• 제목/요약/키워드: partition coefficient(logP)

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Physical properties and determination of eupatilin, a new antigastritic agent, by high performance liquid chromatography

  • Jang, Ji-Myun;Shim, Hyun-Joo;Ahn, Byung-Ok;Kim, Soon-Hoe;Kim, Won-Bae
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2-2
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    • pp.215.3-216
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    • 2003
  • Eupatilin is a major active component of Stillen\ulcorner(Artemisia Herba Extract) having a potent antigastritic effect. We investigated the physical properties of eupatilin using high performance liquid chromatography. Solubility, stability & partition coefficient of eupatilin were investigated. pH-stability of eupatilin was examined over the broad range through pH1-9 at 37$^{\circ}C$ & it has good stability above the broad range pH. The solubility of eupatilin was extremely low but the value of logP was more than 2. Also, a high performance liquid chromatographic method was developed for the determination of eupatilin in rat plasma. (omitted)

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제한효소의 인식자리 변화 -BamHI 특이성에 미치는 산도와 소수성의 영향- (Alteration of Recognition Sequence by Restriction Endonuclease -Effect of pH and Hydrophobicity on BamHI-)

  • 이강민
    • KSBB Journal
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    • 제11권2호
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    • pp.193-200
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    • 1996
  • DNA를 인식하여 절단하는 제한효소의 발견은 유전자를 연구, 조작할 수 있게 되어 분자생물학 연구에 큰 발전을 가져 왔다. 제한효소의 인식자리는 반 응용액의 산도, 유기용애의 소수성에 따라서 달라질 수 있다. 제한 효소 BamHI의 특이성 변화는 유기용 매의 소수성CLogP)과 산도에 직접적인 관계가 있다. 제한효소 BamHI의 인식자리의 특이성 변화는 산도 7.5에셔 LogP값이 -1.3~-1.35, 8.0에서 -1. 0 03~-2.5, 8.5에서 0.75~-2.5, 8.9에서 -0.32 ~­2 2.5 벙위에셔 각각 나타난다. 통일한 유기용매 혼합 물에서 산도가 알카리 일수록 낮은 유기용매 놓도에 서 특이성의 변화가 나타난다. DMSO용액에서 Bam H HI의 특이성 변화는 산도가 7.5일때 20% 농도에서 나타나지만 산도가 8.9일때는 4%에서 나타난다.

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유기용매에 의하여 유발된 Aeromonas hydrophila Bct4의 변형 (Modifications Induced by Organic Solvents to Aeromonas hydrophila IB Bct4)

  • Lazaroaie, Mihaela Marilena
    • 대한화학회지
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    • 제53권3호
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    • pp.325-334
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    • 2009
  • 유기용매들에 대한 내성을 갖고 분해할 수 있는 능력을 가진 박테리아가 해수에서 단리되었지만, 해양조건에서 유기용매가 분해될 때 그들의 역할은 잘 알려져 있지 않았다. 콘스탄차 해수에서 단리된 Aeromonas hydrophila IB$B_{ct4}$는 여러 다른 종류의 유기용매들에 대하여 내성을 갖고 분해할 수 있는 능력을 가지고 있다. 옥탄올-헥산 혼합물에서 2.64 - 3.17 사이의 분배계수지수 (log $P_{ow}$)를 가진 톨루엔, 크실렌 이성질체들 및 에틸벤젠은, 3.69 - 4.39 사이의 log $P_{ow}$를 가진 프로필벤젠, n-헥산 및 n-헵탄보다 이들 박테리아에 더 독성이 있었다. Aeromonas hydrophila IB$B_{ct4}$에 유기용매들을 처리하였을 때 분자수준에서 세포의 변형이 유발되었다. 다른 유기용매들에 의하여 분자수준에서의 세포변화가 다르게 나타난다는 것을 밝힌 이 연구는 배양 조건에서 유기용매에 대한 박테리아 세포들의 반응이 복잡하다는 것을 보여 주고 있다.

3D 프린팅 소재 화학물질의 독성 예측을 위한 Data-centric XAI 기반 분자 구조 Data Imputation과 QSAR 모델 개발 (Data-centric XAI-driven Data Imputation of Molecular Structure and QSAR Model for Toxicity Prediction of 3D Printing Chemicals)

  • 정찬혁;김상윤;허성구;;신민혁;유창규
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제61권4호
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    • pp.523-541
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    • 2023
  • 3D 프린터의 활용이 높아짐에 따라 발생하는 화학물질에 대한 노출 빈도가 증가하고 있다. 그러나 3D 프린팅 발생 화학물질의 독성 및 유해성에 대한 연구는 미비하며, 분자 구조 데이터의 결측치로 인해 in silico 기법을 사용한 독성예측 연구는 저조한 실정이다. 본 연구에서는 화학물질의 분자구조 정보를 나타내는 주요 분자표현자의 결측치를 보간하여 3D 프린팅의 독성 및 유해성을 예측한 Data-centric QSAR 모델을 개발하였다. 먼저 MissForest 알고리즘을 사용해 3D 프린팅으로 발생되는 유해물질의 분자표현자 결측치를 보완하였으며, 서로 다른 4가지 기계학습 모델(결정트리, 랜덤포레스트, XGBoost, SVM)을 기반으로 Data-centric QSAR 모델을 개발하여 생물 농축 계수(Log BCF)와 옥탄올-공기분배계수(Log Koa), 분배계수(Log P)를 예측하였다. 또한, 설명 가능한 인공지능(XAI) 방법론 중 TreeSHAP (SHapley Additive exPlanations) 기법을 활용하여 Data-centric QSAR 모델의 신뢰성을 입증하였다. MissForest 알고리즘 기반 결측지 보간 기법은, 기존 분자구조 데이터에 비하여 약 2.5배 많은 분자구조 데이터를 확보할 수 있었다. 이를 바탕으로 개발된 Data-centric QSAR 모델의 성능은 Log BCF, Log Koa와 Log P를 각각 73%, 76%, 92% 의 예측 성능으로 예측할 수 있었다. 마지막으로 Tree-SHAP 분석결과 개발된 Data-centric QSAR 모델은 각 독성치와 물리적으로 상관성이 높은 분자표현자를 통하여 선택함을 설명할 수 있었고 독성 정보에 대한 높은 예측 성능을 확보할 수 있었다. 본 연구에서 개발한 방법론은 다른 프린팅 소재나 화학공정, 그리고 반도체/디스플레이 공정에서 발생 가능한 오염물질의 독성 및 인체 위해성 평가에 활용될 수 있을 것으로 사료된다.

중공사 나노여과막을 이용한 방향족 농약의 배제 특성 (Rejection Properties of Aromatic Pesticides by a Hollow Fiber NF Membrane)

  • 정용준;키소 요시아키;박순길;김종용;민경석
    • 한국물환경학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.296-300
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    • 2004
  • The rejection properties of 6 aromatic pesticides were evaluated by a continuous flow system equipped with a hollow fiber NF membrane. Different from the separation experiment of batch cell, the rejection and the removal could be calculated exactly because the concentration of feed, permeate and retentate was separately obtained. The lowest and the highest rejection were found in carbaryl(54.8%) and methoxychlor(99.2%), respectively, and the removals were always shown higher than rejections. This may be caused by some reasons such as the solute adsorption on the membrane, the variation of feed concentration. Although molecular weight, molecular width regarded as solute characteristics and log P(n-octanol/water partition coefficient) as hydrophobicity could be applied to explain the rejection property, these factors should be considered together for better analysis. According to the higher relationship between log B(solute permeability) and molecular weight, it was revealed that the solute separation with this membrane was influenced more by molecular weight.

Carbamate계 농약의 생체농축계수 측정 (Determination of Bioconcentration Factor on Carbamates)

  • 민경진
    • 한국환경보건학회지
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    • 제20권4호
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    • pp.80-89
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    • 1994
  • It was reported that BCF's (Bioconcentration Factor) on Carbaryl and BPMC in concentration of 1, 2, 5 and 10 ppm, previously. Carassius auratus(goldfish) was chosen as test organism. Carbamates in fish and in test water were extracted with n-hexane and acetonitrile. GC-ECD was used to detecting and quantitating of Carbamates. Also, partition coefficients were determined with Stir flask method. To evaluate environmental toxicological profiles of tested compounds, experimental concentration were 0.05, 0.1 and 0.5 ppm in contrast to previous report. It was considered that higher BCFs of BPMC due to its higher partition coefficient compared to Carbaryl. The obtained results were as follows: 1. It was possible to determine short term BCF of Carbaryl and BPMC through relatively simple procedure in environmental concentrations. 2. BCF$_3$ of Carbaryl in concentration of 0.05, 0.1 and 0.5 ppm were 4.666 $\pm$ 0.002, 3.622 $\pm$ 0.004, 1.200 $\pm$ 0.002 and BCF$_5$ were 3.897 $\pm$ 0.005, 4.219 $\pm$ 0.017 and 1.186 $\pm$ 0.054, respectively. In the case of BPMC in same condition, BCF$_3$ were 4.077 $\pm$ 0.014, 4.900 $\pm$ 0.005, 4.750 $\pm$ 0.009 and BCF$_5$ were 3.465 $\pm$ 0.010, 4.612 $\pm$ 0.011 and 4.075 $\pm$ 0.012, respectively. 3. Carbaryl concentration in fish extract was increased as increasing test concentration, but BCF were decreased as prolonging test period, especially dropped at 0.5 ppm. 4. In the case of BPMC, BCF were decreased as increasing test concentration, but the concentration in fish extract of 3-day test group was slightly higher than that of 5-day test group. 5. Higher BPMC concentration in fish extract was due to its higher partition coefficient to compared with Carbaryl. 6. Determined logP of Carbaryl and BPMC were 2.200 and 3.180. But the calculated BCF using suggested equation was so different that predict BCF. It is suggested that BCF's of Carbamates have to be determined by experiment.

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농약의 물리화학적 특성연구 (I) Captafol의 수용성, 가수분해, 증기압, 옥탄올/물 분배계수 (Study on Physicochemical Properties of Pesticide. (I) Water Solubility, Hydrolysis, Vapor Pressure, and n-Octanol/water Partition Coefficient of Captafol)

  • 김정한;이성규;김용화;김균
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제40권1호
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    • pp.71-75
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    • 1997
  • 농약의 물리화학적 특성에 관한 연구의 일환으로 captafol의 수용성, 가수분해, 증기압, 분배계수를 표준 측정기법 인 미국 EPA와 OECD 방법에 준하여 측정하였다. 수용성은 $25^{\circ}C$ 조건에서 2.24 ppm이었으며, 가수분해에 의한 반감기는 $25^{\circ}C$에서 77.8시간(pH 3.0), 6.54시간(pH 7.0), 0.72시간(p班 8.0)으로 나타나 알칼리 조건에서 불안정한 화합물임을 확인하였다. 산성조건에서의 반감기는 온도에 영향을 받지 않았으나, 중성, 알칼리 조건에서의 반감기는 $40^{\circ}C$에서 매우 짧았다. 가수분해 실험의 표준 대조물질인 diazinon을 이용하여 실험한 결과 본 연구실에서 수행한 가수분해 실험은 적합한 것으로 판정되었다. Captafol은 상온에서 증기압 ($8.27{\times}10^{-9}\;torr,\;20^{\circ}C$)이 높지 않으므로 휘발에 의하여 대기환경에 영향을 미칠 가능성은 없으리라 예상되었고, log P=6.94-(4401.6/T)라는 관계식을 유도할 수 있었다. Captafol은 옥탄올/물 분배계수치가 높아(Kow=1,523) 먹이연쇄를 통한 생물농축의 가능성이 예상되나 가수분해가 빠르기 때문에 비록 captafol이 수계에 노출된다고 하여도 분해가 빠르게 일어나 어류 생체내에 농축되어 인체에까지 영향을 미칠 가능성은 매우 낮을 것으로 사료되었다.

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계면활성제 탈착촉진법을 이용한 폴리클로네이티드 바이페닐(PCBs)과 페놀류(Phenols)에 의하여 오염된 지반의 정화방안 (Remediation Technique for PCBs-and Phenols-Contaminated Soils by Surfactant-Enhanced Desorption)

  • 박준범;윤현석;김준섭
    • 한국지반공학회논문집
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    • 제15권5호
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    • pp.241-257
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    • 1999
  • 유해 유기 오염물에 의한 지반 오염이 심각한 사회문제로 부각되고 있다. 지반 내로 유입된 소수성 유기 화합물은 대부분 난분해성이며, 일단 흙에 흡착되면 제거하기 어려워 오랜 기간에 걸쳐 지하수 오염원으로 작용하게 된다. 이러한 지반 오염의 심각성은 이미 인식되어 왔지만 이를 위한 적절한 정화 방법은 아직 제시되고 있지 않다. 본 논문에서는 유해 유기물 중 p-Cresol과 3,5-Dichlorobiphenyl에 대하여 계면활성제 용액을 이용한 정화 방법의 적용성을 실험을 통해 연구하였다. 중성 계면활성제, Triton X-100과 음이온성 계면활성제, SDS가 탈착용액으로 사용되었다. 먼저 흙과 유기화합물과의 흡착 특성을 파악하고, 계면활성제 용액을 이용한 회분식 탈착 실험과 연성벽체 투수기를 이용한 주상 실험을 실시하였다. 등온흡착실험에서 각 물질의 선형분배계수, $K_p와\; 옥탄올-물\; 분배계수,\; K_{ow}$는 대수 선형 관계식으로 나타났다. 3,5-Dichlorobiphenyl의 경우 회분식 실험에서 0.5 % 농도의 Triton X-100용액으로의 탈착량이 물에 의한 탈착량에 비하여 28배의 향상을 나타내었다. 지반 오염물질이 소수성이며, 난분해성이 클수록 계면활성제 용액을 이용한 지반정화 효율이 높은 것으로 나타났다.

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Ex Vivo Permeability Characteristics of Porcine Buccal Mucosa to Drugs with Various Polarity

  • Lee, Jae-Hwi;Lee, Yoon-Jin;Yoon, Mi-Kyeong;Choi, Young-Wook
    • Journal of Pharmaceutical Investigation
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    • 제35권2호
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    • pp.71-74
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    • 2005
  • The aim of this study was to analyze characteristics of the barrier function of excised porcine buccal mucosa to the test compounds, estradiol, propranolol HCI, melatonin, and mannitol with a wide range of partition coefficient values. The permeability of melatonin was measured through frozen, stored, and fresh porcine buccal mucosa to examine the impact of storage conditions on the permeability of porcine buccal mucosa. The results demonstrated that the ex vivo permeability of the porcine buccal mucosa was greater for more lipophilic solutes, which was consistent with a series of molecules transported by passive transepithelial diffusion. The melatonin permeation profiles through frozen, stored, and fresh mucosa illustrated that damage was incurred by the freezing process of the mucosal tissue, leading to loss of the barrier function and thereby an increased permeation coefficient. It can be observed that the influence of compound lipophilicity on the association of the compounds with buccal mucosa was clear. The relationship between permeation coefficient and Log P values for the four compounds investigated demonstrated a proportional relationship, further confirming the importance of the lipophilicity of a compound to permeate the buccal mucosa. These results showed that the ex vivo porcine buccal mucosa model is a suitable tool to screen oral mucosal permeability.

경기도 내 대기 중 다이옥신 분포 특성에 관한 연구 (Atmospheric Distribution of PCDD/F Concentrations in Gyeonggi-do, South Korea)

  • 허종원;민윤기;김동기;최일우;김종수;송일석;이강웅
    • 한국대기환경학회지
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    • 제31권6호
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    • pp.548-561
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    • 2015
  • Atmospheric concentrations of polychlorinated dibezo-p-dioxins and furans (PCDD/Fs) were investigated at urban-residential (Group I: Suwon, Guri and Goyang), industrial (Group II: Ansan, Siheung and Bucheon), urban-rural mixed (Group III: Yangju, Pocheon and Dongducheon) and rural regions (Group IV: Yangpyeong) in Gyeonggi-do from February 2012 to November 2012 quarterly. The concentrations of PCDD/Fs ranged from 0.018 to $0.109pgTEQm^{-3}$ in Group I (mean value: $0.061pgTEQm^{-3}$), 0.059 to $0.367pgTEQm^{-3}$ in Group II (mean value: $0.179pgTEQm^{-3}$), 0.072 to $0.836pgTEQm^{-3}$ in Group III (mean value: $0.334pgTEQm^{-3}$) and 0.014 to $0.066pgTEQm^{-3}$ in Group IV (mean value: $0.034pgTEQm^{-3}$), respectively. In spite of the less PCDD/F emission sources than Group II (industrial regions), the level of PCDD/Fs in urban-rural mixed area showed the highest values with high fluctuation. It's likely that the Group III was affected by fugitive emissions such like biomass burning and unregulated open burning. The mean contribution of particle phase to total PCDD/F concentration was above 83% because most of PCDD/F congeners were partitioned into particle phase. We evaluated their gas-to-particles equilibriums with the regression between the particle-gas partition coefficient, $K_P(m^3{\mu}g^{-1})$ and corresponding subcooled liquid vapor pressure ($P_L$). The logarithm-$K_P$ of PCDD/Fs was poorly correlated with $P_L$ at low ambient temperature (below $10^{\circ}C$) and the slope (m) values for log-log plots of the $K_P$ vs. $P_L$ was steeper in the Group 2 and Group 3 than residential area. It implies that the slope values were likely influenced by both the direct emission source of PCDD/Fs and ambient temperature.