였다. 그 결과 형질전환 균주의 두 중금속에 대 한 최소생육저지농도가 구리는 7배, 카드뮴은 6배로 증가한 것을 알 수 있었다. 또한 중금속 흡착률은 형질전환 균주가 E. ccli $DH5{\alpha}$보다 구리가 1.3배, 카드뮴은 1.5배 증가함을 알 수 있었다. 따라서 이 plasmid가 중금속 저항성을 증가시키는데 관여하는 것으로 보였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제3권4호
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• pp.256-260
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• 1993

DNA subfragments, sopA, sopB and sopC which help to maintain the stability of an ori C plasmid, were derived from a mini-F plasmid DNA (EcoRI restriction fragment f5) after digestion with restriction endonuclease, and cloned in the vector plasmid pBR322. The recombinant plasmids obtained were introduced into E. coli KY7231 and E. coli CSR603 strains, and proteins specified by the mini-F fragments were analysed by SDS-PAGE. Two proteins encoded by the F fragments were detected, and their molecular weights were 41,000 and 37,000 daltons. Fluorography after one and two dimensional gel electrophoresis of the lysates showed that these two proteins had been overproduced in the cells which were allowed to incorporate radioactive amino acid after plasmid amplification by chloramphenicol treatment. The isoelectric points of sopA and sopB proteins were 6.6 and 7.0, respectively.

• 미생물학회지
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• 제28권1호
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• pp.27-34
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• 1990

지속성 및 유발성 발한의 두 macrolide-lincosamide-streptogramin B 저항성 인자가 한 Staphylococcus aureus DHI 균주의 염색체 DNA 및 plasmid pDE1(7.4kb)로부터 각각 분리되었다. pDE1상의 유발성 Em 저항성 인자의 염기서열은 이미 보고 된 바 있는 pE194상의 ermC와 동일하였으며 지속성 Em 저항성 인자의 경우는 그 제한효소 인식부위의 mapping 결과로 보아 ermCdb전자에서 유발성 기구에 관여하는 leader peptide 부위가 결여된 인자인 것으로 밝혀졌다.

• 미생물학회지
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• 제54권3호
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• pp.286-288
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• 2018

남자 대학생의 피부에서 분리한 Moraxella osloensis NP7는 베타-락탐과 아미노글리코사이드 항생제에 대해 내성을 보였다. 본 연구에서는 NP7 균주 유전체의 완전한 염기서열과 유전자 주석을 보고하고자 한다. NP7 균주는 원형 염색체와 7개의 플라스미드를 갖고 있다. 염색체는 43.9%의 G + C 함량을 갖는 2,389,582개의 염기쌍을 갖고 있으며, 단백질을 암호하는 2,065개의 유전자를 보유하고 있다. 전체 플라스미드는 평균적으로 40.5%의 G + C 함량을 갖는 654,202개의 염기쌍을 갖고 있으며, 단백질을 암호하는 667개의 유전자를 보유하고 있다. 염색체는 4개의 리보좀 RNA 오페론, 1개의 transfermessenger RNA 유전자, 47개의 tRNA 유전자, 3개의 핵산스위치 유전자 그리고 3개의CRISPR array를 포함하고 있으며, 1개의 CRISPR은 pNP7-1 플라스미드에 존재한다. 베타-락탐과 아미노글리코사이드 항생제에 내성을 부여하는 유전자는 pNP7-1 플라스미드에 존재하고 있다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권2호
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• pp.160-164
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• 1989

알카리성 Bacillus sp. AL-8의 알카리성 amylase 유전자를 포함하는 5.7Kb의 EcoRI 단편을 pUB 110을 vector로 하여 amylase를 생산하지 못하는 B. subtilis sta-1에서 발현시켰다. 재조합 plasmid pMB802와 pMB809는 숙주세포인 B. subtilis에서 매우 안정하게 유지되었으며 amylase 생산이 공여균 주에서 보다 1.8배 증가하였다. 형질전환주에서 생산된 amylase는 공여균주와 같은 효소적 성질을 나타내었다. 5.7Kb 단편을 E. coli에 subcloning한 결과 3.7Kb의 EcoRI 단편에 알카리성 amylase 유전자가 존재하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권7호
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• pp.1213-1216
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• 2007

The vector pCW5 with plasmid pC7, originally isolated in Lactobacillus paraplantarum C7 derived from kimchi, was constructed using a p32 strong promoter, the pC7 replicon, and green fluorescent protein (GFP) as the reporter. The constructed vector was transformed into E. coli and Leuconostoc mesenteroides, and GFP expression detected using a Western blot analysis. GFP fluorescence was recognized in E. coli and Leuconostoc mesenteroides using a confocal microscope. In addition, GFP fluorescence was also clearly detected in several industrially important lactic acid bacteria (LAB), including Lactobacillus bulgaricus, Lactobacillus paraplantarum, and Lactobacillus plantarum. Thus, pCW5 was shown to be effective for Leuconostoc mesenteroides when using GFP as the reporter, and it can also be used as a broad-host-range vector for other lactic acid bacteria.