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Investigation of PCR-RFLPs within Major Histocompatibility Complex B-G Genes Using Two Restriction Enzymes in Eight Breeds of Chinese Indigenous Chickens

  • Xu, R.F.;Li, K.;Chen, G.H.;Qiang, B.Y.Z.;Mo, D.L.;Fan, B.;Li, C.C.;Yu, M.;Zhu, M.J.;Xiong, T.A.;Liu, Bang
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제18권7호
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    • pp.942-948
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    • 2005
  • New polymorphism of major histocompatibility complex B-G genes was investigated by amplification and digestion of a 401bp fragment including intron 1 and exon 2 using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) technique with two restriction enzymes of Msp I and Tas I in eight breeds of Chinese indigenous chickens and one exotic breed. In the fragment region of the gene, three novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) were detected at the two restriction sites. We found the transition of two nucleotides of A294G and T295C occurred at Tas I restriction site, and consequently led to a non-synonymous substitution of asparagine into serine at position 54 within the deduced amino acid sequence of immunoglobulin variable-region-like domain encoded by the exon 2 of B-G gene. It was observed at rare frequency that a single mutation of A294G occurring at the site, also caused an identical substitution of amino acid, asparagine 54-to-serine, to that we described previously. And the transversion of G319C at Msp I site led to a non-synonymous substitution, glutamine 62-to-histidine. The new alleles and allele frequencies identified by the PCR-RFLP method with the two enzymes were characterized, of which the allele A and B frequencies at Msp I and Tas I loci were given disequilibrium distribution either in the eight Chinese local breeds or in the exotic breed. By comparison, allele A at Msp I locus tended to be dominant, while, the allele B at Tas I locus tended to be dominant in all of the breeds analyzed. In Tibetan chickens, the preliminary association analysis revealed that no significant difference was observed between the different genotypes identified at the Msp I and Tas I loci and the laying performance traits, respectively.

Mauna Loa (Hawaii)에서 관측된 대기질 특성의 통계적 분석 (The Statistical Identification of Airmass Characteristics during the Manna Loa Observatory Photochemistry Experiment)

  • Lee, Gang-Woong;Barry J. Huebert
    • Journal of Korean Society for Atmospheric Environment
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    • 제10권E호
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    • pp.332-342
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    • 1994
  • 40가지 이상의 대기중 화학성분과 기상조건이 1988년 5월과 6월 사이의 MLOPEX기간 동안 동시 측정되었다. MLOPEX의 기본 목표는 인간의 직접적 오염을 받지 않는 청정 대류권(free tropo-sphere)에 위치한 Mauna Loa(Hawaii) 관측소에서 대기중 여러 화학 물질들의 배경 농도들을 파악하고 그들의 상관관계를 규명하며, 그 결과를 광화학적 모델에 적응하여 모델의 적합성과 보완점을 이해하는 것이었다. 예상과는 달리 청정 대류권내에서도 상당히 복잡하고 다양한 농도의 변화를 보여 모델에 적용시킬 배경농도를 단순히 평균값으로 결정 하기에는 어려움이 있었다. 이 연구에서는 cluster와 factor 분석의 통계적 방법을 이용하여 MLOPEX 기간동안 관측소에 나타난 기단(airmass)의 특성을 분류하고, 그 중 청정대기를 대표할 수 있는 농도를 결정하는 것이다. cluster 분석방법은 13가지 분석변수(variable)들을 크게 3가지의 그룹; (1)상대적으로 깨끗하고 오래된 공기를 대표하는 변수들 (2)인위적인 오염을 지시하는 변수들 (3)주위 해양과 화산의 영향을 나타내는 변수들로 분리하였다. 또 factor분석에 의해서는 (1)화산 영향 대기 (2)성층권 대기 (3)오염된 대기경계층 공기(boundary-lay-er air) (4)광화학적 연무(haze) (5)해양성 대기경계층 공기 (6)해양성 청정공기들로 분류되었다. 이 결과를 가지고 계산한 Mauna Loa 관측소의 청정공기 배경농도와 조건값들은 다음과 같다. : $O_3$(41$\pm$10ppbv), HN $O_3$(94 $\pm$ 45pptv), N $O_3$$^{-}$(16 $\pm$ 10pptv), S $O_4$= (60 $\pm$ 0pptv), N $H_4$$^{+}$ (71 $\pm$ 6pptv), $Na^{+}$(5 $\pm$ 1pptv), PAN(13 $\pm$9pptv), MeN $O_3$(methyl nitrate, 3.5 $\pm$ 1.5pptv), 2- butyl N $O_3$(0.6$\pm$0.1pptv), $H_2O$$_2$(1015$\pm$44pptv), $C_2$C $l_4$(3.3$\pm$0.1pptv), 응결핵(249$\pm$13$cm^{-3}$), 이슬점온도(-8.5 $\pm$ 5.3$^{\circ}C$).

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식도암의 방사선-항암화학 병용치료결과 (The Results of Combined External Radiotherapy and Chemotherapy in the Management of Esophageal Cancer)

  • 이현주;서현숙;김준희;김철수;김성록;김예회
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제14권1호
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    • pp.17-23
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    • 1996
  • 목적 : 외과적 절제가 불가능하거나 내과적인 문제로 수술을 받을 수 없는 식도암환자에서 방사선-항암화학 병용치료를 시행하였으며 이를 방사선 단독치료군의 치료결과와 후향적으로 비교 분석하였다. 대상 및 방법 : 1983년 10월부터 1994년 12월까지 인제대학교부속 백병원 치료방사선과에서 식도암으로 치료받은 환자 64명중 추적관찰이 가능하였던 55명을 대상으로하였다. 이중 방사선-항암화학 병용치료군은 30명(A군), 방사선 단독치료군은 25명(B군)이었다. 외부방사선치료는 4 MV 선형가속기를 이용하여 식도의 원발병소와 인접 림프절을 포함하는 조사야로 치료하였고, 조사선량은 2520-6480cGy(중앙값 5460cGy), 180-200cGy/fx으로 주었다. 항암화학요법은 방사선 치료전 또는 후에 총1-13회(중앙값 2회)가 시행되었고, 연령 및 성별분포는 두 군에서 유사하였고, 병리 조직학적 소견상 50명이 편평상피암이었다. 진단당시 병기별분포(1983년 AJCC)는 병기 I, II, III가 각각 A군 1, 5, 24명, B군 1, 8, 16명이었다. 종괴크기에 따라 5cm미만과 5cm이상이 각각 A군 5,25명, B군 3,22명이었다. 총 조사선량은 50Gy미만과 50Gy이상이 각각 A군 14, 16명, B군 11, 14명이었다. 두 군의 치료결과 비교 및 각군에서의 예후인자를 알아보기 위하여 병기, 종괴의 크기, 조사선량에 따라 1년 및 2년 생존율을 구하였다. 결과 : 총 추적관찰기간은 2-73개월(중앙값 7개월)이었다. 환자의 중앙생존기간은 A군 7.5개월(20일-29개월), B군 5개월(20일-73개월)이었으며 1, 2년 생존율(YSR)은 각각 A군 $26.7\%$, $8.9\%$, B군 $12.7\%$, $4.3\%$ (p>0.05)였다. 병기 III에서 1YSR은 A군 $24.9\%$ (2YSR $0\%$ B군 $13.7\%$ (2YSR $6.9\%$)였고, 종괴크기 5cm미만과 이상에서 1YSR은 A군 $60.0\%$, $17.4\%$ (2YSR $8.0\%$, $3.5\%$) B군 $0\%$, $14.5\%$ (2YSR $0\%$, $4.8\%$)였다. 조사선량 50Gy이상과 미만에 따라 1YSR이 $31.2\%$, $21.5\%$ (2YSR $6.2\%$, $7.2\%$) B군 $23.0\%$, $0\%$ (2YSR $7.7\%$, $0\%$)였다. 두 군의 1, 2YSR을 진행된 식도암의 경우에서 병기 III, 종괴크기 5cm이상, 조사선량 50Gy이상을 받은 환자를 대상으로 비교분석한 결과 통계학적으로 유의한 차이를 보이지 않았다. 방사선치료후 치료반응을 판정 할 수 있었던 28명에서 완전관해는 A군 4명, B군 1명이었고 전체관해율은 각각 $43.8\%$(7/16), $25.0\%$(3/12)로 나타났다. 치료실패양상을 분석할 수 있었던 35명중 국소실패는 A군과 B군에서 각 각 $52.4\%$(l1/21), $64.3\%$(9/14), 원격전이는 각각 $23.8\%$(5/21), $14.3\%$(2/14), 동시재발이 각 각 $23.8\%$(5/21), $21.4\%$(3/14)였다. 치료에 따른 급성부작용은 병응치료군이 단독치료군에 비해 백혈구감소증과 오심구토의 빈도가 증가하였으나 정도의 차이는 크지 않았다. 결론 : 진행된 병기의 식도암환자에서 방사선-항암화학병용치료를 시행함으로써 별다른 부작용 없이 생존기간 및 1년/2년 생존율을 향상시킬 수 있음을 관찰하였으나 통계학적으로 유의한 차이는 없었다. 방사선치료 단독군에서 총 방사선조사량만이 예후인자로써 확인되었다.

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르 꼬르뷔제의 형성기에 관한 연구 - 라쇼드퐁 시절, 1887-1917 - (A Study on the Formative Years of Le Corbusier -La Chaux-de-Fonds, 1887-1917-)

  • 류전희
    • 건축역사연구
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    • 제7권3호
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    • pp.151-170
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    • 1998
  • This study is about Le Corbusier's early years of loarning and training at La Chaux-de-Fonds. It is an attempt to show how Le Corbusier's groundwork was laid which characterize his work throughout the life. Charles Edouard Jeanneret was trained as a watch engraver and wished to be a painter. C. L'Eplattenier was to play a decisive role in shaping the young introspective boy's future. He encouraged Jeanneret's habit of the close study and observation of nature. Jeanneret was not the product of an established school, but instead made the unusual choice of educating himself. He found two indispensible sources of inspiration in study the past and in contemplating nature. His four years of self-education consisted of extensive reading, summer travels and winter layovers in larger cities-Vienna, Paris, Berlin-while sketching in museums or apprenticing local architects-Pellet, Behrens-. All these impressions then blended together to become part of a comprehensive source book of knowledge and imagination of the later Le Corbusier. A largely self-taught man, he never stopped making notes, drawing and writing, always aspiring to a clearer understanding of the meaning and underlying principles of objects and architecture. Jeanneret's five villas in La Chaux-de-Fonds are barometers which show the sequences of his development and change as an architect. In 1917, being thirty, he uprooted himself from his hometown to get a wider range of opportunities and moved to Paris. By that time Jeanneret was almost ready to blossom into Le Corbusier It was during this formative years of his life that Le Corbusier established the working method, mind-set and philosophical basis that determined the course of an architect in the making.

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하상재료에 따른 교각국부 세굴심의 시간적 변화에 관한 실험연구 (Temporal Effect of Pier Local Scour on Bed Material)

  • 강준구;여홍구;노영신;최종석
    • 한국수자원학회:학술대회논문집
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    • 한국수자원학회 2006년도 학술발표회 논문집
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    • pp.583-587
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    • 2006
  • 국부세굴의 발생은 일반적으로 흐름조건, 구조물 조건과 하상재료 세 가지의 주 원인으로 구분할 수 있다. 흐름조건의 경우 구조물 영향으로 발생되는 3차원적인 와류가 주요원인이며 하상재료의 경우 여러 요인이 있겠지만 비중이 같은 입자라 가정할 경우 입자의 크기를 주요 변수로 정할 수 있다. 교각 국부세굴에 관한 연구는 1960년대 이후 연구자들에 의해 매우 다양하게 수행되어 졌으며 많은 산정공식도 제시되었다. 하지만 기존 연구는 최대세굴심 조건으로 다양한 하상재료와 시간에 대한 세굴변동(홍수사상 등)에 대한 영향을 고려하는데 어려움이 있다. 특히 국내의 경우 다양한 하상재료와 홍수빈도를 고려할 때 이에 대한 세굴적용은 매우 중요한 인자라 할 수 있다. 따라서 교각세굴에 대한 궁극적인 목적은 다양한 하상재료와 홍수빈도를 고려할 수 있는 세굴평가를 제안하는데 있다. 이를 위해 본 연구에서는 우선적인 연구로 입자의 다양성과 이미지 기법을 이용한 실시간 측정을 통해 보완하여 입자에 따른 시간적 변화를 분석하였다. 현재 4가지의 하상재료의 입경차이에 따른 국부세굴의 시간적 변화와 초기세굴 발생의 수리적 조건을 파악하고 기존연구와 비교분석하였으며, 이를 기초자료로 세굴심$(S,\;S_{max})$, 교량주변 전단력$({\tau}_p,\;{\tau}_{pc})$, 접근수로부 전단력$({\tau}_a)$와 입자한계전단력$({\tau}_c)$에 대한 시간분석 (time effect)을 통해 다양한 하상재료와 홍수빈도를 해석을 위한 초기분석을 수행하는데 목적이 있다. 수리모형실험에 사용된 가변경사수로의 제원은 $0.6m(W){\times}20m(L){\times}2m(H)$이며 모형구조물은 투명한 아크릴로 제작하였다. 실험방법은 교각 내부에 CC카메라를 전 후면 및 상측면에 설치하여 세굴 발생을 실시간으로 촬영한 후 이미지 분석을 통해 분석하였다.

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유기성 폐기물의 발생 악취 제거를 위한 Delftia sp.의 성장조건 최적화 (Growth Optimization of Delftia sp. for the Odor Control of Organic Waste)

  • 권혁구;정준오;추덕성;이장훈
    • 한국환경보건학회지
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    • 제35권5호
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    • pp.393-401
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    • 2009
  • We isolated and identified a microorganism which was excellent for ammonia oxidation in the biological control of ammonia gas in odor producing materials from organic composting. The isolated strain was tested for growth characteristics and ammonia elimination efficiency under various conditions of temperature, pH, carbon concentration and ammonia concentration. The strain was isolated from a culture broth used in a $NO_2$ producing test with Griess-Ilosvay reagent. The results of 16S rRNA sequence from the isolated strain by using BLANST (Basic Local Alignment Search Tool) and confirming RDP (Ribosomal Database Project II) and ERRD (The European Ribosomal RNA Database) indicate that the strain is related to Delftia sp. UV-Spectrophotometer (Shimadzu, UVmini-1240) was used as a microbial growth test by measuring turbidity on OD660nm and ammonia concentration was measured by Spectrophotometer (HACH, DR-4000). The optimum growth culture conditions of the ammonia oxidizer Delftia sp. were $30^{\circ}C$, pH 7, glucose concentration 1.00% and $(NH_4)_2SO_4$ 0.5 g/l. Ammonia elimination efficiency was over 94% under the same conditions.

Breeding Prolific Garole with Malpura Sheep for In creased Reproductive Efficiency in Semi Arid Tropics of India

  • Sharma, R.C.;Arora, A.L.;Mishra, A.K.;Kumar, S.;Singh, V.K.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권6호
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    • pp.737-742
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    • 2004
  • Garole, a prolific small sized sheep breed of West Bengal, was introduced in the Mutton project of the Institute in 1997 to explore the possibility of incorporating fecundity gene(s) into monotocus Malpura sheep of Rajasthan. Results of reproduction and production traits in respect of Garole${\times}$Malpura (G${\times}$M) half-breds have been obtained. Of 35 lambing obtained so far from the ewes of Garole${\times}$Malpura, 45.71% were twin lambing, whereas, Malpura sheep produced mostly single lamb except 2.55% twin lambing on an average. Other reproduction traits in G${\times}$M ewes such as lambing rate, litter size at birth and weaning were considerably improved over Malpura ewes. Results revealed that the fecundity genes responsible for increasing ovulation rate and litter size have been incorporated in to the G${\times}$M genotype and it might prove a valuable germ plasm towards evolving a new prolific strain of sheep. Interestingly, survivability of G${\times}$M half-breds was almost at par with the local Malpura sheep in harsh climatic conditions of semi-arid tropics. The body weights at different ages of G${\times}$M half-breds were on little lower side compared to contemporary Malpura lambs. Average kilogram of lambs weaned/ewe lambed in Malpura and G${\times}$M genetic group was 11.86 and 11.07 kg respectively. In view of minimizing the differences in body weights and kg of lambs weaned/ewe lambed between the two genetic groups, G${\times}$M ewes has to be backcrossed with Malpura rams to raise the inheritance of latter up to 75% level. However, further research is needed to reach on certain conclusions regarding net returns from such crosses.

Resveratrol attenuates 4-hydroxy-2-hexenal-induced oxidative stress in mouse cortical collecting duct cells

  • Bae, Eun Hui;Joo, Soo Yeon;Ma, Seong Kwon;Lee, JongUn;Kim, Soo Wan
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제20권3호
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    • pp.229-236
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    • 2016
  • Resveratrol (RSV) may provide numerous protective effects against chronic inflammatory diseases. Due to local hypoxia and hypertonicity, the renal medulla is subject to extreme oxidative stress, and aldehyde products formed during lipid peroxidation, such as 4-hydroxy-2-hexenal (HHE), might be responsible for tubular injury. This study aimed at investigating the effects of RSV on renal and its signaling mechanisms. While HHE treatment resulted in decreased expression of Sirt1, AQP2, and nuclear factor erythroid 2-related factor 2 (Nrf2), mouse cortical collecting duct cells (M1) cells treated with HHE exhibited increased activation of p38 MAPK, extracellular signal regulated kinase (ERK), c-Jun N-terminal kinase (JNK), and increased expression of NOX4, $p47^{phox}$, Kelch ECH associating protein 1 (Keap1) and COX2. HHE treatment also induced $NF-{\kappa}B$ activation by promoting $I{\kappa}B-{\alpha}$ degradation. Meanwhile, the observed increases in nuclear $NF-{\kappa}B$, NOX4, $p47^{phox}$, and COX2 expression were attenuated by treatment with Bay 117082, N-acetyl-l-cysteine (NAC), or RSV. Our findings indicate that RSV inhibits the expression of inflammatory proteins and the production of reactive oxygen species in M1 cells by inhibiting $NF-{\kappa}B$ activation.

무역수출 라이브지수를 활용한 중소수출기업 발굴 연구 (A Study on Detection of Small Export Companies Utilizing Trade Exports Live Index)

  • 김희천;임춘성;성주원
    • 한국빅데이터학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.115-126
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    • 2019
  • 무역수출 분야에서 수출 지수에 관한 논의는 수차례 있었으나 객관적 지표로 설명할 수 있는 명확한 무역수출 지수는 없다. 한국무역협회(KITA), 대한무역투자진흥공사(KOTRA) 등에서 지표를 만들고자 하는 시도를 하고 있으나 수출기업의 역량을 표현할 수 있는 방법에 대하여 현재 계속 고민 중이다. 이에 본 연구는 기업의 규모, 신용도와 같은 공시지표와 거래고객수, 거래횟수, 상품개수, 거래량, 거래기간 등의 활동지표를 feature로 설정하여 인공지능 학습 데이터 셋을 구축하고, 딥러닝 알고리즘에서 Lightgbm을 이용하여 수출 가능 기업에 대한 분류 모델을 제시한다. 또한 기업이 속한 산업 군집 분류 모델로 Graph Neural Network을 사용하여 기업간, 품목간, 사업군에서의 수출 가능 역량을 표현하는 수출 Live지수를 산출하였으며 이는 지수를 산출하는 현재로부터 기업의 과거 활동을 포함함으로써 객관성을 확보하였다.

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Association between PCR-RFLP of Melatonin Receptor 1a Gene and High Prolificacy in Small Tail Han Sheep

  • Chu, M.X.;Ji, C.L.;Chen, G.H.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제16권12호
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    • pp.1701-1704
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    • 2003
  • Melatonin regulates circadian rhythms and reproduction changes in seasonally reproductive mammals through binding to high-affinity, G-protein-coupled receptors. Small Tail Han sheep that has significant characteristics of high prolificacy and nonseasonal ovulatory activity is an excellent local sheep breed in P. R. China. The exon 2 of the ovine melatonin receptor 1a (MTNR1A) gene was amplified and a uniform fragment of 824 bp was obtained in 150 ewes of Small Tail Han sheep. The 824 bp PCR product was digested with restriction endonucleases Mnl I and Rsa I, and genetic polymorphism was detected by PCR-RFLP. Polymorphic Mnl I site was detected at base position 605 of the exon 2 of the MTNR1A gene. There were two kinds of genotypes in Small Tail Han sheep, AB (303 bp, 236 bp/67 bp) and BB (236 bp/67 bp, 236 bp/67 bp). The results indicated that genotype AA (303 bp, 303 bp) at Mnl I-RFLP site did not exist in non-seasonal estrous Small Tail Han sheep, which suggested that there was an association between genotype AA (303 bp, 303 bp) and reproductive seasonality in sheep. Polymorphic Rsa I site was detected at base position 604 of the exon 2 of the MTNR1A gene. Three kinds of genotypes were found in Small Tail Han sheep, AA (290 bp, 290 bp), AB (290 bp, 267 bp/23 bp) and BB (267 bp/23 bp, 267 bp/23 bp). Least squares means of litter size in the first parity and the second parity for genotype AA (290 bp, 290 bp) at Rsa I-RFLP site were 0.43 and 1.06 more than those for genotype AB (290 bp, 267 bp/23 bp) in Small Tail Han sheep.