Cui, Jian Dong;Zhao, Gui Xia;Zhang, Ya Nan;Jia, Shi Ru
Food Science and Biotechnology
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제18권4호
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pp.954-958
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2009
Effects of controlled- and uncontrolled-pH operations on phenylalanine ammonia lyase (PAL) production by a recombinant Escherichia coli strain were investigated at uncontrolled-pH ($pH_{UC}$) and controlled-pH ($pH_C$) of 5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, and 8.5 in bioreactor systems. The results showed that the recombinant PAL activity was improved significantly by controlled pH strategy. Among the $pH_C$ operations, the highest PAL activities were obtained under $pH_C$ 7.5 strategy where cell mass ($OD_{600\;nm}$) and PAL activity was 1.3 and 1.8 fold higher than those of $pH_{UC}$, respectively. The maximum PAL activity reached 123 U/g. The $pH_C$ 7.5 strategy made recombinant plasmid more stable and therefore allowed easier expression of PAL recombinant plasmid, which increased PAL production. It was indicated that the new approach (controlled-pH strategy) obtained in this work possessed a high potential for the industrial production of PAL, especially in the biosynthesis of L-phenylalanine.
원유 분해세균에 의한 원유 분해능을 조사한 결과, Xanthomonas camperstris M12, Xanthomonas sp. M28, Acintobacter lwoffi G1, Klebsiella pneumoniae L25, 그리고 Pseudomonas maltophilia N246 등의 순서로 나타났다. Xanthomonas maltophilia M12, Xanthomonas sp. M28, 그리고 Pseudomonas maltophilia N246 균주 모두 pctane 분해시의 온도는 $30^{\circ}C$에서 최적이었으며, 최적 pH는 X.camperstris M12와 Xanthomonas sp. M28이 7.0-7.5 이었고, P.maltophilia N246이 7.5-9.0이었다. N246 균주의 최적 NaCl농도는 3.0-3.5 이었다. P.maltophilia N246와 X.campestris M12는 모두 플라스미드를 갖고 있음을 확인하였고, N246 균주로 부터 플라스미드를 제거하였을 경우 octane 분해능이 소실되었으므로 이 플라스미드 위에 octane 분해 유전자가 있음이 확인되었다. 이 균주이 OTC 플라스미드의 크기는 118kb이었다. 또한, N246 균주는 ampicillin 항생제에 내성을 나타내었다.
Chromosomal DNA fragments of Bacillus sp. YA-14 isolated from soil as a potent xylan hydrolyzing bacterium, were ligated to a vector plasmid, pBR322, and used to transfer Escherichia coli HB101 cells. The recombinant plasmid pYDC21 was found to enable the transformants to produce xylanase. pYDC21 was found to contain the 3 kb HindIII fragment originated from the Bacillus sp. YA-14 chromosomal DNA by southern hybridization. The optimum temperature and pH for the reaction of xylanse produced by E. coli (pYDC21) were appeared at 50$_7$C and pH 7.0, respectiveiy. the xylanase enzyme was stable between pH 5.0 and 7.0 and maintained stably up to 4$0^{\circ}C$.
TOL plsmid size of Flavobacterium odoratum SUB53 was estimated as 83 Md and the optimum concentration of m-toluate degradation by TOL plasmid was 5 mM. $H_{2}$ production by Rhodopseudomonas sphaeroides KCTC1425 was largely dependent on nitrogenase activity and showed the highest at 30 mM malate with 7 mM glutamate as nitrogen source. Nitrogenase activities were inhibited by 0.3 mM $NH_{4}^{+}$ions, to be appeared the decrease of $H_{2}$ production. Conjugation of TOL plasmids from F. odoratum SUB53 and Pseudomonas putida mt-2 to R. sphaeroides showed the optimum at the exponential stage of recipient cells in presence of helper plasmid pRK2013. According to the investigation of catechol-1,2-oxygenase (C-1, 2-O) and catechol-2,3-oxygenase (C-2,3-O) activities of R. sphaeroides C1 (TOL SUB53) and C2 (TOL mt-2), the gene for C-2,3-O is located on TOL plasmid and gene for C-1, 2-O on the chromosome of R. sphaeroides. m-Toluate was biodegraded by TOL plasmid in R. sphaeroides C1 and C2, presumably to be produced $H_{2}$ gas from the secondary metabolites of m-toluate.e.
Zoogloea ramigera 115SLR로부터 다당류 생합성에 관여하는 유전자를 분리하기 위해서 균주의 genomic DNA로부터 제조된 gene bank로부터 plasmid pLEX3이 얻어졌다. 이로부터 재조합된 5.0 kb DNA fragment를 포함하는 plasmid pLEX10은 다당류의 형태를 변환시키는 유전자를 포함하고 있으며, 이중에서 upstream 영역에 해당하는 1.7 kb DNA fragment가 분리되었다. 1.7 kb DNA 염기서열의 결과로부터 단백질을 인지 할 수 있는 2개의 ORF가 존재하였으며, 50 kDa 단백질을 인지 할 수 있는 ORF3은 X. campestris의 다당류 생합성 유전자들인 gumC와 R. meliloti의 exoP와 아미노산의 동질성을 나타내었다. ORF4는 N-terminal 영역이 결여된 단백질을 인지하며, Thermotoga maritime의 다당류 export에 관여하는 단백질과 동질성을 보였다. Z. ramigera 115SLR and Z. ramigera 115SLR/pLEX10은 각각 slime또는 capsule 형태의 다당류를 생합성하며 이들로부터 생합성된 다당류양은 각각 0.26% (w/v) and 0.16% (w/v)였다.
Cloning을 위한 host와 vector의 이용 가능성을 타진하기 위해 호알칼리성 Bacillus속 K-17을 host로, pUB110과 pBD64를 vector로 사용하여 Bacillus속 K-17의 protoplast 형질전환조건을 검토하였다. 원형질체의 형성은 200$\mu\textrm{g}$/$m\ell$의 Iysozyme 을 처리하였으며, 원형질체 형성의 최적 온도, PH및 배양시간은 각각 4$0^{\circ}C$, 7.0 및 4시간으로 나타났다. 원형질체는 DM3 재생배지에서 재생시켰으며 0.8% agar, 0.5M sodium succinate 농도에서 가장재생이 좋았다. 형질전환시 PEG의 농도는 40%(w/v) PEG 6,000 30%(v/v)가 최적으로 나타났다. 형질전환체의 특성을 조사한 결과, plasmid 안정성은 pUB110이 pBD64보다 더 안정하였으며, 최대 효소활성은 비슷하였지만 효소 분비시간은 pUB110 은 2.5일, pBD64의 경우는 3일로 Bacillus속 K-17의 2일에 비해 약간 지연되었다.
각 효모 숙주 및 vector에 따라 lithium염 처리에 의한 생효모형질전환 최적 조건을 얻기 위하여 5종의 효모 숙주(S. cerevisiae Dl3-lA, DKD-5D, DBY-746, MC-16 및 S2022D)에 3종의 효모plasmid vector(YRp 7, YEp 13 및 YIp 5 )의 형질전환 실험과 아울러 이들 각 형질전환체내에서 도입된 plasmid들의 안정성을 조사하였다. lithium 염의 경우 LiCl가 Li-acetate에 비하여 좋은 효과를 보였으며 LiCl처리에 의한 최적 형질전환 조건은 각 숙주-vector계에 있어서 공히 균체 배양 시간은 16시간 (5.4 $\times$$10^6$ - 2.4$\times$$10^8$cells/$m{\ell}$ ) 내외, LiCl의 농도는 0.1-0.2M, PEG(4000)의 농도는 35%, induction시간은 60분 내외 열처리는 42$^{\circ}C$에서 5분간, LiCi처리 buffer는 0.1M tris-HCl(pH 7.6)에서 가장 높은 형질전환 빈도를 보였다. 한편 Protoplast 형질전환법과 형질전환빈도를 비교해 본 결과 DKD-5 D(YEp13)과 Dl3-lA(YRp7)의 경우는 protoplast법이 DKD-5D(YRp 7), 및 DBY-746(YEp 13)에서는 LiCl처리법이 형질전환 빈도가 높았으며 MC-16(YEp 13)의 경우는 양방법에서 공히 비교적 낮은 빈도를 보였다. 각 형질전환체내에서의 도입된 plasmid의 안정성은 선택배지에서 배양했을 경우- YRp 7이 Dl3-lA 및 DKD- 5D 숙주에서 70세대후에는 80-85%가 유실되었으나 YEp13은 DKD-5D 및 DBY-746에서 35%밖에 유실되지 않았으며 MC-16숙주에서는 55% 유실로서 비교적 안정하였다. 또한 비선택배지에 배양시에는 선택배지에 배양했을 경우 보다 안정성이 다소 낮았으나 같은 경향은 보였다.
A novel lactobacilli replicon from plasmids of Lactobacillus reuteri KCTC 3678 was isolated. Eight L. reuteri strains from Korean Collection for Type Cultures (KCTC) and Korea Food Research Institute (KFRI) were screened for cryptic plasmids and most strains harbored 1 or 2 plasm ids. Particularly, L. reuteri KCTC 3678 contained 6 plasm ids which all were used for screening of lactobacilli replicon. EcoRI digests of the plasmid DNA prep from L. reuteri KCTC 3678 were ligated with pUC19 and the recombinant DNAs were serially named from pLR1 to pLR7. A cat (chloramphenicol acetyltransferase; $Cm^r$) gene originated from pC194 was introduced into pLR1-7, resulting in pLR1cat-pLR7cat, respectively. The recombinant plasmids were introduced into L. reuteri KCTC 3679, and only transformants harboring pLR5cat were obtained, indicating that the insert in pLR5 functioned as a lactobacilli replicon.
Erro-prone PCR에 의해서 열안정성이 향상된 Streptomyces coelicolor A(3) 유래의 L-threonine aldolase를 Corynebacterium glutamicum R에서 과잉발현시키기 위하여 Corynebacterium용 vector plasmid인 pCRB1의 SD배열과 개시코든사이의 1염기를 제거한 고발현용 vector plasmid인 pCG-H44(2)를 구축하였다. pCG-H (2)에 의해서 형질전환된 C. glutamicum R 균주(CGH44-2)에서 L-TA를 발현시킨 결과, 기존의 Corynebacterium용 vector plasmid인 pCRB1(CGH44-1)보다 L-TA의 발현량이 높았다. L-threo-DOPS의 합성을 위한 최적조건은 $30^{\circ}C$, 0.1 M cirtric acid buffer(pH 7.0)이었으며, 0.1% TritonX-100를 첨가하였을 경우 보다 높은 활성을 보였다. 최적조건하에서 CGH44-2를 whole cell biocatalyst로 이용한 반복회분식반응에서 재조합대장균을 숙주로 이용한 경우보다 재조합Corynebacterium을 이용하였을 경우, 목적하는 L-threo-DOPS의 합성이 안정적으로 이루어졌다.
수질환경에서 일어나는 GEM 균주의 항생물질내성유전자의 전이동태를 연구하기 위하여, $Km^{r}$ plasmid 의 conjugation을 실시하였다. 그 결과 conjugant 들에 나타나는 plasmid 의 재배열을 agarose gel 에서 비교분석하였고, DNA probe 유전자의 행방을 추구하였다. GMM 균주들 (DKC600 과 DKC601) 의 $Km^{r}$유전자는 자연계 분리균주(DK1) 보다 더 높은 전이율이 나타났으나, recipient 에 따라 다소 차이가 있었다. Conjugant 들에서 나타나는 plasmid 의 재배열도 donor가 GMM 균주에서 전이된 plasmid 들은 특이하게 그 분자량이 커졌다. LB 에서 수온이 10.deg.C 보다는 25.deg.C 이상 그리고 pH 가 9 에서 5에 가까울수록$Km^{r}$ 유전자는 더 많이 전이되었으나, FW 에서는 수온과 pH 에 의한 영향이 거의 없었다. 또 FW 에서는 GMM 균주의 conjugant 들에서 chromosome 이외에 plasmid 가 거의 발견되지 않았다. 이와 같이 plasmid 들이 다양하게 재배열된 conjugant 들에서 Southern analysis 에 의하여 $Km^{r}$ 유전자의 행방을 알아본 결과, LB 에서는 DK1 뿐만 아니라 GMM 균주들의 $Km^{r}$ plasmid 가 전이된후 그대로 존재하였다. 그러나 FW 의 수질환경에서는 donor 의 $Km^{r}$ plasmid / 는 없어지고 chromosome 에서 hybridization signal 이 나타났다. 또 FW 에서는 donor 가 DK1 일 경우 pDK101 은 수온과 pH 의 영향없이 pDK101 이 그대로 전이되었다. 그러므로 LB 나 AW 에서는 DK1 뿐만 아니라 GMM 규주들의 Km$^{r}$ plasmid 가 전이된후 conjugant 에 그대로 존재하였고 기타의 plasmid 들이 다양하게 재배열되었지만, FW 수질환경에서는 DKC600 의 $Km^{r}$ 유전자가 수온이나 pH 에 상관없이 chromosome 에 integration 되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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