• 제목/요약/키워드: isozyme loci

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Genetic Studies of Oenothera odorata Populations in Korea Based on Isozyme Analysis

  • Huh, Hong-Wook
    • Journal of Plant Biology
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    • 제39권3호
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    • pp.223-229
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    • 1996
  • The genetic variation in Korean evening primorse (Oeothera odorata L.) populations was examiend to estimate the level of allozyme variation within populatons using starch gel electrophoresis. 7 of 13 loci (Adh, Est-1, Est-2, Mdh-2, Pgd-2, Pgm-1, and Idh) revealed (Ps=43.2%) were polymorphic. The mean number of alleles per locus (A) and polymorphic locus (Ap) for populations were 1.64 and 2.46, respectively. The effective number of alleles (Aep) within populations relatively was low ranging from 1.08 to 1.22 with a mean of 1.14. Within populations, the mean number of allele per polymorphic loci (Ap) was 2.46, the mean number of alleles per locus (A) was 1.64, and the mean genetic diversity was 0.093. About 2.7% of the total allozyme diversity resided among populations (Mean GST=0.0274). FIS, a measure of the deviation from random mating within 13 populations, was relative low (mean FIS=0.03636). The indirect estimate of gene flow, based on the mean GST, was high (Nm=8.88). Estimates of gene flow were consistent with low levels of genetic differentiation among populations.

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소나무의 몇가지 다형적(多形的) 동위효소(同位酵素)의 유전분석(遺傳分析)(II) - Acid phosphatase, alcohol dehydrogenase와 catalase 동위효소(同位酵素)의 유전양식(遺傳樣式) - (Genetic Analysis of Some Polymorphic Isozymes in Pinus densiflora(II) - Inheritance of acid phosphatase, alcohol dehydrogenase and catalase isozymes -)

  • 김진수;홍용표
    • 한국산림과학회지
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    • 제68권1호
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    • pp.32-36
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    • 1985
  • 소나무의 acid phosphatase (ACP), alcohol dehydrogenase (ADH)와 catalase (CAT) 동위효소(同位酵素) 유전양식(遺傳樣式)을 구명(究明)하기 위하여 배유조직(胚乳組織)을 수평식 감자전분 전기영동법에 의하여 분석(分析)하였다. ACT 동위효소(同位酵素)는 최소한 3~4개의 지역(地域)으로 분리(分離)되었으나 분리가 잘된 ACP-A 지역(地域)의 동위효소(同位酵素)만이 분석(分析)되었다. ACP-A 지역(地域)에서 관찰된 5개(A1-A5)의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型)들은 공히 Mendel의 분리비(分離比)를 보여 이들이 각각 ACP-A 유전자좌(遺傳子座)에 존재(存在)하는 5개의 대립유전자(對立遺傳子)에 의해 지배받고 있음을 알 수 있었다. 2개의 ADH 지역(地域)이 (ADH-A와 ADH-B) 분리(分離)되었으나, 양극(陽極)으로의 이동(移動)속도가 빠른 ADH-A 지역(地域)에서는 분석(分析)에 사용된 재료(材料)에서 변이(變異)가 발견(發見)되지 않았다. ADH-B 지역(地域)에서는 3개의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型) (B1-B3)들이 관찰되었고 이들이 공히 1:1의 분리비를 보여 ADH-B 유전자좌(遺傳子座)에 존재하는 3개의 대립유전자(對立遺傳子)에 의해 지배됨이 추정되었다. 수개의 band로 구성된 5개의 동위효소(同位酵素) 표현형(表現型)이 CAT에서 관찰되었으며, 이형접합성(異型接合性)인 모수(母樹)에서 이들 표현형간(表現型間)의 분리(分離)가 1:1 분리비(分離比)로부터 편차(偏差)를 보이지 않았으므로, 소나무에 있어서 CAT 동위효소(同位酵素)는 5개의 대립유전자(對立遺傳子)가 존재(存在)하는 하나의 유전자좌(遺傳子座)에 의해 지배되는 것으로 추정하였다.

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한국산 또아리물달팽이과 ( family Planorbidae ) 3종에서의 동위 효소 변이 (Isozyme Variability in Three Species of Freshwater Planorbid Snails in Korea : Gyraulus convexiusculus , Hippeutis cantori and Segmentina hemisphaerula)

  • 정평림;정영헌;김기선
    • 한국패류학회지
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    • 제11권1호
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    • pp.51-61
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    • 1995
  • A horizontal starch gal electrophoresis for enzyme proteins extracted from 3 species of Korean planorbid snails; Gyraulus convexiusculus, Hippeutis cantori and Segmentina hemisphaerula was carried out in order to elucidate their genetic relationships.The results from 12 enzymes employed in three different kinds of buffer systems are summarized as follows:1) Two loci from each enzyme of aldehyde oxidase, esterase, glucose phosphate isomerase. isocitrate dehydrogenase, leucine aminopeptidase, malate dehyogenase, peptidase and xanthine oxidase were detected, and only one locus was observed from each of the following four enzymes: 6-phosphogluconate dehydrogenase, glyceraldehyde-phosphate dehydrogenase, glutamate oxaloacetate transaminase and glycerol-3-phosphate dehydrogenase.2) Most of loci in 3 species of planorbid snails employed showed homozygous and monomorphic banding patterns and some of them were specifis as genetic markers among different species. However, a few of loci (EST-1. EST-2 and GPI-2)showed polymorphic banding patterns. 3)Hippeutis cantori and Segmentina hemisphaerula were more closely clustered in a dendrogram with the genetic iddentity value of 0.431, and these two species were lineated with Gyraulus convexiusculus as another cluster at the value of 0.294.In summarizing the above results, three species of Korean planorbid snails employed in this study mostly showed monomorphic enzyme protein banding patterns and genetic differences specific among 3 species.

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Genetic Diversity of Soybean Landraces in Korea

  • Han, Ouk-Kyu;Abe, Jun;Shimamoto, Yoshiya
    • 한국작물학회지
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    • 제44권3호
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    • pp.256-262
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    • 1999
  • To evaluate the genetic diversity and structure of the South Korean soybean population, 233 landraces collected in various regions of the country were surveyed for 15 allozyme loci and one protein locus. The South Korean population was fixed or nearly fixed at seven of the 16 loci tested. The number of alleles per locus was 2.06 and Nei’s gene diversity was 0.194. These values were lower than the values for the same 16 loci previously reported for the Japanese and Chinese populations. The differences among eight regional groups were not so marked, with only 7.2% of the total variation arising from regional differentiation. Three southern regional groups (Chollabuk-do, Chollanam-do and Kyong-sangnam-do) exhibited a relatively high variability because of frequent occurrence of alleles characteristic of the Japanese population. A marked difference was found in allelic frequencies at the Dial locus between large-seeded landraces and small-seeded ones, suggesting that the latter, which are used mainly for bean sprouts, had been established independently of the former, which are used mostly for soy sauce and cooking with rice. Not only the region but also the usage as food materials should therefore be taken into consideration in designing an efficient collection and preservation method for the Korean soybean landraces.

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일본 해역에 서식하고 있는 도다리, Pleuronichthys cornutus, 2형간의 유전적 분기 (Genetic Divergence of Two Types of Finespotted Flounder, Pleuronichthys cornutus, Distributed in the Japan Sea Area)

  • 박중연;목도명박;강용주
    • 한국수산과학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.306-313
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    • 1994
  • 일본에서 상업적으로 중요한 어종 중의 하나인 도다리 2형간 유전적 분기의 정도를 측정하기 위하여 전분 gel 전기영동법에 의한 isozyme분석을 행하였다. 도다리 2형간에 있어서 14종의 효소를 지배하는 22유전자좌가 검출되었으며 2형간에 있어서 공통의 대림유전자를 가지고 있지 않은 완전분기는 3유전자좌(Acp, Idh-2 및 Mdh-2)에서 관찰되었다. 2형간에 있어서 측정된 Nei의 유전적거리는 0.46592이었으며 2형간에 있어서 유전적 변이성의 차이를 나타내는 평균 이형 접합체율의 기대치는 A type에서 0.120, B type에서는 0.095로 나타났다. 이상의 결과로부터 2형간에 있어서 유전적으로 상호 분기되어 있었으며 그들의 분기 년도는 대략 $2.3{\times}10^6$년 전으로 추정된다.

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반송(Pinus densiflora for. multicaulis)의 몇 가지 동위효소(同位酵素)의 유전변이(遺傳變異) (Genetic Variation of Several Isoenzymes in Pinus densiflora for. multicaulis)

  • 황재우;이석우
    • 한국산림과학회지
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    • 제85권3호
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    • pp.409-415
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    • 1996
  • 반송의 유전변이를 조사하기 위해 전국에서 선발한 31개체에 대한 배유조직을 이용하여 4개 동위효소에 대한 전기영동을 실시하였으며, 분석된 결과를 소나무와 비교하였다. 분석 결과 최소 7개의 유전자좌(GDH-A, GOT-B, GOT-C, IDH-A, LAP-A, LAP-B)가 다형성을 나타냈으며, 이들 유전자좌에서 관측된 대립유전자 수는 2-4개였다. 본 연구에서 조사된 유전자좌에서는 소나무와 반송을 구별할 수 있는 표식인자(標識因子)를 발견할 수 없었으며, 각 유전자좌별 대립유전자 빈도 분포 역시 소나무와 반송이 거의 동일하였다. 반송의 99% 수준에서의 다형적 유전자좌의 비율, 유전자좌당 대립유전자수, 이형접합율의 관측치와 기대치는 각각 85.7, 2.3개, 0.165와 0.186%로 소나무에 비해서 유전변이는 적은 것으로 나타났다.

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희귀(稀貴) 수종(樹種) 눈향나무 집단(集團)의 동위효소(同位酵素) 분석(分析)에 의한 유전변이(遺傳變異) 연구(硏究) (Genetic Variation in the Endemic Rare Tree Species, Juniperus chinensis var. sargentii HENRY)

  • 양병훈;권해연;한상돈
    • 한국자원식물학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.76-82
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    • 2006
  • 우리나라 고산 지역에 제한적으로 자생하는 희귀 유전자원인 눈향나무(Juniperus chinensis var. sargentii HENRY)의 설악산 및 한라산 집단을 대상으로 동위효소 분석에 의한 유전적 다양성을 조사하였다. 총 7개 동위효소에서 11개의 재현성 있는 유전자좌가 분석되었으며, 이중 Mdh-1, Mdh-2, Mdh-3 및 Pig-1 유전자좌를 제외한 7개 유전자좌에서 다형성이 관찰되었다. 분석된 두 집단의 유전변이량은 각각 A=2.2, $A_e=1.61,\;P_{95}=54.5,\;H_{o}=0.179,\;H_e=0.287$(설악산 집단)과 A=2.1, $A_e=1.48,\;P_{95}=63.6,\;H_{o}=0.270,\;H_e=0.250$(한라산 집단)으로 국내 타 침엽수종으로부터 동위효소 분석을 통해 추정된 유전변이량에 비해 다소 높은 경향을 보였으며, 분석 집단간 유전적 분화 정도는 그리 높지 않은 것으로 나타났다($F_{ST}=0.039$). 설악산 집단의 경우 이형접합도의 관찰치가 기대치에 비해 매우 낮았으며 근교계수 값이 매우 높게 나타나(F=0.376), 전반적으로 근친교배 또는 유전적 부동의 영향을 많이 받고 있는 것으로 추정되었다. 이는 설악산 눈향나무 집단의 분포 면적이나 개체수가 한라산 집단에 비해 매우 적기 때문인 것으로 추정되며, 향후 설악산 집단의 보존을 위한 보다 적극적인 노력이 필요한 것으로 사료된다.

Genetic Diversity and Speciation of Rana rugosa (Amphibia; Ranidae)

  • Yang, Suh-Yung;Min, Mi-Sook;Kim, Jong-Bum;Suh, Jae-Hwa;Kang, Young-Jin
    • Animal cells and systems
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    • 제4권1호
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    • pp.23-30
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    • 2000
  • Horizontal starch gel electrophoresis for 29 populations (n=543) of the wrinkled frog, Rana rugosa, from Korea and Japan was peformed to assess the degree of genic variation and genetic diversity, and to understand the biogeographic pattern of distribution and speciation. A sum of 22 presumptive loci was screened from 17 enzymes and general proteins. Four loci, Aco, Est-3, Me-2, and Pgm, demonstrated high levels of polymorphism. The degree of average genetic variation of R. rugosa was P=22.7% (9.1-40.9%), Ho=0.086 (0.048-0.165) and He=0.090 (0.042-0.168). In the south-eastern region of the Korean peninsula (Chongsong, Yongchon, Ulsan, Kyongju, Pohang, yongdok and Ulchin), a few unique alleles in the Mpi locus were detected and their biogeographic implications were considered. The degree of genetic differentiation among the Korean populations was moderate (S=0.900), whereas the degree of genetic diversity between Korean and Japanese populations was notably high (S=0.687, D=0.293). This result corresponds with the data obtained by the mitochondrial cytochrome b gene sequence (Lee et al., 1999) suggesting that the Korean and Japanese R. rugosa might have evolved a specific level of genetic differentiation since their geographic isolation.

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칠성장어(Lampetra japonica) 조직내 젖산수소이탈효소 동위효소들의 이질성 (Heterogeneity of Lactate Dehyrogenase Isozymes in tissues of Lampetra japonica)

  • 조성규;염정주
    • 한국동물학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.319-328
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    • 1993
  • 칠성장어류를 제외한 모든 척추동물은 여러 유전자로 이루어진 젖산수소이탈효소를 지니고, 칠성장어류의 LDH는 cellulose acetate 및 starch gel 전기영동한 결과 단일 동위효소로 보고되어졌다. 그러나 본 실험에서 polyacrylamide gel 전기영동 방법에 의해서 칠성장어 골격근, 심장 및 신장의 LDH는 3개의 동위효소, 간의 LDH는 2개의 동위효소로 분리되었다. Polyacrylamide gel isoelectric focusing 방법으로는 골격근과 심장의 LDH는 4개의 동위효소, 간의 LDH는 2개의 동위효소로 분리되었고, 골격근의 LDH는 chromatofocusing한 결과 4개의 LDH 동위효소로 분리되었다. 칠성장어 골격근 LDH 동위효소들은 Sphadex G-200 gel filtration 결과 분자량이 140,000정도로 나타났다. 골격근, 심장 및 간조직 LDH 동위효소는 pyruvate에 의해 비슷한 정도로 저해되었으며 LDH $A_4$및 B$_4$동위효소의 중간정도의 저해를 보여주었다. 그리고 심장, 간 및 골격근 LDH 동위효소는 열에 안정하였다. 상기의 결과들로부터 칠성장어는 단일 동위효소가 아니라 동위효소들을 가지며 이 동위효소들을 이루는 각 하부단위체들의 구조는 유사하다고 사료된다.

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Genetic diversity and structure of natural populations of Picea jezoensis in South Korea

  • Lee, Seok Woo;Yang, Byeong Hoon;Hur, Seong Doo;Lee, Jung Joo;Song, Jeong Ho;Moriguchi, Yoshinari
    • 한국산림과학회지
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    • 제97권2호
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    • pp.187-195
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    • 2008
  • Picea jezoensis (Sieb. et Zucc.) Carriere is one of the major and widespread components of the cold-temperate and boreal forests in Russian Far East, northeast China, Korea, and Japan. However, it is restricted to a highly fragmented range in South Korea with small populations. Mean expected heterozygosity $(H_e)$ based on 22 loci in 11 isozyme systems was 0.077 for four sampled populations that covered the whole distribution range of P. jezoensis in South Korea. This value is within the range reported for conifers, but it is very low compared to that of other spruce species as well as that of P. jezoensis populations in Russian Far East. Most populations had a slight excess of heterozygotes and the Wright's $F_{IS}$ (-0.019) was comparable to that previously reported for other spruce species. In all of the four populations, the Wilcoxon sign-rank test indicated no greater heterozygosity than that expected for populations at mutation-drift equilibrium, suggesting that the populations have not been bottlenecked recently. Despite a fragmented range and isolated populations, population differentiation was not high $(F_{ST}=0.047)$ and the number of migrants per generation was 5.09. Nei's genetic distances were also small $({\bar{D}}=0.005)$ but strongly related to geographic distances between populations, suggesting an Isolation by Distance. The northernmost isolate, Mt. Gyebang population was genetically distinct from the other three populations. Implications for the conservation of genetic variation of P. jezoensis in South Korea were discussed.