• 제목/요약/키워드: hydrogen donor

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Pharmacophore Modelling, Quantitative Structure Activity Relationship (QSAR) and Docking Studies of Pyrimidine Analogs as Potential Calcium Channel Blockers

  • Choudhari, Prafulla B.;Bhatia, Manish S.;Jadhav, Swapnil D.
    • 대한화학회지
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    • 제57권1호
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    • pp.99-103
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    • 2013
  • The present communication deals with the Pharmacophore modeling, 3D QSAR and docking analysis on series of Pyrimidine derivatives as potential calcium channel blockers. The computational studies showed hydrogen bond donor, hydrogen bond acceptor, and hydrophobic group are important features for calcium channel blocking activity. These studies showed that Pyrimidine scaffold can be utilized for designing of novel calcium channels blockers for CVS disorders.

A New Empirical Potential Function and Its Application to Hydrogen Bonding

  • Kang, Young-Kee;Jhon, Mu-Shik
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제2권1호
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    • pp.8-11
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    • 1981
  • A new potential function based on spectroscopic results for diatomic molecules is presented and applied to the hydrogen bonding systems. The potential energy of interaction is supposed to have electrostatic, polarization, dispersion, repulsion and effective charge-transfer contributions. Estimates of the effective charge-transfer quantity have been made based on the average charge of the proton donor and the acceptor atoms. For dimers such as water, methanol, acetic acid and formic acid, the vibrational stretching frequencies and dimerization energies are calculated and dicussed in connection with Badger-Bauer rule.

Nocardia sp의 생리 생화학적연구 (제2보) Tellurite 환원효소에 관하여 (The Physiological and Biochemical Studies of Nocardia sp (Part 2) Tellurite-Reducing Enzyme)

  • 홍순덕
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제5권3호
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    • pp.141-151
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    • 1977
  • Nocardia sp의 tellurite 및 tellurate 환원효소의 세포내 분포 및 이의 정제법에 대한 실험과 효소 화학약 성질에 대한 연구를 요약하면 다음과 같다. Nocardia sp의 tellurite 및 tellurate 환원효소는 세포질중에 존재하며 T.T.C.의 환원부위와는 세포내에서의 존재양식이 서로 다르다. 세포용성 성분을 균체로부터 조제하여 이것을 재료로 해서 유안여석법, DEAE-Cellulose column chromatography등을 병용함에 따라, tellurite및 tellurate 환원순서의 정제가 가능하다. 이상의 정제효소를 사용하여 이의 낙소 화학적 성질에 대하여 검토한 결과, 수소공여체로는 NADH, NADPH 환원형(methylene blue)의 어느 것이든 작용한다는 것을 알았지마는 아마 생리적 수소공여체는 NADH, NADPH의 양자이든가 또는 이들 양자중에서 어느 하나일 것이다. 한편 이들 수소공여체에 대한 수소수용기는 본 효소에 있어서는 tellurite가 균체의 기질이 되지마는 tellurite 및 tellurate와 화학구조가 유사한 selenite, selenate를 환원하여 각각의 기질화합물중에 함유되어 있는 금속을 석출한다는 것도 알게 되었다.

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이성분 혼합용매의 구조에 대한 열역학적 연구(제1보). 알코올-Cosolvent 혼합물의 분몰랄엔탈피 (Thermodynamic Studies on the Structure of Binary Mixed Solvents(Ⅰ). Partial Molal Enthalpies of Alcohol-Cosolvent Mixtures)

  • 나상무;박영동
    • 대한화학회지
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    • 제41권2호
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    • pp.63-68
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    • 1997
  • 등유전성 용매내에서 분자간 상호작용과 액체구조에 대한 정보를 얻기 위하여 양성자성 용매(protic solvent)인 ROH(R=Me, Et)와 양극성 비양성자성 용매(dipolar aprotic solvent)인 MeCN,$Me_2CO,\;MeNO_2(or EtNO_2)$간의 이성분 혼합물에서 각 성분의 분몰 용해엔탈피를 열량계법으로 측정하고 이를 이용하여 mixing과정에 대한 잉여엔탈피를 결정하였다. 이로부터 두 성분간의 수소결합 세기는$ROH-ROH>ROH-Me_2CO>ROH-MeCN>ROH-MeNO_2(or EtNO_2)$순으로 감소하며, ROH의 수소결합주게 산도(hydrogen bond donor acidity)는 MeOH>EtOH의 순으로 감소하며 이로부터 이성분 액체혼합물이 형성될 때의 에너지론(energetics)에 미치는 가장 강한 상호작용이 특별한 수소결합에 기인됨을 알 수 있었다.

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병풀(Centella asiatica)로부터의 asiaticoside와 madecassoside의 추출효율에 미치는 DES의 영향 (Effect of deep eutectic solvent (DES) on the extraction of asiaticoside and madecassoside from Centella asiatica)

  • 최재영;전유임;하성호
    • 분석과학
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    • 제36권3호
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    • pp.128-134
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    • 2023
  • 병풀(Centella asiatica) 추출물인 asiaticoside와 madecassoside는 항균성 및 피부재생 등의 효과로 인해 아시아 지역에서 치료용 연고에 사용되고 있으며, 병풀의 재배 및 추출효율을 높이기 위한 연구가 상업화를 위해 활발히 진행되고 있다. 본 연구에서는 환경 친화적인 추출 용매인 deep eutectic solvents(DESs)가 병풀에서 asiaticoside와 madecassoside의 추출 효율에 미치는 영향을 관찰하기 위하여 다양한 수소결합 받개(hydrogen bond acceptor, HBA)와 주개(hydrogen bond donor, HBD)의 혼합 몰비(HBA1: HBD2, HBA1:HBD3, HBA1:HBD4, 그리고 HBA1:HBD5)로 제조하여 추출용매로 사용하였며, 용매 추출에서 일반적으로 사용되고 있는 추출용매인 증류수(DW)와 methanol (MeOH)의 추출 결과를 최적화된 HPLC조건으로 분리하여 정량 분석하였다. 그 결과, DW와 DES를 3:7로 혼합하여 사용한 경우가 단일 MeOH를 사용한 경우보다 약 1.4배 높은 추출 효율을 보였다. 반대로 MeOH과 DES를 3:7로 혼합하여 사용하는 경우에서는 단일 MeOH를 사용하는 경우보다 약 6 % 낮은 추출 효율을 보였다.

Excited State Dynamics of Curcumin and Solvent Hydrogen Bonding

  • Yang, Il-Seung;Jin, Seung-Min;Kang, Jun-Hee;Ramanathan, Venkatnarayan;Kim, Hyung-Min;Suh, Yung-Doug;Kim, Seong-Keun
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제32권spc8호
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    • pp.3090-3093
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    • 2011
  • Curcumin is a natural product with antioxidant, anti-inflammatory, antiviral and antifungal functions. As it is known that the excited state intramolecular hydrogen transfer of curcumin are related to its medicinal antioxidant mechanism, we investigated its excited state dynamics by using femtosecond transient absorption spectroscopy in an effort to understand the molecule's therapeutic effect in terms of its photophysics and photochemistry. We found that stronger intermolecular hydrogen bonding with solvents weakens the intramolecular hydrogen bonding and decelerates the dynamical process of the enolic hydrogen. Exceptions are found in methanol and ethylene glycol due to their nature as simultaneous hydrogen bonding donor-acceptor and high viscosity solvent, respectively.

Rhodopseudomonas sphaeroides의 고정화균체에 의한 수소생산의 효율적 기질 공급 (Effective Supply of Substrate for Hydrogen Production by Immobilized Cells of Rhodopseudornonas sphaeroides)

  • 김진상;홍용기;신일식;조학래;장동석
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제20권1호
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    • pp.79-84
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    • 1992
  • Rhodopseudomonas sphaeoides B6 세포를 agar gel 중에 고정했을 때, 수소생산을 위한 최적 agar 농도는 2(w/v)였다. B6의 2% agar gel 고정화균체(300ml gel: 2.85 mg dry cells/ml)와 비고정세포(1l culture: 0.87 mg dry cells/ml)에 있어서 초기의 최고 수소 생산활성은 각각 47.5 및 48.0ml/hr/culture로 거의 같았다. 그러나, 수소생산이 거의 정지된 배양후기에는 lactate의 제한공급( 10 mmole)에 의한 비고정세포의 활성회복은 50% 이하로 감소되었지만, 고정화세포의 활성은 거의 초기상태로 회복되었다. B6의 고정화균체를 이용하여 12시간 주기의 광조사조건으로, 매 1l의 수소생산시 마다 그에 소비된 만큼의 기질에 상당하는 9.3mmole의 DL-lactate와 1.86mmole의 L-glutamate 함유 기본배지를 주기적으로 공급한 결과, 228시간의 배양기간 동안 명암의 반복조건에도 불구하고 평균 510 ml/day/300m/ gel(2.9mg dry cells/ml)의 속도로 수소생산이 지속되었다. 이 결과는 광합성세균에 의한 수소생산에 있어서, 보다 효율적 기질공급과 가변적인 태양광 이용 조건에 대응되는 자동배양 시스템의 구성 가능성을 시사한다.

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Hydrogen Bonding Analysis of Hydroxyl Groups in Glucose Aqueous Solutions by a Molecular Dynamics Simulation Study

  • Chen, Cong;Li, Wei Zhong;Song, Yong Chen;Weng, Lin Dong;Zhang, Ning
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제33권7호
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    • pp.2238-2246
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    • 2012
  • Molecular dynamics simulations have been performed to investigate hydrogen bonding characteristics of hydroxyl groups in glucose aqueous solutions with different concentrations. The hydrogen bonding abilities and strength of different O and H atom types have been calculated and compared. The acceptor/donor efficiencies have been predicted and it has been found that: (1) O2-HO2 and O3-HO3 are more efficient intramolecular hydrogen bonding acceptors than donors; (2) O1-HO1, O4-HO4 and O6-HO6 are more efficient intramolecular hydrogen bonding donors than acceptors; (5) O1-HO1 and O6-HO6 are more efficient intermolecular hydrogen bonding acceptors than donors while hydroxyl groups O2-HO2 and O4-HO4 are more efficient intermolecular hydrogen bonding donors than acceptors. The hydrogen bonding abilities of hydroxyl groups revealed that: (1) the hydrogen bonding ability of OH2-$H_w$ is larger than that of hydroxyl groups in glucose; (2) among the hydroxyl groups in glucose, the hydrogen bonding ability of O6-HO6 is the largest and the hydrogen bonding ability of O4-HO4 is the smallest; (3) the intermolecular hydrogen bonding ability of O6-HO6 is the largest; (4) the order for intramolecular hydrogen bonding abilities (from large to small) is O2-HO2, O1-HO1, O3-HO3, O6-HO6 and O4-HO4.