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Occurrence and Multiplex PCR Detection of Citrus Yellow Vein Clearing Virus in Korea

  • Taemin Jin;Ji-Kwang Kim;Hee-Seong Byun;Hong-Soo Choi;Byeongjin Cha;Hae-Ryun Kwak;Mikyeong Kim
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제40권2호
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    • pp.125-138
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    • 2024
  • Citrus yellow vein clearing virus (CYVCV) is a member of the Alphaflexiviridae family that causes yellow vein clearing symptoms on citrus leaves. A total of 118 leaf samples from nine regions of six provinces in Korea were collected from various citrus species in 2020 and 2021. Viral diagnosis using next-generation sequencing and reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) identified four viruses: citrus tristeza virus, citrus leaf blotch virus, citrus vein enation virus, and CYVCV. A CYVCV incidence of 9.3% was observed in six host plants, including calamansi, kumquat, Persian lime, and Eureka lemon. Among the citrus infected by CYVCV, only three samples showed a single infection; the other showed a mixed infection with other viruses. Eureka lemon and Persian lime exhibited yellow vein clearing, leaf distortion, and water-soak symptom underside of the leaves, while the other hosts showed only yellowing symptoms on the leaves. The complete genome sequences were obtained from five CYVCV isolates. Comparison of the isolates reported from the different geographical regions and hosts revealed the high sequence identity (95.2% to 98.8%). Phylogenetic analysis indicated that all the five isolates from Korea were clustered into same clade but were not distinctly apart from isolates from China, Pakistan, India, and Türkiye. To develop an efficient diagnosis system for the four viruses, a simultaneous detection method was constructed using multiplex RT-PCR. Sensitivity evaluation, simplex RT-PCR, and stability testing were conducted to verify the multiplex RT-PCR system developed in this study. This information will be useful for developing effective disease management strategies for citrus growers in Korea.

국내유통농산물 중 잔류농약 모니터링 및 안전성 평가 (Monitoring of Pesticide Residues and Risk Assessment of Agricultural Products Consumed in South Korea)

  • 김성훈;최원조;백용규;김우성
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제37권11호
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    • pp.1515-1522
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    • 2008
  • 본 연구는 물리.화학적인 특성이 서로 다른 37종의 농약 성분을 GC/MS/MS로 농약 성분별 MRM에 대한 동시다성분 분석법을 개발하였으며, 이 분석법에서 제시한 MRM을 이용하여 농산물 중 잔류하고 있는 농약성분의 정성 및 정량이 동시에 가능하게 하였고, 이 분석법은 기존의 장비(GC, HPLC, GC/MS 등)를 이용한 검사법에 비해 1건 처리 시 소요되는 분석시간이 짧으며(1건 분석 시 소요시간 30분 이내) 검사결과의 정확성에서 우수하였다. 잔류농약분석에 일반적으로 사용되는 GC-ECD 및 GC-NPD를 사용하지 않고 정성 및 정량이 동시에 가능한 GC-MS/MS를 사용하여 MRM mode를 이용한 농약성분의 동시 분석 및 분석법에 따른 validation을 실시하였다. 그 결과 real sample인 콩과 레몬의 경우 모든 농약에서 70% 이상의 회수율을 보였으며, correlation coefficient($r^2$)도 대부분의 농약에서 0.99 이상의 좋은 직선성을 나타내었다. 또한 분석법을 근거로 국내유통 중인 농산물의 잔류실태를 파악하기 위해 모니터링을 실시하였으며 검출된 농약성분에 한해서는 섭취하는 농약에 대한 위해도를 평가하였다. 국내의 대형시장에 유통되는 농산물 약 1,000여건을 수거하여 확립된 분석법으로 잔류농약 모니터링을 실시하였다. 그 결과 23개의 농산물에서 잔류농약이 검출되었는데 주로 엽채류에서 잔류농약이 검출되었고 금귤류에서 주로 검출된 과실류는 2.2%의 검출율을 보였다. 이 중 MRL을 초과하는 수준의 농약이 검출된 것은 엽채류 중 하나인 무 잎에서 검출되어 0.1%의 부적합율을 나타냈다. 검출된 농약과 그 검출량을 토대로 농약의 1일 섭취허용량(acceptable daily intake, ADI)을 바탕으로 음식을 통해 매일 섭취하는 농약이 사람에게 미치는 위해도를 평가한 결과 ADI 대비 $0.0000{\sim}0.3462%$의 현저히 낮은 수준으로 나타났다.

과일류의 명칭 및 분류: 국내와 코덱스 비교 (Classification and Nomenclature of Fruit Commodities in South Korea and Codex Alimentarius Commission)

  • 이미경
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제33권3호
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    • pp.162-167
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    • 2018
  • 본 연구는 과일류의 국내 명칭에 상응하는 코덱스 명칭과 코드번호, 그리고 변경 또는 검토가 요구되는 국내 명칭과 분류를 파악하기 위해 수행되었다. 국내 명칭과 분류에 대해서는 식품공전과 식품의 농약 잔류허용기준 발간물을 그리고 코덱스에 대해서는 'Codex Classification of Foods and Animal Feeds'를 검토하였다. 연구 결과는 다음과 같았다. 첫째 구기자, 무화과, 석류, 오미자에 대한 분류가 국내와 코덱스가 다르므로 이에 대한 검토가 필요한 것으로 나타났다. 둘째 감, 감귤, 구기자, 금귤, 나무딸기, 대추, 대추야자, 리치, 매실, 머루, 모과, 복분자, 산딸기, 산수유, 앵두, 오미자, 유자, 으름, 자두, 코코넛, 키위, 탱자의 경우 국문 또는 영명을 국내에서 조차 달리 사용하고 있거나 코덱스와 차이가 있으므로 이들 식품 명칭에 대한 개정이나 검토가 필요한 것으로 나타났다. 셋째 복숭아의 경우 천도복숭아를 포함하는 지가 명확하지 않고 라즈베리와 나무딸기 둘 모두가 국내 영명이 Raspberry 이므로 이들 식품 명칭에 대한 면밀한 검토가 필요한 것으로 판단된다.