• 제목/요약/키워드: mitochondrial DNA polymorphism

검색결과 101건 처리시간 0.027초

RFLP Analysis of the mtDNA COI Region in Four Abalone Species

  • Park, Choul-Ji;Kijima, Akihiro
    • Fisheries and Aquatic Sciences
    • /
    • 제9권3호
    • /
    • pp.101-106
    • /
    • 2006
  • The cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene region of mitochondrial DNA (mtDNA) was examined in four abalone species to estimate its utility as a genetic marker using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. The utility was evaluated in terms of genetic divergence and relationships among Haliotis discus hannai, H. rufescens, H. rubra, and H. midae in both hemispheres of the world. There was clear genetic divergence in the mtDNA COI region between all pairs of the four species. Moreover, relationships among the abalone species were reflected in their geographical distributions and morphological characteristics. Therefore, RFLP analysis of the mtDNA COI region is a suitable genetic marker for the estimation of genetic divergence and relationships among abalone species. However, it is not effective for the evaluation of genetic differences within abalone species.

한국인 집단에서 사립체 DNA에 존재하는 5178 A/C 다형성과 고혈압과의 관련성에 관한 연구 (Lack of Association of the Mitochondrial DNA 5178 A/C Polymorphism with Hypertension in a Korean Population)

  • Kang, Byung-Yong;Kim, Seon-Jeong;Jang, Dai-Ho;Kim, Hyun-Hee;Lee, Kang-Oh
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
    • /
    • 제18권1호
    • /
    • pp.27-32
    • /
    • 2003
  • 고혈압은 다양한 유전적 요인과 환경적 요인이 상호작용하는 다인자성 질환으로 알려져 있으며, 최근의 연구에 의하면 사립체 DNA에 존재하는 유전적 다형성이 고혈압과 유의한 관련성을 나타낸다는 보고가 있다. 이에 본 연구에서는 한국인 집단을 대상으로 하여 사립체 DNA의 5178번째 위치의 염기서열에 존재하는 A/C 다형성이 고혈압과 관련성을 나타내는 지를 분석하였다. 환자-대조군 연구를 수행한 결과, 사립체 DNA의 5178번째 위치에 존재하는 다형성의 대립 유전자 빈도는 한국인에서 고혈압군과 정상 혈압군 사이에 유의한 차이를 나타내지 않았다. 따라서, 이 다형성은 적어도 한국인에 대해서는 고혈압에 유의하게 영향을 미치는 유전적 소인은 아닌 것으로 사료된다.

Acanthamoeba pustulosa와 A. palestinensis의 동위효소 및 rDNA PCR-RFLP 양상의 유사성 (Close relatedness of Acanthomoeba pintulosa with Accnthcmoebc palestinensis based on isoenzyme profiles and rDNA PCR-RFLP patterns)

  • 김영호;옥미선
    • Parasites, Hosts and Diseases
    • /
    • 제34권4호
    • /
    • pp.259-266
    • /
    • 1996
  • 형태학적 제3군 가시아메바의 taxonomic validity는 아직 확실하지 않다. 이번 연구에서 제3군에 속하는 6종의 가시 아메바 즉 A. culbertsoni A. healyi A. palestinensis. A. pustulosa, A. royreba 및 A. lenticulata의 type strain들의 동위효소. 미토콘트리아 DNA 및 small subunit(ssu) rDNA의 Restriction Fragment Length Polymorphism(RFLP) 양상을 비교하여 이들의 taxonomic validity를 검토하였다. 미토콘드리아 DNA의 RFLP 양상은 분리주간에 서로 심한 차이를 보였다. A. palestinensis와 A. pustulosc는 거의 동일한 rDNA RFLP(추정 염기 치환율 2.6%) 및 동위효소의 양상을 보여 A. palestinensis와 A. pustulosc는 같은 종으로 판단되었다. 그외의 종들은 서로 아주 다양한 rDNA RFLP 및 동위효소의 양상을 나타내어 독립종으로 인정되었다.

  • PDF

김포 장기동 유적 출토 인골의 유전자 분석 연구 (The Genetic Analysis Study of Ancient Human Bones Excavated at Janggi-dong site, Gimpo)

  • 서민석;조은민;김윤지;김수훈;강소영
    • 보존과학회지
    • /
    • 제30권4호
    • /
    • pp.409-416
    • /
    • 2014
  • 유적지에서 발굴되는 조선시대 인골은 보존 상태가 대부분 양호하여 형질인류학, 유전학, 그리고 화학적 연구를 수행할 수 있다. 본 연구에서는 김포 장기동 유적지에서 발굴된 조선시대 인골 6개체에 대한 DNA 분석을 통하여 미토콘드리아 DNA 변이형을 결정하였으며, 성별 분석결과를 토대로 남성 피장자의 Y 하플로그룹을 동정하였다. 유전자 분석에 앞서 보존상태가 양호한 것으로 판단되는 인골 6구를 대상으로 조직학 지수를 판별하였다. 미토콘드리아 DNA 변이형은 아시아인에서 높은 빈도로 나타나는 G, R11, M7, A5 등의 하플로그룹이 확인되었다. 인골의 성별을 확인하기 위하여 아밀로제닌 유전자 분석을 수행한 결과, 6구의 인골에서 여성 4구와 남성 2구의 성별을 확인할 수 있었다. 남성으로 판명된 인골에 Y 염색체 단일염기다형성 분석을 적용해본 결과, 하플로그룹 O로 확인되었다. 향후 출토 인골의 광범위한 분석을 위하여 인골을 선별한 경우에는 본 연구에서 제시한 조직학 지수를 적용하고, 미토콘드리아 DNA와 핵 DNA의 다양한 분석을 병행하여 출토 인골간의 유연관계를 규명하는 것이 필요하다.

Manganese Superoxide Dismutase (MnSOD Val-9Ala) Gene Polymorphism and Susceptibility to Gastric Cancer

  • Moradi, Mohammad-Taher;Yari, Kheirollah;Rahimi, Zohreh;Kazemi, Elham;Shahbazi, Mehrdad
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
    • /
    • 제16권2호
    • /
    • pp.485-488
    • /
    • 2015
  • Background: Oxidative stress caused by the generation of reactive oxygen species plays an important role in human carcinogenesis. Manganese superoxide dismutase (MnSOD) Val-9Ala in the mitochondrial target sequence is the best known polymorphism of this enzyme. The purpose of the current research was to assess the association of MnSOD Val-9Ala genotypes with the risk of gastric cancer. Materials and Methods: This case-control study covered 54 gastric cancer patients compared to 100 cancer free subjects as controls. Extraction of DNA was performed on bioptic samples and genotypes were identified with a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. Results: The frequencies of MnSOD Ala/Ala, Ala/Val and Val/Val genotypes in healthy individuals were 24.3, 66.7 and 9%, respectively. However, in gastric cancer patients, Ala/Ala, Ala/Val and Val/Val were observed in 24.0, 48.0 and 28.0% (p=0.01). In patients the frequency of MnSOD Val allele was higher (52%) compared to that in controls (42%). Conclusions: The results of this study show a positive association between MnSOD Val-9Ala gene polymorphism and risk of gastric cancer disease in Iranian population.

한우 경제형질에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop 영역의 염기서열 변이효과 (Effect of Sequence Variation in Bovine Mitochondrial DNA D-loop Region on Economic Traits for Hanwoo)

  • 오재돈;윤두학;공홍식;임현진;이학교;조병욱;홍기창;전광주
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • 제45권6호
    • /
    • pp.933-938
    • /
    • 2003
  • 본 연구는 한우 mt DNA D-loop 영역의 염기변이 다형성과 경제형질간의 관련성을 분석하기 위하여 수행하였다. 한우의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환 의해 총 25개의 polymorphic site가 확인되었다. 그중 주요 Polymorphic site의 염기변이 빈도는 169, 16042, 16093, 16119, 16255 및 16302번째 위치에서 0.891, 0.117, 0.109, 0.182, 0.197 및 0.117로 검출되었다. 169 및 16119번째 위치에서의 염기치환에 의한 MS의 효과는 -1.08(p〈0.05), 1.29(p〈0.01)로 나타났으며, 169 및 16042번째 위치에서의 염기치환에 의한 BF의 효과는 -0.31(p〈0.01)과 0.34(p〈0.01)로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 mtDNA내 D-loop 영역의 염기서열 변이 빈도 등은 한우집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석은 물론 모계유전 양상 분석을 통한 한우의 형성과정과 타 품종과의 계통분류적 상호 관계 등의 분석에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

Holstein의 유량과 유지방 생산에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop 영역의 염기 서열 변이 효과 (Effect of Sequence Variation in Mitochondrial DNA D-loop Region on Milk and Milk Fat Production in Holstein Cows)

  • 오재돈;공홍식;이학교;전광주
    • Reproductive and Developmental Biology
    • /
    • 제29권1호
    • /
    • pp.9-13
    • /
    • 2005
  • 본 연구는 젖소(Holstein종)의 mtDNA D-loop 영역 염기변이 다형성과 경제형질간의 관련성을 분석하기 위하여 수행하였다. 젖소의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환에 의해 총 35개의 polymorphic site가 확인되었다. 그중 주요 Polymorphic site의 염기변이 빈도는 106, 169, 16057, 16231 및 16255 지역에서 높은 빈도의 염기치환이 검출되었다. 169 지역은 A가 G로 염기치환이 일어났고 그 빈도는 0.555로 높게 나타났으며 염기치환에 의한 산유량 효과는 1259.6 kg(P<0.05)로 나타났다. 유지방과의 관계를 분석한 결과 16118 지역은 A가 G로 치환되는 빈도가 0.02로 검출되었으며, 16135 지역은 T가 C로 치환되는 빈도가 0.02로 검출되었고, 16302 지역은 G가 A로 치환되는 빈도가 0.04로 검출되었다. 이 지역들이 유지방에 미치는 변이 효과는 - 156, - 118.15 및 - 67.77 kg(P<0.1)으로 나타났다. 본 연구에서 검출한 젖소 mtDNA내 D-loop 영역의 염기서열 변이 빈도와 유량, 유지방과의 연관성 분석 결과 등은 젖소집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석으로 다양한 유전적 지표인자 발굴에 도움이 될 것이며 이를 통해 분자유전학적 기법을 이용한 젖소의 육종전략을 확립하는데 기초 자료가 되는 것은 물론 분자육종학적인 연구에 기초 자료로서 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다.

한우 산유량에 미치는 Mitochondrial DNA D-loop영역의 염기서열 변이효과 (Effect of Sequence Variation in Bovine Mitochondrial DNA D-Ioop Region on ~ilk Production for Hanwoo)

  • 공홍식;오재돈;임현진;이학교;전광주;윤두학;전기준;최재관;최연호;조병욱
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • 제46권5호
    • /
    • pp.729-734
    • /
    • 2004
  • 본 연구는 한우의 mtDNA D-loop 영역 염기 변이가 산유량에 미치는 효과를 검증하기 위하여 수행하였다. 젖소의 mtDNA D-loop 영역에서 단일염기의 치환이 20 개의 지역에서 확인되었다. 그중 8, 169, 16042, 16051, 16057, 16093, 16119, 16122, 16209, 16255, 16302 bp 지역에서 높은 빈도의 염기치환이 검출되었다. 16119bp 지역에서는 T가 C로 치환된 빈도가 0 .138로 검출되었으며, 이 위치에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 -1.61 (p<0.1)로 나타났다. 16185bp 지역에서의 염기치환에 의한 산유량 효과는 3.557(p<0.05)로 나타났으며 G가 A로 치환된 빈도는 0.063로 나타났다. 본 연구에서 검출한 한우 다유계통 집단의 mtDNA내 D- loop 영역의 염기서열 변이 빈도와 유량과의 연관성분석 결과 등은 한우 집단의 유전적 변이성 추정과 좀 더 다양한 경제형질과의 관련성 분석으로 다양한 유전적 지표인자 발굴에 도움 될 것이며 이를 통해 분자유전학적 기법을 이용한 한우의 육종 전략을 확립하논데 기초 자료가 되는 것은 물론 우려나라 고유 품종인 한우의 유전자원 보존과 분자육종학적인 연구에 기초 자료로서 유용하게 활용 할 수 있을 것으로 기대된다.