막장, 재래식 된장 및 막장과 재래식의 혼용 된장을 주원료로 제조한 쌈장의 일반 성분, 유리 아미노산, 향기성분 등의 품질을 검토한 결과는 다음과 같다. 쌈장은 수분 $51.2{\sim}53.5%$, 염분 $11.47{\sim}14.05%$, 총당 $20.38{\sim}23.6%$, 환원당 $8.44{\sim}9.29%,\;pH\;4.76{\sim}5.53$의 범위로 총당은 막장구, 환원당은 혼용구의 쌈장에서 높았다. 쌈장의 유리 아미노산으로 glutamic acid가 $230.6{\sim}310.9mg/100\;g$으로 가장 높았다. 쌈장의 명도, 적색도, 황색도 값은 재래식 된장구 및 혼용구된장구의 쌈장에서 높았다. 쌈장의 휘발성 향기 성분으로 acid류 13종, alcohol 11종, ester 7종, aldehyde 3종, alkane 4종, phenol 4종, pyraine 3종 등 총 54종이 동정되었다. Ethanol, acetic acid ethyl ester, 3-methyl butanoic acid, 2,4-hexadienoic acid, acetic acid등은 면적비율이 높아 쌈장 향기의 주성분으로 추측된다. 막장구에서는 pentanoic acid methyl ester, 4-methoxy-2-buten-1-ol이 , 재래식 된장구에서는 2-methyl-1-propanol, butanoic acid, 3-methyl butanoic acid 등이, 혼용구에서는 ethanol, ethyl acetate, 2,4-hexadienoic acid 등의 향기성분이 각각 타시험구 보다 면적 비율이 높은 것으로 나타났다.
소금생산을 위해 25% 이상의 함수를 저장해 놓는 염전의 해주로부터 호염성 세균 4균주를 분리하고 높은 염분농도에서도 ${\beta}$-glucosidase를 생성하는 HJS1과 HJS6 균주를 선발하였다. 이들 ${\beta}$-glucosidase 생성세균은 NaCl 1-10%에서 70-79U/mg의 최적 활성을 나타내었고, NaCl 3%에서 최대 활성을 나타내었으며 NaCl 0-20% 농도에서 최대 효소 활성대비 75%이상의 효소활성을 유지하는 내염성 ${\beta}$-glucosidase를 생성하는 것으로 확인되었다. 내염성 ${\beta}$-glucosidase 생성 HJS1과 HJS6 균주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 검토한 결과, Roseivivax roseus $BH87090^T$ (FJ897782)와 99.8%의 상동성을 나타내었고 상기 균주들의 염기서열은 NCBI GenBank에 각각 AB971835와 AB971836로 등록하였다. 계통학적으로 근연종인 Roseivivax roseus $BH87090^T$와의 DNA-DNA 상동성을 비교 검토한 결과, 90.1-90.3%를 나타내었다. 이들 균주의 주요 균체지방산은 $C_{16:0}$, $C_{18:1}$${\omega}7c$, $C_{19:0}$ cyclo ${\omega}8c$ 그리고 11-methyl $C_{18:1}$${\omega}7c$를 함유하고 Quinone종은 Q-10로 근연종 Roseivivax roseus $BH87090^T$ 균주와 동일한 특징을 나타내어 Roseivivax roseus로 동정되었다. 반면, 비교 균주 Roseivivax roseus $BH87090^T$는 ${\beta}$-glucosidase 생성하지 않는 것으로 나타났다. 본 연구에서 분리된 Roseivivax roseus HJS1과 HJS6 균주는 내염성 ${\beta}$-glucosidase 효소 개발을 위한 유전자원으로 활용 가능하리라 사료된다.
직접 생균수 측정법(DVC)과 평판계수법(PC)을 이용하여 소나무림과 상수리나무림 토양에 분포하는 세균군집의 정량적 평가를 실시한 결과, DVC법에 의해 계수된 생균수에 대해 평판법에 의해 계수된 생균수 1% 미만으로 나타났다. 이상의 결과로부터 산림토양 내에 평판배양법으로는 배양이 곤란한 난배양성(viable but non culturable; VBNC) 세균이 99% 이상 존재해 있는 것으로 판단되었다. 이들 VBNC 세균의 군집구조 해석을 위하여 토양으로부터 직접 DNA를 추출하고 16S rDNA-ARDRA 분석을 통하여 계통학적 특성을 검토하였다. 소나무림과 삼수리나무림 토양으로부터 각각 111 clones, 108 clones을 획득하고 HaeIII 절편양상에 따라 30 groups과 26 groups의 ARDRA group으로 분류하였다. 각 ARDRA group으로부터 대표 clone을 선발하여 16S rDNA 염기서 열을 결정한 결과, 소나무림 토양의 경우 ${\alpha}$-proteobacteria (12 clones), ${\gamma}$-proteobacteria (3 clones), ${\delta}$-proteobncteria (1clone), Flexibacter/Cytophaga (1 clone), Actinobacteria (4 clones), Acidobacteria (4 clones), 그리고 Planctomycetes (5 clone)의 7개의 계통군이 확인되었으며, 상수리나무림 토양에서는 ${\alpha}$-proteobacteria (4 clones), ${\gamma}$-proteobacteria (2 clones), Actinobacteria (10 clones), Acidobacteria (8 clones), Planctomycetes (1 clone), 그리고 Verrucomicrobia (1clone)로 6개의 다양한 계통군이 확인되었다. 이상, 소나무림과 상수리나무림 토양 내에 존재하는 99% 이상의 VBNC 세균군집의 대부분은 미배양성 혹은 미동정균으로 계통학적으로 다양한 미지의 미생물로 구성되어 있음이 확인되었다.
김치 starter로 개량된 유기산내성 변이균주 L. paramesenteroides P-200이 갖는 강한 내산성에 관한 생리적 성질을 규명하기 위하여 proton 투과도, ATPase 활성, glycolysis 활성, $Mg^{++}$ 해리도, 세포막의 지방산 조성을 야생균주 (LP-W)와 비교 분석하였다. Proton 투과도 설험 결과 150 mM KCl 수용액 및 3% NaCl 수용액에서 변이균주 P-200의 $t_{1/2}$ 최대값이 pH 4.0, 5.0 그리고 6.0에서 모두 야생균주 LP-W 보다 2내지 3분 정도 더 큰 값을 가지며 실제 proton 투과도 실험에서 proton의 평형을 이루는 시간이 LP-W 보다 약 50% 정도 더 길었다. ATPase 활성의 결과에서도 최대 활성은 P-200이 pH 5에서 0.7unit/mg을, LP-W가 pH 6에서 0.6unit/mg을 나타내어, 산성 환경에서 P-200이 LP-W보다 더욱 높은 활성을 유지하였다. 또한 전체 pH 4-7 범위에서 P-200이 야생균주 LP-W 보다 높은 활성을 보였다. 해당작용의 pH 의존성 결과에서는 최대 활성이 P-200은 pH 4에서 97%이었고, LP-W는 pH 5에서 96%이었다 그리고 pH 5를 제외하면 측정한 pH 3-7 범위에서 LP-W에 비하여 P-200이 높은 해당작용 활성을 보였다. $Mg^{++}$ 해리도에 있어서는 pH 4에서 2시간 경과 후 P-200이 LP-W 보다 약 1/3 정도 $Mg^{++}$이 유출되었다. 지방산조성의 경우, LP-W에서 내산성을 증가시키는 $C_{19:0\;cyclo}$은 0%이었으나 P-200의 경우는 11.4%로 크게 증가하였다. 따라서 이상 5가지 내산성특성을 조사한 것 중 지방산조성에서 가장 큰 차이를 보였는데, 무엇보다 $C_{19:0\;cyclo}$가 0%에서 11.4%로 크게 증가하여 이러한 지방산 조성의 변화가 P-200이 LP-W 보다 더 강한 내산성을 가질 수 있었던 것에 가장 크게 기여하였을 것으로 생각되었다.
Global warming will have far-reaching effects on our ecosystem. However, its effects on Antarctic soils have been poorly explored. To assess the effects of warming on microbial abundance and community composition, we sampled Antarctic soils from the King George Island in the Antarctic Peninsula and incubated these soils at elevated temperatures of $5^{\circ}C$ and $8^{\circ}C$ for 14 days. The reduction in total organic carbon and increase in soil respiration were attributed to the increased proliferation of Bacteria, Fungi, and Archaea. Interestingly, bacterial ammonia monooxygenase (amoA) genes were predominant over archaeal amoA, unlike in many other environments reported previously. Phylogenetic analyses of bacterial and archaeal amoA communities via clone libraries revealed that the diversity of amoA genes in Antarctic ammonia-oxidizing prokaryotic communities were temperature-insensitive. Interestingly, our data also showed that the amoA of Antarctic ammonia-oxidizing bacteria (AOB) communities differed from previously described amoA sequences of cultured isolates and clone library sequences, suggesting the presence of novel Antarctic-specific AOB communities. Denitrification-related genes were significantly reduced under warming conditions, whereas the abundance of amoA and nifH increased. Barcoded pyrosequencing of the bacterial 16S rRNA gene revealed that Proteobacteria, Acidobacteria, and Actinobacteria were the major phyla in Antarctic soils and the effect of short-term warming on the bacterial community was not apparent.
본 연구에서는 계육 창상부위의 원인이 되는 세균을 동정하였다. 계육의 등과 다리 창상 부위로부터 무작위 선별법을 통해 총 10주의 균주를 분리하였다. 순수 분리 배양된 균주의 세포막 지방산 조성 분석 결과, 5 균주가 높은 유효성을 지녔으며, Shigella sonnei, Proteus mirabilis, Escherichia coli로 동정되었다. 또한 16S rRNA sequence를 실시한 결과, 동정된 균주는 Shigella sonnei(99%), Proteus mirabilis(99%) 그리고 Escherichia coli(99%)와 높은 염기서열 상동성을 나타냈다. 따라서 본 연구에서 조사된 계육의 등과 다리 부위 주요 창상 원인균은 Shigella sonnei, Proteus mirabilis, Escherichia coli인 것으로 밝혀졌다.
Kamra, D.N.;Saha, Sudipto;Bhatt, Neeru;Chaudhary, L. C.;Agarwal, Neeta
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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제16권3호
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pp.374-379
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2003
Four rumen fistulated Murrah buffaloes were used to study the effect of four diets differing in roughage to concentrate ratio on rumen biochemical changes, microbial enzyme profile and in sacco degradability of feed in a $4{\times}4$ Latin Square design. The animals were fed four diets consisting of 80:20, 70:30, 60:40 and 50:50 ratios of wheat straw and concentrate mixtures, respectively. Wheat straw and concentrate mixture were mixed with water (0.6 l/kg feed) and complete feed mixture was offered to the animals at 8:00 h and 16:00 h in two equal parts. The variation in pH of rumen liquor (difference of maximum and minimum during 0-8 h post feeding) increased with increasing level of concentrate mixture in the diet. There was no effect of diet composition on volatile fatty acids, total nitrogen and trichloro-acetic acid precipitable nitrogen in the rumen liquor, but ammonia nitrogen increased with increasing level of concentrate mixture in the ration. Major portions of all fibre degrading enzymes were present in the particulate material (PM) of the rumen contents, but protease was absent in PM fraction. The activities of micro-crystalline cellulase, acetyl esterase and protease increased with increase in the level of concentrate mixture, but the activities of other enzymes (carboxymethylcellulase, filter paper degrading activity, xylanase, $\beta$-glucosidase and $\beta$-xylosidase) were not affected. The in sacco degradability and effective degradability of feeds increased with increasing level of concentrate mixture in the ration.
Objective: To investigate the effect of host genetics on gut microbial diversity, we performed a structural survey of the fecal microbiota of four purebred boar pig lines: Duroc, Landrace, Hampshire, and Yorkshire. Methods: The V3-V4 regions of the 16S rRNA genes were amplified and sequenced. Results: A total of 783 operational taxonomic units were shared by all breeds, whereas others were breed-specific. Firmicutes and Bacteroidetes dominated the majority of the fecal microbiota; Clostridia, Bacilli, and Bacteroidia were the major classes. Nine predominant genera were observed in all breeds and eight of them can produce short-chain fatty acids. Some bacteria can secrete cellulase to aid fiber digestion by the host. Butyric, isobutyric, valeric, and isovaleric acid levels were highest in Landrace pigs, whereas acetic and propionic acid were highest in the Hampshire breed. Heatmap was used to revealed breed-specific bacteria. Principal coordinate analysis of fecal bacteria revealed that the Landrace and Yorkshire breeds had high similarity and were clearly separated from the Duroc and Hampshire breeds. Conclusion: Overall, this study is the first time to compare the fecal microbiomes of four breeds of boar pig by high-throughput sequencing and to use Spearman's rank correlation to analyze competition and cooperation among the core bacteria.
Kim, Kyong-Heon;Kim, Baek-Cheol;Lee, Hwa-Jung;Jeong, Seung-Il;Kim, Hong-Jun;Ju, Young-Sung
한방안이비인후피부과학회지
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제17권3호
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pp.26-32
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2004
Objective: The aim of this work is to investigate the antibacterial activity of the essential oil obtained from Artemisia lavandulaefolia (A. lavandulaefolia), as the development of microbial resistance to antibiotics make it essential to constantly look for new and active compounds effective against pathogenic bacteria. Method: The aerial parts of A. lavandulaefolia (1 kg) were subjected to steam distillation for 3 h, using a modified Clevenger type apparatus in order to obtain essential oil. Diethyl ether was the extracting solvent kept at 25?. The essential oil were analyzed by gas chromatography (GC) and gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS). The essential oil and the composition were tested for antimicrobial activities against 15 different genera of oral bacteria. Ninety-nine compounds accounting for 94.74$\%$</TEX> of the oil were identified. The main compounds in the oil were 1,8-cineole (5.63$\%$), yomogi alcohol (4.49$\%$), camphor (4.92$\%$), a-caryophyllene (16.10$\%$), trans-a-famesene (5.09$\%$), a-terpineol (3.91$\%$), borneol (5.27$\%$), cis-chrysanthenol (6.98$\%$), and a-humulene oxide (3.33$\%$). The essential oil and its compounds were tested for antimicrobial activity against 10 different genera of oral bacteria. Conclusion: The essential oil of A. lavandulaefolia exhibited considerable inhibitory effects against all obligate anaerobic bacteria (MICs, 0.025 - 0.05 ㎎/ml) tested, while their major compounds demonstrated various degrees of growth inhibition
Physicochemical factors, microbial population size and the properties of the bacterial isolates were assessed to find out the nature of soil ecosystem of Mt. Paektu. Samples were obtained from the surface layer of soils on which specific plant community is developed. Average content of moisture, organic matter and avaiable phosphate of the soils were 21.6%, 17.3% and 2.48mg/100g, respectively. These values were similar to those of developing forest soils, but were slightly lower than those of climax ecosystem such as Piagol in Mt. Chiri. The population size of soil bacteria ranged from 2.7 to $202.5{\times}10^5$ CFU/g.dry soil, and the size is somewhat dependent on the content of moisture and oranic matter of the forest soil. A large number of bacteria was able to decompose macromolecules such as starch, elastin and gelatin. While the distribution rate of resistant bacteria to antibiotics was high, that to toxic chemicals was low. This means that the competition between microorgani는 predominate over the interference with artificial behaviour such as spread of pesticides in the surveyed region. Bacterial species composition of each soil was comparatively simple. Pseudomonas, Agrobacterium, Flavobacterium and Xanthomonas which are Gram-negative short rods were widely distributed in the forest soils. The endospore forming Bacillus species were also main constituents of the soil microflroa. any one of the strains was not identified as Azospirillum or Micrococcus which are known to be one of major constituents of the forest soil. for the correct identification of isolates chemotaxonomic studies will be proceeded, and the strains are to be stored in the Type collection Center.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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