• 제목/요약/키워드: heavy chain

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Identification of Candidate SNP (Single Nucleotide Polymorphism) for Growth and Carcass Traits Related to QTL on Chromosome 6 in Hanwoo (Korean Cattle)

  • Lee, Y.S.;Lee, J.H.;Lee, J.Y.;Kim, J.J.;Park, H.S.;Yeo, J.S.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제21권12호
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    • pp.1703-1709
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    • 2008
  • As genetic markers, single nucleotide polymorphisms (SNP) are very appropriate for the development of genetic tests for economic traits in livestock. Several microsatellite markers have been identified as useful markers for the genetic improvement of Hanwoo. Among those markers, ILSTS035 was recently mapped at a similar position with four SNPs (AH1_11, AH1_9, 31465_446, and 12273_165) in a linkage map of EST-based SNP in BAT6. Among the four SNPs, two SNPs (31465_446 and 12273_165) were analyzed using BLAST at the NCBI web site. The sequences including the 12273_165 SNP were identified at the intron region within the LOC534614 gene on the gene sequence map (Bos taurus NCBI Map view, build 3.1). The LOC534614 gene represents a protein similar to myosin heavy chain, fat skeletal muscle, embryonic isoform 1 in the dog, and myosin_1 (Myosin heavy chain D) in Macaca mulatta. In cattle, the myosin heavy chain was associated with muscle development. The phenotypic data for growth and carcass traits in the 415 animals were analyzed by the mixed ANCOVA (analysis of covariance) linear model using PROC GLM module in SAS v9.1. By the genotyping of Hanwoo individuals (n = 415) to evaluate the association of SNP with growth and carcass traits, it was shown that the 12273_165 SNP region within LOC534614 may be a candidate marker for growth. The results of the statistical analyses suggested that the genotype of the 12273_165 SNP significantly affected birth weight, weight of the cattle at 24 months of age, average daily gain and carcass cold weight (p<0.05). Consequently, the 12273_165 SNP polymorphisms at the LOC534614 gene may be associated with growth in Hanwoo, and functional validation of polymorphisms in LOC534614 should be performed in the future.

Association Analysis of Myosin Heavy-chain Genes mRNA Transcription with the Corresponding Proteins Expression of Longissimus Muscle in Growing Pigs

  • Men, X.M.;Deng, B.;Tao, X.;Qi, K.K.;Xu, Zi Wei
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제29권4호
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    • pp.457-463
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    • 2016
  • The goal of this work was to investigate the correlations between MyHC mRNA transcription and their corresponding protein expressions in porcine longissimus muscle (LM) during postnatal growth of pigs. Five DLY ($Duroc{\times}Landrace{\times}Yorkshire$) crossbred pigs were selected, slaughtered and sampled at postnatal 7, 30, 60, 120, and 180 days, respectively. Each muscle was subjected to quantity MyHCs protein contents through an indirect enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), to quantity myosin heavy-chains (MyHCs) mRNA abundances using real-time polymerase chain reaction. We calculated the proportion (%) of each MyHC to total of four MyHC for two levels, respectively. Moreover, the activities of several key energy metabolism enzymes were determined in LM. The result showed that mRNA transcription and protein expression of MyHC I, IIa, IIx and IIb in LM all presented some obvious changes with postnatal aging of pigs, especially at the early stage after birth, and their mRNA transcriptions were easy to be influenced than their protein expressions. The relative proportion of each MyHC mRNA was significantly positively related to that of its corresponding protein (p<0.01), and MyHC I mRNA proportion was positively correlated with creatine kinase (CK), succinate dehydrogenase (SDH), malate dehydrogenase (MDH) activities (p<0.05). These data suggested that MyHC mRNA transcription can be used to reflect MyHC expression, metabolism property and adaptive plasticity of porcine skeletal muscles, and MyHC mRNA composition could be a molecular index reflecting muscle fiber type characteristics.

Comparison of Characteristics of Myosin Heavy Chain-based Fiber and Meat Quality among Four Bovine Skeletal Muscles

  • Kim, Gap-Don;Yang, Han-Sul;Jeong, Jin-Yeon
    • 한국축산식품학회지
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    • 제36권6호
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    • pp.819-828
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    • 2016
  • Muscle fiber characteristics account for meat quality and muscle fibers are mainly classified into three or more types according to their contractile and metabolic properties. However, the majority of previous studies on bovine skeletal muscle are based on myosin ATPase activity. In the present study, the differences in the characteristics of muscle fibers classified by the expression of myosin heavy chain (MHC) among four bovine skeletal muscles such as longissimus thoracis (LT), psoas major (PM), semimembranosus (SM) and semi-tendinosus (ST) and their relationships to beef quality were investigated. MHCs 2x, 2a and slow were identified by LC-MS/MS and IIX, IIA and I fiber types were classified. PM, which had the smallest size and highest density of fibers regardless of type, showed the highest myoglobin content, CIE $L^*$, $a^*$, $b^*$ and sarcomere length (p<0.05), whereas ST with the highest composition of IIX, showed high shear force and low sarcomere length (p<0.05). The correlation coefficients between muscle fiber characteristics and meat quality showed that type IIX is closely related to poor beef quality and that a high density of small-sized fibers is related to redness and tenderness. Therefore, the differences in meat quality between muscles can be explained by the differences in muscle fiber characteristics, and especially, the muscles with good quality are composed of more small-sized fibers regardless of fiber type.

오징어 식해 숙성중 단백질 화학적 변화 -온도 및 수분함량의 영향- (Biochemical Changes in Muscle Protein of Squid Sikhae during Fermentation -Effects of Temperature and Moisture Content-)

  • 이남혁;오세욱;김영명
    • 한국식품과학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.292-297
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    • 1996
  • 본 연구에서는 오징어를 주원료로_하여 제조한 식해의 숙성과정증 수분함량 및 속성온도에 따른 단백질화학적 변화를 검토하였다. 속성과정중 pH의 변화는 수분함량 및 숙성온토가 높을 수록 빠르게 저하되었으며 이에 따른 산도의 변화도 빠르게 증가되었다. 또한 젖산균의 생성속도에 있어서도 수분함량 및 숙성온도가 높을수록 빨랐다. 한편 숙성과정중의 오징어 근단백질의 subunit 조성의 변화는 식해의 제조과정중 MHC에 상당하는 성분은 완전히 소실되었으며, 그 후 숙성기간이 경과함에 따라 A에 상당하는 성분도 서서히 소실되었다. 이와같은 결과는 적어도 숙성초기가지는 오징어육의 자가분해효소에 의한 것으로 숙성초기까지는 오징어의 자가분해효소에 의한 것으로 사료되며, 그후의 단백질의 분해과정은 숙성 진행과 함께 숙성 관여미생물 성장에 의해 생성되는 protease 및 오징어육 자체내 산성 protease에 의한 것으로 생각되었다.

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Construction and Characterization of a Single-Chain Immunoglobulin

  • Kim, Youn-Kyu;Choi, In-Hak;Ryu, Chun-Jeih;Hong, Hyo-Jeong
    • BMB Reports
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    • 제30권3호
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    • pp.177-181
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    • 1997
  • We constructed a single-chain immunoglobulin in which the carboxyl end of the heavy chain variable domain is covalently joined to the amino terminus of the light chain variable domain via peptide linker and the carboxyl end of the light chain variable domain is linked to human ${\gamma}1$ Fc region through the hinge region. The molecule was expressed in Chinese hamster ovary cells, assembled into a dimeric molecule and secreted into the culture medium. The dimeric molecule (2E11) was purified from the culture supernatant by affinity chromatography on Protein G-Sepharose column. The size of the unreduced or reduced protein was the expected molecular weight of approximately 120 or 60 kDa, respectively, as assessed by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The antigen-binding affinity of 2E11 was almost the same as that of a native antibody counterpart (CS131A), suggesting that the single-chain immunoglobulin may function like a native antibody.

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토양 내 서식하는 공벌레의 중금속 축적에 따른 생태적 연구 (Ecological study on effects of heavy metal accumulation on pillbugs)

  • 이상돈
    • 환경영향평가
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    • 제20권5호
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    • pp.675-684
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    • 2011
  • In nature, the overall effect of heavy metals on the biota can be influenced by a number of environmental factors like soil characteristics and air pollution by elevated $CO_2$. Pillbugs (Isopoda, Armadillium vulgare) take up heavy metals with their food and store them mainly in the vesicles of hepatopancreas. They accumulate certain metals, occur in relatively large numbers, are easily collected and identified, and provide sufficient material for analysis. The species are decomposing litter well and soil impurities into N and P. Therefore, it has been suggested that total body concentration of metals in pillbugs could be positively correlated to the levels of environmental exposure and that pillbugs could be used as biological indicators of metal pollution and global change by $CO_2$. The aim of the study is to determine effects of heavy metal concentrations in soil and elevated $CO_2$ on pillbugs' body accumulation of heavy metal and growth rate. In this study, the concentrations of six metals (Fe, Mg Cu, Zn, Pb, Cd) have been determined. Pillbugs (N=287) were collected at five sites during Jul-Aug, 2006. Cu and Zn concentrations in the body were much higher than in the soils(1.39-41.70 times). This indicated that bioaccumulation of some of the heavy metals were increasing in the food-chain. The high bioconcentration of lead in Sangam may be partly associated with reclaimed land uses.

In vitro에서 핵산치환인자 BAP이 단백질-분자 샤페론 복합체 해리에 미치는 영향 (A Nucleotide Exchange Factor, BAP, dissociated Protein-Molecular Chaperone Complex in vitro)

  • 이명주;김동은;이태호;정영기;김영희;정경태
    • 생명과학회지
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    • 제16권3호
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    • pp.409-414
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    • 2006
  • 소포체는 세포막의 합성뿐만 아니라 세포막에 존재하거나 세포외로 분비되어져야 할 단백질을 합성하는 세포내 소기관이다. 소포체에서 단백질이 합성되어질 경우 이황화결합이 형성되고 glycosylation 등의 수식이 일어나며, 이와 동시에 folding과 assembly과정을 거쳐 삼차원적 구조로 성숙이 되는데 이 과정은 folding enzyme과 molecular chaperone의 도움을 받아 이루어진다. 소포체 내에 존재하는 molecular chaperone 중 가장 잘 알려진 것으로 BiP이 있다. BiP의 기능은 N-terminus의 ATPase domain에 의해 조절되고 ATPase domain은 이것과 선택적으로 결합하는 조절인자에 의해 ATPase의 활성이 영향을 받는다. BiP의 핵산치환조절인자로서 발견된 BAP은 ATPase domain에 결합된 ADP를 ATP로 치환하는 것으로 기능이 알려져 있다. 이 BAP의 핵산치환기능이 BiP의 샤페론 작용에 어떤 영향을 미치는지를 in vitro에서 항체 heavy chain을 이용하여 알아보았다. BAP은 ATP보다 ADP가 결합되어 있는 BiP과 더 잘 결합을 하며, in vitro에서 BiP과 결합하고 있는 unfolded 단백질을 BAP은 BiP으로부터 해리하였다. 또한 소포체내에 존재하는 Hsp70 homologue chaperone인 BiP과 Grp170에 대한 BAP의 결합특이성을 anti-Grp170과 anti-BAP 항체로 co-immunoprecipitation을 하여 확인한 결과 BAP은 Grp170과 결합을 하지 않았다. 따라서 BAP은 ER내에 존재하는 동일한 family group에 속하는 Grp170과 BiP에 대하여 BiP에만 특이성을 갖는 것으로 나타났다.

기능성 어육단백질의 젤화 특성과 산업적 응용-1. 가열변성 중 화학결합에 미치는 pH의 영향 (Gelation Properties and Industrial Application of Functional Protein from Fish Muscle-1. Effect of pH on Chemical Bonds during Thermal Denaturation)

  • 정춘희;김진수;진상근;김일석;정규진;최영준
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제33권10호
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    • pp.1668-1675
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    • 2004
  • 근원섬유단백질과 알칼리 용액으로 처리하여 회수한 단백질의 가열 중 ANS 소수성의 변화, IR스펙트럼의 변화, SH기의 변화, 전기영동상의 변화 및 엔탈피의 변화로 비교하여 회수 단백질의 가열 변성기구를 조사하였다. 갈고등어와 냉동 꼬마민어의 근원섬유단백질은 가열 온도의 상승과 더불어 소수성 잔기가 외부로 노출되고 소수성 상호작용은 6$0^{\circ}C$ 부근에서 최대로 일어나지만, 근형질 단백질을 포함하는 회수단백질은 근원섬유 단백질과 ANS 소수성에서 차이를 보였다. pH가 증가함에 따라 1636 $cm^{-1}$ /에 해당하는 peak가 증가하였다. 반응성 SH기와 총 SH기 수의 차이는 pH 7.0과 pH 10에서 비교적 큰 것으로 나타났다. SDS-PAGE 상에서 pH가 상승함에 따라 myosin heavy chain의 중합체가 확인되었다. 알칼리 공정으로 제조한 회수 단백질을 시차주사열량계로 분석한 결과, 회수 단백질은 33.1,44.3 및 65.5$^{\circ}C$에서 전이 온도가 나타나며, myosin의 변성 에 해당하는 온도인 51.7$^{\circ}C$의 peak는 보이지 않았다. 회수 단백질의 가열 젤은 극단적 인 pH 처리에 의한 $\alpha$-helix 구조의 $\beta$-sheet 구조 전환, 가열에 의한 S-S 결합의 형성과, myosin heavy chain 중합체 형성에 의한 것으로 보인다.

측두엽 간질환자의 혈청에서 프로테오믹스기법을 활용한 질병관련 단백질 동정 (Proteomic analysis of human serum from patients with temporal lobe epilepsy)

  • 이창우;유승택;최하영;고은정;곽용근
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제52권5호
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    • pp.567-575
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    • 2009
  • 목적 : 간질은 전세계인구의 0.5%에서 발병하며 유전적 성향이 많고, 이는 중추신경계의 과 흥분성에 기인한다고 알려져 있다. 최근 프로테오믹스기법의 발달로 질병관련 단백질 동정이 활발히 연구되어지고 있다. 더불어, 간질의 진단은 영상기법 및 뇌파 분석 등이 이용되고 있으나, 가장 손쉽고 경제적인 혈청단백질을 이용한 진단법은 확립되어 있지 못하다. 그러므로 본 연구에서는 측두엽 간질환자의 혈장 단백질을 분석하여 간질의 진단 표지단백질 및 질병관련단백질을 발굴하고자 하였다. 방 법 : 저자들은 8명의 측두엽 간질환자와 8명의 정상인 혈청을 비교하였다. 결 과 : 간질환자의 혈청에서 정상 혈청단백질과 유의하고 일관성 있는 차이를 보이는 12개의 단백질을 발견하였다. 그 중, 6개의 단백질을 동정하였고, 6개의 단백질은 동정하지 못하였다. 더불어, haptoglobin Hp2, PRO2675, immunoglobulin heavy chain constant region gamma 2와 1개의 명명되지 않은 단백질 및 3개의 미지의 단백질을 포함한 7개의 단백질은 간질환자의 혈액에서 증가하였다. 반면, MHC class I antigen, plasma retinol-binding protein precursor 및 3개의 미지의 단백질을 포함한 5개의 단백질은 감소하였다. 결 론 : MHC class I antigen, immunoglobulin heavy chain constant region gamma 2 및 수술 전에 증가하였던 3개의 미지의 단백질 중에서 1개, 감소하였던 3개의 미지의 단백질 중에서 2개를 포함한 모두 5개의 단백질은 간질을 일으키는 뇌 부위 절제 후 정상으로 회복되었다. 이는 이런 단백질들을 측두엽 간질의 진단 및 경과관찰인자로서, 활용할 수 있음을 시사한다. 나아가, 이러한 단백질들은 간질의 병태 생리 연구 및 새로운 치료약물개발의 표적 단백질로 활용될 수 있을 것이다.