• 제목/요약/키워드: human enteroviruses (HEV)

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부산지역에서 분리된 엔테로바이러스의 유행양상 분석 및 유전자형 연구 (Genetic Characterization for Human Enterovirus Isolated from Busan Region in Korea)

  • 김남호;민상기;박은희;박연경;권순목;진성현
    • 생명과학회지
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    • 제20권6호
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    • pp.907-913
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    • 2010
  • 부산지역에서 2007년부터 2009년까지 3년 동안 임상적으로 HEV 의심 환자 검체 총 2,743건(대변 1,503건, 뇌척수액 1,213건, 인후도찰물 27건)의 검체 중 240건(8.7%)에서 HEV가 검출되었다. 연도별로는 2007년에는 HEV 감염의심 환자 검체 1,001건에서 86건(8.6%)에서 HEV가 분리되었고, 2008년의 경우 979건 중 85건(8.7%), 2009년 763건 중 69건(9.0%)이 분리되었다. 본 연구에 사용된 검체 2,743건 중 1,315건이 6월부터 9월까지 4개월간 의뢰되어 전체 의뢰건수의 48.0%를 차지하였다. HEV는 5월부터 분리율이 증가하기 시작해서 6월(15.5%), 7월(15.8%), 8월(15.3%)에 높게 나타나 HEV 분리가 하절기에 집중되어 나타난 것을 확인할 수 있었다. 검사건수 별 양성률은 남자 9.5%, 여자 8.7%로 성별에 따른 분리율의 차이를 찾기는 어려웠으며, 대부분 10세 이하의 연령에서 바이러스가 분리되었다. 분리된 HEV 분리주들에 대하여 VP1 region sequencing을 통하여 HEV의 유전형을 확인하여 HEV-A와 HEV-B 두 종류의 유전자형이 부산지역에서 유행하였음을 확인하였다. HEV-A의 부산지역 분리주 31주를 이용하여 상동성 비교분석을 실시한 결과 분리주 31주 사이에 21.8~100%의 상동성을 보였으며, HEV-B의 부산지역 분리주 41주를 이용하여 상동성 비교분석을 실시한 결과 분리주 41주 사이에 56.0~100%의 상동성 보여 최근 3년간 부산지역에 분리된 HEV 혈청형들 사이에 상동성의 차이를 보이는 결과를 확인 할 수 있었으며, 이를 볼 때 부산지역에서 유행하는 HEV 내에 상당한 정도의 유전자 변이를 추정해 볼 수 있었다.

서울시내 소화기 및 호흡기 환자에서 분리한 엔테로바이러스 감염실태 및 유전형분석 (Genotypes and Infection Status of Human Enterovirus Associated with Enteric and Respiratory Patients in Seoul, Korea)

  • 장정임;오세아;박상훈;함희진;조석주;최성민;강병학;황서연;김진석
    • 한국환경보건학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.178-186
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    • 2013
  • Objective: Human enteroviruses (HEVs) are a common causative agent of gastrointestinal or respiratory infections. In this study, to examine the genotypic diversity and characteristics of HEVs associated with patients in Seoul, we collected and analyzed stool and throat swab samples taken from patients with acute gastroenteritis or a common cold from 2011 to 2012. We researched the difference in genetic characteristics of HEVs from gastroenteritis and respiratory patients. Methods: For genetic analysis, we amplified the 5'-noncoding region and partial VP1 region of HEVs by RT-PCR. The genotypes of HEVs were further identified based on nucleotide sequences of the VP1 region. Results: The majority of the HEV infections in Seoul occurred from June to August. The molecular characteristic assay showed that although the majority of HEVs can be propagated by a fecal-oral route, Coxsackievirus A2 (n=13, 19.4%), A4 (n=8, 11.9%), and A5 (n=4, 6.0%) can be preferentially transmitted by a respiratory route. Conclusions: This Enterovirus surveillance system plays an important role in preparing for a severe outbreak. The genotypic characteristics of HEV may provide potentially useful data needed for epidemiological studies.