• 제목/요약/키워드: nonredundant

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A proteomic approach reveals the differential protein expression in Drosophila melanogaster treated with red ginseng extract (Panax ginseng)

  • Liu, Qing-Xiu;Zhang, Wei;Wang, Jia;Hou, Wei;Wang, Ying-Ping
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제42권3호
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    • pp.343-351
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    • 2018
  • Background: Red ginseng is a popularly used traditional medicine with antiaging effects in Asian countries. The present study aimed to explore the changes in protein expression underlying the mechanisms of life span extension and antiaging caused by red ginseng extract (RGE) in Drosophila melanogaster. Methods: A proteomic approach of two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-DE) was used to identify the differential abundance of possible target proteins of RGE in D. melanogaster. The reliability of the 2-DE results was confirmed via Western blotting to measure the expression levels of selected proteins. Proteins altered at the expression level after RGE treatment (1 mg/mL) were identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight tandem mass spectrometry and by searching against the National Center for Biotechnology nonredundant and Uniprot protein databases. The differentially expressed proteins were analyzed using bioinformatics methods. Results: The average survival life span of D. melanogaster was significantly extended by 12.60% with RGE treatment (1 mg/mL) compared to untreated flies. This followed increased superoxide dismutase level and decreased methane dicarboxylic aldehyde content. Based on the searching strategy, 23 differentially expressed proteins were identified (16 up-regulated and 7 down-regulated) in the RGE-treated D. melanogaster. Transduction pathways were identified using the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes database, and included the hippo and oxidative phosphorylation pathways that play important roles in life span extension and antiaging process of D. melanogaster. Conclusion: Treatment with RGE in D. melanogaster demonstrated that mechanisms of life span extension and antiaging are regulated by multiple factors and complicated signal pathways.

RTOS 용 원격 대화형쉘 설계 및 구현 (Development of a Remote Interactive Shell for RTOS)

  • 김대희;남영광;김흥남;이광용
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제9D권4호
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    • pp.677-686
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    • 2002
  • 내장형 시스템의 실시간 운영체제(RTOS)에서는 메모리와 CPU 속도 등의 제한적인 환경에서 원하는 기능을 최적으로 최단시간에 구현할 수 있는 개방형 개발도구 환경이 요구된다. 이러한 개방형 개발환경에는 타겟 시스템에 최소의 부담을 주면서 사용자가 편리하게 원하는 정보를 원격지에서 대화식으로 빠르게 접근, 참조, 제어 할 수 있는 원격 대화형 쉘이 필수적이다. 본 논문에서는 원격지에서 모듈별 로딩, 태스크의 스폰과 더불어 태스크 상태 등을 확인할 수 있는 원격 대화형 쉘 프로그램의 설계와 그에 대한 구현방법을 기술하고 원격지에서 타겟의 부담을 최소화하여 실시간 운영체계에서 정보접근이 용이하고 유지보수가 쉬운 개발환경이 가능하도록 하였다. 이 대화형 쉘은 Q-PLUS RTOS와 연동되어 작동하며 ARM계열의 EBSA285 타겟보드와 NT 호스트상에서 구현, 테스트되었다.

Harnessing the Power of IL-7 to Boost T Cell Immunity in Experimental and Clinical Immunotherapies

  • Jung-Hyun Park;Seung-Woo Lee;Donghoon Choi;Changhyung Lee;Young Chul Sung
    • IMMUNE NETWORK
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    • 제24권1호
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    • pp.9.1-9.21
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    • 2024
  • The cytokine IL-7 plays critical and nonredundant roles in T cell immunity so that the abundance and availability of IL-7 act as key regulatory mechanisms in T cell immunity. Importantly, IL-7 is not produced by T cells themselves but primarily by non-lymphoid lineage stromal cells and epithelial cells that are limited in their numbers. Thus, T cells depend on cell extrinsic IL-7, and the amount of in vivo IL-7 is considered a major factor in maximizing and maintaining the number of T cells in peripheral tissues. Moreover, IL-7 provides metabolic cues and promotes the survival of both naïve and memory T cells. Thus, IL-7 is also essential for the functional fitness of T cells. In this regard, there has been an extensive effort trying to increase the protein abundance of IL-7 in vivo, with the aim to augment T cell immunity and harness T cell functions in anti-tumor responses. Such approaches started under experimental animal models, but they recently culminated into clinical studies, with striking effects in re-establishing T cell immunity in immunocompromised patients, as well as boosting anti-tumor effects. Depending on the design, glycosylation, and the structure of recombinantly engineered IL-7 proteins and their mimetics, recombinant IL-7 molecules have shown dramatic differences in their stability, efficacy, cellular effects, and overall immune functions. The current review is aimed to summarize the past and present efforts in the field that led to clinical trials, and to highlight the therapeutical significance of IL-7 biology as a master regulator of T cell immunity.

Mass Spectrometry를 이용한 난자 특이적인 Diva와 상호작용하는 단백질의 동정 (Identification of Oocyte-Specific Diva-Associated Proteins using Mass Spectrometry)

  • 윤세진;김정웅;최경희;이숙환;이경아
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제33권3호
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    • pp.189-198
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    • 2006
  • 목적: 본 연구진은 난자성숙 과정의 조절 기작을 규명하기 위하여 생쥐의 미성숙 난자와 성숙난자에서 차이 나게 발현하는 유전자의 목록을 얻은 바 있다. 이들 유전자 중에서 Bcl-2 homolog인 Diva 유전자가 난자에 특이적으로 발현함을 본 연구를 통해 규명하였는데 이러한 Diva의 기능을 밝혀내기 위하여 immunoprecipitation (IP)과 Mass Spectrometry (MS)를 이용하여 Diva와 결합하여 상호작용하는 단백질을 동정하고자 하였다. 연구방법: NIH/3T3 세포주에 Diva를 encoding하는 pCMV-FLAG-Diva를 24 시간 동안 과발현 시키고 대조군으로는 유전자 없는 pCMV-FLAG empty vector를 transfection 하였다. FLAG에 특이적인 항체로 IP하여 Diva와 결합하는 면역복합체를 형성하게 한 후 이를 12% SDS-polyacrylamide gel 상에서 전기 영동하였고 Coomassie Blue 염색을 통해 단백질 발현양상을 관찰하였다. 대조군에서는 관찰되지 않으면서 Diva 유전자가 발현하는 실험군에서만 확인되는 밴드를 오려내어 trypsin을 사용하여 in-gel digestion 한 후 MS 분석을 시행하였다. 모든 mass spectra는 4700 Proteomics Analyzer (Applied Biosystems, Framingham, MA)에 의해 positive reflector mode에서 얻어졌다. 이렇게 얻어진 단백질들은 MASCOT Peptide Mass Fingerprint software (Matrixscience, London)을 이용하여 NCBI nonredundant database를 찾아서 동정하였다. 결과: Diva를 과발현하는 세포주에서만 관찰되는 15개 밴드에 대한 MS/MS 분석 결과, Diva와 결합하는 단백질로서 actin과 그 외에 ${\alpha}$-actinin, tropomyosin, tropomodulin 3 등의 actin-binding 단백질을 동정하였다. Diva를 과발현하는 NIH/3T3 세포주에서 면역 복합체를 형성하는 actin과 tropomyosin이 실제 난소 조직에서도 Diva와 결합하는지 IP와 Western blot을 통해 확인한 결과, actin과 tropomyosin 모두 Diva와 결합함을 확인함으로써, Diva는 이 두 단백질과 난소에서 상호작용함을 알 수 있었다. 결론: 본 연구는 Diva와 결합하여 상호작용하는 단백질들이 cytoskeletal system의 actin filament와 관계 있음을 규명한 최초의 보고이다. Diva가 actin과 tropomyosin과 결합하는 것을 고려해볼때, 난자 특이적인 Diva는 아마도 난자성숙 동안에 cytoskeletal system 을 조절하는 역할을 할 것으로 사료된다.