• Title/Summary/Keyword: journal profiling

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Comparison of Traditional and Commercial Vinegars Based on Metabolite Profiling and Antioxidant Activity

  • Jang, Yu Kyung;Lee, Mee Youn;Kim, Hyang Yeon;Lee, Sarah;Yeo, Soo Hwan;Baek, Seong Yeol;Lee, Choong Hwan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권2호
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    • pp.217-226
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    • 2015
  • Metabolite profiles of seven commercial vinegars and two traditional vinegars were performed by gas chromatography time-of-flight mass spectrometry with multivariate statistical analysis. During alcohol fermentation, yeast, nuruk, and koji were used as sugars for nutrients and as fermentation substrates. Commercial and traditional vinegars were significantly separated in the principal component analysis and orthogonal partial least square discriminant analysis. Six sugars and sugar alcohols, three organic acids, and two other components were selected as different metabolites. Target analysis by ultra-performance liquid chromatography quadruple-time-of-flight mass spectrometry and liquid chromatography-ion trap-mass spectrometry/mass spectrometry were used to detect several metabolites having antioxidant activity, such as cyanidin-3-xylosylrutinoside, cyanidin-3-rutinoside, and quercetin, which were mainly detected in Rural Korean Black raspberry vinegar (RKB). These metabolites contributed to the highest antioxidant activity measured in RKB among the nine vinegars. This study revealed that MS-based metabolite profiling was useful in helping to understand the metabolite differences between commercial and traditional vinegars and to evaluate the association between active compounds of vinegar and antioxidant activity.

액화석유가스(LPG) 지하저장기지에서의 TSP(Tunnel Seismic Prediction)탐사

  • 차성수
    • 지구물리
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    • 제5권2호
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    • pp.75-86
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    • 2002
  • 평택 및 인천의 액화석유가스(LPG) 지하저장기지에 대해 VSP(Vertical Seismic Profiling)탐사를 터널에 응용한 TSP(Tunnel Seismic Prediction)탐사를 시공 중에 실시하였다. 평택 LPG 지하저장기지에서의 TSP탐사는 저장동굴이 위치한 남양호 하부에 존재하고 사전조사단계에서 파악된 단층의 방향과 규모를 확인하기 위하여 실시하였다. 단층의 위치 및 규모를 입체적으로 파악하기 위하여 진입터널, 수벽공터널 및 공사용터널에서 TSP탐사를 수행하였으며, 진입터널에서 천공된 4공의 조사 공과 비교되었다. TSP탐사 결과는 조사공 결과와 일치하였고, 파악된 단층대의 위치에 따라 기존에 설계된 저장동굴의 배치와 연장을 변경하였다. 해저에 건설된 인천 LPG 지하저장기지의 경우 시공 중에 많은 출수가 있어 효과적인 지수를 위해 지질구조에 대한 정확한 파악이 요구되었다. TSP탐사에 의한 파쇄대 분포의 파악으로 적절한 지보 및 그라우팅 대책이 이루어졌다.

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Microbial Community Profiling in cis- and trans-Dichloroethene Enrichment Systems Using Denaturing Gradient Gel Electrophoresis

  • Olaniran, Ademola O.;Stafford, William H.L.;Cowan, Don A.;Pillay, Dorsamy;Pillay, Balakrishna
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권4호
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    • pp.560-570
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    • 2007
  • The effective and accurate assessment of the total microbial community diversity is one of the primary challenges in modem microbial ecology, especially for the detection and characterization of unculturable populations and populations with a low abundance. Accordingly, this study was undertaken to investigate the diversity of the microbial community during the biodegradation of cis- and trans-dichloroethenes in soil and wastewater enrichment cultures. Community profiling using PCR targeting the l6S rRNA gene and denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) revealed an alteration in the bacterial community profiles with time. Exposure to cis- and trans-dichloroethenes led to the disappearance of certain genospecies that were initially observed in the untreated samples. A cluster analysis of the bacterial DGGE community profiles at various sampling times during the degradation process indicated that the community profile became stable after day 10 of the enrichment. DNA sequencing and phylogenetic analysis of selected DGGE bands revealed that the genera Acinetobacter, Pseudomonas, Bacillus, Comamonas, and Arthrobacter, plus several other important uncultured bacterial phylotypes, dominated the enrichment cultures. Thus, the identified dominant phylotypes may play an important role in the degradation of cis- and trans-dichloroethenes.

Metabolic Changes of Phomopsis longicolla Fermentation and Its Effect on Antimicrobial Activity Against Xanthomonas oryzae

  • Choi, Jung Nam;Kim, Jiyoung;Ponnusamy, Kannan;Lim, Chaesung;Kim, Jeong Gu;Muthaiya, Maria John;Lee, Choong Hwan
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권2호
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    • pp.177-183
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    • 2013
  • Bacterial blight, an important and potentially destructive bacterial disease in rice caused by Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo), has recently developed resistance to the available antibiotics. In this study, mass spectrometry (MS)-based metabolite profiling and multivariate analysis were employed to investigate the correlation between timedependent metabolite changes and antimicrobial activities against Xoo over the course of Phomopsis longicolla S1B4 fermentation. Metabolites were clearly differentiated based on fermentation time into phase 1 (days 4-8) and phase 2 (days 10-20) in the principal component analysis (PCA) plot. The multivariate statistical analysis showed that the metabolites contributing significantly for phases 1 and 2 were deacetylphomoxanthone B, monodeacetylphomoxanthone B, fusaristatin A, and dicerandrols A, B, and C as identified by liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS), and dimethylglycine, isobutyric acid, pyruvic acid, ribofuranose, galactofuranose, fructose, arabinose, hexitol, myristic acid, and propylstearic acid were identified by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS)-based metabolite profiling. The most significantly different secondary metabolites, especially deacetylphomoxanthone B, monodeacetylphomoxanthone B, and dicerandrol A, B and C, were positively correlated with antibacterial activity against Xoo during fermentation.

HPLC-based metabolic profiling and quality control of leaves of different Panax species

  • Yang, Seung-Ok;Lee, Sang Won;Kim, Young Ock;Sohn, Sang-Hyun;Kim, Young Chang;Hyun, Dong Yoon;Hong, Yoon Pyo;Shin, Yu Su
    • Journal of Ginseng Research
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    • 제37권2호
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    • pp.248-253
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    • 2013
  • Leaves from Panax ginseng Meyer (Korean origin and Chinese origin of Korean ginseng) and P. quinquefolius (American ginseng) were harvested in Haenam province, Korea, and were analyzed to investigate patterns in major metabolites using HPLC-based metabolic profiling. Partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) was used to analyze the the HPLC chromatogram data. There was a clear separation between Panax species and/or origins from different countries in the PLS-DA score plots. The ginsenoside compounds of Rg1, Re, Rg2, Rb2, Rb3, and Rd in Korean leaves were higher than in Chinese and American ginseng leaves, and the Rb1 level in P. quinquefolius leaves was higher than in P. ginseng (Korean origin or Chinese origin). HPLC chromatogram data coupled with multivariate statistical analysis can be used to profile the metabolite content and undertake quality control of Panax products.

내장형 소프트웨어의 성능 향상을 위한 새로운 레지스터 할당 기법 (A New Register Allocation Technique for Performance Enhancement of Embedded Software)

  • Jong-Yeol, Lee
    • 대한전자공학회논문지SD
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    • 제41권10호
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    • pp.85-94
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    • 2004
  • 본 논문에서는 메모리 접근 연산을 레지스터 접근 연산으로 변환함으로써 레지스터를 할당하여 내장형 소프트웨어의 성능 향상을 도모할 수 있는 위한 레지스터 할당 기법을 제안한다. 제안된 방법에서는 프로파일링(Profiling)을 통하여 메모리 트레이스(trace)를 얻는다. 그리고 각 함수의 수행 횟수에 대한 프로파일링 결과로부터 높은 동적 호출 횟수를 가지는 대상 함수를 선정하여 제안된 레지스터 할당 기법을 적용한다. 이와 같이 최적화의 대상이 되는 함수의 수를 줄임으로써 전체적인 컴파일 시간을 줄일 수 있다. 최적화대상 함수의 메모리 트레이스를 탐색하여 레지스터 접근 연산으로 변경될 경우 수행 사이클을 줄일 수 있는 메모리 접근 연산을 찾는다. 찾아진 메모리 접근 연산에 대해서는 컴파일러의 중간단계 코드를 수정하여 프로모션 레지스터(promotion register)를 할당한다. 이와 같은 과정을 거쳐 메모리 접근 연산이 프로모션 레지스터에 대한 접근 연산으로 대체되고 이로부터 성능향상을 얻을 수 있다. 제안된 레지스터 프로모션 기법을 ARM과 MCORE 프로세서용 컴파일러에 적용한 후 MediaBench와 DSPStone 벤치마크를 이용하여 cycle count를 비교함으로써 성능을 측정하였다. 그 결과 ARM과 MCORE에 대하여 평균 14%와 18%의 성능향상을 얻을 수 있었다.

경찰청 아동음란물프로파일링 시스템을 이용한 아동음란물 차단 및 수사 방안 (Blocking and investigation of child pornography using child pornography profiling system of National Police Agency)

  • 이상덕
    • 디지털포렌식연구
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    • 제12권3호
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    • pp.97-108
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    • 2018
  • 컴퓨터기술 및 네트워크의 발전은 메신저, 이메일, 웹하드, 토렌트등 서비스 사용자의 손쉬운 대용량 파일 전송을 가능하게 하였다. 이는 소지자체가 불법인 아동음란물파일 소지자가 빠르게 다른 사용자에게 아동음란물을 전송 할 수 있다는 것을 의미한다. 하지만 현재는 메신저, 이메일, 웹하드, 토렌트 사용자간의 아동음란물을 배포를 예방하거나 차단하는 구체적인 방법에 대해 제안된 것은 없다. 본 논문에서는 '경찰청 아동음란물프로파일링시스템'의 보관되어 있는 MD5, SHA-1 해시값을 이용하여 아동음란물의 배포를 차단하고 소지자의 가입자 정보를 이용하여 아동음란물 소지 피의자를 특정할 수 있는 방법을 제안한다. 사용자가 파일을 배포하기 전 파일의 해시값을 추출하여 경찰청 아동음란물프로파일링시스템과 비교한 후 동일 값이 있을 경우 파일의 전송을 차단하고 해당 소지자에게 경고를 보내게 되며 서비스제공 기업은 가입자 정보를 수사기관에게 보내 아동음란물 소지자에 대한 수사를 신속하고 정확한 수사를 진행할 수 있다.

PQC 표준화 알고리즘 CRYSTALS-KYBER에 대한 비프로파일링 분석 공격 및 대응 방안 (Non-Profiling Analysis Attacks on PQC Standardization Algorithm CRYSTALS-KYBER and Countermeasures)

  • 장세창;하재철
    • 정보보호학회논문지
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    • 제32권6호
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    • pp.1045-1057
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    • 2022
  • 최근 양자 내성 암호 표준화 사업을 진행 중인 미국의 국립표준기술연구소는 표준화가 확정된 4개의 알고리즘을 발표하였다. 본 논문에서는 PKE/KEM 분야에서 표준화가 확정된 CRYSTALS-KYBER 알고리즘의 복호화 과정 중 비프로파일링 기반 전력 분석 공격인 CPA(Correlation Power Analysis)와 DDLA(Differential Deep Learning Analysis)에 의해 개인 키가 노출될 수 있음을 보이고자 한다. 실험 결과 개인 키의 일차 다항식 계수복구에 성공하였으며, 특히 DDLA에서는 중간 값의 해밍 웨이트(Hamming Weight)를 라벨로 사용하는 모델에서 평가 기법인 NMM(Normalized Maximum Margin)의 값이 13.0으로 가장 높은 값을 가져 개인 키를 복구할 수 있는 것을 확인하였다. 또한, 복호화 과정 중 암호문을 랜덤하게 분할하고 계수별 곱셈 연산의 시작 지점을 랜덤화하는 방어 기법을 적용하면 상기한 공격을 방어하는 것을 확인하였다.

심해무인잠수정 해미래를 이용한 다중빔 음향측심기의 운용 - 마리아나 열수해역 탐사 결과 및 후처리 - (Multi-beam Echo Sounder Operations for ROV Hemire - Exploration of Mariana Hydrothermal Vent Site and Post-Processing)

  • 박진영;심형원;이판묵;전봉환;백혁;김방현;유승열;정우영
    • 한국해양공학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.69-79
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    • 2017
  • This paper presents the operations of a multi-beam echo sounder (MBES) installed on the deep-sea remotely operated vehicle (ROV) Hemire. Hemire explored hydrothermal vents in the Forecast volcano located near the Mariana Trench in March of in 2006. During these explorations, we acquired profiling points on the routes of the vehicle using the MBES. Information on the position, depth, and attitude of the ROV are essential to obtain higher accuracy for the profiling quality. However, the MBES installed on Hemire does not have its own position and depth sensors. Although it has attitude sensors for roll, pitch, and heading, the specifications of these sensors were not clear. Therefore, we had to merge the high-performance sensor data for the motion and position obtained from Hemire into the profiling data of the MBES. Then, we could properly convert the profiling points with respect to the Earth-fixed coordinates. This paper describes the integration of the MBES with Hemire, as well as the coordinate conversion between them. Bathymetric maps near the summit of the Forecast volcano were successfully collected through these processes. A comparison between the bathymetric maps from the MBES and those from the Onnuri Research Vessel, the mother ship of the ROV Hemire for these explorations, is also presented.

Gene Expression Profiling of the Rewarding Effect Caused by Methamphetamine in the Mesolimbic Dopamine System

  • Yang, Moon Hee;Jung, Min-Suk;Lee, Min Joo;Yoo, Kyung Hyun;Yook, Yeon Joo;Park, Eun Young;Choi, Seo Hee;Suh, Young Ju;Kim, Kee-Won;Park, Jong Hoon
    • Molecules and Cells
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    • 제26권2호
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    • pp.121-130
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    • 2008
  • Methamphetamine, a commonly used addictive drug, is a powerful addictive stimulant that dramatically affects the CNS. Repeated METH administration leads to a rewarding effect in a state of addiction that includes sensitization, dependence, and other phenomena. It is well known that susceptibility to the development of addiction is influenced by sources of reinforcement, variable neuroadaptive mechanisms, and neurochemical changes that together lead to altered homeostasis of the brain reward system. These behavioral abnormalities reflect neuroadaptive changes in signal transduction function and cellular gene expression produced by repeated drug exposure. To provide a better understanding of addiction and the mechanism of the rewarding effect, it is important to identify related genes. In the present study, we performed gene expression profiling using microarray analysis in a reward effect animal model. We also investigated gene expression in four important regions of the brain, the nucleus accumbens, striatum, hippocampus, and cingulated cortex, and analyzed the data by two clustering methods. Genes related to signaling pathways including G-protein-coupled receptor-related pathways predominated among the identified genes. The genes identified in our study may contribute to the development of a gene modeling network for methamphetamine addiction.