• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권3호
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• pp.279-288
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• 2002

본 연구는 국내 홀스타인 젖소 보증종모우 16두와 후보종모우 93두를 이용하여 선천성 장애 유전자의 검색을 통하여 불량 유전자의 존재 유무를 판별함과 동시에 가축의 선발 및 육종, 개량시 기초자료로 제공하고자 하는데 그 목적이 있으며, 본 연구의 결과를 요약하면 아래와 같다. 공시재료(홀스타인 젖소 보증종모우 16두, 후보 종모우 93두) 109두에 대하여 DUMPS (deficiency of uridine monophophate synthase)의 검색결과 모든 개체에서 DUMPS 유전자를 보유하는 개체는 없는 것으로 판명되었다. 또한 PCR-RFLP(Ava I) 방법에 의해 조기 검색이 가능하게 되었다. 한편, BLAD(bovine leukocyte adhesion deficiency) 검색결과, 보증종모우 16두에서는 검출되지 않았으나, 후보우 93두중 5두에서 BLAD 잠재성 보유개체(carrier)로 판명되었고, 혈통확인을 통하여 BLAD 유전자의 전이 경로를 추정할 수 있었으며, PCR 증폭산물에 대한 제한효소 처리시 HaeⅢ 보다는 TaqⅠ 제한효소를 사용하였을 때 더 효율적으로 판명할 수 있는 것으로 나타났다. Citrullinemia 검색결과 보증종모우 16두 및 후보종모우 93두 모두에서 잠재성 보유개체는 없는 것으로 판명되었으나 citrullinemia에 대한 폭넓고 다양한 조사 및 분석이 이루어져야 할 것으로 사료된다. 본 연구의 결과로 미루어 볼 때 가축의 유전성 질환에 대한 다양하고 폭넓은 연구가 이루어 져야 할 것으로 사료되며, 가축의 선발과 육종, 개량에 있어서 지속적이며 혈통의 철저한 관리를 통한 개량의 방향을 설정하여야 할 것으로 판명되었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제52권5호
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• pp.357-366
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• 2010

한우의 유전체 전장의 정보를 Illumina BeadArray$^{TM}$ Bovine SNP50 assay를 이용하여 단일염기다형 현상을 조사한 결과, 유전적 다양성을 보이는 좌위가 약 32,567 좌위 이상에서 다양성을 보이고 있었으며 약 5,554 좌위에서 다양성이 조사되지 않았다. 이는 조사된 자료의 가계집단의 수가 크게 제한되었기 때문에 기인될 수 있으며 또 다른 원인으로는 한우 종축집단의 크기가 작을 수 있다는 현상을 반증한다고 사료된다. 유전분석의 기초가 되는 혈통기록에 의한 개체간 혈연관계를 유전체 정보에 의한 혈연관계와 비교하여 본 결과, 유전체 정보에 의한 혈연관계의 크기가 혈통기록에 의한 혈연관계보다 좀 더 정확하게 추정될 수 있다는 장점이 있으며 혈통기록상의 오류로 그릇된 혈연관계의 크기를 유전체 정보를 통하여 보완할 수 있다는 장점이 있다. 이러한 장점을 활용하면 유전체정보를 이용한 유전능력 평가의 정확성을 크게 향상시킬 수 있을 것으로 사료되었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제55권5호
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• pp.359-365
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• 2013

단형질 개체모형을 이용한 육종가 추정프로그램의 해를 구하는 컴퓨터 프로그램을 포트란 언어를 이용하여 자체개발하였고, 프로그램은 자료기반으로 반복적으로 계산을 해 나가는 간접법을 이용한 것으로 일반적인 알고리즘으로 프로그램을 개발하고 이의 효율을 개선한 개선알고리즘으로 프로그램을 개발하여, 두 프로그램 간 효율을 비교하였다. 기존의 전통적인 알고리즘은 순차적인 반복문을 이용하여 자료를 읽고 기록하는 방법이며, 새로운 알고리즘은 효과별로 LHS를 직접 작성하여 추정하는 방법을 사용하였다. 개발된 두 가지 프로그램으로 육종가를 추정하고, 그 추정 값이 정확하게 평가되었는지 알아보기 위하여 기존에 개발되어 사용되고 있는 BLUPF90 (Misztal, 2007)과 MTDFREML (Boldman 등, 1999)과 비교하여 보았다. 서로 다른 프로그램으로 추정된 육종가간의 상관은 전체 항목에서 99% 이상 고도의 상관이 나타났으며, 프로그램 추정치 간의 높은 상관으로 볼 때 Model I, Model II는 정확하게 개발되었고 평가된 것을 확인할 수 있었다. Solution이 수렴 될 때까지의 반복횟수는 Model I은 2,568 round, Model II는 1,038 round로 수렴되어 Model II가 Model I보다 작은 반복횟수에서 수렴이 된 것을 확인할 수 있었으며, 수렴속도는 Model I은 256.008초, Model II는 235.729초로 Model II가 Model I 보다 약 10% 정도 개선된 것을 확인할 수 있었다. 개발된 프로그램을 기존 D/B와 연계한다면 농가 및 지자체 등에 지속적인 개량 정보를 제공할 수 있으며, 농가 단위 암소 유전능력평가로 암소개량을 도모할 수 있을 것이라 사료된다.

• 한국버섯학회지
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• 제18권4호
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• pp.331-338
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• 2020

민자주방망이버섯의 대량 생산 및 상업적 실용화를 위하여 야생 균주에 비해 재배기간이 짧고 자실체 발생이 잘 이루어지는 신품종을 육성하기 위하여 본 연구를 수행하였다. 민자주방망이버섯 유전자원 18계통을 수집하고 볏짚발효배지를 이용한 상자 재배를 통해 자실체가 발생한 4계통을 교배모본으로 선발하였다. 단포자 교배를 통해 671조합의 교배를 하였으나 'CBMLN-19' 계통과 'CBMLN-30' 계통을 교배한 17조합만이 교배가 이루어졌다. 그 중 균사 생장이 빠르고 밀도가 높은 8계통을 1차 선발하였다. 볏짚발효배지에 유전자원 14계통, 교배계통 8계통을 접종 후 배양기간을 조사한 결과 교배계통 중 6계통은 20일만에 배양이 완료되었으며 유전자원 14계통 중 7계통은 배양이 완료되기 까지 40일 이상이 소요되어 대부분의 교배계통에서 배양기간이 20일 이상 단축되었다. 배양이 완료된 계통은 식양토를 1~2 cm 복토하여 후 배양을 하였고 균사 배양이 완전히 완료되었을 때 균긁기를 한 후 자실체 발생을 유도하였다. 발생 유도 환경은 온도 14℃, 상대습도 95% 이상, CO2농도 1,500~2,000 ppm 이었으며, 야간에 6℃로 온도를 낮추어 하온 충격을 주었다. 그 결과 유전자원 'CBMLN-31', 'CBMLN-44' 2계통, 교배계통 'CBMLN-96', 'CBMLN-103' 2계통 총 4계통에서 자실체가 발생하였다. 접종 후 자실체가 발생되기까지의 기간은 대조구인 유전자원 'CBMLN-31'이 100일로 가장 길었고, 교배계통인'CBMLM-103'이 45일로 가장 짧았다. 자실체 특성 조사 결과 교배계통인 'CBMLN-103'은 개체중이 1.9 g으로 작은 형태를 나타냈으며, 상자 당 유효경수 123개로 4계통 중 발생량이 가장 많았다. 또 다른 교배계통 'CBMLN-96'은 개체중이 5.5 g 으로 'CBMLN-103' 보다 큰 형태를 나타냈으나, 상자 당 유효경수는 30개로 발생량이 적었다. 수량성 조사 결과 대조구인 'CBMLN-31'계통에서 상자 당 수량 783 g으로 가장 높게 나타났고, 교배계통 'CBMLN-96'은 165 g, 'CBMLN-103'은 232 g으로 나타났다. 교배계통 2계통에서 수량성은 대조구 'CBMLN-31'보다 낮았지만 자실체 발생량이 많았으며, 재배기간이 40일~55일 단축되어 이 2계통을 우량계통으로 선발하고자 한다.

• 생명과학회지
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• 제32권4호
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• pp.279-284
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• 2022

본 연구는 일반농가에서 적용 가능한 유전평가시스템을 구축을 위해 경기 지역에서 사육중인 암소 619두를 BLUP (Best Linear Unbiased Prediction)과 GBLUP (Genomic Best Linear Unbiased Prediction)을 사용하여 각 형질(도체중, 등심단면적, 등지방두께, 근내지방도) 별 추정 육종가의 정확도를 비교분석 하였다. GBLUP의 경우 참조집단의 크기를 다르게 그룹을 나누어 분석하였다. 분석결과 GBLUP 참조집단의 크기가 커질수록 각 형질의 육종가의 정확도도 상승하는 것을 확인 하였다. BLUP과 GBLUP 방법을 사용하여 추정한 육종가의 정확도를 비교하면, GBLUP 방법을 사용하여 육종가를 추정하였을 때 도체중, 등심단면적, 등지방두께 근내지방도순으로 각각 0.10, 0.09, 0.09, 0.11 이상 상승한 것을 확인할 수 있었다. 따라서, GBLUP 방법을 암소 평가 및 선발에 적용한다면, 정밀하고 정확한 개체 선발이 가능하고 참조집단의 크기를 더욱 키운다면 보다 정확한 개체 선발을 할 수 있기 때문에 선발의 효율성이 증가할 것으로 사료된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제25권9호
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• pp.1216-1222
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• 2012

Somatic cells count (SCC), milk yield (MY) and pedigree information of 2,791 first lactation cows that calved between 1990 and 2010 on 259 Thai farms were used to estimate genetic parameters and trends for SCC and its genetic association with MY. The SCC were log-transformed (lnSCC) to make them normally distributed. An average information-restricted maximum likelihood procedure was used to estimate variance components. A bivariate animal model that considered herd-yr-season, calving age, and regression additive genetic group as fixed effects, and animal and residual as random effects was used for genetic evaluation. Heritability estimates were 0.12 (SE = 0.19) for lnSCC, and 0.31 (SE = 0.06) for MY. The genetic correlation estimate between lnSCC and MY was 0.26 (SE = 0.59). Mean yearly estimated breeding values during the last 20 years increased for SCC (49.02 cells/ml/yr, SE = 26.81 cells/ml/yr; p = 0.08), but not for MY (0.37 kg/yr, SE = 0.87 kg/yr; p = 0.68). Sire average breeding values for SCC and MY were higher than those of cows and dams (p<0.01). Heritability estimates for lnSCC and MY and their low but positive genetic correlation suggested that selection for low SCC may be feasible in this population as it is in other populations of dairy cows. Thus, selection for high MY and low SCC should be encouraged in Thai dairy improvement programs to increase profitability by improving both cow health and milk yield.

• 한국수정란이식학회지
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• 제28권2호
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• pp.79-85
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• 2013

The recent development in genetic assisted selection (combining traditional- and genome assisted selection method) and reproduction technologies will allow multiplying elite cow in Hanwoo small farm. This review describes the new context and corresponding needs for genome assisted selection schemes and how reproductive technologies can be incorporated to get more genetic gain for cow genetic improvement in Hanwoo. New improved massive phenotypes and pedigree information are being generated from commercial farm sector and these are allowing to do genetic evaluation using BLUP to get elite cows in Korea. Moreover cattle genome information can now be incorporated into breeding program. In this context, this review will discuss about combining the reproductive techniques (Multiple Ovulation Embryo Transfer; MOET) and genome assisted selection method to get more genetic gain in Hanwoo breeding program. Finally, how these technologies can be used for multiplication of elite cow in small farm was discussed.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제25권8호
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• pp.1063-1072
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• 2012

Effective population size ($N_e$) is an important measure to understand population structure and genetic variability in animal species. The objective of this study was to estimate $N_e$ in Sapsaree dogs using the information of rate of inbreeding and genomic data that were obtained from pedigree and the Illumina CanineSNP20 (20K) and CanineHD (170K) beadchips, respectively. Three SNP panels, i.e. Sap134 (20K), Sap60 (170K), and Sap183 (the combined panel from the 20K and 170K), were used to genotype 134, 60, and 183 animal samples, respectively. The $N_e$ estimates based on inbreeding rate ranged from 16 to 51 about five to 13 generations ago. With the use of SNP genotypes, two methods were applied for $N_e$ estimation, i.e. pair-wise $r^2$ values using a simple expectation of distance and $r^2$ values under a non-linear regression with respective distances assuming a finite population size. The average pair-wise $N_e$ estimates across generations using the pairs of SNPs that were located within 5 Mb in the Sap134, Sap60, and Sap183 panels, were 1,486, 1,025 and 1,293, respectively. Under the non-linear regression method, the average $N_e$ estimates were 1,601, 528, and 1,129 for the respective panels. Also, the point estimates of past $N_e$ at 5, 20, and 50 generations ago ranged between 64 to 75, 245 to 286, and 573 to 646, respectively, indicating a significant $N_e$ reduction in the last several generations. These results suggest a strong necessity for minimizing inbreeding through the application of genomic selection or other breeding strategies to increase $N_e$, so as to maintain genetic variation and to avoid future bottlenecks in the Sapsaree population.

• 한국연초학회지
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• 제17권1호
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• pp.27-32
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• 1995

A new flue-cured tobacco mutant line BU 8832-85 was developed at Taegu Experiment Station, Korea Ginseng and Tobacco Research Institute in 1994. KF 8832-85 was resulted from a cross of flue-cured cultivars NC 95$\times$NC 2326, and developed by a pedigree system of breeding ; initial selection was made by plant type and resistance to bacterial wilt(BW) disease(heudomonas solanaceamm) in the F2 generation under the natural field conditions infested with the pathogen. One white flowered plant was occurred by spontaneous mutation in a certain line among the F3 generatioin while the others were pink. Six plants from the seeds by selfing were selected at the field infested with the pathogen among 240 populations with white flowering in the F4, KF 8832-85 was selected based on yield and leaf quality trials among 6 lines in Fs generation. BCF 8832-85 was compared with its Parent for certain agronomic and chemical characteristics at Taegu Experiment Station in 1993 and 1994. The results showed that KF 8832-85 have white flower, the stalk height was approximately that of NC 2326 but averaged about loom taller than NC 95. It produced ground suckers as much as NC 95, and did not breakdown leaf at the same as WC 2326. KF 8832-85 have high resistance to bacterial wilt disease. Yield of KF 8832-85 was 10 and 18% higher then that of NC 2326 and WC 95, respectively. Price per Kg was equal to that of NC 2326. The contents of nicotine and reducing sugar did not differ significantly from NC 95, while total nitrogen was significantly lower than NC 95. Therefore, the new mutant line is genetically stable for agronomic and chemical characteristics and provides a source of bacterial wilt disease resistance for use in breeding resistant flue-cured cultivars. Key words : Mutant line, White flower, Spontaneous mutation.

• Animal Bioscience
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• 제34권4호
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• pp.516-524
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• 2021

Objective: The genetic evaluation of Santa Inês sheep was performed for resistance to gastrointestinal nematode infection (RGNI) and body size using different relationship matrices to assess the efficiency of including genomic information in the analyses. Methods: There were 1,637 animals in the pedigree and 500, 980, and 980 records of RGNI, thoracic depth (TD), and rump height (RH), respectively. The genomic data consisted of 42,748 SNPs and 388 samples genotyped with the OvineSNP50 BeadChip. The (co)variance components were estimated in single- and multi-trait analyses using the numerator relationship matrix (A) and the hybrid matrix H, which blends A with the genomic relationship matrix (G). The BLUP and single-step genomic BLUP methods were used. The accuracies of estimated breeding values and Spearman rank correlation were also used to assess the feasibility of incorporating genomic information in the analyses. Results: The heritability estimates ranged from 0.11±0.07, for TD (in single-trait analysis using the A matrix), to 0.38±0.08, for RH (using the H matrix in multi-trait analysis). The estimates of genetic correlation ranged from -0.65±0.31 to 0.59±0.19, using A, and from -0.42±0.30 to 0.57±0.16 using H. The gains in accuracy of estimated breeding values ranged from 2.22% to 75.00% with the inclusion of genomic information in the analyses. Conclusion: The inclusion of genomic information will benefit the direct selection for the traits in this study, especially RGNI and TD. More information is necessary to improve the understanding on the genetic relationship between resistance to nematode infection and body size in Santa Inês sheep. The genetic evaluation for the evaluated traits was more efficient when genomic information was included in the analyses.