Sang-Min Kim;Dong Yeol Kim;Jiwon Park;Young-Ah Moon;Inn-Oc Han
BMB Reports
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제57권2호
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pp.92-97
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2024
Elevated blood glucose is associated with an increased risk of atherosclerosis. Data from the current study showed that glucosamine (GlcN), a normal glucose metabolite of the hexosamine biosynthetic pathway (HBP), promoted lipid accumulation in RAW264.7 macrophage cells. Oleic acid- and lipopolysaccharide (LPS)-induced lipid accumulation was further enhanced by GlcN in RAW264.7 cells, although there was no a significant change in the rate of fatty acid uptake. GlcN increased acetyl CoA carboxylase (ACC), fatty acid synthase (FAS), scavenger receptor class A, liver X receptor, and sterol regulatory element-binding protein-1c (SREBP-1c) mRNA expression, and; conversely, suppressed ATP-binding cassette transporter A1 (ABCA-1) and ABCG-1 expression. Additionally, GlcN promoted O-GlcNAcylation of nuclear SREBP-1 but did not affect its DNA binding activity. GlcN stimulated phosphorylation of mammalian target of rapamycin (mTOR) and S6 kinase. Rapamycin, a mTOR-specific inhibitor, suppressed GlcN-induced lipid accumulation in RAW264.7 cells. The GlcN-mediated increase in ACC and FAS mRNA was suppressed, while the decrease in ABCA-1 and ABCG-1 by GlcN was not significantly altered by rapamycin. Together, our results highlight the importance of the mTOR signaling pathway in GlcN-induced macrophage lipid accumulation and further support a potential link between mTOR and HBP signaling in lipogenesis.
본 연구는 치아밀집이 과도한 치아크기에 의해 나타나는지 아니면 좁은 치열궁으로 인해 초래되는지 그 원인을 규명하기 위하여 시행되었다. 앵글씨 1급 구치관계를 가지면서 상악 하악 모두 7mm이상의 치아밀집을 나타내는 경우와 정상교합자를 각각 실험군과 대조군으로 설정하였다. 82조(남29, 여53)의 치아밀집 석고모형과 82조(남37, 여45)의 정상교합 석고모형에서 각 치아의 치관 근원심폭경과 협측 및 설측 치열궁 폭경을 측정하고 치아밀집군과 정상교합군 간에 비교한 결과 치관근원심폭경과 치열궁 폭경 모두에서 두 군간의 유의한 차이가 나타났다. 치아밀집의 기여요인을 살펴본 본 연구 결과 치아밀집은 치열궁과 치아크기, 모두에 의해 초래됨으로 치열궁 확장 및 치아발치, 모두가 치료방법으로 사용될 수 있음을 알 수 있었다
본 연구에서는 레이저유도 플라즈마 분광법(Laser induced breakdown spectroscopy, LIBS) 기반의 금속 종류별 스펙트럼 데이터를 이용하여 연성정보(soft information)를 추정하고 최빈 클래스로 분류하는(most probable classification) 금속 분류 방법을 제안한다. 폐금속 자원과 같이 사전 정보가 없는 금속을 분류하는 경우 몇 가지 핵심 구성성분에 대한 정량 분석을 통해서 클래스를 추정하는 방법이 효율적이다. 이에 따라 부분 집합 기반의 부분최소제곱회귀법(Partial Least Square Regression, PLSR)을 이용하여 LIBS 검출 스펙트럼으로부터 각 성분의 농도를 독립적으로 신뢰성 있게 추정하고, 인증 표준물질(CRM) 등 알려진 모집합의 농도정보에 기반하여 최고 확률을 갖도록 분류하는 기술을 제안한다. 샘플 스펙트럼들의 다변량 분석을 통해서 여러 성분의 추정 농도를 다변량 정규 분포를 갖는 것으로 가정하고 통합(Joint) 추정 연성정보를 구할 수 있으며, 이를 활용한 최빈 확률 검출이나 추가적인 사전 정보의 결합 등을 통해서 분류 성능을 향상시킬 수 있다. 제안된 기술의 평가를 위해서 9가지 종류의 CRM 금속시료의 LIBS 스펙트럼 데이터를 사용하며, 부분 집합 기반의 PLSR 농도 추정 기술을 기반으로 단변량 혹은 다변량 정규 분포 연성 정보추정을 통해 미지 금속의 검출과 연성 정보의 검출 등을 테스트 하였다. 또한 방사형 차트(Radar chart)를 이용하여 추정된 농도와 획득한 연성정보를 효과적으로 시각화함으로써 기존 라이브러리에 포함된 부분 집합의 금속과 비교하여 해당 금속과의 유사성을 그래프를 통해 추정할 수 있다.
교류와 경쟁력 향상을 위해서는 검정기준, 평가방법과 모델 등에 많은 보완이 필요하다. 따라서, 본 연구는 현재 국내의 50단계의 심사점수를 낙농선진국에서 채택하고 있는 9점제로의 변환을 통해 국제기준을 국내 현실에 맞게 적용하기 위해 실시했다. 분석에는 한국 종축개량협회(KAIA)의 젖소에 대한 혈통기록 및 2001에서 2006년도 사이에 실시된 체형 측정 기록 중 최종점수와 15개 체형형질에 대해 초산차의 기록을 갖는 32,487두의 암소집단의 선형심사기록 자료가 이용되었다. 9점제로 변경한 집단이 더욱 정규성을 띄는 분포 특성을 나타내었다. 상관분석결과에서도 모든 형질에서 50점제와 9점제 심사 점수간에 0.98 이상의 상관계수를 나타내었다. 따라서, 50 점제에서 9점제로의 변경이 가능할 것으로 판단된다. 하지만, 9점제로의 변환 후 모든 형질에서 심사자에 따라 고도의 유의성을 보였고(P<0.001), 점수제간 F값은 발굽기울기와 앞유방의 붙음성은 심사자간 변이가 비교적 높게 나타났다. 이것은 9점제로의 변환 후에도 심사자의 주관적인 요소가 점수에 영향을 미치는 것을 의미한다. 따라서, 선형형질 점수제 변환은 환경효과에 대한 다양한 분석을 통하여 적합성 여부를 결정해야 할 것이다.
In a homothallic filamentous fungus Aspergillus nidulans, sexual and asexual developments are largely affected by the genetic and environmental factors. To regulate the complex subsets of genes involved in the developmental processes accurately, tight regulations of transcription factors are required. The forkhead type transcription factors are the class of regulators that function in a broad spectrum of cellular and developmental processes in many species from yeast to human. Here, we identified the fkhA and fkhB genes that encode a conserved forkhead transcription factors. The fkhA deletion resulted in the complete loss of fruiting body formation under all conditions favoring sexual development, suggesting that the fkhA gene is required for sexual development in A. nidulans. Overexpression of fkhA resulted in enhanced formation of fruiting bodies under induction condition not only in the normal condition but also in the condition of presence of 0.6 M KCl, which strongly inhibits sexual development. To know the function of the fkhB gene, we also generated fkhB knock-out strain in A. nidulans. Deletion of fkhB resulted in abnormal conidiophore formation under standard conditions and delayed sexual development process, suggesting that the fkhB gene plays an important role in conidiophore morphogenesis Taken together, these results suggest that the fkhA gene is necessary and sufficient for regulating sexual development and the fkhB gene is a transcription factor related in asexual developmental process in A. nidulans.
The right-handed double-helical structure of DNA (B-DNA), which follows the Watson-Crick model, is the canonical form of DNA existing in normal physiological settings. Even though an alternative left-handed structure of DNA (Z-DNA) was discovered in the late 1970s, Z-form nucleic acid has not received much attention from biologists, because it is extremely unstable under physiological conditions, has an ill-defined mechanism of its formation, and has obscure biological functions. The debate about the physiological relevance of Z-DNA was settled only after a class of proteins was found to potentially recognize the Z-form architecture of DNA. Interestingly, these Z-DNA binding proteins can bind not only the left-handed form of DNA but also the equivalent structure of RNA (Z-RNA). The Z-DNA/RNA binding proteins present from viruses to humans function as important regulators of biological processes. In particular, the proteins ADAR1 and ZBP1 are currently being extensively re-evaluated in the field to understand potential roles of the noncanonical Z-conformation of nucleic acids in host immune responses and human disease. Despite a growing body of evidence supporting the biological importance of Z-DNA/RNA, there remain many unanswered principal questions, such as when Z-form nucleic acids arise and how they signal to downstream pathways. Understanding Z-DNA/RNA and the sensors in different pathophysiological conditions will widen our view on the regulation of immune responses and open a new door of opportunity to develop novel types of immunomodulatory therapeutic possibilities.
Let R be a ring and n a fixed non-negative integer. $\cal{TI}_n$ (resp. $\cal{TF}_n$) denotes the class of all right R-modules of FGT-injective dimensions at most n (resp. all left R-modules of FGT-flat dimensions at most n). We prove that, if R is a right $\prod$-coherent ring, then every right R-module has a $\cal{TI}_n$-cover and every left R-module has a $\cal{TF}_n$-preenvelope. A right R-module M is called n-TI-injective in case $Ext^1$(N,M) = 0 for any $N\;{\in}\;\cal{TI}_n$. A left R-module F is said to be n-TI-flat if $Tor_1$(N, F) = 0 for any $N\;{\in}\;\cal{TI}_n$. Some properties of n-TI-injective and n-TI-flat modules and their relations with $\cal{TI}_n$-(pre)covers and $\cal{TF}_n$-preenvelopes are also studied.
Didit B Nugroho;Bernadus AA Wicaksono;Lennox Larwuy
Communications for Statistical Applications and Methods
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제30권2호
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pp.163-178
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2023
GARCH-X(1, 1) model specifies that conditional variance follows an AR(1) process and includes a past exogenous variable. This study proposes a new class from that model by allowing a more general (non-linear) variance function to follow an AR(1) process. The functions applied to the variance equation include exponential, Tukey's ladder, and Yeo-Johnson transformations. In the framework of normal and student-t distributions for return errors, the empirical analysis focuses on two stock indices data in developed countries (FTSE100 and SP500) over the daily period from January 2000 to December 2020. This study uses 10-minute realized volatility as the exogenous component. The parameters of considered models are estimated using the adaptive random walk metropolis method in the Monte Carlo Markov chain algorithm and implemented in the Matlab program. The 95% highest posterior density intervals show that the three transformations are significant for the GARCHX(1, 1) model. In general, based on the Akaike information criterion, the GARCH-X(1, 1) model that has return errors with student-t distribution and variance transformed by Tukey's ladder function provides the best data fit. In forecasting value-at-risk with the 95% confidence level, the Christoffersen's independence test suggest that non-linear models is the most suitable for modeling return data, especially model with the Tukey's ladder transformation.
세계는 안구 질병 치료, 시력 회복 서비스, 훈련된 안과 전문의의 부족 등 안과 측면에서 어려움에 직면해 있다. 안구 병리를 조기에 발견하고 진단하면 시각 장애를 예방할 수 있다. 하지만 기존의 망막 영상 공개 데이터 세트는 임상에서 발견되는 다양한 질병으로 구성되어 있지 않기 때문에 다양한 안구 질환을 분류하는 방법을 개발하기가 어렵다. 본 연구는 2021 ISBI challenge에서 공개된 데이터 세트인 Retinal Fundus Multi-disease Image Dataset (RFMiD) 을 이용하여 안구 질환을 분류하는 방법을 제안한다. 본 연구의 목표는 망막 이미지를 정상, 비정상 범주로 선별하기 위한 강력하고 일반화 가능한 모델을 개발하는 것이다. 제안된 모델의 성능은 수신자 조작 특성 곡선 아래 면적 점수로 비공개 테스트 데이터 세트에 대해 0.9782의 값을 보여준다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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