• 생명과학회지
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• 제16권3호
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• pp.382-386
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• 2006

고양이의 혈통 등록을 위한 개체식별 및 친자판정을 목적으로 microsatellite DNA다형을 조사한 결과 다음과 같은 성적을 얻었다. 고양이 20두를 대상으로 microsatellite DNA다형의 대립유전자를 조사한 본 연구에서는 관찰된 대립유전자의 수는 $3{\sim}8$개 (평균 5.5개)이며 marker별 대립유전자는 FCA005 142bp (0.3750), FCA026 148 bp (0.5500), FCA075 136 bp (0.5000), FCA105 191 bp (0.4250), FCA224 156 bp (0.7750), FCA229 166 bp (0.6500), FCA240 163 bp (0.3000), FCA293 185 bp (0.5000), FCA453 186 bp (0.5500), FCA651 134 bp (0.6750) 대립유전자가 높은 빈도로 관찰되었다. Expected heterozygosity와 PIC는 각각 $0.390{\sim}0.827$(평균 0.639), $0.357{\sim}0.780$(평균 0.581)으로 나타났고 FCA240의 marker는 PIC value가 0.70 이상이었다. 또한 PE는 $0.076{\sim}0.444$으로서 10개 marker를 조합시 total PE는 0.9441로 관찰되었다. 10개의 microsatellite DNA다형 좌위를 가지고 친자관계를 분석한 결과 8두 중에서 1두(12.50%)가 모순으로 판정되었다. 또한 국내에서 사육중인 고양이의 개체식별 및 친자판정에 microsatellite marker를 활용할 수 있을 것으로 사료된다.

• 한국임상수의학회지
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• 제17권1호
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• pp.234-237
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• 2000

The dornor, 2 years old, 20kg and mixed breed, was bred naturally on day 1 and day 3 of estrus and eight gastrulae were collected by flushing the uterus of the donor after laparatomy on day 13 after the second mating. The embryos were frozen by programmable freezer and preserved for about 3 months in liquid nitrogen. Another bitch in natural estrus, 2 years old, 30kg, mixed breed, was selected as the recipient and the frozen embryos(8 gastrulae) were thawed and each 4 embryos were transferred into upper partr of left and right uterine horn, respectively, on day 13 after the proper mating day determined by vaginal smear. The ecipient delivered 6 offspring 48 days after embryo transfer. Of 6 puppies, one was still birth and two puppies died one month after birth. Parentage test was performed by DNA analysis using microsatellite sequences for 3 puppiers, the recipient, the donor, the male dog bred with the donor, and the male dog raised near to the recipient. The markers selected for the test were CXX 873(133-157 base pair) and CXX 894(141-165 base pair). Using primers manufactured according to the markers, the blood samples were processed for polymerase chain reaction and the PCR products were treated for electrophoresis. The three puppies showed identical band to that of recipient, consequently, it was concluded that the puppies were offspring of the recipient mated naturally by the male dog, not the offspring by embryo transfer.

• 한국어류학회지
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• 제27권1호
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• pp.10-15
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• 2015

현재 IUCN의 취약 등급인 대왕바리(giant grouper, Epinephelus lanceolatus) 친어의 효율적인 관리 시스템 구축을 위한 기반연구로서 기 개발되어 있는 동종의 microsatellite 마커를 이용한 가계도 분석 효율을 조사하였다. 대왕바리 친어 32마리를 8개의 microsatellite 마커로 분석한 결과 총 52개의 대립유전자가 검출되었으며, 기대치 이형접합율은 0.663, 근친교배계수는 0.011로 조사되어 현재 확보된 대왕바리 친어는 유전 다양성이 비교적 잘 유지되고 있었다. 하지만 유효집단 크기가 35로 추정됨으로써 지속적인 친어 확보의 필요성을 보였다. 해당 마커를 이용한 동일 유전자형 출현 확률은 무작위 집단에서 $6.85{\times}10^{-11}$ 그리고 한쪽 부모의 유전자형 확보 및 양친의 유전자형이 확보된 상태에서의 부권 부정률은 각각 0.00835, 0.00027로 나타났으며, 주좌표 분석 결과 친어의 유전자형은 중복되지 않았다. 따라서 본 연구에 이용한 8개의 microsatellite 마커로도 유전자형 데이터베이스를 기반으로 한 대왕바리 친어 관리 시스템 구축이 가능할 것이며, 이를 활용한 유전 다양성이 높은 자손 생산 및 유전적으로 유사한 개체의 중복 확보를 방지할 수 있어 친어 확보의 효율성을 높일 수 있을 것이다.

• 한국작물학회지
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• 제47권5호
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• pp.379-383
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• 2002

Allelic diversity of 44 microsatellite marker loci originated from the coding regions of specific genes or the non-coding regions of barley genome was analyzed for 19 barley genotypes. Multi-allelic variation was observed at the most of marker loci except for HVM13, HVM15, HVM22, and HVM64. The number of different alleles ranged from 2 to 12 with a mean of 4.0 alleles per micro-satellite. Twenty-one alleles derived from 10 marker loci are specific for certain genotypes. The level of polymorphism (Polymorphic Information Content, PIC) based on the band pattern frequencies among genotypes was relatively high at the several loci such as HVM3, HVM5, HVM14, HVM36, HVM62 and HVM67. In the cluster analysis using genetic similarity matrix calculated from microsatellite-derived DNA profiles, two major groups were classified and the spike-row type was a major factor for clustering. Correlation between genetic similarity matrices based on microsatellite markers and pedigree data was highly significant ($r=0.57^{**}$), but these two parameters were moderately associated each other. On the other hand, RAPD-based genetic similarity matrix was more highly associated with microsatellite-based genetic similarity ($r=0.63^{**}$) than coefficient of parentage.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2000년도 춘계 학술대회지
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• pp.102-103
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• 2000

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제52권5호
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• pp.357-366
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• 2010

한우의 유전체 전장의 정보를 Illumina BeadArray$^{TM}$ Bovine SNP50 assay를 이용하여 단일염기다형 현상을 조사한 결과, 유전적 다양성을 보이는 좌위가 약 32,567 좌위 이상에서 다양성을 보이고 있었으며 약 5,554 좌위에서 다양성이 조사되지 않았다. 이는 조사된 자료의 가계집단의 수가 크게 제한되었기 때문에 기인될 수 있으며 또 다른 원인으로는 한우 종축집단의 크기가 작을 수 있다는 현상을 반증한다고 사료된다. 유전분석의 기초가 되는 혈통기록에 의한 개체간 혈연관계를 유전체 정보에 의한 혈연관계와 비교하여 본 결과, 유전체 정보에 의한 혈연관계의 크기가 혈통기록에 의한 혈연관계보다 좀 더 정확하게 추정될 수 있다는 장점이 있으며 혈통기록상의 오류로 그릇된 혈연관계의 크기를 유전체 정보를 통하여 보완할 수 있다는 장점이 있다. 이러한 장점을 활용하면 유전체정보를 이용한 유전능력 평가의 정확성을 크게 향상시킬 수 있을 것으로 사료되었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제4권2호
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• pp.67-70
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• 2002

The RAPD data were used to assess genetic similarity among f grape cultivars. Of the 100 random primers tested on genomic DNA, 10 primers could be selected for Benetic analysis, and the selected primers generated a total of 115 distinct amplification fragments. A similarity matrix was constructed on the basis of the presence or absence of bands. The 7 grape cultivars analyzed with UPGMA were clustered into two groups of A and B. The similarity coefficient value of cultivars was high. The mean similarity index for all pairwise comparisons was 0.851, and ranged from 0.714 ('Rosaki' and 'Black Olympia') to 0.988 ('Kyoho' and 'Daebong'). After due consideration of differences in cultural and morphological characteristics of these two theoretically identical cultivars, it could be deduced that 'Daebong' is a bud sport of 'Kyoho' cultivar.

• Plant Resources
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• 제2권2호
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• pp.75-80
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• 1999

Twenty two varieties of pecan including wild types were classified based on 6 characters measured by principal component analysis score distance. The results are summarized as fellow. Twenty two varieties were classified into 5 groups based in PCA score distance. Five groups were distinctly characterized by many morphological characters. Total variation could be explained by 51%, 95%, 99% with first, third and fifth principal components respectively. Varimax rotation of the factor loading of the first factors indicated that the first component was highly loaded with leaf characters, the second component with fruit characters, but fruit length was negative loaded. The second, the third and the fourths groups of cultivars had very close genetic parentage similarity.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권2호
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• pp.191-198
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• 2003

국내에서 사육중인 치와와 31두, 풍산개 20두, 래브라도 리트리버 8두를 대상으로 micro-satellite DNA형의 유전자 빈도에 기초하여 heterozygosity, PIC, 그리고 PE를 분석한 결과를 요약하면 다음과 같다. 치와와의 대립유전자 수는 4${\sim}$14개로서 expected heterozygosity와 PIC는 각각 0.432${\sim}$0.883 (평균 0.711), 0.397${\sim}$0.856(평균 0.659)으로 나타났으며 PEZ1, PEZ3, PEZ6, PEZ10, PEZ12의 marker는 PIC 0.7이상으로 나타났고 14개 marker를 조합시 부권부정율은 0.9999로 관찰되었다. 풍산개의 대립유전자 수는 2${\sim}$9개로서 expected heterozygosity와 PIC는 각각 0.262${\sim}$0.817 (평균 0.559), 0.222${\sim}$0.772 (평균 0.503)으로 나타났고 PEZ1, PEZ6, PEZ13의 marker는 PIC 0.7이상으로서 16개 marker를 조합시 부권부정율은 0.9991로 관찰되었다. 래버라도 리트리버의 대립유전자 수는 3${\sim}$5개로서 expected heterozygosity와 PIC는 각각 0.425${\sim}$0.808(평균 0.660), 0.354${\sim}$0.717(평균 0.563)으로 나타났고 PEZ8, PEZ12의 marker는 PIC 0.7이상으로 관찰되었으며 12개 marker를 조합시 부권부정율은 0.9968로 관찰되었다. 이상의 결과는 microsatellite DNA형에 의한 개의 친자감정 및 개체식별에 유용한 자료로 활용할 수 있을 것으로 사료된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권8호
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• pp.1071-1074
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• 2005

Microsatellite polymorphism and their genetic relationships were estimated using genotype information of 183 dogs from 11 microsatellite loci. The breeds include the indigenous Korean breeds Jindo dog (30), Poongsan dog (20) and Miryang dog (44) together with Chihauhau dog (31) and German Shepherd dog (58). Jindo dogs showed the highest expected heterozygosity (0.796${\pm}$0.030) and polymorphic information contents (0.755) in all populations. The phylogenetic analysis showed the existence of two distinct clusters supported by high bootstrap values: the Korean native dogs and other dogs. They clearly show that Poongsan dog and Miryang dog are closely related to each other when compared with Jindo dog. Microsatellite polymorphism data was shown to be useful for estimating the genetic relationship between Korean native dogs and other dog breeds, and also can be applied for parentage testing in those dog breeds.