• 제목/요약/키워드: pHi

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Cloning and Idendification of dTDP-L-Rhamnose Biosynthetic Gene Cluster from Thermus caldophilus GK24

  • Kim, Ki-Chan;Lee, Seung-Don;Han, Ju-Hee;Sohng, Jae-Kyung;Liou, Kwang-Kyoung
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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    • pp.749-754
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    • 2000
  • 알려진 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase의 amino acid 서열로 부터 primer를 제작하여 내열성 균주인 Thermus caldophilus GK24에서 colony hybridization 과정을 거쳐 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase를 포함하는 cosmid DNA를 얻었다. 유전자 분석을 위해 cosmid DNA를 subclone 하여 작은 크기로 분리하였다. 분리된 cosmid를 pSMTC-1 으로 명명하고 pSMTC-1를 BamHI으로 반응시켜 BamHI 단편 모두를 pGEM 7(+)를 이용하여 subclone 하였다. 각각의 이름은 크기에 따라 pKCB10(1.2kb-BamHI), pKCB20(1.6kb-BamHI), pKCB30(2.Ikb-BamHI), pKCB40(2.5kb-BamHI), pKCB50(2.5kb-BamHI), pKCB60(2.7kb-BamHI), pKCB70(3.4kb-BamHI), pKCB80(4.4kb-BamHI), pKCB90(7.0kb-BomHI) 으로 명명하였다. 각각의 subclone된 유전자를 분석하기 위해 Erase-a-base 방법을 이용하여 template를 준비하였고 이를 자동 염기서열 분석기를 이용하여 염기서열을 분석하였다. 염기서열분석 결과 pKCB80(4.2kb)에 dTDP-D-glucose synthase(orfA) 유전자를 비롯하여 dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase(orfB), orfC (dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase) 그리고 orfD(dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose 3,5-epimerase)와 유사한 유전자들이 있음이 확인 되었고 dTDP-L-rhamnose의 생합성 과정을 예상할 수 있었다.

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Effects of Dopamine on Intracellular pH in Opossum Kidney Cells

  • Kang, Kyung-Woo;Kim, Yung-Kyu
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제7권3호
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    • pp.187-191
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    • 2003
  • $Na^+/H^+$ exchanger (NHE) has a critical role in regulation of intracellular pH (pHi) in the renal proximal tubular cells. It has recently been shown that dopamine inhibits NHE in the renal proximal tubules. Nevertheless, there is a dearth of information on the effects of long-term (chronic) dopamine treatment on NHE activities. This study was performed to elucidate the pHi regulatory mechanisms during the chronic dopamine treatments in renal proximal tubular OK cells. The resting pHi was greatly decreased by chronic dopamine treatments. The initial rate and the amplitude of intracellular acidification by isosmotical $Na^+$ removal from the bath medium in chronically dopamine-treated cells were much smaller than those in control. Although it seemed to be attenuated in $Na^+$-dependent pH regulation system, $Na^+$-dependent pHi recovery by NHE after intracelluar acid loading in the dopamine-treated groups was not significantly different from the control. The result is interpreted to be due to the balance between the stimulation effects of lower pHi on the NHE activity and counterbalance by dopamine. Our data strongly suggested that chronic dopamine treatment increased intrinsic intracellular buffer capacity, since higher buffer capacity was induced by lower resting pHi and this effect could attenuate pHi changes under extracellular $Na^+$-free conditions in chronically dopamine-treated cells. Our study also demonstrated that intracellular acidification induced by chronic dopamine treatments was not mediated by changes in NHE activity.

이유자돈 사료 내 동애등에(Hermetia illucens)의 첨가가 분변지수, 혈액성상, 면역반응 및 소장형태에 미치는 영향 (Effects of Hermetia Illucens Supplementation on Fecal Score, Blood Profiles, Immune Response and Small Intestinal Morphology in Weaned Pigs)

  • 최요한;김조은;정현정;조은석;김동우;김진수
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제21권4호
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    • pp.392-399
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    • 2020
  • 본 실험은 사료 내 동애등에(HI, Hermetia illucens)의 첨가가 이유자돈의 분변지수, 혈액성상, 면역반응 및 소장형태에 미치는 영향을 구명하기 위해 수행하였다. 본 실험을 위해 총 24두의 이유자돈(Landrace×Yorkshire×Duroc; 5.86±0.13 kg)을 공시하였으며, 개시체중에 기반하여, 4처리 6반복, 반복당 1두씩 완전임의 배치하였다. 실험기간은 0~14일간 진행하였다. 실험 처리구는 옥수수-대두박 기초사료를 대조구로 하여 기초사료 내 HI를 1, 2 및 3% 첨가한 처리구가 포함되었다. 혈액성상에서 사료 내 HI의 첨가수준이 증가함에 따라 혈중 단핵구(p<0.01)와 호산구(p<0.05)가 유의적으로 증가하는 것으로 나타났으며, 적혈구는 선형적으로 감소하는 경향이 관찰되었다(p=0.08). 한편, 면역반응에서 혈 중 TNF-α의 수치는 사료 내 HI의 첨가수준이 증가함에 따라 선형적으로 감소하는 경향이 관찰되었으며(p=0.067), 분변지수 또한 HI의 첨가수준이 증가함에 따라 선형적으로 감소하는 경향이 관찰되었다(p=0.058). 소장형태에서 십이지장의 융모 높이는 HI의 첨가수준이 증가할수록 개선되는 유의적인 효과가 나타났다(p<0.05). 본 실험의 결과들을 종합해 보면, 사료 내 HI 첨가는 이유자돈의 설사저감, 면역반응 및 소장형태에 긍정적인 효과를 미치는 것을 시사한다.

옥수수 엽록체 rbcL 유전자의 클로닝 (Cloning of the rbcL Gene from Maize Chloroplast)

  • 이재선
    • Journal of Plant Biology
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    • 제35권2호
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    • pp.165-171
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    • 1992
  • rbcL 유전자 발현조절에 관한 연구의 일환으로 Cp DNA로부터 분리한 rbcL 유전자를 클로닝하였다. 옥수수의 엽록체로부터 DNA를 분리한 후 제한효소 BamHI으로 절단하여 rbcL 유전자가 포함된 BamHI 9 절편을 pUC19에 클로닝하여 재조합 플라스미드 pRLYS1을 만들었다. 쌀의 rbcL 유전자 일부를 probe로 사용하여 pRLYS1과 Southern hybridization한 결과와 제한효소 BamHI, HindIII, 그리고 PstI으로 절단된 pRLYS1 절편의 전기영동 결과로부터 재조합 플라스미드의 내부에 완전한 rbcL 유전자의 존재를 확인하였고 삽입방향을 결정하였다.

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A role of Sodium Bicarbonate Cotransporter(NBC) in $HCO_3^-$ Formation in Human Salivary Gland Acinar Cells

  • Jin, Mee-Hyun;Koo, Na-Youn;Jin, Mei-Hong;Hwang, Sung-Min;Park, Kyung-Pyo
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제33권4호
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    • pp.143-147
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    • 2008
  • The sodium bicarbonate cotransporter (NBC) protein is functionally expressed in salivary glands. In this experiment, we examined the role of NBC in $HCO_3^-$ formation in human parotid gland acinar cells. Intracellular pH (pHi) was measured in 2'-7'-bis(carboxyethyl)-5(6)-carboxyfluorescein (BCECF)-loaded cells. Acetazolamide (0.1 mM) and 4,4'-diisothio cyanatostilbene-2,2'-disulphonic acid (DIDS, 0.5 mM) were used as specific inhibitors of carbonic anhydrase and NBC, respectively. The degree of inhibition was assessed by measuring the pHi recovery rate (${\Delta}pHi$/min) after cell acidification using an ammonium prepulse technique. In control experiments, ${\Delta}pHi$/min was $1.40{\pm}0.06$. Treatment of cells with 0.5 mM DIDS or 0.1 mM acetazolamide significantly reduced ${\Delta}pHi$/min to $1.14{\pm}0.14$ and $0.74{\pm}0.15$, respectively. Simultaneous application of DIDS and acetazolamide further reduced ${\Delta}pHi$/min to $0.47{\pm}0.10$. Therefore, DIDS and acetazolamide reduced ${\Delta}pHi$/min by 19% and 47%, respectively, while simultaneous application of both DIDS and acetazolamide caused a reduction in ${\Delta}pHi$/min of 67%. These results suggest that in addition to carbonic anhydrase, NBC also partially contributes to $HCO_3^-$ formation in human parotid gland acinar cells.

제한효소의 인식자리 변화 -BamHI 특이성에 미치는 산도와 소수성의 영향- (Alteration of Recognition Sequence by Restriction Endonuclease -Effect of pH and Hydrophobicity on BamHI-)

  • 이강민
    • KSBB Journal
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    • 제11권2호
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    • pp.193-200
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    • 1996
  • DNA를 인식하여 절단하는 제한효소의 발견은 유전자를 연구, 조작할 수 있게 되어 분자생물학 연구에 큰 발전을 가져 왔다. 제한효소의 인식자리는 반 응용액의 산도, 유기용애의 소수성에 따라서 달라질 수 있다. 제한 효소 BamHI의 특이성 변화는 유기용 매의 소수성CLogP)과 산도에 직접적인 관계가 있다. 제한효소 BamHI의 인식자리의 특이성 변화는 산도 7.5에셔 LogP값이 -1.3~-1.35, 8.0에서 -1. 0 03~-2.5, 8.5에서 0.75~-2.5, 8.9에서 -0.32 ~­2 2.5 벙위에셔 각각 나타난다. 통일한 유기용매 혼합 물에서 산도가 알카리 일수록 낮은 유기용매 놓도에 서 특이성의 변화가 나타난다. DMSO용액에서 Bam H HI의 특이성 변화는 산도가 7.5일때 20% 농도에서 나타나지만 산도가 8.9일때는 4%에서 나타난다.

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$Na^+/H^+$ exchanger와 $HCO_3^-$ transporter에 의한 흰쥐 타액선 선세포내 pH 조절 (MODULATION OF INTRACELLULAR pH BY $Na^+/H^+$ EXCHANGER AND $HCO_3^-$ TRANSPORTER IN SALIVARY ACINAR CELLS)

  • 박동범;서정택;손흥규;이종갑
    • 대한소아치과학회지
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    • 제25권2호
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    • pp.352-367
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    • 1998
  • Intracellular pH (pHi) plays an important role in the regulation of cellular processes by influencing the acitivity of various enzymes in cells. Therefore, almost every type of mammalian cell possesses an ability to regulate its pHi. One of the most prominent mechanisms in the regulation of pHi is $Na^+/H^+$ exchanger. This exchanger has been known to be activated when cells are stimulated by the binding of agonist to the muscarinic receptors. Therefore, the aims of this study were to compare the rates of $H^+$ extrusion through $Na^+/H^+$ exchanger before and during muscarinic stimulation and to investigate the possible existence of $HCO_3^-$ transporter which is responsible for the continuous supply of $HCO_3^-$ ion to saliva. Acinar cells were isolated from the rat mandibular salivary glands and loaded with pH-sensitive fluoroprobe, 2', 7'-bis(2-carboxyethyl)-5(6)-carboxyfluorescein(BCECF), for 30min at room temperature. Cells were attached onto the coverglass in the perfusion chamber and the changes in pHi were measured on the iverted microscope using spectrofluorometer. 1. By switching the perfusate from $HCO_3^-$-free to $HCO_3^-$-buffered solution, pHi decreased by $0.39{\pm}0.02$ pH units followed by a slow increase at an initial rate of $0.04{\pm}0.007$ pH units/min. The rate of pHi increase was reduced to $0.01{\pm}0.002$ pH units/min by the simultaneous addition of 1 mM amiloride and $100{\mu}M$ DIDS. 2. An addition and removal of $NH_4^+$ caused a decrease in pHi which was followed by an increase in pHi. The increase of pHi was almost completely blocked by 1mM amiloride in $HCO_3^-$-free perfusate which implied that the pHi increase was entired dependent on the activation of $Na^+/H^+$ exchanger in $HCO_3^-$-free condition. 3. An addition of $10{\mu}M$ carbachol increased the initial rate of pHi recovery from $0.16{\pm}0.01$ pH units/min to $0.28{\pm}0.03pH$ units/min. 4. The initial rate of pHi decrease induced by 1mM amiloride was also increased by the exposure of the acinar cells to $10{\mu}M$ carbachol ($0.06{\pm}0.008pH$ unit/min) compared with that obtained before carbachol stimulation ($0.03{\pm}0.004pH$ unit/min). 5. The intracellular buffering capacity ${\beta}1$ was $14.31{\pm}1.82$ at pHi 7.2-7.4 and ${\beta}1$ increased as pHi decreased. 6. The rate of $H^+$ extrusion through $Na^+/H^+$ exchanger was greatly enhanced by the stimulation of the cells with $10{\mu}M$ carbachol and there was an alkaline shift in the activity of the exchanger. 7. An intrusion mechanism of $HCO_3^-$ was identified in rat mandibular salivary acinar cells. Taken all together, I observed 3-fold increase in $Na^+/H^+$ exchanger by the stimulation of the acinar cells with $10{\mu}M$ carbachol at pH 7.25. In addition, I have found an additional mechanism for the regulation of pHi which transported $HCO_3^-$ into the cells.

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사람의 p53 유전자와 Glutathione S-Transferase와의 융합 단백질의 대장균에서의 발현 (Expression of Human p53 Gene as Glutathione S-transferase Fusion Proteins in Escherichia coli)

  • 오상진
    • 미생물학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.279-285
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    • 1993
  • p53 유전자의 변화는 인간의 여러 암에서 가장 흔하게 발견되며 종양세포내에서는 이러한 변형된 p53 단백질의 양의 증가가 초래된다. 세포내에 축적된 p53 단백질의 발견은 인간의 암증세를 판단할 유용한 기중이 되기도 한다. 본 연구에서는 이러한 면역조직화학 검사에 쓰일 수 있는 폴리클로날 항체를 만들기 위햐여 사람의 p53 유전자를 glutathione S-transferase 와의 융합 단백질의 형태로서 대장균내에서 발현시켰다. p53 의 아미노산 1-158번을 코딩하고 있는 NeoI fragment 와 아미노산 159-393 번을 코딩하는 NocI-BamHI fragment 를 BamHI linker 를 이용하여 in frame 으로 pGEX-2T 의 BamHI 자리에 삽입하여 재조합 플라스미드 pGTNS 와 pGTNL 을 각각 만들었다. 또 PCR 에 의한 증폭에 의햐여 아미노산 38-145번을 코딩하는 유전자 부위를 증폭하였으며 BamHI 과 PvuII 로 절단하여 pGEX-2T의 BamHI 과 SmaI 자리에 삽입함으로써 pGTBP 를 제조하였다. 이들 재조합 균주들을 IPTG 로 4시간 induction 한 후 세포 추출물로부터 glutathione Sepharose bead 를 이용하여 융합단백질을 분리하였다. Bead 에 결합된 단백질은 10% SDS-polyacrylamide gel 에서 전기영동하였으며, 각각의 분자량은 54 kDa, 53 kDa 와 40 kDa 였다. 이러한 방법으로 1리터 배양으로부터 약 1mg 의 단백질을 정제하였다.

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HI-FORM DECK를 이용한 부분 PC 계단 접합부의 접합방식에 따른 실험적 연구 (A study on experiment from the Stair Joints Constructed with PC system part of it using the HI-FORM DECK)

  • 장극관;이은진;진병창;강우주;한태경
    • 한국콘크리트학회:학술대회논문집
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    • 한국콘크리트학회 2008년도 추계 학술발표회 제20권2호
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    • pp.9-12
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    • 2008
  • 반강접합은 핀접합의 단점을 보완하고 강접합의 장점을 수용할 수 있는 중간 형태이다. 현재 국내에서 핀접합에 대한 연구는 활성화 되어있으나 반강접합에 대한 연구는 많지 않기 때문에 본 연구에서는 3가지 형태의 실험체를 제작하여 성능을 입증하려 했다. 실험체는 강접합 HI-R, 반강접합 HI-S, 핀접합 HI-P등 총 3개이다. 실험결과 HI-R은 접합부 전단파괴, HI-S는 고정단 상부 휨파괴, HI-P는 경사계단 슬래브 하부 휨파괴로 나타났고 최대내력은 각각 51.74, 51.4, 24.63kN으로 측정되었고, 강성은 1.58, 1.19, 0.37을 나타냈다. 항복강도는 각각 44.5, 47.3, 24kN을 보유하고, 연성비는 3.31, 2.32, 1.54로 나타냈고, 사용하중 작용 시의 처짐은 KBC기준에 의거하여 HI-P실험체가 기준을 초과하는 것으로 나타났다. 철근 변형률분포로 보아 HI-S는 초기에 HI-R과 유사한 거동을 보이나 항복이후 접합부 내부요소들의 응력분담으로 핀접합보다는 우수한 성능을 보유한 반강접 접합부로 판단할 수 있었다.

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Effects of carnosine and hypothermia combination therapy on hypoxic-ischemic brain injury in neonatal rats

  • Byun, Jun Chul;Lee, Seong Ryong;Kim, Chun Soo
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제64권8호
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    • pp.422-429
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    • 2021
  • Background: Carnosine has antioxidative and neuroprotective properties against hypoxic-ischemic (HI) brain injury. Hypothermia is used as a therapeutic tool for HI encephalopathy in newborn infants with perinatal asphyxia. However, the combined effects of these therapies are unknown. Purpose: Here we investigated the effects of combined carnosine and hypothermia therapy on HI brain injury in neonatal rats. Methods: Postnatal day 7 (P7) rats were subjected to HI brain injury and randomly assigned to 4 groups: vehicle; carnosine alone; vehicle and hypothermia; and carnosine and hypothermia. Carnosine (250 mg/kg) was intraperitoneally administered at 3 points: immediately following HI injury, 24 hours later, and 48 hours later. Hypothermia was performed by placing the rats in a chamber maintained at 27℃ for 3 hours to induce whole-body cooling. Sham-treated rats were also included as a normal control. The rats were euthanized for experiments at P10, P14, and P35. Histological and morphological analyses, in situ zymography, terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick end-labeling (TUNEL) assays, and immunofluorescence studies were conducted to investigate the neuroprotective effects of the various interventional treatments. Results: Vehicle-treated P10 rats with HI injury showed an increased infarct volume compared to sham-treated rats during the triphenyltetrazolium chloride staining study. Hematoxylin and eosin staining revealed that vehicle-treated P35 rats with HI injury had decreased brain volume in the affected hemisphere. Compared to the vehicle group, carnosine and hypothermia alone did not result in any protective effects against HI brain injury. However, a combination of carnosine and hypothermia effectively reduced the extent of brain damage. The results of in situ zymography, TUNEL assays, and immunofluorescence studies showed that neuroprotective effects were achieved with combination therapy only. Conclusion: Carnosine and hypothermia may have synergistic neuroprotective effects against brain damage following HI injury.