• 제목/요약/키워드: pathogenic factors

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Functional Identification and Genetic Analysis of O-Antigen Gene Clusters of Food-Borne Pathogen Yersinia enterocolitica O:10 and Other Uncommon Serotypes, Further Revealing Their Virulence Profiles

  • Bin Hu;Jing Wang;Linxing Li;Qin Wang;Jingliang Qin;Yingxin Chi;Junxiang Yan;Wenkui Sun;Boyang Cao;Xi Guo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제34권8호
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    • pp.1599-1608
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    • 2024
  • Yersinia enterocolitica is a globally distributed food-borne gastrointestinal pathogen. The O-antigen variation-determined serotype is an important characteristic of Y. enterocolitica, allowing intraspecies classification for diagnosis and epidemiology purposes. Among the 11 serotypes associated with human yersiniosis, O:3, O:5,27, O:8, and O:9 are the most prevalent, and their O-antigen gene clusters have been well defined. In addition to the O-antigen, several virulence factors are involved in infection and pathogenesis of Y. enterocolitica strains, and these are closely related to their biotypes, reflecting pathogenic properties. In this study, we identified the O-AGC of a Y. enterocolitica strain WL-21 of serotype O:10, and confirmed its functionality in O-antigen synthesis. Furthermore, we analyzed in silico the putative O-AGCs of uncommon serotypes, and found that the O-AGCs of Y. enterocolitica were divided into two genetic patterns: (1) O-AGC within the hemH-gsk locus, possibly synthesizing the O-antigen via the Wzx/Wzy dependent pathway, and (2) O-AGC within the dcuC-galU-galF locus, very likely assembling the O-antigen via the ABC transporter dependent pathway. By screening the virulence genes against genomes from GenBank, we discovered that strains representing different serotypes were grouped according to different virulence gene profiles, indicating strong links between serotypes and virulence markers and implying an interaction between them and the synergistic effect in pathogenicity. Our study provides a framework for further research on the origin and evolution of O-AGCs from Y. enterocolitica, as well as on differences in virulent mechanisms among distinct serotypes.

식초절임 무의 HACCP 시스템 적용을 위한 미생물학적 위해 분석 (Microbiological Hazard Analysis for HACCP System Application to Vinegared Pickle Radishes)

  • 권상철
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.69-74
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    • 2013
  • 본 연구는 식초절임 무의 HACCP (Hazard Analysis Critical Control Point)시스템 구축을 위하여 생물학적 위해요소분석을 위한 목적으로 2012년 2월 1일~6월 31일까지 약 150일 동안 수행하였다. 일반적인 식초절임 무 제조업체의 제조공정을 참고로 하여 공정도를 작성하였으며, 식초절임 무의 원료 농산물(무), 용수, 첨가물과 포장재료에 입고, 보관, 정선, 세척, 표피제거, 절단, 선별, 충진, 내포장, 금속검출, 외포장, 보관 및 출하공정에 대하여 작성하였다. 원료 무의 세척 전, 세척 후의 Coliform group, Staphylococcus aureus, Salmonella spp., Bacillus cereus, Listeria Monocytogenes, E. coli O157:H7, Clostridium perfringens, Yeast 와 Mold를 측정한 결과 Bacillus cereus는 세척 전 $5.00{\times}10$ CFU/g이었으나, 세척 후 검출되지 않았으며, Yeast 와 Mold 는 세척 전 $3.80{\times}10^2$ CFU/g, 세척 후 10 CFU/g로 감소되었으며 나머지 병원성균은 검출되지 않았다. 조미액의 pH(2~5)별 미생물의 변화를 시험한 결과 모든 균이 검출되지 않은 pH 3~4를 조미액의 pH로 결정하였다. 작업장별 공중낙하균 (일반세균수, 대장균, 진균수) 시험결과 내포장실, 조미액가공실, 세척실, 보관실의 미생물수는 10 CFU/Plate, 2 CFU/Plate, 60 CFU/Plate 그리고 20 CFU/Plate 가 검출되었다. 종사자 손바닥 시험결과 일반세균수 346 $CFU/Cm^2$, 대장균군 23 $CFU/Cm^2$로 높게 나타나 개인위생관리에 대한 교육 및 훈련이 요구 되었다. 제조설비 및 기구의 표면오염도를 검사한 결과 모든 시료에서 대장균군은 검출되지 않았고, 일반세균은 PP Packing machin과 Siuping machine (PE Bulk)에서 가장 많은 $4.2{\times}10^3CFU/Cm^2$, $2.6{\times}10^3CFU/Cm^2$ 검출되었다. 위의 위해분석 결과 병원성미생물을 예방, 감소 또는 제거할 수 있는 조미액 가공 공정이 CCP-B (Biological)로 관리되어야 하고, 한계기준은 pH 3~4로 결정하였다. 따라서 전통한과생산에의 HACCP 모델 적용을 위한 미생물학적 위해도 평가에서와 같이 조미액 가공 공정의 관리기준 및 이탈시 조치방법, 검증방법, 교육 훈련과 기록관리 등 철저한 HACCP 관리계획이 필요할 것으로 생각된다.

미나리(Oenanthe javanica) 수확 후 처리 환경에서의 위생지표세균 및 병원성 미생물 오염도 조사 (Investigation of Microbial Contamination in Oenanthe javanica at Postharvest Environments)

  • 김연록;이경아;최인욱;이영하;김세리;김원일;류송희;이효섭;류재기;김황용
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.268-277
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    • 2014
  • 본 연구는 미나리 수확 후 처리환경의 미생물학적 위해 요소를 조사하기 위해 4개 지역의 미나리 재배농가 9곳을 선정하였다. 미나리 재배농가로부터 다양한 시료를 채취하여 위생지표세균과 병원성 미생물(Escherichia coli O157:H7, Listeria monocytogenes, Staphylococcus aureus and Bacillus cereus)에 대한 오염도를 조사하였다. 먼저, 9개 농가의 재배환경의 미생물 오염도를 분석한 결과 총 호기성 세균과 대장균군이 각각 0~7.00, 0~4.25 log CFU/g, mL, or $100cm^2$ 수준으로 검출되었다. 대장균(E. coli)은 몇몇 농가의 토양, 관개용수, 세척수 및 작업자의 손에서 양성반응을 확인하였으며, 양성반응이 관찰된 농가의 경우 작물인 미나리에서도 양성반응을 보였다. 병원성 미생물 중 B. cereus는 토양에서 가장 많이 검출되었으며, 한 농가의 미나리를 제외한 모든 농가의 세척 후 미나리에서 평균 1.2 log CFU/g수준으로 검출되었다. 황색포도상구균은 세척 후 미나리에서 한 건 정성적으로 검출되었으며, 이외에 다른 병원성 미생물은 관찰되지 않았다. 미나리의 경우 손질 및 세척 후에도 오염도가 유사하거나 오히려 다소 증가하는 경향을 보였다. 이상의 결과 미나리 생산농가의 수확 후 처리 시설 및 작업자에 의해 미생물의 교차 오염 가능성이 있으므로 이에 대한 위생관리를 철저히 해야 한다. 또한, 안전성이 확보된 미나리 생산을 위해서는 GAP와 같은 관리제도의 적용이 필요하다.

인공 대수층내에서 발생하는 해수침투의 지화학적 분석 및 병원성 지표 미생물의 사멸 특성 (Geochemical Analysis and Fates of Pathogenic Indicating Bacteria on Seawater Intrusion in a Sand Box Model)

  • 이소정;박헌주;성은혜;소명호;김창균
    • 대한환경공학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.385-392
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    • 2008
  • 본 연구에서는 해수침투를 방지하기 위해 실험실에서 제조한 하수 방류수를 이용하였으며, 각각의 함양 및 양수 조건에 따른 해수침투 진행 과정을 지표미생물인 Escherichia coli와 Enterococcus faecalis를 이용하여 평가하였다. 해수침투의 대표적인 화학적 지표인자인 Cl$^-$와 Ca$^{2+}$, Mg$^{2+}$ 및 비전도도값 등은 해수에 의해 인공 대수층내의 지질매체와 양이온간의 이온 교환이 발생되는 수조 내에서 동시에 분석되었다. 지표 생물로 이용된 Escherichia coli와 Enterococcus faecalis 모두 해수침투에 따라 증가하는 염분 농도에 민감하게 반응하였으며, Enterococcus faecalis의 경우 Escherichia coli 보다 염분 농도에 더 큰 저항을 보였다. 시간에 따른 Enterococcus faecalis / Escherichia coli 값은 함양과 양수가 10 mL/min으로 동일할 경우에는 E. coli 초기 주입 농도가 90% 이상의 사멸을 보이는 18시간 이후에 50$\sim$100배 이상으로 증가하였다. 그러나 함양과 양수가 5 mL/min의 경우에는 E. coli의 완만한 사멸율로 인해 운전 시간 내내 2.5$\sim$5.0 사이의 일정한 비를 유지하였다. 또한 본 연구에서 분석된 염소 이온과 비전도도, Ca$^{2+}$ 및 Mg$^{2+}$농도는 서로간에 0.9 이상의 높은 상관관계를 나타내었으며, 인공 해수가 인공 대수층내로 침투되면서 일어나는 양이온 교환 반응의 진행 여부는 음의 $\Delta$Na, $\Delta$Mg값과 양의 $\Delta$Ca의 관측을 통해 효과적으로 확인할 수 있었다.

Inhibition of Microbial Quorum Sensing Mediated Virulence Factors by Pestalotiopsis sydowiana

  • Parasuraman, Paramanantham;Devadatha, B;Sarma, V. Venkateswara;Ranganathan, Sampathkumar;Ampasala, Dinakara Rao;Reddy, Dhanasekhar;Kumavath, Ranjith;Kim, In-Won;Patel, Sanjay K.S.;Kalia, Vipin Chandra;Lee, Jung-Kul;Siddhardha, Busi
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제30권4호
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    • pp.571-582
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    • 2020
  • Quorum sensing (QS)-mediated infections cause severe diseases in human beings. The control of infectious diseases by inhibiting QS using antipathogenic drugs is a promising approach as antibiotics are proving inefficient in treating these diseases. Marine fungal (Pestalotiopsis sydowiana PPR) extract was found to possess effective antipathogenic characteristics. The minimum inhibitory concentration (MIC) of the fungal extract against test pathogen Pseudomonas aeruginosa PAO1 was 1,000 ㎍/ml. Sub-MIC concentrations (250 and 500 ㎍/ml) of fungal extract reduced QS-regulated virulence phenotypes such as the production of pyocyanin, chitinase, protease, elastase, and staphylolytic activity in P. aeruginosa PAO1 by 84.15%, 73.15%, 67.37%, 62.37%, and 33.65%, respectively. Moreover, it also reduced the production of exopolysaccharides (74.99%), rhamnolipids (68.01%), and alginate (54.98%), and inhibited the biofilm formation of the bacteria by 90.54%. In silico analysis revealed that the metabolite of P. sydowiana PPR binds to the bacterial QS receptor proteins (LasR and RhlR) similar to their respective natural signaling molecules. Cyclo(-Leu-Pro) (CLP) and 4-Hydroxyphenylacetamide (4-HPA) were identified as potent bioactive compounds among the metabolites of P. sydowiana PPR using in silico approaches. The MIC values of CLP and 4-HPA against P. aeruginosa PAO1 were determined as 250 and 125 ㎍/ml, respectively. All the antivirulence assays were conducted at sub-MIC concentrations of CLP (125 ㎍/ml) and 4-HPA (62.5 ㎍/ml), which resulted in marked reduction in all the investigated virulence factors. This was further supported by gene expression studies. The findings suggest that the metabolites of P. sydowiana PPR can be employed as promising QS inhibitors that target pathogenic bacteria.

藏府와 身形의 病機 및 病症에 대한 比較考察 (Comparative study on patterns and symptoms of disharmony(病機病症) between the internal organs(藏府) and external bodily form(身形))

  • 백상룡
    • 대한한의학원전학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.21-21
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    • 2000
  • All living things including human being consist of soul(spirit) and body. Soul is the root of a life and body frames it. I wrote this paper to tell how internal injury due to endogenous etiological factors and affection due to exegenous pathogenic factors, affect the internal organs and the external bodily from. This paper begins with description of the patterns of disharmony of the internal organs. General disorders of each Five-Jang(五藏) an be classified into two types of soul and body. The Liver and the Heart which lead changing to Yang(陽) of vital energy, have close relationship with spiritual symptoms because spirit is related to Yang. The Lung, Kidneys, the Spleen which lead changing to m(陰) of vital energy, mainly connected with physical disorders because body is relatively close to m. The Five-Jang are ruled by the Five-Phases(五行) system and cause troubles with Oche(五體) and the nine body orifice. Otherwise the main function of the Six-Bu(六府) is to receive food, absorb the usuable portions, and transmit and excrete waste. Therefore they can cause such problems as abdominal pain, distention, difficulty in urination, and constipation. The spleen is responsible for sending Grain-Ki)穀氣) 내 that is closely connected with the six-Bu. The Gall bladder takes care of control of giving out spirit. That's why it presents many symptoms related to the spirit that is ruled by the Five-Jang. Patterns of disharmony of external bodily form is influenced by the state of Maridians. Bodily forms get divided into many parts by the function of six-meridians(六經) to which they belong. Six-meridians have their own function related to excretion, related to excretion, retention, and balance(開闔樞). If local bodily froms get affected by pernicious influences, the Meridians to which they are attached will lose harmony and connot fulfil their own functions. Because the meridian symtem unifies all parts of the body, the whole body will be under the influence of the affection although local parts of the bodily forms get affected. Therefore the symptoms of disharmony should be considered in a synthetic view. There are however, also cases which should be focused on the very meridian channels affected. Disorder within a Meridian generates derangement in the pathway make it not to benefit the muscles and skin belong to it. Because the meridians connect the interior organs with the exterior bodily form, they are influenced by each other.

장부(藏府)와 신형(身形)의 병기(病機) 및 병증(病症)에 대한 비교고찰(比較考察) (Comparative study on patterns and symptoms of disharmony(病機病症) between the internal organs(藏府) and external bodily form(身形))

  • 백상룡
    • 대한한의학원전학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.22-42
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    • 2000
  • All living things including human being consist of soul(spirit) and body. Soul is the root of a life and body frames it. I wrote this paper to tell how internal injury due to endogenous etiological factors and affection due to exogenous pathogenic factors, affect the internal organs and the external bodily from. This paper begins with description of the patterns of disharmony of the internal organs. General disorders of each Five-Jang(五藏) an be classified into two types of soul and body. The Liver and the Heart which lead changing to Yang(陽) of vital energy, have close relationship with spiritual symptoms because spirit is related to Yang. The Lung, Kidneys, the Spleen which lead changing to m(陰) of vital energy, mainly connected with physical disorders because body is relatively close to m. The Five-Jang are ruled by the Five-Phases(五行) system and cause troubles with Oche(五體) and the nine body orifice. Otherwise the main function of the Six-Bu(六府) is to receive food, absorb the usable portions, and transmit and excrete waste. Therefore they can cause such problems as abdominal pain, distention, difficulty in urination, and constipation. The spleen is responsible for sending Grain-Ki(穀氣) so that is closely connected with the six-Bu. The Gall bladder takes care of control of giving out spirit. That's why it presents many symptoms related to the spirit that is ruled by the Five-Jang. Patterns of disharmony of external bodily form is influenced by the state of Meridians. Bodily forms get divided into many parts by the function of six-meridians(六經) to which they belong. Six-meridians have their own function related to excretion, related to excretion, retention, and balance(開闔樞). If local bodily forms get affected by pernicious influences, the Meridians to which they are attached will lose harmony and cannot fulfil their own functions. Because the meridian system unifies all parts of the body, the whole body will be under the influence of the affection although local parts of the bodily forms get affected. Therefore the symptoms of disharmony should be considered in a synthetic view. There are however, also cases which should be focused on the very meridian channels affected. Disorder within a Meridian generates derangement in the pathway make it not to benefit the muscles and skin belong to it. Because the meridians connect the interior organs with the exterior bodily form, they are influenced by each other.

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주암호에서 미세조류의 계절적 군집 변화 (Seasonal Variation of Picoplankton Community in Lake Juam)

  • 정정조
    • 대한환경공학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.271-277
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    • 2010
  • 본 연구에서는 다목적댐인 주암호에서 물리화학적 인자의 변화에 따른 미세조류의 계절적 변동특성을 파악하는 것을 목적으로 하여, 4회에 걸쳐 주암호 3개 지점에서 기초환경 변화와 Micro-, Nano-, Picoplankton의 계절적 군집변화 양상을 조사하였다. 강수량이 많고 수온이 가장 높았던 7월에 평균 Chl-a의 농도가 18.03 mg/$m^3$으로 가장 높은 결과를 나타내었으며, 그 다음이 10월, 4월 그리고 1월이 가장 낮은 1.86 mg/$m^3$으로 조사되었다. 모든 계절에서 표층 보다는 수심 2 m와 5 m의 수층에서 가장 높은 Chl-a의 농도를 나타내었으며, 그 이상의 수심에서는 Chl-a의 농도가 점차 감소하는 경향을 보였다. 전체적으로 20~200 ${\mu}m$의 Microplankton이 33.9~54.2%로 가장 높은 비율을 차지하고 있었으며, 2~20 ${\mu}m$의 Nanoplankton이 24.3~30.5%를 점유하고 있었으며, 나머지 2 ${\mu}m$ 미만의 Picoplankton이 21.6~41.2%의 비율을 차지하고 있는 것으로 조사되었다. 따라서 주암호에서 취수된 원수의 경우는 picoplankton과 같은 미세플랑크톤이 상당비율로 포함되어 있기 때문에 응집?침전 및 사여과 공정 등의 같은 정수처리 공정에서 제거되지 못한다면 후속공정인 염소소독에 의해 미세플랑크톤의 세포내의 물질이 생물학적으로 분해 가능한 유기물(AOC; Assimilable organic carbon)로 전환되어 후속 공정인 급수 배수관망에서 세균 및 병원미생물의 재증식(Regrowth)을 유발시킬 가능성이 있을 것을 판단해 볼 수 있다.

금궤요략${\cdot}$경계토뉵하혈흉만어혈병맥증병치 제십육(第十六)에 대(對)한 연구(硏究) (Study on the 'Diagnosis and Treatment of Terror and Palpitation due to Fright and the Several Hemorrhagic Diseases' in Synopsis of Golden Chamber)

  • 윤주헌;박금숙;권미자;임동국;정헌영
    • 동의생리병리학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.13-24
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    • 2008
  • This Chapter mentioned Terror and Palpitation due to Fright(驚悸) and Hemorrhagic disease(血證). Terror and Palpitation due to FrightAcctually Terror(驚) is different from Palpitation(悸). Terror(驚) is one of the seven emotions. But in this case, It refer to the Palpitation and the uneasiness of mind due to one's hearing a strange sound of seeing a strange. Tremulous Pulse can be appear. So Terror(驚) is caused by Exopathic Factors(外因) and belongs to Excess syndrome(實證). Palpitaion(悸) is the sensation of plamus, palpitation and unrest not because of being frightened. It is usurally caused by the deficiency of Ki(氣) and blood(血). So Deep, Thready and weak pulse can be appear. So Palpitaion(悸) is caused by Endopathic Factors and belongs to Deficiency Syndrome. In this Chapter, Terror and Palpitation due to Fright(驚悸) treat with the Kyeji-ke-jakyak-ka-chokchil-moryu-yongkol-kuyuk-tang(桂枝去芍藥加蜀漆牡蠣龍骨救逆湯) and Banha-mahwang-hwan(半夏麻黃丸). There are two type in Hemorrhagic disease(血證). One is bleeding(出血) and another is blood stasis(瘀血). The contents which relate with the Hemorrhagic disease(血證) are Hematemisis(吐血), Rhinorrhagia, Hemafecia(下血). In hemorrhage pathological mechanisms, there are two mechanisms. One is that Fire and Heat(火熱) pressure blood. Another is that cold and deficiency(虛寒) disable Ki(氣) from keeping blood flowing within vessels. Blood stasis(瘀血) can be called Extravasated Blood(惡血), Coagulated Blood, Blood retention(蓄血,積血), Dead Blood(死血) and Emaciation due to Blood disorder(乾血). It refer to a morbid state of unsmooth circulation and blood stagnancy often resulting from Ki(氣) stagnation, Ki(氣) deficiency and accumulation of pathogenic coldness. The symptom of Blood stasis are 'Fullness sensation in the chest, Lip Flaccidity, Cyonotic Tongue and Dryness of Mouth'. And the man who have Blood stasis, want to rinse his mouth with the water, but he can't drink the water because there isn't interior Heat of Excess Type. The symptom of Cyonotic Tongue(舌靑) had influence on diagnosing Blood stasis(瘀血) in offspring.

지질대사 조절에서 SREBP의 역할 (SREBP as a Global Regulator for Lipid Metabolism)

  • 이원화;서영교
    • 생명과학회지
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    • 제28권10호
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    • pp.1233-1243
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    • 2018
  • SREBPs는 지질의 항상성 및 대사를 조절하는 전사 인자이다. 이들은 내인성 콜레스테롤, 지방산(FA), 트리아실글리세롤(TG) 및 인지질 합성에 필요한 효소의 발현을 정밀하게 조절한다. 3종류의 SREBP 단백질은 2개의 다른 유전자에 의해 암호화 된다. SREBP1 유전자는 SREBP-1a와 SREBP-1c를 만든다. 이는 RNA의 alternative splicing에 의한 대체 프로모터의 이용으로부터 유도된다. SREBP-2는 별도의 유전자에서 유래한다. 또한, SREBPs는 ER 스트레스, 염증, 자가포식 및 세포사멸과 같은 수많은 병인과정에 관여하며, 비만, 이상 지질혈증, 당뇨병 및 비알콜성 지방간 질환 등을 유발하는 것으로 알려져 있다. 유전체의 분석은 SREBPs가 생물학적 신호 전달, 세포 신진 대사, 및 성장을 조절하는 중요한 연결고리임을 보여 주었다. 이 과정에서 SREBP는 PI3K-Akt-mTOR 경로를 통해 활성화 된다고 알려져 있다. 하지만 정확한 분자 메커니즘은 좀더 밝혀져야 한다. 이 리뷰에서는 세포, 기관 및 생물개체 수준의 생리학 및 병태 생리학 영역에서 SREBP의 역할에 대한 포괄적인 이해를 넓혀 줄 것이다.