• Journal of Plant Biotechnology
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• 제30권1호
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• pp.73-80
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• 2003

패랭이꽃속의 분포와 개발을 위한 기초자료로 강원도에서 자생 2종과 수집가능한 7 외래종에 대한 기내배양체의 특성을 조사하였다. 캘러스의 유도를 위해 조직부위별 다양한 절편체들을 2,4-D. NAA, BA가 농도별로 처리된 MS 배지에 치상한 후, 27$^{\circ}C$ 광조건과 2.0mg/L 2,4-D와 0.5 mg/L BA의 조합배지에서 배양했을 때 3주 후 절단면에서 callus가 형성되기 시작하였으며, 패랭이꽃 (Dianthus chinensis)의 잎절편체에서 가장 양호하였다. Organogenic 캘러스의 선발은 기내에서 증식된 adventitious shoot의 절편체 유래 캘러스로부터 가능했으며 이들 캘러스를 1.0 mg/L BA와 0.1 mg/L NAA가 조합된 배지에 치상하였을 때 약 30% 정도의 shoot 형성률을 보였고 multiple shoot의 분화를 관찰할 수 있었다. In vitro에서 증식된 adventitious shoot 절편체를 1.0 mg/L BA와 0.1 mg/L NAA가 포함된 N6 배지에 치상했을 때, 캘러스 단계를 거치지 않고 직접 shoot이 형성되었고 D. gratianopol 유래 adventitious shoot 절편체는 52%의 높은 shoot 형성률을 보였다. 이들 multiple shoot로부터 재분화된 소식물체는 0.1 mg/L NAA가 포함된 MS 배지에서 뿌리가 유도되고 vermiculite가 담긴 pot에 이식 후 85% 습도하에서 활착되어 정상적인 개화된 개체를 획득할 수 있었다. 0.03 M EMS 처리된 패랭이꽃의 adventitious, shoot 절편체 유래 캘러스로부터 힌꽃의 패랭이꽃의 도연변체식물 (M23)이 분화되었으며 종자 형성이 가능하였다.

• 한국응용곤충학회지
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• 제35권4호
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• pp.315-320
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• 1996

Drosophila의 actin 5C 유전자 promoter에 쥐의 DNA polymerase $\beta$cDNA를 도입시킨 형질전환 초파리가 고감수성 환경성 변이원 검출계로 사용할 수 있는지를 조사하였다. 체세포 염색체 재조환과 체세포 염색체 돌연변이의 검출을 위해서는 geterozygous(mwh/+) 계통을 사용하였다. 염색체상의 결실이나 비분리 등에 의한 small mwh spot의 자연 발생적 빈도는 non-transgenic w 계통과 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통에서 각각 0.351 및 0.606 정도였다. 체세포 염색체 재조환에 의한 large mwh spot의 자연 발생적 빈도의 경우는 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통(0.063)이 non-transgenic w 계통(0.021)에 비해 약 3배 정도 높게 나타났다. IQ, Glu-P-1 및 {TEX}$AFB_{1}${/TEX} 등의 돌연변이원의 처리에 의한 경우, 두 종류의 mutant clone의 발생 빈도는 쥐의 DNA polymerase $\beta$가 도입된 transgenic p[pol $\beta$]-130 계통이 non-transgenic w 계통에 비하여 모두 약 2-3배 정도 높게 나타났다. 본 연구의 결과는 쥐의 DNA polymerase $\beta$가 최소한 체세포 염색체 돌연변이 유발이나 체세포 염색체 재조환의 생성 과정에 관여함을 의미하며, 형질전환 초파리 계통이 환경성 변이원 검출계로서 충분한 응용가능성이 있음을 보여 주었다.

• 한국육종학회지
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• 제42권4호
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• pp.413-418
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• 2010

국내에서 육성된 품종인 '일품'을 대상으로 현미배양 후대의 주요 농업형질에 대한 변이체의 발생양상과 범위 및 종류 등을 조사하고 변이집단의 크기와 변이집단의 육종적 유용성에 대한 결과는 다음과 같다. '일품' 완숙현미 유래 캘러스로부터 424개체의 식물체를 재분화하고 297개체로부터 종자를 채종하여 계통 재배하면서 간장, 출수기 등 주요 농업형질과 형태적 변이를 조사하였다. 주요 농업형질과 형태적 특성이 모품종과 다른 변이체는 전체의 21.5%인 64계통이었으며 조사한 형질 중 변이의 발생빈도가 가장 높았던 형질은 출수기로 9.1%인 27계통이었고 'opaque endosperm'이 1.7%, 'rolling leaf'가 1.3% 등이었다. $S_2$세대의 분리는 출수기가 가장 많았으며 'dwarf/semi dwarf'와 'rolling leaf' 및 'opaque endosperm' 변이체는 $S_1$세대에서는 계통 내 분리를 보였으나 $S_2$ 세대 에서는 분리하지 않았다. 이상의 결과에서 보면 조직 배양 후대에 발생하는 변이는 생성범위가 넓고 빈도 또한 높아 새로운 유전자원으로 유용하게 활용할 수 있을 것으로 생각된다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제32권4호
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• pp.435-440
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• 1989

Alkaline protease를 생산하는 Bacillus subtilis를 $100{\mu}g/ml$ NTG 처리하여 $Arg^-,\;Try^-,\;His^-\;Ade^-$ 영양요구성주를 분리하였다. 원형질체 형성은 대수증식기의 균체를 lysozyme $200{\mu}g/ml$로 $42^{\circ}C$에서 $10{\sim}30$분간 처리하였을 때 약 99%였다. 재생배지에 0.3M sodium succinate, polyvinylpyrrolidone 2.0%, casamino acid 0.5%, $10mM\;MgCl_2$ 및 $20mM\;CaCl_2$를 첨가했을 때 재생율은 25.2% 였다. 원형질체 융합은 40%(w/v)의 PEG 6,000 용액을 상온에서 $1{\sim}5$분간 처리시 약 $2{\sim}8{\times}10^{-5}$의 융합빈도를 얻을 수 있었다.

• Genomics & Informatics
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• 제20권2호
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• pp.18.1-18.7
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• 2022

According to long-term projections, by 2030, the world's population is predicted to reach 7.5 billion individuals, and there will be roughly 27 million new cancer cases diagnosed. The global burden of breast cancer (BC) is expected to rise. According to the Ministry of Health-Iraqi Cancer Registry, cancer is the second largest cause of death after cardiovascular disease. This study investigated the interleukin-18 (IL18) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) -607C/A rs1946518 and -137G/C rs187238 using the sequence-specific amplification-polymerase chain reaction approach. Regarding the position -607C/A, there was a highly significant difference between the observed and expected frequencies in patients and controls (χ² = 3.16 and χ² = 16.5), respectively. The AA and CA genotypes were associated with significantly increased BC risk (odds ratio [OR], 3.68; p = 0.004 and OR, 2.83; p = 0.04, respectively). Women with the A allele had a 5.03-fold increased susceptibility to BC. The C allele may be a protective allele against BC (OR, 0.19). Although position -137G/C showed no significant differences in the CC genotype distribution (p = 0.18), the frequency of the CC genotype was significantly higher in patients than in controls. In contrast, patients had a significantly higher frequency of GC genotypes than controls (p = 0.04), which was associated with an increased risk of developing BC (OR, 2.63). The G allele frequency was significantly lower in patients than in controls (55.0% vs. 76.2%, respectively). This SNP may be considered a common genotype in the Iraqi population, with the wild-type G allele having a protective function (OR, 0.19) and the mutant C allele having an environmental effect (OR, 2.63).

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제61권4호
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• pp.455-462
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• 2023

Since 2015, countries in the Sahel region have implemented large-scale seasonal malaria chemoprevention (SMC). However, the mass use of sulfadoxine-pyrimethamine (SP) plus amodiaquine impacts the genetic diversity of malaria parasites and their sensitivity to antimalarials. This study aimed to describe and compare the genetic diversity and SP resistance of Plasmodium falciparum strains in Mali and Niger. We collected 400 blood samples in Mali and Niger from children aged 3-59 months suspected of malaria. Of them, 201 tested positive (Niger, 111, 55.2%; Mali, 90, 44.8%). Polymorphism of merozoite surface protein 1 (msp1) genetic marker showed 201 allotypes. The frequency of the RO33 allotype was significantly higher in Niger (63.6%) than in Mali (39.3%). There was no significant difference in the frequency of the K1 and MAD20 allotypes between the 2 countries. The multiplicity of infection was 2 allotypes per patient in Mali and one allotype per patient in Niger. The prevalence of strains with the triple mutants Pfdhfr51I/Pfdhfr59R/Pfdhps436A/F/H and Pfdhfr51I/Pfdhfr59R/Pfdhps437G was 18.1% and 30.2%, respectively, and 7.7% carried the quadruple mutant Pfdhfr51I/Pfdhfr59R/Pfdhps436A/F/H/Pfdhps437G. Despite the significant genetic diversity of parasite populations, the level of SP resistance was comparable between Mali and Niger. The frequency of mutations conferring resistance to SP still allows its effective use in intermittent preventive treatment in pregnant women and in SMC.

• 미생물학회지
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• 제43권4호
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• pp.243-249
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• 2007

Centromere는 채세포분열과 생식세포분열 등 맡은 주요 기능을 담당하는 고도로 분화된 구조이다. Alphoid DNA (${\alpha}$-satellite)는 인간뿐 아니라 모든 영장류의 염색체 내 centromere에서 발견되는 반복서열의 대부분을 차지한다. 인간 인공염색체(Human Artificial Chromosome, HAC)의 개발에서 가장 핵심적인 부분은 centromere의 분리 및 안정적인 유지에 있다. 이 영역은 출아효모에서 alphoid DNA 반복서열을 hook으로 이용하여 Transformation-associated recombination (TAR) cloning법을 사용하여 선택적으로 분리할 수 있다. 이러한 실험방법으로 먼저 repeat array를 rolling-circle amplication (RCA)를 통하여 약 5 kb까지 길이를 연장시킨 후, 효모내에서 상동성재 조합을 이용한 TAR cloning법을 사용하여 분리할 수 있다. 이렇게 분리된 35 kb-50 kb 길이의 4종류의 centromeric DNA repeat arrays (2,4,5,6 mer)를 사용하여, 반복서열의 안정성 유지를 조사하기 위해 상동성재조 합 변이주인 rad51, rad52, rad54를 사용하여 비교 분석하였다. 야생주, rad51과 rad54 변이주를 이용하여 형질전환을 수행한 결과, 반복서열의 크기에 있어서 많은 변화를 나타내었다. 반면, rad52 변이주는 야생주와 다르게 형질전환빈도가 매우 낮은 비율로 나타났으나, centromeric DNA repeat array의 안정성은 3배 이상으로 높게 나타냈다. 이러한 결과들을 미루어, rad52 변이주를 사용하여 centromeric DNA repeat arrays의 형질전환실험에서 발생하는 맡은 변이를 줄일 수 있을 것으로 보인다. 이러한 유전적 방법은 HAC 제작에서 반복서열의 유지에 훨씬 효율적으로 사용할 수 있을 것으로 사료된다.

• Genomics & Informatics
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• 제15권4호
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• pp.136-141
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• 2017

Accurate detection of genomic alterations, especially druggable hotspot mutations in tumors, has become an essential part of precision medicine. With targeted sequencing, we can obtain deeper coverage of reads and handle data more easily with a relatively lower cost and less time than whole-exome or whole-genome sequencing. Recently, we designed a customized gene panel for targeted sequencing of major solid cancers. In this study, we aimed to validate its performance. The cancer panel targets 95 cancer-related genes. In terms of the limit of detection, more than 86% of target mutations with a mutant allele frequency (MAF) <1% can be identified, and any mutation with >3% MAF can be detected. When we applied this system for the analysis of Acrometrix Oncology Hotspot Control DNA, which contains more than 500 COSMIC mutations across 53 genes, 99% of the expected mutations were robustly detected. We also confirmed the high reproducibility of the detection of mutations in multiple independent analyses. When we explored copy number alterations (CNAs), the expected CNAs were successfully detected, and this result was confirmed by target-specific genomic quantitative polymerase chain reaction. Taken together, these results support the reliability and accuracy of our cancer panel in detecting mutations. This panel could be useful for key mutation profiling research in solid tumors and clinical translation.

• 한국균학회지
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• 제21권3호
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• pp.230-234
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• 1993

R. nigricans Ehrenberg의 돌연변이주를 분리하기 위하여 화학적인 돌연변이원인 N-Methyl-N'-Nitro-N-Nitrosoguanidine(MNNG)과 Ethyl Methane Sulphonate(EMS)의 최적 처리 조건을 조사하였을 때, MNNG농도는 $125{\mu}g/ml$, 처리시간이 60분일 때 돌연변이율이 가장 높은 생존율 0.1-1.0%를 나타내었다. MNNG를 이용하여 영양요구성 돌연변이주 Leucine auxotroph를 분리하였으며, 포자낭병의 길이가 축소된 것, 포자낭병의 모양이 나선형으로 변한 것, 그리고 포자낭과 포자낭포자의 크기가 감소된 것 등 세 가지 형태적 변이주를 분리하였다.

• 미생물학회지
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• 제29권2호
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• pp.75-79
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• 1991

The yeast L-A virus (4.6 kb dsRNA genome) encodes the major coat protein and a "gag-pol" fusion minor coat protein that separately encapsidate itself and $M_{1}$, a 1.8 kb dsRNA satellite virus encoding a secreted protein toxin (the killer toxin). The teast chromosomal SKI genes prevent viral cytopathology by lowering the virus copy number. Thus, $ski^{-}$ mutants are ts and cs for growth. We transformed a ski2-2 virus-infested mutant with a yeast bank in a high copy cloning vector and selected the rare healthy transformants for analysis. One type of transformant segregated M-O L-A-O cells with high frequency. Elimination of the DNA clone from the ski2-2 strain eliminated this phinotype and introduction of the DNA clone recovered from such transformants into the parent ski2-2 strain, or into ski3 or ski6 mutants gave the same phenotype. This killer-curing phenotype was due to the curing of the helper L-A dsRNA virus. The 6.5 kb insert only had this activity when carried on a high copy vector and in $ski^{-}$ cells (not in $SKI^{+}$ cells). This 6.5 kb insert acts as a mutagen on L-A dsRNA producing a high rate of deletion mutations.mutations.