• 한국식품영양과학회지
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• 제39권6호
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• pp.805-812
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• 2010

본 연구에서는 조리법에 따른 마늘의 항 유전 독성 효과를 확인하기 위해 생마늘, 구운 마늘, 초절임 마늘의 에탄올 또는 메탄올 추출물을 백혈구에 처리한 후 comet assay를 수행하였다. 그 결과 조리 방법, 추출 용매에 상관없이 모든 추출물에서 DNA 손상 억제 효과가 것으로 나타났으며 활성산소인 $H_2O_2$에 대한 DNA 손상 억제 효과는 생마늘 메탄올 추출물에서, 지질과산화물인 HNE에 대한 DNA 손상 억제 효과는 구운 마늘 메탄올 추출물에서 높은 것으로 나타났다. 또한 $H_2O_2$로 유도한 스트레스에서는 마늘 추출물의 농도를 1, 5, 10, 50 ${\mu}g$/mL으로 증가시킬수록 DNA 손상 억제능이 좋은 것으로 나타난 반면 HNE로 스트레스를 유도한 군에서는 저농도인 1 ${\mu}g$/mL에서 오히려 높은 효능이 나타났다. 따라서 마늘의 항 유전 독성 효과는 한국인의 일반적인 마늘 섭취 형태인 생마늘, 구운 마늘, 초절임 마늘에 상관없이 탁월한 것을 알 수 있었다. 이와 같은 마늘의 항 유전 독성효과는 식재료로써의 마늘의 소비 및 의약품 소재로써의 이용성을 증진시킬 수 있는 자료가 될 것으로 사료된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제37권1호
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• pp.17-23
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• 2009

PCR법을 이용하여 Thermus thermophilus HJ6 유래 DNA polymerase(Tod) 유전자를 클로닝하고 염기서열을 분석한 결과, ORF는 2,505개의 뉴클레오타이드로 구성되고 834개의 아미노산을 암호화하였다. 아마노산 서열을 바탕으로 상동성을 분석한 결과, Thermus thermophilus HB8 유래 DNA polymerase와 98%, Thermus aquaticus 유래 DNA polymorase와 86%의 identity를 나타내었다. 이 유전자를 박테리오파지 $\lambda$ 유래 온도감수성 프로모터(PR, PL)를 포함하는 pJLA503 벡터를 이용하여 대장균에서 발현하였다. 발현된 효소는 열처리, $HiTrap^{TM}$ Q column과 $HiPrep^{TM}$ Sephacryl S-200 HR 26/60 columun으로 정제하여 94 kDa의 단백질을 얻을 수 있었다. 정제된 효소의 DNA 중합 활성에 대한 최적온도는 $75{\sim}80^{\circ}C$이고 최적 pH가 9.0이었다. $Mg^{2+}$ and $Mn^{2+}$에 대한 최적 농도는 각각 2.5mM과 1mM이었고 효소활성은 2가 양이온의 존재 하에서는 활성화 되지만 1가양이온에서는 저 해되었다. Tod DNA 중합효소를 이용한 PCR 실험결과, Tod DNA 중합효소는 DNA 증폭 및 PCR 관련 기술에 응용 가능할 것으로 생각된다.

• 핵의학기술
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• 제23권1호
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• pp.35-39
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• 2019

[목적] B형 간염바이러스(hepatitis B virus, HBV)감염은 전세계적으로 중요한 공중 보건 문제이며 만성간염, 간 경변, 간암의 주요 원인으로 알려져 있으며, 이러한 질환의 진단 및 치료에 B형 간염바이러스의 혈청학적 검사는 필수적이다. 항 바이러스 치료중인 B형 간염 환자를 대상으로 면역방사계수 측정법(IRMA; Immunoradiometric assay)과 화학발광 미세입자 면역분석법(CMIA; Chemiluminescent Micropartical Immunoassay)을 이용하여 HBe-Ag 검사를 시행하였고, 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR; Realtime-Polymerase Chain Reaction)법을 이용하여 혈청 내 HBV DNA 검출율 을 비교 분석 하였다. [대상 및 방법] 항 바이러스 치료가 시행중인 B형 간염 환자 270명을 대상으로 HBeAg 혈청 검사와 HBV DNA 정량 검사를 실시하였다. HBeAg 혈청 검사는 검출 원리가 다른 두 가지 혈청학적 검사법(IRMA, CMIA)을 적용 하였고, 혈청 내 HBV DNA는 Abbott m2000 System을 사용하여 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR; Realtime-Polymerase Chain Reaction)법으로 정량 측정 하였다. [결과] HBeAg 검출율은 면역방사계수법(IRMA)의 경우 24.1% (65/205), 화학발광 미세입자 면역 분석법(CMIA)에서는 82.2% (222/48)의 결과를 보였다. 혈청학적 검사방법(IRMA, CMIA)에 따른 HBeAg 검사결과의 일치율은 33% (89/270)이다. 실시간 중합효소 연쇄반응(RT-PCR)을 이용한 혈청 내 HBV DNA의 검출율은 29.3% (79/191)를 보였고, 혈청 내 HBV-DNA 농도는 $16IU/mL{\times}1.0{\times}10^9IU/mL$ 이며 검출한계는 <15IU/mL 이다. 면역방사계수법(IRMA)으로 HBeAg 검출결과가 양성일때 55.4%, 그리고 음성일때 20.9%의 HBV DNA 검출율과 $1.1{\times}10^8IU/mL$, $5.7{\times}10^5IU/mL$의 혈청내 HBV DNA농도를 나타냈다. 이에 반해 화학발광 미세입자 면역 분석법(CMIA)의 경우 HBeAg 검출결과가 양성일때 HBV DNA 검출율은 28.4%, 음성일때 33.3%의 결과를 나타냈으며 혈청 내 HBV DNA농도는 $6.0{\times}10^7IU/mL$, $2.4{\times}10^5IU/mL$ 이었다. 면역방사계수법과 화학발광 미세입자 면역 분석법에서 동일하게 HBeAg 검출 결과가 양성인 경우 HBV DNA 검출율은 62.3%의 결과를 보였으며, 혈청 내 HBV DNA 농도는 $1.1{\times}10^8IU/mL$ 이다. [결론] 혈청학적 검사법에 따른 HeAg 검출율은 많은 차이를 보였다. 이러한 차이는 검사kit에 사용된 Ab의 특성과 epitope, HBV의 genotype등 여러 가지 원인으로 생각된다. 혈청학적 검사 결과로 분류 된 그룹별 HBV DNA의 검출율과 농도를 비교한 결과, Group II(IRMA 양성, CMIA 양성, N=53)에서 높은 검출율과 농도를 확인할 수 있었다.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2004년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea
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• pp.47-50
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• 2004

The defenses against free radical damage include specialized repair enzymes that correct oxidative damages in DNA, and detoxification systems such as superoxide dismutases. These defenses may be coordinated genetically as global responses. We hypothesized that the expression of the SOD and the DNA repair genes would inhibit DNA damage under oxidative stress. Therefore, the protection of E. coli mutants deficient in SOD and DNA repair genes $(sod^-\;xth^-\;and\;nfo^-)$ was demonstrated by transforming the mutant strain with a plasmid pYK9 which encoded Photobacterium leiognathi CuZnSOD and human AP endonuclease. The results show that survival rates were increased in $sod^+\;xth^-\;nfo^+$ cells compared to $sod^-\;xth^-\;ap^+,\;sod^-\;xth^-\;ap^-,\;and\;sod^+\;xth^-\;ap^-$ cells under oxidative stress generated from 0.1 mM Paraquat or 3 mM $H_2O_2$. The data suggested that, at least, SOD and DNA repair enzymes may have collaborate protection and repair of the damaged DNA. Additionally, both enzymes are required for protection against free radicals.

• 한국동물학회지
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• 제38권1호
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• pp.87-95
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• 1995

한국산 담수어류의 잉어목, 황어아과(Leuciscinae) 어류 2속 5종의 계통적 유연관계를 구명하기 위하여 mtDNA분석을 실시하였다 6 base를 인지하는 10개의 제한효소를 처리하여 얻어진 강tDNA의 크기는 16.5-17.5 Kb였으며 Bcl I, Bgl I, Bgl II, Hin dIII, Pvu II, Xba I 등은 종간 차이가 뚜렷하였다. 각종의 집단간 mtDNA분화정도는 매우 낮았으나(p=1% 미만) M. oxyephalus의 무주집단과 제주집단은 예리적으로 큰 차이를 보였다(p=5.3%) Moroco속의 종간 분화정도를 비교한 결과 M. oxycephafus와 M. lagowsk서 사이가 평균 f=7.2%로 근면관계가 제일 가까웠고 M. keumkang과 M. semotilus는 타종들과 근연관계가 제일 멀었다. Moroco속과 Phoxinus속간의 평균 유전적 분화정도는 f=13.7%로 현저한 차이를 보였다. Brown 등(1979)의 공식을 이용하여 이들 황어아과 2속 5종의 분화시기를 추정한 결과 이들은 후기 선신세(Pliocene)와 흥적세(Pleistocene) 사이에 분화된 것으로 추정되었으며 이 결과는 동위효소 연구에서 얻어진 결파(Yang and Min, 1989)와 잘 일치한다.

• Archives of Pharmacal Research
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• 제22권5호
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• pp.474-478
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• 1999

Modulation of unscheduled DNA synthesis by dehydroepiandrosterone (DHEA) after exposure to various chemical carcinogens was investigated in the primary rat hepatocytes. Unscheduled DNA synthesis was induced by treatment of such direct acting carcinogens as methly methanesulfonate (MMS) and ethyl methanesulfonate (EMS) or procarcinogens including benzo(a)pyrene (BaP) and 7, 12-dimethylbenz(a)anthracene (DMBA). Unscheduled DNA synthesis was determined by measuring [methyl-3H]thymidine radioactivity incorporated into nuclear DNA of hepatocytes treated with carcinogens in the presence or absence of DHEA. Hydroxyurea $(5{\times}10^{-3} M)$was added to growth medium to selectively suppress normal replication. DHEA at concentrations ranging from $(1{\times}10^{-6} M)$ to$(5{\times}10^{-4} M)$ did not significantly inhibit unscheduled DNA synthesis induced by either MMS $(1{\times}10^{-4} M)$ or EMS $(1{\times}10^{-2} M)$. In contrast, DHEA-significantly inhibited unscheduled DNA synthesis induced by BaP $(6.5{\times}10^{-5} M)$ and DMBA.$(2{\times}10^{-5} M)$. DHEA-induced hepatotoxicity in rats was examined using lactate dehydrogenase (LDH) release as an indicator of cytotoxicity. DHEA exhibit no significant increase in LDH release compared with the control at 18 h. These data suggest that nontoxic concentration of DHEA does not affect the DNA excision repair process, but it probably influence the enzymatic system responsible for the metabolic activation of procarcinogens and thereby decreases the amount of the effective DNA adducts formed by the ultimate reactive carcinogenic species.

• 한국수정란이식학회지
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• 제13권2호
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• pp.159-172
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• 1998

사람 성장호르몬 수용체(hGHR) cDNA는 PCR방법에 의하여 fagment로서 보고되어진 바 있으나, liver cDNA로 부터 전장을 cloning한 보고는 없는 실정으로 본 연구에서는 기능을 가진 약 4.6kbp의 cDNA hGHR을 cloning 하는데 성공하였다. 먼저 cloning하기 위하여 human liver mRNA와 human breast cancer tissue로부터 회수한 mRNA를 RT-PCR방법에 의하여 human cDNA library와 cloning에 필요한 probe를 제작하였다. human library mRNA는 GT-PCR방법에 의하여 증폭하여 증폭되어진 산물은 λZAP Vector를 이용하여 cDNA library를 구축하였고,screeing을 위하여 임 보고 되어진 hGHR fragment native sequence를 기초로 N-terminal부분의 primer를 설계하여 950bp의 probe를 얻는데 성공하였다. 이 probe를 이용하여 준비된 human liver cDNA library로부터 2.5$\times$10 6개의 plaque로부터 6개의 positive clone을 획득하였고, 이들중 poly Asignal인 "AATAAA"를 포함하고 있는 가장 긴 약 3.8kbp의 clone을 sequencing한 결과 open reading frame을 포함하고 있었으나, 5'부분의 결손되어 있었다. 그리하여 이 부분은 human breast cancer tissue로 부터 회수한 mRNA를 RT-PCR에 의하여 증폭하였고, sequencing결과 이미 보고되어진 native hGHR와 비교한 결과 하나의 nucleotide가 silent mutation으로 판명되었다.한편 human liver cDNA library로부터 cloning한 3.8cp의 positive clone의 5'end의 결손된 부분에 silent mutation된 PCR 산물을 연결함으로써 native hGHR와 유사한 cDNA hGHR subcloning에 성공하였다. 이러한 cDNA hGHR의 clone이 function을 가지고 있는지를 검토하기 위하여 eukaryotic 발현 vector인 pCXN2에 의거 ligation한 후 chinese hamster ovary cell[CHO-KI]에 transfect를 실시하였다. Dexamethasone은 첨가하지 않고 hGH만의 존재하에서 이들 cell을 배양시키고 cell menbrane에서 발현 여부를 판정키 위하여 hGHR monocloual antibody를 사용하여 flow cytometery해석을 실시하는 한편 125I-hGH binding assay에 의하여 hGH binding activity를 측정하였다. 최종적으로 GH signal transduction의 target genedf으로 알려져 있는 serine protease inhibitor 2.1(Spi 2.1) gene의 promotor activity를 검토한 결과 hGHR을 transfect한 CHO Cell에 있어서 hGH의 농도에 의존적으로 증가되었다. 따라서 본 실험에서 cloning한 cDNA hGHR는 native hGHR와 같은 기능을 가지는 것으로 판명되었다.것으로 판명되었다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제26권3호
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• pp.379-383
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• 2005

This research aims to develop DNA chip array without an indicator. We fabricated microelectrode array by photolithography technology. Several DNA probes were immobilized on an electrode. Then, indicator-free target DNA was hybridized by an electrical force and measured electrochemically. Cyclic-voltammograms (CVs) showed a difference between DNA probe and mismatched DNA in an anodic peak. Immobilization of probe DNA and hybridization of target DNA could be confirmed by fluorescent. This indicator-free DNA chip microarray resulted in the sequence-specific detection of the target DNA quantitatively ranging from $10^{-18}\;M\;to\;10^{-5}$ M in the buffer solution. This indicator-free DNA chip resulted in a sequence-specific detection of the target DNA.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제38권1호
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• pp.7-12
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• 1996

누에 RAPD-PCR 최적조건에 대해 실험한 결과, 중합효소 연쇄반응(PCR)의 최적조건은 반응액 25$\mu$l에 대해 주형 DNA 30ng, dNTP mixture 200$\mu$M, primer 300mM, Taq DNA Polymerase 1.0unit 및 Mg2+ 1.5mM로 판단되었으며, 또 상기의 실험조건을 기본으로 하여 annealing 온도를 탐색한 결과 35$^{\circ}C$-42$^{\circ}C$에서 DNA의 증폭이 안정적임이 밝혀졌다. 또한 동일한 품종내에서 개체간 및 암수간의 DNA 다형성은 인정되지 않았고, 품종간 DNA 다형성은 OPM 04 primer를 사용한 결과 5개의 RAPD 마커로 인정 되었다. 양친간 다형성이 인정된 primer를 사용하여 F2 33개체에 대해 DNA를 증폭시킨 결과 800 bp band가 3 :1 로 분리되었으므로 누에 품종간 유전적 유연관계 및 유전자 지도작성의 가능성을 제시했다.

• 미생물학회지
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• 제25권2호
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• pp.94-102
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• 1987

Rat liver LDH A-cDNA has been isolated from a .lambda.gt11-rat lover cDNA library and partially characterized. The size of the isolated rat liver LDH A-cDNA if shown to be 1.6Kb and restriction enzyme sites for the rat liver LDH A-cDNA are also mapped. 682-nucleotide sequence coding for 3'-end of rat liver LDH A-cDNA has been analyzed and compared to the nucleotide sequence of the same region of rat $C_6$-glioma cell LDH A-cDNA which has been cloned from the hormonally stimulated cell cultures. The result shows that 177 nucleotide sequences coding for the C-terminal 59-amino acids are identical but 505 nucleotide sequences of 3'-nontranslated region of the two LSH A-cDNA exhibit characteristic differences in thier nucleotide sequences. Computer analysis for the folding structures for 3'-end 400 nucleotide sequences of the two LDH A-cDNA shows a possibility implying that the two LDH A-mRNAs isolated from different tissues of rats may have different half life and therefore their translational efficiency may be different. It has been previously demonstrated that isoproterenol stimulated rat $C_6$ -glioma cell cultures produce LDH A-mRNA showing 2 to 3-fold longer half life in comparison to that of noninduced LHD A-mRNA. The result therefore support for the idea that hormonally stimulated rat $C_6$-glioma cells may produce LDH A-mRNA containing different nucleotide sequences at the 3'-end nontranslated region by which the hormonally induced LDH A-mRNA could have more stable secondary mRAN structure in comparison to that of noninduced LDH A-mRNA.