• 미생물학회지
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• 제30권4호
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• pp.246-251
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• 1992

대두 (Glycine max) 뿌리혹의 질소고정 공생균주 Bradyrhizobium japonicum SNU001 의 nod 유전자를 클로닝하였다. Rhizobium meliloti 의 4.5 kb EcoRI/ HindIII 절편을 탐침으로 한 게놈 혼성화 반응을 분리균주의 게놈상에 nod 유전자가 존재함을 확인하고, lambda EMBL3-BamHI vector 를 이용하여 genomic library 를 작성하였다. 작성된 library 로부터 1, 2 차 선별과정을 통해 nod 유전자가 있는 클론 1-5 를 선별하고, 클론 2로부터 nod DABC 탐침과 lambda DNA 탐침을 사용한 혼성화반응을 수행하여 삽입된 genomic DNA 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하였다. nod DABC 탐침과 가장 강한 혼성화반응을 보인 phage 클론 lambda CNS-1 의 3.9 kb BamHI 절편을 pBS KS(+) vector 에 subcloning 하고 동일한 탐침을 이용한 혼성화반응을 통해 subclone pBjCNS-1 을 선별하였다. 이 subclone 에 대한 부분적인 제한효소 지도를 작성하여 nod DABC 가 1.8 KpnI/SacI 절편에 존재함을 확인하였다.

• 한국의학물리학회지:의학물리
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• 제32권4호
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• pp.130-136
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• 2021

Purpose: The Halcyon radiotherapy platform at Groote Schuur Hospital was delivered with a factory-configured analytical anisotropic algorithm (AAA) beam model for dose calculation. In a recent system upgrade, the Acuros XB (AXB) algorithm was installed. Both algorithms adopt fundamentally different approaches to dose calculation. This study aimed to compare the dose distributions of cervical carcinoma RapidArc plans calculated using both algorithms. Methods: A total of 15 plans previously calculated using the AAA were retrieved and recalculated using the AXB algorithm. Comparisons were performed using the planning target volume (PTV) maximum (max) and minimum (min) doses, D95%, D98%, D50%, D2%, homogeneity index (HI), and conformity index (CI). The mean and max doses and D2% were compared for the bladder, bowel, and femoral heads. Results: The AAA calculated slightly higher targets, D98%, D95%, D50%, and CI, than the AXB algorithm (44.49 Gy vs. 44.32 Gy, P=0.129; 44.87 Gy vs. 44.70 Gy, P=0.089; 46.00 Gy vs. 45.98 Gy, P=0.154; and 0.51 vs. 0.50, P=0.200, respectively). For target min dose, D2%, max dose, and HI, the AAA scored lower than the AXB algorithm (41.24 Gy vs. 41.30 Gy, P=0.902; 47.34 Gy vs. 47.75 Gy, P<0.001; 48.62 Gy vs. 50.14 Gy, P<0.001; and 0.06 vs. 0.07, P=0.002, respectively). For bladder, bowel, and left and right femurs, the AAA calculated higher mean and max doses. Conclusions: Statistically significant differences were observed for PTV D2%, max dose, HI, and bowel max dose (P>0.05).

• 대한기계학회:학술대회논문집
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• 대한기계학회 2001년도 추계학술대회논문집A
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• pp.27-31
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• 2001

Hi-Nicalon SiC fiber reinforced SiC composites (SiC/SiC) have been fabricated by the reaction sintering process. Braided Hi-Nicalon SiC fiber with double interphases of BN and SiC was used in this composite system. The microstructures and the mechanical properties of reaction sintered SiC/SiC composites were investigated through means of electron microscopies (SEM, TEM, EDS) and bending tests. The matrix morphology of reaction sintered SiC/SiC composites was composed of the SiC phases that the composition of the silicon and the carbon is different. The TEM analysis showed that the residual silicon and the unreacted carbon were finely distributed in the matrix region of reaction sintered SiC/SiC composites. Reaction sintered SiC/SiC composites also represented proper flexural strength and fracture energy, accompanying the noncatastrophic failure behavior.

• 천문학회보
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• 제37권2호
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• pp.235-235
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• 2012

The "Widefield ASKAP L-band Legacy All-sky Blind surveY" (WALLABY) is an extragalactic HI survey which aims to examine HI properties and large-scale distribution of ~500,000 galaxies out to z ~ 0.27, covering a wide range of science goals associated with galaxy formation and evolution (P.I.: B. Koribalski & L. Staveley-Smith). The combination of ASKAP's exquisite column density sensitivity and a large primary beam will make it possible to systematically investigate the rarely explored low column-density HI in the universe. Ultimately, the largest and most homogeneous data set from WALLABY will drastically improve and broaden our knowledge on galaxy formation and evolution. ASKAP will be on-line in 2013, so to ensure timely and efficient reduction and analysis of the large WALLABY data set, we have been developing and testing reliable source finding tools and data analysis pipelines. In this talk I present recent progress of WALLABY, especially on the kinematic parameterisation pipeline for the spatially resolved galaxies detected by WALLABY.

• 한국임상수의학회지
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• 제24권4호
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• pp.603-607
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• 2007

계군 수준에서 닭 전염성 기관지염(IBV)을 검출하는데 필요한 표본크기를 추정하기 위하여 강원도 충북 및 충남 지역의 총 9,980수의 산란계로부터 회수된 총 48회의 혈청시료를 사용하였다. 의뢰된 모든 혈청에 대해서는 개별 시료와 크기가 10인 합병혈청(pool)으로 구분하여 HI 역가를 측정하였다. 적어도 1개의 감염된 pool을 검출하는 것을 95%신뢰하기 위해서는 총 48회의 의뢰건 중 5개 이하의 pool이 요구되는 비율이 72.9%를 차지하였고 90% 신뢰수준에서는 77.1%로 나타났다. 전체적으로 볼 때 필요한 pool의 개수는 양성 pool의 개수가 증가할수록 감소하였다. 개별시료에서 양성판정을 위한 HI 역가의 기준을 9 이상과 10 이상으로 설정할 때 혈청 유병율은 각각 50.1%와 33.4%로 나타났으며, 합병혈청에 대한 양성 판정기준을 8 이상으로 설정할 경우 59.9%로 분석되었다. 매 의뢰된 시료에서 개별시료와 합병혈청 간의 상관계수는 판정기준 9 이상에서 0.592(p<0.001), 10 이상에서 0.561(p<0.001)로 두 상관계수간 차이가 없었고 공통상관계수는 0.576으로 나타났다. 이러한 결과에 근거할 때 IBV 감염증을 검출하기 위하여 합병혈청을 사용하는 전략은 조사의 목적이 계군의 감염여부에만 관심을 두는 경우 한가지 대안이 될 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제32권4호
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• pp.258-263
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• 1994

보리수나무(Elaeagnus umbellata) 뿌리혹엣 분리한 공생균주인 Frankia 균주 EuIK1 게놈에 대해 K. pneumoniae의 nifH,D를 탐침으로 Southern hybridization을 수행한 결과, 3.2 Kb와 5.5 Kb BamHI 절편과 15 Kb PstI 절편이 강한 혼성화 반응을 보여 이들 절편에 nifH,D 유전자가 존재함을 확인하였다. 동일 탐침을 사용한 colony hybridization을 통해 pWE15 cosmid vector 에 작성되 게놈 library로부터 하나의 nif-클론 (pEuNIF)을 선별하였다. 이 클론을 BamHI으로 절단한 후 동일한 탐침으로 혼성화 반응을 수행한 결과, 3.2 Kb와 5.5 Kb가 강한 혼성화 반응을 보였으며, 이 결과는 게놈 혼성화 반응 결과와 일치하였다. 그러나 Frankia FaC1의 nifH 만을 탐침으로 이용한 결과 3.2Kb BamHI 절편만이 혼성화 반응을 나타내었다. 또한 3.2 Kb의 3‘ 말단과 5.5 Kb의 5’ 말단의 염기서열로부터 추론한 아미노산 서열을 ArI3의 nifD와 비교한 결과 182번부터 240번까지, 241번부터 282번까지의 아미노산 서열과 각각 매우 높은 유사성을 보였다. 이러한 결과로부터 3.2Kb 절편에는 nifH와 일부의 nifD 서열이 존재하고, 이 절편에 연속된 5.5Kb 절편에는 나머지 nifD서열이 존재함을 알 수 있었다.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 1996년도 춘계학술대회
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• pp.178-178
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• 1996

Hepatitis B virus (HBV) infection is one of the serious problems in Southeast Asia including Korea because it causes chronic hepatitis, which can easily be transformed In fatal conditions such as cirrhosis and hepatoma. Even though lots of informations on structural characteristics and gene expression mechanisms have been accumulated, the mechanism for HBV-induced hepatocellular injury which is believed to be the consequences of the immunological response is not well understood. In order tn perform immunopathological studies for prevention and treatment of HBV infection, we designed transgenic mice as a disease model which can mimic HBV infection, In this study, a promoter-HBV DNA fragment for the preparation of HBV transgenic mice has been constructed. To add a proper enzyme site on 5' end of HBV gene, total HBV (subtype adr) gene was inserted into BamHI site of pBluescript SK vector and reextracted by PstI-SacI treatment A liver-specific promoter, rat ${\alpha}$ 2u globulin gene promoter, was insrted to pBluescript SK vector and reextracted by BamHI-PstI treatment, Promoter-HBV DNA was constructed by ligation of two fragments using identical PstI sites. For large scale production of promoter-HBV DNA, it was inserted to BamHI-SacI site of pBluescript SK vector.

• 미생물학회지
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• 제24권1호
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• pp.7-11
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• 1986

Pseudomonas의 분해계 플라스미드와 이들에 유용한 벡터를 개발하기 위해서 본 연구실에서 분리, 보존하고 있는 Pseudomonas 중에서 P.putita KU 190으로부터 하나의 플라스미드를 분리하여 그 특성을 해석코저 하였다. size marker로 RP4와 pSy343를 사용하여 플라스미드의 크기를 결정한 바 41Kb로 나타났으며, 이 플라스미드를 pKU 41라 명명하였다. 제한효소 Bglll, BamHl, Eco Rl, HindIII, Sall등으로 이 플라스미드를 소화하여 이들의 제한효소 pattern을 조사한 결과, Bg III가 1. BamHl 3, Hin dIll는 3, EcoRI은 6 그리고 SalI은 13개 이상의 절단부위를 가지고 있었다. 이 제한효소의 절단부위, 토막들의 크기로부터 BamHI, HindIII에 대한 지도를 작성하였다. 플라스미드의 생울학적 기능을 조사하기 위하여 탄화수소 자화능에 대한 큐어링 실험을 하였으나 이로부터 뚜렷한 관련성 여부를 관찰할 수 없었다.

• Molecules and Cells
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• 제26권2호
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• pp.206-211
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• 2008

HI0381 of Haemophilus influenzae was investigated by circular dichroism (CD) and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy. HI0381 is a 153-residue peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein, and a part of the larger Tol/Pal network. Here, we report its backbone $^1H$, $^{15}N$, and $^{13}C$ resonance assignments, and secondary structure predictions. About 97% of all of the $^1HN$, $^{15}N$, $^{13}CO$, $^{13}C{\alpha}$, and $^{13}C{\beta}$ resonances covering 131 non-proline residues of the 134 residue, mature protein, were clarified by sequential and specific assignments. CSI and TALOS analyses revealed that HI0381 contains five ${\alpha}$-helices and five ${\beta}$-strands. To characterize the structure of HI0381, the effects of pH and salt concentration were investigated by CD. In addition, the structural changes occurring when HI0381 was in a membranous environment were investigated by comparing its HSQC spectra and CD data in buffer and in DPC micelles; the results showed that helix ${\alpha}4$ and strand ${\beta}4$ became aligned with the membrane. We conclude that the conformation of HI0381 is affected by the membrane environment, implying that its folded state is directly related to its function.

• 미생물학회지
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• 제23권2호
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• pp.122-128
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• 1985

Bacillus thuringiensis serovar israelensis 4Q1 contains 8 different covalently closed-circular (CCC) plasmids of molecular weight 204, 267, 109, 103, 16, 7.6, 6.4, and 5.0kb. The three smallest plasmids, designated pBti6, and pBti8 may prove to be useful as cloning vectors because of thier size and ease of isolation. The three plasmids were incubated separately with 9 different restriction enzymes and 7 of the enzymes tested cleaved one or more of the plasmids. Plasmid pBti6 has a single site for Bg1 II, Pst I and Pvu II, two sites for Bc1 I and Eco RI, and five sites for Hind III. Plasmid pBti7 has a single site for Bam HI and Pst I, two sites for Hind III, and three sites for PvuII. Plasmic pBti8 has a single site for Bam HI, BelI and Hind III, two sites for Eco RI, and three sites for Bgl II and Pvu II. Composite restriction enzyme maps for pBti6, pBti7 and pBti8 were constructed. The sites of restriction enzyme cleavage were determined by single, double and partial digests of the plasmid DNA. All the restriction sites were aligned relative to the single Bgl II(pBti6), Pst I(pBti7) or Hind III(pBti8) site, respectively.