• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제13권6호
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• pp.48-54
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• 2013

최근 영화나 CF등에 사용되는 컴퓨터 그래픽스(Computer Graphics, 이하 CG)분야의 유체 시뮬레이션에서는 CPU와 GPU를 혼합하여 사용하는 기술들이 소개되고 있다. 본 논문에서는 유체 시뮬레이션 수행을 위한 투영 단계에서 멀티쓰레드를 이용하여 기존의 CPU와 GPU 간의 작업을 순차적으로 수행하던 방식을 개선하여 CPU와 GPU 간의 작업을 병렬처리 방법을 제시하였다. 제시된 방법을 통해 많은 계산량을 필요로 하는 유체시뮬레이션의 효율성을 높일 수 있었다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2002년도 봄 학술발표논문집 Vol.29 No.1 (B)
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• pp.631-633
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• 2002

본 논문은 U5P 프로세서 기반의 스마트 카메라에 사용되는 효율적이고 소형화된 영상 저리 플랫폼의 설계에 대해 설명한다 제한된 소량의 기억장치를 갖는 내장형 시스템의 제약조건을 만족시키기 위해서 제안된 플랫폼은 블록 처리의 개념을 사용하여 입력 영상을 처리한다. 먼저 입력 영상이 적당한 수의 데이터 블록으로 나누어진다. 그리고 나서 영상 불록들은 일련의 블록 기반 함수들에 의해서 처리된다. 처리된 블록들은 다시 하나의 결과 영상으로 모아진다. 블록 처리는 요구되는 메모리 크기를 줄여줄 뿐만 아니라 multithreading과 병렬 처리를 통한 더 빠른 수행을 가능하도록 해준다. 플랫폼을 구성하는 대부분의 함수들은 이러만 블록 처리의 장점을 살려서 일련의 영상 블록들을 처리한다. 소개되는 플랫폼은 특화된 하드웨어를 사용하지 않고 사용자의 요구에 맞는 또다른 영상 처리와 압축 기법을 추가하는 것이 가능하게 해준다.

• 대한전자공학회:학술대회논문집
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• 대한전자공학회 2006년도 하계종합학술대회
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• pp.717-718
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• 2006

In this paper, we present an RTOS named HEART (Highly Expandable AOP-based Real-Time operating system). It is modularized into a single base and multiple optional features. The base implements a core functionality and each feature implements a specific functionality of RTOS such as interrupt nesting, multithreading, inter-thread communication, and etc. Users can customize HEART just by selecting needed features. Then a specialized version of HEART is automatically generated. We argue that HEART enables the rapid construction of optimized and application-specific RTOSes for diverse embedded systems.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2002년도 춘계학술발표논문집 (상)
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• pp.241-244
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• 2002

본 논문은 Post-PC 에 사용되는 DSP 프로세서 기반 디지털 카메라의 효율적이고 소형화된 영상 처리 플랫폼 설계에 대해 설명한다. 제한된 소량의 기억장치를 갖는 내장형 시스템의 제약조건을 만족시키기 위해서 제안된 플랫폼은 블록 처리의 개념을 사용하여 입력 영상을 처리한다. 먼저 입력 영상이 적당한 수의 데이터 블록으로 나누어진다. 그리고 나서 영상 블록들은 일련의 블록 기반 함수들에 의해서 처리된다. 처리된 블록들은 다시 하나의 결과 영상으로 모아진다. 블록 처리는 요구되는 메모리 크기를 줄여줄 뿐만 아니라 multithreading 과 병렬 처리를 통한 더 빠른 수행을 가능하도록 해준다. 플랫폼을 구성하는 대부분의 함수들은 이러한 블록 처리의 장점을 살려서 일련의 영상 블록들을 처리한다. 소개되는 플랫폼은 특화된 하드웨어를 사용하지 않고 사용자의 요구에 맞는 또다른 영상 처리와 압축 기법을 추가하는 것이 가능하게 해준다.

• 반도체디스플레이기술학회지
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• 제12권3호
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• pp.13-18
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• 2013

Motion estimation is a key technique of modern video processing that significantly improves the coding efficiency significantly by exploiting the temporal redundancy between successive frames. Thread-level parallelism is a promising method to accelerate the motion estimation process for multithreading general-purpose processors. In this paper, we propose a parallel motion estimation algorithm which parallelizes the motion search process of the current H.264/AVC encoder. The proposed algorithm is implemented using the OpenMP application programming interface (API) and can be easily integrated into the current encoder. The experimental results show that the proposed parallel algorithm can reduce the processing time of the motion estimation up to 65.08% without any penalty in the rate-distortion (RD) performance.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2004년도 봄 학술발표논문집 Vol.31 No.1 (B)
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• pp.391-393
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• 2004

본 논문에서는 실시간 객체 지향 모델의 시나리오 기반 다중 쓰레딩에 대한 실험적 평가를 위해 PBX (Private Branch eXchange, 사설 교환기) 시스템에 대한 사례 연구 결과를 제시한다. 사용된 PBX 시스템은 재구성 가능한 동적 구조와 전형적인 계층 구조와 같은 실세계의 응용들에서 발견되는 많은 특징을 보인다 이 실험적 연구는 (1) 설계자의 사용 편리성과 (2) 결과적인 실행 바이너리의 성능이 얼마나 향상되는지를 평가하는 것을 목적으로 한다. 본 논문에서는 우리의 도구를 통해 시나리오 기반 다중 쓰레딩 실행 바이너리를 생성하는 것과 함께 시나리오를 모델링하기 위해 이를 어떻게 적응하는지를 보인다 이 사례 연구는 우리의 방법이 규모의 복잡한 모델을 다룰 수 있으며 시나리오 기반 다중 쓰레딩이 실세계 모델에 대하여 성능 향상을 가져오는 것을 명백하게 보여준다.

• Genomics & Informatics
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• 제16권4호
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• pp.38.1-38.3
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• 2018

Gene-gene interaction (GGI) analysis is known to play an important role in explaining missing heritability. Many previous studies have already proposed software to analyze GGI, but most methods focus on a binary phenotype in a case-control design. In this study, we developed "Hierarchical structural CoMponent analysis of Gene-Gene Interactions" (HisCoM-GGI) software for GGI analysis with a continuous phenotype. The HisCoM-GGI method considers hierarchical structural relationships between genes and single nucleotide polymorphisms (SNPs), enabling both gene-level and SNP-level interaction analysis in a single model. Furthermore, this software accepts various types of genomic data and supports data management and multithreading to improve the efficiency of genome-wide association study data analysis. We expect that HisCoM-GGI software will provide advanced accessibility to researchers in genetic interaction studies and a more effective way to understand biological mechanisms of complex diseases.

• Genomics & Informatics
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• 제16권4호
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• pp.39.1-39.3
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• 2018

The rapid increase in genetic dataset volume has demanded extensive adoption of biological knowledge to reduce the computational complexity, and the biological pathway is one well-known source of such knowledge. In this regard, we have introduced a novel statistical method that enables the pathway-based association study of large-scale genetic dataset-namely, PHARAOH. However, researcher-level application of the PHARAOH method has been limited by a lack of generally used file formats and the absence of various quality control options that are essential to practical analysis. In order to overcome these limitations, we introduce our integration of the PHARAOH method into our recently developed all-in-one workbench. The proposed new PHARAOH program not only supports various de facto standard genetic data formats but also provides many quality control measures and filters based on those measures. We expect that our updated PHARAOH provides advanced accessibility of the pathway-level analysis of large-scale genetic datasets to researchers.

• 한국정보처리학회논문지
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• 제6권11호
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• pp.2932-2945
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• 1999

As the Internet and Java technology have been growing up, parallel processing approach to utilize those idle resources connected to the Internet has become quite attractive. In this paper, JICE(Java Internet Computing Environment) was implemented as a parallel computing platform based on the Internet using multithreading and RMI mechanisms provided by Java. The basic model of JICE is constructed as three components, such as a client, a set of workers, and a broker. A worker communicates with other workers via a globally shared memory system. It provides users with master-slave programming model and a collection of library functions. The basic model of JICE is also extended as a multimanaging system. This multimanaging system is evaluated by analysis to show its effectiveness. According to numerical analysis and experiments with several benchmarks, it is shown that the performance of basic model depends on the shared memory reference ratio and user's library is a quite promising.

• ETRI Journal
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• 제37권2호
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• pp.212-221
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• 2015

As the amount of re-sequencing genome data grows, minimizing the execution time of an analysis is required. For this purpose, recent computing systems have been adopting both high-performance coprocessors and host processors. However, there are few applications that efficiently utilize these heterogeneous computing resources. This problem equally refers to the work of single nucleotide polymorphism (SNP) detection, which is one of the bottlenecks in genome data processing. In this paper, we propose a method for speeding up an SNP detection by enhancing the utilization of heterogeneous computing resources often used in recent high-performance computing systems. Through the measurement of workload in the detection procedure, we divide the SNP detection into several task groups suitable for each computing resource. These task groups are scheduled using a window overlapping method. As a result, we improved upon the speedup achieved by previous open source applications by a magnitude of 10.