• 제목/요약/키워드: parC

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임상검체와 가축으로부터 분리된 대장균을 대상으로 Quinolone계 항균제 내성인자 분석 (Analysis of Quinolone Resistance Determinants in Escherichia coli Isolated from Clinical Specimens and Livestock Feces)

  • 성지연
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제50권4호
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    • pp.422-430
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    • 2018
  • 퀴놀론 항균제가 사람과 동물에게 부적절하고 광범위하게 사용될 경우 항균제내성인자의 출현 및 확산이 가속화 될 수 있다. 본 연구에서는 돼지의 직장면봉 검체(N=40) 및 임상 검체로(N=25)부터 분리된 총 65균주의 nalidixic acid 내성 대장균을 대상으로 quinolone 내성 기전을 조사하였다. 항균제 감수성은 디스크 확산법에 의해 결정되었다. Quinolone 내성과 관련된 유전자와 돌연변이를 조사하기 위해 PCR 및 DNA sequencing이 수행되었다. 총 65균주의 nalidixic acid 내성 대장균 중 62균주가 gyrA, parC, parE 유전자에 돌연변이를 포함하고 있었는데, gyrA 유전자에 돌연변이를 포함하고 있는 균주는 62균주(95.4%)였고, 35균주(53.8%)가 parC 유전자에 돌연변이를 갖고 있었으며, 7균주(10.8%)가 parE 유전자에 돌연변이를 포함하고 있었다. 35균주는 gyrA 와 parC 유전자에 모두 돌연변이를 가지고 있는 것으로 나타났다. 총 65균주의 대장균을 대상으로 plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) determinants를 조사하였다. 65균주의 nalidixic acid 내성 대장균 중 13균주에서 qnrS 유전자가 검출되었으나 이 중 10균주는 gyrA, parC, parE 유전자에 돌연변이를 포함하고 있는 것을 나타났다. 본 연구에서는 사람과 돼지로부터 분리된 대장균이 quinolone 계열 항균제에 내성을 나타내는데 중요한 역할을 하는 기전이 gyrA, parC, parE 유전자에 염색체 돌연변이가 발생하는 경우임을 확인하였는데 이 돌연변이들은 치료목적 또는 동물의 성장촉진을 위한 항균제의 과다사용으로 유발될 수 있다.

Mutations in the gyrB, parC, and parE Genes of Quinolone-Resistant Isolates and Mutants of Edwardsiella tarda

  • Kim, Myoung-Sug;Jun, Lyu-Jin;Shin, Soon-Bum;Park, Myoung-Ae;Jung, Sung-Hee;Kim, Kwang-Il;Moon, Kyung-Ho;Jeong, Hyun-Do
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권12호
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    • pp.1735-1743
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    • 2010
  • The full-length genes gyrB (2,415 bp), parC (2,277 bp), and parE (1,896 bp) in Edwardsiella tarda were cloned by PCR with degenerate primers based on the sequence of the respective quinolone resistance-determining region (QRDR), followed by elongation of 5' and 3' ends using cassette ligation-mediated PCR (CLMP). Analysis of the cloned genes revealed open reading frames (ORFs) encoding proteins of 804 (GyrB), 758 (ParC), and 631 (ParE) amino acids with conserved gyrase/topoisomerase features and motifs important for enzymatic function. The ORFs were preceded by putative promoters, ribosome binding sites, and inverted repeats with the potential to form cruciform structures for binding of DNA-binding proteins. When comparing the deduced amino acid sequences of E. tarda GyrB, ParC, and ParE with those of the corresponding proteins in other bacteria, they were found to be most closely related to Escherichia coli GyrB (87.6% identity), Klebsiella pneumoniae ParC (78.8% identity), and Salmonella Typhimurium ParE (89.5% identity), respectively. The two topoisomerase genes, parC and parE, were found to be contiguous on the E. tarda chromosome. All 18 quinolone-resistant isolates obtained from Korea thus far did not contain subunit alternations apart from a substitution in GyrA (Ser83$\rightarrow$Arg). However, an alteration in the QRDR of ParC (Ser84$\rightarrow$Ile) following an amino acid substitution in GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) was detected in E. tarda mutants selected in vitro at $8{\mu}g/ml$ ciprofloxacin (CIP). A mutant with a GyrB (Ser464$\rightarrow$Leu) and GyrA (Asp87$\rightarrow$Gly) substitution did not show a significant increase in the minimum inhibitory concentration (MIC) of CIP. None of the in vitro mutants exhibited mutations in parE. Thus, gyrA and parC should be considered to be the primary and secondary targets, respectively, of quinolones in E. tarda.

폴리아릴레이트-나일론 6 블록공중합체 : 합성 및 폴리아릴레이트 혹은 나일론 6 단일중합체와의 상용성 (Polyarylate-Nylon 6 Block Copolymers : Synthesis and Its Miscibility in Binary Blends with Polyarylate or Nylon 6 Homopolymer)

  • 안태완;이석민;정한모;이상원
    • 공업화학
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    • 제4권2호
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    • pp.349-357
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    • 1993
  • Hydroxy-difunctional polyarylate(PAR) 올리고머와 toluene diisocyanate를 반응시켜 합성한 고분자 활성체를 사용하여 ${\varepsilon}$-caprolactam을 음이온 중합하여 다양한 블록길이의 PAR-nylon 6 블록공중합체들을 합성하였다. 합성한 블록공중합체들의 열적성질을 differential scanning calorimeter(d.s.c.)로 측정한 결과, 블록공중합체를 구성하는 PAR 블록과 nylon 6 블록은 부분적 상용성을 가졌으며, 그 정도는 블록의 길이가 짧을수록 컸다. PAR-nylon 6 블록공중합체와 PAR 혹은 nylon 6 homopolymer와의 이원블렌드에서 PAR homopolymer와 PAR 블록, nylon 6 homopolymer와 nylon 6 블록 사이의 분자수준의 섞임을 시사하는 거동을 d.s.c.로 관찰할 수 있었다.

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The Ligand Occupancy of Endothelial Protein C Receptor Switches the Signaling Specificity of Thrombin from a Disruptive to a Protective Response in Endothelial Cells

  • Bae, Jong-Sup;Kim, Yong-Ung;Park, Moon-Ki
    • 한국환경과학회:학술대회논문집
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    • 한국환경과학회 2008년도 추계학술발표회 발표논문집
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    • pp.538-544
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    • 2008
  • Activated protein C (APC) is thought to exert antiinflammatory activities through the endothelial protein C receptor (EPCR)-dependent cleavage of protease activated receptor 1 (PAR-1) in endothelial cells. Since thrombin cleaves PAR-1 with $\sim$3-4-orders of magnitude higher efficiency, and PAR-1 is a target for proinflammatory activities of thrombin, it is not understood how APC can elicit protective responses through the cleavage of PAR-1. In this study, we demonstrate that EPCR is associated with caveolin-1 in endothelial lipid rafts, but its occupancy by protein C leads to its dissociation from caveolin-1 and subsequent recruitment of PAR-1 to protective signaling pathways through the coupling of PAR-1 to Gi-protein. When EPCR is bound by protein C, the PAR-1-dependent protective response in endothelial cells can be mediated by either thrombin or APC. These results provide a new paradigm for understanding the mechanism through which PAR-1 and EPCR participate in cellular signaling events in endothelial cells.

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TopoisomeraseII and Topoisomerase IV Gene Mutations Fluoroquinolone Resistance of Pseudomonas aeruginosa

  • Kim Yuntae;Baik Heongseok
    • 대한의생명과학회지
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    • 제10권4호
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    • pp.507-514
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    • 2004
  • The Pseudomonas aeruginosa isolated from the clinical specimens has a mutation on the QRDR (quinolone resistance determining region). There were obvious mutations in both gyrA and parC gene which are major targets of quinolone. Simultaneous mutations were found two sites or more on these genes in all of ten strains. GyrB or parE gene had only silent mutation without converted amino acids. We confirmed that P. aeruginosa from clinical specimens exhibited decreased sensitivity to fluroquiolone due to changed Thr-83→lle and Asp-87→Asn types on gyrA and altered Ser-87→Leu type on parC. This is the first finding that a new Met-93→Thr type on parC as well as mutations on gyrB or parE genes differed from existing patterns. This study showed more mutations of gyrA rather than parC, suggesting that change of Type Ⅳ topoisomerase is more serious than that of type Ⅱ (DNA gyrase).

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DEVS 형식론을 이용한 공항 PAR 관제 시스템 자동화 방안 검증 (Verification of Automatic PAR Control System using DEVS Formalism)

  • 성창호;구정;김탁곤;김기형
    • 한국시뮬레이션학회논문지
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    • 제21권3호
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    • pp.1-9
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    • 2012
  • 본 논문에서는 공항 정밀접근 항공기의 안전성을 증대시키기 위한 방법으로 S/W 패킷모뎀을 이용한 PAR 관제 자동화 방안을 제안하고, DEVS 형식론을 이용하여 제안하는 시스템의 기능을 검증하였다. 기존의 PAR 관제는 음성으로 항공기를 통제함으로써 조종사의 정보 획득 능력이 떨어질 수 있다. 이를 해결하기 위하여 디지털 신호에 의한 자동 관제 시스템을 제안하고, 공항의 PAR이 추적하고 있는 항공기의 비행경로, 강하각, 거리를 조종사에게 실시간으로 전송해 주고 일반화함으로서 관제사의 숙련도와 관제 특성에 기인하는 요소를 배제할 수 있다. 제안된 시스템의 동작을 검증하기 위하여 확장된 DEVS 형식론인 C-DEVS 형식론을 사용하고, 하나의 모델로 합성된 원자 모델을 통해 시스템의 전체 상태 시퀀스를 검색하여 시스템의 안전성(Safeness)과 필연성(Liveness)을 검증할 수 있다. 제안하는 시스템의 C-DEVS 모델을 기존의 음성 관제 시스템과 비교하여 두 시스템이 동일한 상태 시퀀스를 가짐을 확인하였으며, 모든 상태를 검증함으로써 실제 상황에 적용할 수 있을 것으로 생각된다.

비뇨생식기계 검체로부터 분리된 Ureaplasma 종의 Fluoroquinolone 내성과 관련된 gyrA, gyrB, parC, parE 유전자의 돌연변이 양상 (Mutation Patterns of gyrA, gyrB, parC and parE Genes Related to Fluoroquinolone Resistance in Ureaplasma Species Isolated from Urogenital Specimens)

  • 조은정;황유연;구본경;박제섭;김영권;김성현
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제48권2호
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    • pp.74-81
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    • 2016
  • Fluoroquinolone 계 항생제의 광범위한 사용으로 인해 이 약제에 대한 내성 Ureaplasma 종의 분리 비율이 높아지고 있다. Fluoroquinolone 계 항생제 내성은 주로 DNA gyrase와 topoisomerase IV 유전자의 돌연변이로 인해 발생하는 것으로 알려져 있다. DNA gyrase는 A와 B 2개의 소단위로 이루어져 있으며, gyrA와 gyrB 유전자에 의해 암호화되어 있고, Topoisomerase IV는 parC와 parE 유전자에 의해 암호화되어 있다. 본 연구가 진행된 서울의 1개 3차 병원에서 2012년부터 2013년까지 1년동안 Ureaplasma 종의 fluoroquinolone 계 항생제인 OFL과 CIP의 항생제검사 감수성 결과를 분석한 결과 내성과 중등도를 합산할 경우 66.08%, 92.69%로 매우 높은 내성 비율을 보였다. 이에 Ureaplasma 종을 OFL과 CIP에 대한 감수성을 기준으로 4개 그룹으로 분류하여 gyrA, gyrB, parC, parE 유전자의 돌연변이 여부를 검사하여 항생제 내성과의 관련성을 밝히고자 하였다. 그 중 parC 유전자의 돌연변이 빈도가 높아 topoisomerase IV의 돌연변이가 fluoroquinolone 계 약제에 대한 내성과 밀접한 관련이 있음을 확인할 수 있었다. 본 연구를 통해 GyrB의 Asn481Ser, ParC의 Phe149Leu, Asp150Met, Asp151Ile, Ser152Val, ParE의 Pro446Ser, Arg448Lys을 추가로 발견할 수 있었다. 최근 fluoroquinolone 계 항생제의 사용이 증가하고 있기 때문에 추후 Ureaplasma 종의 fluoroquinolone 계 항생제 내성에 대한 지속적인 모니터링이 필수적일 것으로 사료되며, 이와 관련한 유전자의 돌연변이 양상과의 상관관계를 분석하여 기존 배양검사의 단점을 보완할 수 있는 분자 진단학적 검사법의 추가적인 분석이 필요할 것으로 사료된다.

Effects of Tissue Factor, PAR-2 and MMP-9 Expression on Human Breast Cancer Cell Line MCF-7 Invasion

  • Lin, Zeng-Mao;Zhao, Jian-Xin;Duan, Xue-Ning;Zhang, Lan-Bo;Ye, Jing-Ming;Xu, Ling;Liu, Yin-Hua
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권2호
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    • pp.643-646
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    • 2014
  • Objective: This study aimed to explore the expression of tissue factor (TF), protease activated receptor-2 (PAR-2), and matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) in the MCF-7 breast cancer cell line and influence on invasiveness. Methods: Stable MCF-7 cells transfected with TF cDNA and with TF ShRNA were established. TF, PAR-2, and MMP-9 protein expression was analyzed using indirect immunofluorescence and invasiveness was evaluated using a cell invasion test. Effects of an exogenous PAR-2 agonist were also examined. Results: TF protein expression significantly differed between the TF cDNA and TF ShRNA groups. MMP-9 protein expression was significantly correlated with TF protein expression, but PAR-2 protein expression was unaffected. The PAR-2 agonist significantly enhanced MMP-9 expression and slightly increased TF and PAR-2 expression in the TF ShRNA group, but did not significantly affect protein expression in MCF-7 cells transfected with TF cDNA. TF and MMP-9 expression was positively correlated with the invasiveness of tumor cells. Conclusion: TF, PAR-2, and MMP-9 affect invasiveness of MCF-7 cells. TF may increase MMP-9 expression by activating PAR-2.

Isolation of Norfloxacin Resistan Escherichia Coli from the Han River and Characterization of Resistance Mechanism

  • Yoosun Jung;Hunjin Hong;Hyeran Nam;Lee, Yeonhee
    • Journal of Microbiology
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    • 제40권1호
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    • pp.63-69
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    • 2002
  • A total of twenty-five norfloxacin resistant Escherichia coli were isolated from Joongrang-chun stream, a branch of the Han River in Seoul, Korea from May to July in 2000 and their norfloxacin resistance mechanism was characterized for target site mutation, permeability, and efflux pump. Fourteen iso- lates contained the same three mutations, Ser83→Leu and Asp87→Asn in GyrA and Ser90→ lle in ParC. Six isolates had Ser83→Leu and Asp87→Tyr in GyrA and Ser87→lle in ParC while one isolate had Ser83→Leu and Va1103→Ala in GyrA and Ser80→lle in ParC. Two isolates had mutation(s) in GyrA without any mutation in ParC. Two isolates had Ser80→Arg in ParC instead of the commonly found Ser80→lle. Every norfloxacin resistant isolate had an efflux system but the correlation between the efflux activity and MIC was not observed. The amount of OmpF for norfloxacin permeability decreased in resistant isolates compared to the susceptible strains. When amplified polymorphic DNA (RAPD) and pulse field gel electrophoresis (PFGE) were performed, these isolates showed no similarity to each other or clinical isolates.

팔물탕(八物湯) 복용이 산후 유즙분비 관련인자에 미치는 영향 (Effect on Factors Related Lactation after Administration of Palmul-tang)

  • 송윤희;김태희
    • 대한한방부인과학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.12-29
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    • 2010
  • Purpose: This study was conducted to investigate the effect on factors related lactation after administration of Palmul-tang in postpartum C57BL/6N mice. Materials and Methods: Experimental groups were divided into control group post-par group and pre-par group. Pre-par and post-par group were administered Palmul-tang(p.o) twice a week for 4 weeks or 3 weeks respectively. Control group was administered normal saline for 3 weeks. Then we observed morphological change, immunohistochemical density and milk protein gene expression of factors related lactation within mammary gland of postpartum mice. Results: In post-par and pre-par groups, adipose tissue within mammary gland significantly decreased, and ductal branch and alveoli prominently developed than that of control group at 1~3 weeks after administraion of Palmul-tang. In post-par and pre-par groups, density of immunoreactivity on oxytocin, prolactin, estrogen and progesterone receptors in mammary glandular tissue significantly increased than that of control group. mRNA expression of $\beta$-casein and placental lactogen (PL)-1 in post-par group was more increased than that of control and pre-par groups. Conclusion: These results suggest that Palmul-tang significantly improved factors related lactation at postpartum period.