Oh, Sang Heon;Choi, Su Ryun;Pang, Wenxing;Rameneni, Jana Jeevan;Yi, So Young;Kim, Man-Sun;Im, Su Bin;Lim, Yong Pyo
Korean Journal of Agricultural Science
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v.45
no.1
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pp.1-8
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2018
Glucosinolates are one of the important plant secondary metabolites that are produced mainly in Brassicaceae plants. The compounds are primarily involved in defense responses to biotic and abiotic resistance in plants and play important biological roles during plant growth and development. In this study, the glucosinolate profiles in leaves of two different Brassica oleracea populations were compared using high-performance liquid chromatography (HPLC). The nine major glucosinolates compounds in cabbage leaves were identified as belonging to the aliphatic and indolic groups. Among them, sinigrin, which belongs to the aliphatic group, was recorded to be 41% whereas glucobrassicin and 4-methoxyglucobrassicin, which belong to the indolic group, were recorded to be 53.8%. In addition, we performed a genetic analysis to identify regions of the genome regulating glucosinolates biosynthesis in the $F_3$ population of Brassica oleracea. A total of 9 glucosinolates were used for the quantitative trait locus (QTL) analysis. Out of 9, a total of 3 QTLs were identified and they were associated with sinigrin, glucobrassicin, and 4-methoxyglucobrassicin synthesis located in Chromosome 1 and Chromosome 8, respectively. The results of this study will provide valuable information for the breeding of cabbage containing high glucosinolate content, and our next target is to develop component-specific and tightly linked markers for various glucosinolates.
Nie, Hualin;Kim, Sujung;Lee, Yongjae;Park, Hyungjun;Lee, Jeongeun;Kim, Jiseong;Kim, Doyeon;Kim, Sunhyung
Journal of Plant Biotechnology
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v.47
no.3
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pp.194-202
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2020
The sweetpotatoes (Ipomoea batatas) generate adventitious roots (ARs) from cut stems that develop into storage roots and make for an important means of propagation. However, few studies have investigated the hormones involved in AR development in sweetpotato. In this study, the expression patterns of hormone-related genes involved in AR formation were identified using the transcriptome data. RNA-seq data from stems grown for 0 and 3 days after cutting were analyzed. In addition, hormone-related genes were identified among differentially expressed genes (DEGs) and filtered genes, and cluster analysis was used to characterize expression patterns by function. Most hormone-related regulated genes expressed 3 days after growing the cut stems were abscisic acid (ABA)-related genes, followed by ethylene- and auxin-related genes. For ABA, the biosynthesis genes (including genes annotated to NINE-CIS-EPOXYCAROTENOID DIOXYGENASE 3 (NCED3)) and signal transduction and perception genes (including genes annotated to PROTEIN PHOSPHATASE 2Cs (PP2Cs)) tended to decrease. Expression patterns of auxin- and ethylene-related genes differed by function. These results suggest that ABA, auxin, and ethylene genes are involved in AR formation and that they may be regulated in a hormone function-dependent manner. These results contribute to the identification of hormone functions during AR formation and may contribute to understanding the mechanism of AR formation in the sweetpotato.
Korea's protected horticulture is rapidly increasing in scale due to various advantages such as year-round harvesting, labor savings through automation and shortened culture period, and greater income generation. This study was conducted to investigate the impact of protected horticulture on water quality. The results of this study are expected to provide basic data contributing to improvements towards sustainable agriculture and eco-friendly design of protected horticulture complex. The average T-N and T-P loads from vinyl greenhouses were 286.55± 143.98 mg/L and 59.14±13.77 mg/L, respectively and those from glass greenhouses 380.68 ± 150.41 mg/L and 61.85±20.72 mg/L. The annual discharge of wastewater derived from the monthly discharge from the horticulture greenhouses were estimated at 2597 ton/ha, with the annual phosphorus load amounting to 155.3 kg/ha. The average T-N and T-P loads in the tested greenhouse effluents were in excess of 8.3- and 13.5-fold the standards for the Korean wastewater plant effluent. The waste nutrient solution discharged from a protected horticulture complex can cause water contamination. Therefore, there is a need to conduct follow-up research using a water purification system or a trench method to develop a eco-friendly protected horticulture complex for sustainable agriculture.
Experiments were conducted to estimate optimal potassium strength in the nutrient solution for ‘Nokgwang’and‘Kwari’green pepper seedlings cultured in small plug-cell trays. Plant height, stem diameter, and leaf area increased with increasing K concentration, with greater effect on ‘Kwari’ than ‘Nokgwang’. Total dry weight increased by increasing potassium strength.‘Kwari’had heavier dry weight than ‘Nokgwang’Chlorophyll content differed by cultivars and potassium strength. The highest chlorophyll content was obtained at 2.0 strength potassium in‘Nokgwang’, but not in‘Kwari’Net photosynthesis was greater in plants fertilized with 1.5 strength potassium for‘Nokgwang’and 2.0 strength potassium for ‘Kwari’than the other treatments.
This study investigated the applicability of horticultural media with recycled coir substrates the growth of Chinese cabbage (Brassica campestris L. ssp. Pekinensis) and lettuce (Lactuca sativa L.) crop. The six different types of coir based substrates were A, Coir 45: Perlite 35: Vermiculite 12: Zeolite 8 (%), B, Coir 55: Perlite 25: Vermiculite 12: Zeolite 8 (%), C, Coir 65: Perlite 15: Vermiculite 12: Zeolite 8 (%), D, Coir 75: Perlite 5: Vermiculite 12: Zeolite 8 (%), E, Coir 85: Perlite 5: Vermiculite 5: Zeolite 5 (%) and F, nursery media (control). The pH and Electric conductivity of the horticultural nursery media were 6.06-7.00 and $0.45-1.10dS/m^{-1}$, respectively. The nursery media containing coir substrates had higher level of Total N, Ca, K, Mg and P than those without coir. Additionally, it was observed that the growth of Chinese cabbage was the best on D (containing 75% coir) while that of lettuce was the best on E (containing 85% coir). In general, when substrates containg a higher percentage of coir were used, the growth of Chinese cabbage and lettuce was ideal. Additionally, the P, Ca, and Mg content in both plants was not significantly altered by the amount of coir present in the media. However, with an increase in the amount of coir substrate, the chlorophyll, N, and K content was increased. After harvesting, there was no significant difference in the chemical properties of the horticultural nursery media of both plants. Thus, it can be suggested that, coir substrate after a single use could be recycled as horticulture nursery media.
Horticulture, Environment, and Biotechnology : HEB
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v.59
no.6
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pp.909-917
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2018
Quercetin and its glycoside derivatives were identified and quantified using high-performance liquid chromatograph (HPLC) and liquid chromatograph/mass spectrometer/mass spectrometer (LC/MS/MS) in the leaves, flowers, and fruits of 22 Malus genotypes. In all genotypes, small amounts of quercetin aglycone were present, with water-soluble glycoside forms were the most abundant in different Malus plant tissues, including quercetin-3-galactoside, quercetin-3-rutinoside, quercetin-3-glucoside, quercetin-3-xyloside, quercetin-3-arabinoside, and quercetin-3-rhamnoside. Among these six quercetin glycosides, quercetin-3-galactoside was the common form in Malus plants, except in the leaves and flowers of M. ceracifolia and M. magdeburgensis, and in the fruits of M. micromalus 'Haihong Fruit', where there was a higher concentration of quercetin3-glucoside. Among the different tissues tested, leaves contained the highest concentration of quercetin and its glycosides, while fruits contained the lowest concentrations of these compounds. Among the genotypes we analyzed, no specific genotype consistently contained the highest concentration of quercetin and its glycoside derivatives. M. domestica 'Honeycrisp' had the highest total compound concentration (approximately $1600mg\;kg^{-1}$), whereas M. hupehensis contained the lowest in its fruits. In contrast, the concentration of total quercetin and its glycosides was more than $5000mg\;kg^{-1}$ in the leaves of eight genotypes and greater than $2500mg\;kg^{-1}$ in the flowers of seven species. In general, the concentration of quercetin and its glycoside derivatives depended on the species and tissue type. These results may provide useful information for the evaluation and selection of edible Malus fruits and the materials for quercetin glycoside extraction.
Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. niveum (Fon) is the most serious soil-borne disease in the world and has become the main limiting factor of watermelon production. Reliable and quick detection and quantification of Fon are essential in the early stages of infection for control of watermelon Fusarium wilt. Traditional detection and identification tests are laborious and cannot efficiently quantify Fon isolates. In this work, a real-time polymerase chain reaction (PCR) assay has been described to accurately identify and quantify Fon in watermelon plants and soil. The FONRT-18 specific primer set which was designed based on identified specific sequence amplified a specific 172 bp band from Fon and no amplification from the other formae speciales of Fusarium oxysporum tested. The detection limits with primers were 1.26 pg/µl genomic DNA of Fon, 0.2 pg/ng total plant DNA in inoculated plant, and 50 conidia/g soil. The PCR assay could also evaluate the relationships between the disease index and Fon DNA quantity in watermelon plants and soil. The assay was further used to estimate the Fon content in soil after disinfection with CaCN2. The real-time PCR method is rapid, accurate and reliable for monitoring and quantification analysis of Fon in watermelon plants and soil. It can be applied to the study of disease diagnosis, plant-pathogen interactions, and effective management.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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