Lee Jun-Han;Do Nam-Yong;Park Sung-Yong;Kim Gun-Hyung;Cho Sung-Il
Korean Journal of Head & Neck Oncology
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v.21
no.2
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pp.139-145
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2005
Background and Objectives: Because of squamous cell carcinoma of the head and neck undergoes a generally poor hospital course, the prognostic significance of the squamous cell carcinomas in head and neck have been evaluated to identify those features associated with aggressive biologic behavior according to the immunologic and histopathologic characteristics. Materials and Method: To assess the significance of EGFR, c-erbB-2, p21 and p53 protein in head and neck tumors and their correlation with prognostic factors, samples from 74 patients with squamous cell carcinomas of larynx, pharynx, and oral cavity were studied immunohistochemically. Results: EGFR, c-erbB-2, p21, and p53 protein were expressed 94.6%, 24.3%, 85.1%, and 55.4% in 74 cases of head and neck squamous cell carcinoma, respectively. The positive expression of EGFR was associated significantly with clinical stage and the negative expressions of p21 was associated significantly with histopathologic differentiation. There were no significant relationships between the reactivity of EGFR, c-erbB-2, p21, and p53 protein. Conclusion: The expression of EGFR, c-erbB-2, p21 and p53 protein could be related to oncogenesis, and the expression of p21 and EGFR protein can be used as a prognosticator in head and neck squamous cell carcinoma under certain limitations, but c-erbB-2 and p53 protein expression alone is not enough for evaluating prognosis of the carcinoma.
The purpose of this study was to construct a protein-protein interaction (PPI) network related to oral squamous cell carcinoma (OSCC). Each protein was ranked and those most associated with OSCC were mined within the network. First, OSCC-related genes were retrieved from the Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database. Then they were mapped to their protein identifiers and a seed set of proteins was built. The seed proteins were expanded using the nearest neighbor expansion method to construct a PPI network through the Online Predicated Human Interaction Database (OPHID). The network was verified to be statistically significant, the score of each protein was evaluated by algorithm, then the OSCC-related proteins were ranked. 38 OSCC related seed proteins were expanded to 750 protein pairs. A protein-protein interaction nerwork was then constructed and the 30 top-ranked proteins listed. The four highest-scoring seed proteins were SMAD4, CTNNB1, HRAS, NOTCH1, and four non-seed proteins P53, EP300, SMAD3, SRC were mined using the nearest neighbor expansion method. The methods shown here may facilitate the discovery of important OSCC proteins and guide medical researchers in further pertinent studies.
Background: Aberrant microRNA expression has been associated with the pathogenesis of a variety of human malignancies including oral squamous cell carcinoma (SCC). In this study, we examined primary oral SCCs for the expression of 6 candidate miRNAs, of which five (miR-34a, miR-143, miR-373, miR-380-5p, and miR-504) regulate the tumor suppressor TP53 and one (miR-99a) is involved in AKT/mTOR signaling. Materials and Methods: Tumor tissues (punch biopsies) were collected from 52 oral cancer patients and as a control, 8 independent adjacent normal tissue samples were also obtained. After RNA isolation, we assessed the mature miRNA levels of the 6 selected candidates against RNU44 and RNU48 as endogenous controls, using specific TaqMan miRNA assays. Results: miR-34a, miR-99a, miR-143 and miR-380-5p were significantly down-regulated in tumors compared to controls. Moreover, high levels of miR-34a were associated with alcohol consumption while those of miR-99a and miR-143 were associated with advanced tumor size. No significant difference was observed in the levels of miR-504 between the tumors and controls whereas miR-373 was below the detection level in all but two tumor samples. Conclusions: Low levels of miR-380-5p and miR-504 that directly target the 3'UTR of TP53 suggest that p53 may not be repressed by these two miRNAs in OSCC. On the other hand, low levels of miR-34a or miR-143 may relieve MDM4 and SIRT1 or MDM2 respectively, which will sequester p53 indicating an indirect mode of p53 suppression in oral tumors.
Background: Epigenetic silencing of tumor suppressor genes due to promoter hypermethylation is one of the frequent mechanisms observed in cancers. Hypermethylation of several tumor suppressor genes involved in cell cycle regulation has been reported in many types of tumors including oral squamous cell carcinomas. LATS1 (Large Tumor Suppressor, isoform 1) is a novel tumor suppressor gene that regulates cell cycle progression by forming complexes with the cyclin dependent kinase, CDK1. Promoter hypermethylation of the LATS1 gene has been observed in several carcinomas and also has been linked with prognosis. However, the methylation status of LATS1 in oral squamous cell carcinomas is not known. As oral cancer is one of the most prevalent forms of cancer in India, the present study was designed to investigate the methylation status of LATS1 promoter and associate it with histopathological findings in order to determine any associations of the genetic status with stage of differentiation. Materials and Methods: Tumor chromosomal DNA isolated from biopsy tissues of thirteen oral squamous cell carcinoma biopsy tissues were subjected to digestion with methylation sensitive HpaII enzyme followed by amplification with primers flanking CCGG motifs in promoter region of LATS1 gene. The PCR amplicons were subsequently subjected to agarose gel electrophoresis along with undigested amplification control. Results: HpaII enzyme based methylation sensitive PCR identified LATS1 promoter hypermethylation in seven out of thirteen oral squamous cell carcinoma samples. Conclusions: The identification of LATS1 promoter hypermethylation in seven oral squamous cell carcinoma samples (54%), which included one sample with epithelial dysplasia, two early invasive and one moderately differentiated lesions indicates that the hypermethylation of this gene may be one of the early event during carcinogenesis. To the best of our knowledge, this is the first study to have explored and identified positive association between LATS1 promoter hypermethylation with histopathological features in oral squamous cell carcinomas.
Bayat, Zeynab;Ahmadi-Motamayel, Fatemeh;Salimi Parsa, Mohadeseh;Taherkhani, Amir
Genomics & Informatics
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v.19
no.4
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pp.42.1-42.17
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2021
Salivary gland carcinoma (SGC) is rare cancer, constituting 6% of neoplasms in the head and neck area. The most responsible genes and pathways involved in the pathology of this disorder have not been fully understood. We aimed to identify differentially expressed genes (DEGs), the most critical hub genes, transcription factors, signaling pathways, and biological processes (BPs) associated with the pathogenesis of primary SGC. The mRNA dataset GSE153283 in the Gene Expression Omnibus database was re-analyzed for determining DEGs in cancer tissue of patients with primary SGC compared to the adjacent normal tissue (adjusted p-value < 0.001; |Log2 fold change| > 1). A protein interaction map (PIM) was built, and the main modules within the network were identified and focused on the different pathways and BP analyses. The hub genes of PIM were discovered, and their associated gene regulatory network was built to determine the master regulators involved in the pathogenesis of primary SGC. A total of 137 genes were found to be differentially expressed in primary SGC. The most significant pathways and BPs that were deregulated in the primary disease condition were associated with the cell cycle and fibroblast proliferation procedures. TP53, EGF, FN1, NOTCH1, EZH2, COL1A1, SPP1, CDKN2A, WNT5A, PDGFRB, CCNB1, and H2AFX were demonstrated to be the most critical genes linked with the primary SGC. SPIB, FOXM1, and POLR2A significantly regulate all the hub genes. This study illustrated several hub genes and their master regulators that might be appropriate targets for the therapeutic aims of primary SGC.
Kim, Gyoo-Cheon;Lee, Kyoung-Duk;Park, Jae-Hyun;Kim, Duk-Han;Park, Jeong-Kil;Park, June-Sang;Park, Bong-Soo
Journal of Oral Medicine and Pain
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v.30
no.2
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pp.231-238
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2005
Anti-cancer drugs have been shown to target diverse cellular functions in mediation cell death in chemosensitive tumors. Most antineoplastic drugs used in chemotherapy of leukemias and solid tumors induce apoptosis in drug-sensitive target cells. However, the precise molecular requirements that are central for drug-induced cell death are largely unknown. Etoposide is used for the treatment of lung and testicular cancer. This study was performed to examine whether etoposide promote apoptosis in human oral squamous carcinoma cells (OSC9) as well as in lung and testicular cancer. Etoposide had a significant dose- and time-dependent inhibitory effect on the viability of OSC9 cells. TUNEL assay showed the positive reaction on condensed nuclei. Hoechst stain demonstrated that etoposide induced a change in nuclear morphology. The expression of p53 was increased at 48 hour, suggesting that the nuclear of OSC9 cell was damaged, thereby inducing apoptosis. Etoposide treatment induced caspase-3 cleavage and activation. Intact PARP protein 116-kDa and 85-kDa cleaved product were observed. The activated caspase-3 led cleavage of the PARP. These results demonstrate that etoposide-induced apoptosis in OSC9 cells is associated with caspase-3 activation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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