• 제목/요약/키워드: light translation system

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Effects of Minor Arginyl tRNA and Isoleucyl tRNA on the Expression of Clostridium botulinum Neurotoxin Light Chain in Escherichia coli

  • Kim, Jin-Sook;Seong, Hye-Young;Kim, Mi-Wha;Ku, Jong-Seo;Choi, Soon-Yong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권2호
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    • pp.287-291
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    • 2003
  • Botulinum neurotoxin type A (BONT/A) is an extremely potent toxin, which is produced by Clostridium botulinum. The light chain of this protein (BONT/A LC), which is known as a zinc endopeptidase, cleaves SNAP-25 involved in the exocytosis process. In this work, the expression of recombinant BoNT/A LC in E. coli is described. The BONT/A LC gene of C. botulinum contains a high frequency of the arginine AGA and isoleucine ATA codons that are rarely used in genes of E. coli, hampering the translation of recombinant protein. The argD and ilex tRNA genes were cloned into pACYC184 vector, resulting in pAAD131X plasmid. The translational stress of the toxin gene related to codon bias was reversed by fupplernentation of the AGA arginyl tRNA of T4 phage and AUA isoleucyl tRNA of E. coli. This system may be applicable for the expression of a variety of AT-rich heterologous genes in E. coli.

광섬유 EFPI 센서를 이용한 실시간 고정밀 변위 측정 (Real-time Measurement of Precision Displacement using Fiber Optic EFPI Sensor)

  • 박상욱;김대현;김천곤;홍창선
    • 한국복합재료학회:학술대회논문집
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    • 한국복합재료학회 2003년도 추계학술발표대회 논문집
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    • pp.154-157
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    • 2003
  • Precision displacement of less than a few nm resolution was measured in real-time using fiber optic EFPI sensor. The novel method for real-time processing of analyzing EFPI output signal was developed and verified. Linearity in the mean values of interferometric light intensity among adjacent fringes was shown, and the sinusoidal approximation algorithm that estimates past and coming fringe values was verified through the linearity. Real-time signal processing program was developed, and the intensity signal of the EFPI sensor was transformed to the phase shift with this program. The resolution below 0.4 ~ 10 nm in the displacement range of $0 ~ 300\mu\textrm{m}$ was obtained by reducing the photodetector noise using low-pass filter and signal averaging. The nano-translation stage with a Piezo-electric actuator and the EFPI sensor system was designed and tested. This stage successfully reached to the desired destination in $15\mu\textrm{m}$ range within 1 nm accuracy.

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Comparative Analysis of Completely Sequenced Insect Mitochondrial Genomes

  • Lee, Jin-Sung;Kim, Ki-Hwan;Suh, Dong-Sang;Park, Jae-Heung;Suh, Ji-Yoeun;Chung, Kyu-Hoi;Hwang, Jae-Sam
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제2권1호
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    • pp.1-6
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    • 2001
  • This paper reports a few characteristics of seven insect mitochondrial genomes sequenced completely (Bombyx mori, Drosophila melanogaster, D. yakuba, Apis mellifera, Anopheles gambiae, A. quadrimaculatus, and Locusta migratoria). Comparative analysis of complete mt genome sequences from several species revealed a number of interesting features (base composition, gene content, A+T-rich region, and gene arrangement, etc) of insect mitochondrial genome. The properties revealed by our work shed new light on the organization and evolution of the insect mitochondrial genome and more importantly open up the way to clearly aimed experimental studies for understanding critical roles of the regulatory mechanisms (transcription and translation) in mitochondrial gene expression.

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회전 불변 제르니케 모멘트를 이용한 실시간 지하철 기호 객체 검출 (Real-time Sign Object Detection in Subway station using Rotation-invariant Zernike Moment)

  • 원선희;김계영;최형일
    • 디지털콘텐츠학회 논문지
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    • 제12권3호
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    • pp.279-289
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    • 2011
  • 시각 장애인을 위한 실시간 보행보조 시스템의 안전한 보행안내와 편리한 서비스를 제공하기 위해 최신 하드웨어 기술과 소프트웨어 기술이 결합되고 있다. 이 시스템은 보행자가 원하는 목적지까지 보행할 수 있도록 장애물 검출 및 인지와 장소인식, 기호인식으로 구성된다. 본 논문에서는 보행보조 시스템의 중요한 요소 중 하나인 기호인식을 위해 지하철 역 내부에서의 기호 객체 검출 시스템을 개발하였다. 본 논문은 조명과 잡음이 존재하는 복잡한 환경으로부터 기호 객체 영역을 강건하게 검출할 수 있는 적응적인 특징맵을 제안하였다. 그리고 보행 시 객체의 이동, 회전 및 크기에 불변하도록 고속 제르니케 모멘트 특징을 이용하여 기호를 인식한다. 화살표, 화장실, 출구번호 3개의 기호를 대상으로 하며, 에이다부스트 분류기를 이용하여 기호를 학습 및 인식한다. 실험결과에서는 5000장의 기호영상 데이터 베이스의 3개의 기호에 대해 평균 87.16%의 검출율과 20 frame/sec의 처리속도를 통해 안정적이며 실시간 시스템에 적합함을 입증한다.

『온병조변』의 병리학적 고찰 (The Pathologic study on 『Wenbingtiaobian』)

  • 박미선;김영목
    • 동의생리병리학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.8-19
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    • 2017
  • This study on "Wenbingtiaobian" covers identifying pattern of prescription, understanding system of multiple syndrome differentiations, characteristics of treatment and medicinal substances. The source books are "Korean translation of Wenbingtiaobian", "Modern Shanghanlun", "Jinkuiyaolueyishi", "Chinese Medicine Formulas". "Wenbingtiaobian" has system of multiple patterns including three energizer syndrome differentiation, classification of disease, six meridian syndrome differentiation and wei-qi-ying-xue syndrome differentiation. That describes cause, location, nature, power and transmutation of disease. Wei-qi-ying-xue pattern is meaningful to warm-heat disease and three energizer pattern is relevant to dampness-heat disease. The warm disease shows mostly yang brightness bowel syndrome and patterns of three yin viscera. In aspect of the heat disease, qi aspect pattern makes up the largest number of syndrome differentiation and have sometimes with bowel excess or fluid deficiency. And treatment for wei aspect pattern is primarily 'outthrust the pathogen with pungent-cool'. Deficiency cold pattern and cold pattern with dampness occupy most of cold patterns. And many dampness patterns are dampness-heat pattern in middle energizer and 'inhibited lung qi transforming' is major mechanism. Patterns with fluid deficiency in qi aspect syndrome appear mostly in upper or middle energizer and in xue aspect syndrome appear mostly in lower energizer and they form 20% of all syndrome differentiations. The treatment of clearing heat uses pungent-cool(cold) for upper energizer, sweet-cold for middle energizer, sweet(salty)-cold for lower energizer. The treatment of tonifying yin uses mostly salty-cold for middle or lower energizer. The treatment of outthrusting pathogen is applied to all the wei-qi-ying-xue aspect combined with other treatments by using pungent-cool(cold) and light herbs. Understanding diseases in the respect of syndrome differentiation can enhance understanding of modern diseases from a perspective of Korean Traditional Medicinal(KTM) and can make clinical application of KTM treatments easy. Data from this study are expected to be basic for standardization and systemization of KTM.

플래쉬 메모리 시스템을 위한 인덱스 블록 매핑 (Index block mapping for flash memory system)

  • 이정훈
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제15권8호
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    • pp.23-30
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    • 2010
  • 플래시 메모리는 비휘발성이며 시스템에 전원이 없는 상태에서도 데이터를 유지할 수 있는 특성을 가지는 메모리이다. 게다가 빠른 접근 시간과 저전력 소비, 충격에 강하고, 작은 크기와 매우 가벼운 특성을 가진다. 가격이 점차 낮아 지고 용량이 증가함에 따라 플래시 메모리의 활용도는 가전제품, 내장형 시스템, 그리고 이동 단말기 등에 널리 사용되고 있는 추세이다. 이러한 플래시 메모리를 구동함에 있어서 필수적인 소프트웨어인 FLT이 필요하다. 본 연구에서는 기존의 블록 매핑 알고리즘의 가장 큰 단점을 극복하기 위한 새로운 FTL 알고리즘을 제안한다. 핵심적인 사항은 기존의 블록 매핑 테이블에 추가하여 작은 램 메모리를 이용하여 섹터 위치를 바로 알 수 있는 인텍스 블록 매핑 테이블을 제안하고자 한다. 시뮬레이션 결과에 따르면 제안된 FTL은기존의 하이브리드 매핑과 비교했을 때 수행 시간을 평균45%정도 줄이는 효과를 얻을 수 있었으며, 메모리 사상 요구량에 대해서 약 12% 줄이는 효과를 얻을 수 있었다.

누에 후부실샘 특이 발현 유전자 클로닝 (Cloning of the posterior silk glands specific-expressed gene of silkworm)

  • 박옥란;김성렬;김성완;강석우;구태원;최광호
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제53권1호
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    • pp.44-49
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    • 2015
  • 본 연구는 누에 후부실샘에서 특이적으로 발현하는 새로운 전사체를 탐색하고 이의 프로모터 영역을 분석함으로서 향후 형질전환누에 제작용 전이벡터 시스템의 효율성 제고를 위해 활용하고자 하였다. 우선 새로운 후부실샘 특이 발현 전사체 선발을 위해 ACP-based dd-PCR 방법으로 후부실샘에서 특이적으로 발현하는 34개 PCR 증폭 산물이 선발되었는데, 이 중 지금까지 보고된 바 없는 새로운 전사체인 ACP-16(366 bp)이 선발되었다. Northern blotting hybridization 분석 결과, ACP-16은 후부실샘에서 특이적으로 발현되는 것이 확인되었으며 전사체 발현량에서는 fibroin light chain 보다는 적었으며 전사체 크기에서는 fibroin light chain 보다는 다소 큰 것으로 확인되었다. ACP-16 유전자 프로모터 영역을 클로닝 하기 위해 게놈 유전자은행으로부터 ACP-16 (366 bp)를 탐침으로 전체 17.4 kb 크기의 파이지 클론을 선발할 수 있었으며, 전사체 상류에 유전자 발현조절에 필요한 TATA box와 Cap box 구조를 확인할 수 있었다. 본 연구에서 확보된 ACP-16 유전자의 프로모터 영역은 이후 코어 프로모터 개발 연구를 통하여 효과적인 누에 형질전환 시스템 구축에 적용할 수 있을 것으로 기대된다.

신선 동결 아킬레스 동종건을 이용한 전방 십자 인대 재건술 - 임상적 결과, 2차 관절경 및 조직학적 소견 - (Arthroscopic Anterior Cruciate Ligament Reconstruction using Fresh Frozen Achilles Allograft - Clinical results, 2nd look Arthroscopic and Histologic findings -)

  • 전철홍;하대호;최민규;유선수
    • 대한관절경학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.7-12
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    • 2001
  • 목적 : 신선 동결 아킬레스 동종건을 이용한 전방 십자 인대 재건술 후 1년 추시상 임상적 결과와 2차 관절경 및 조직학적 소견을 조사하여 동종건의 유용성을 살펴보았다. 대상 및 방법 : 추시 가능한 58면 59예를 대상으로 주. 객관적 지표 Telos stress arthrometer, modified Feagin Scoring System을 이용 분석하였다. 평균 연령 및 추시 기간은 25세($18\~49$세), 15개월($12\~19$개월)이었다. 이중 16명을 대상으로 2차 관절경 소견을 확인하고 광학현미경 및 전자 현미경을 이용하여 조직 검사를 하였다. 결과 : Lysholm Score는 술 전 60점에서 88.2점, 전방 전위는 술 전 7.1mm에서 술 후 2.3mm로 향상되었다. 2차 관절경적 육안적 소견은 정상 인대와 비슷한 두께와 긴장상태를 보였으며 골성 조직과의 연결부에서 혈관 재형성을 보이고 있었다. 조직학적 소견은 광학 현미경 소견상 정상 인대와 비슷한 세포 밀집도를 보였으며, 전자 현미경 소견상 콜라겐 섬유는 종적으로 평행한 배열을 보이고 횡 단면상 정상 조직과 유사한 단일 형태의 직경을 보였다. 결론 : 신선 동결 동종 아킬레스건은 임상적 결과와 조직학적 소견들로 보아 자가건의 대치건으로서 사용이 충분할 것으로 사료된다.

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$GafChromic^{(R)}$ EBT2 Film Dosimetry를 위한 품질 관리용 초기 프로그램 개발 (Development of Preliminary Quality Assurance Software for $GafChromic^{(R)}$ EBT2 Film Dosimetry)

  • 박지연;이정우;최경식;홍세미;박병문;배용기;정원균;서태석
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제21권1호
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    • pp.113-119
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    • 2010
  • GafChromic EBT2 필름 dosimetry에 필요한 품질 관리용 소프트웨어를 개발하였다. 개발한 프로그램에서는 EBT2 필름특성에 맞게 붉은색, 초록색, 파란색 및 회색 채널에 따른 필름 교정이 가능하도록 하였다. 또한 평판형 스캐너의 빛의 산란 효과나 필름 내 방사선에 반응하는 물질(active layer)의 두께 차이가 선량 검증에 미치는 영향을 평가할 수 있도록 하였다. EBT2 필름을 이용한 측정 결과는 방사선 치료계획 시스템, ECLIPSE 또는 2차원 이온 전리함 배열의 선량 값과 비교할 수 있다. 개발한 소프트웨어를 이용한 GafChromic EBT2 필름의 선량 검증은 파일 입력, 잡음 제거, 배경 보정(background) 및 반응 물질 보정(active layer correction), 선량 계산 및 평가 단계를 통해서 이루어진다. 절대적 또는 상대적 배경 보정 방법을 선택적으로 적용할 수 있으며 필름 교정 결과 및 교정 곡선에 대한 적합식(fitting equation)은 결과 파일로 출력할 수 있다. 선량 행렬의 화소 크기 조정을 위한 보간법, 대화식 영상 이동 및 회전 기능을 이용하여 선량 행렬 간 구조적 위치를 일치시킨 후, 빔 측면도(beam profile) 및 등선량곡선(isodose curve)을 비교할 수 있다. 또한 거리 및 선량 차이에 대한 허용값을 적용하여 gamma index 및 gamma histogram을 이용한 선량 분석이 가능하다. 60도 동적 쐐기 조사면과 전립선 세기조절방사선치료의 조사면을 이용하여 개발한 소프트웨어의 기초 성능 평가를 수행하였을 때, 동적 쐐기 조사면에서 ECLIPSE와 EBT2 필름 간 절대적 빔 측면도는 3% 오차 범위 내에서 일치하였다. EBT2 필름을 이용한 두 종류의 선량 검증 모두, 99% 이상의 영역이 3 mm, 3%의 gamma index의 평가 기준을 만족하였다. 개발한 선량 검증용 소프트웨어를 이용하여 주기적으로 수행되는 일반적인 품질관리뿐만 아니라 빔의 세기가 조절된 복잡한 조사면의 품질관리에도 활용할 수 있으며, Radiochromic 필름을 이용한 선량 평가에 필요한 유용한 분석 툴을 제공할 수 있다.