• 제목/요약/키워드: halophilic

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Moderate 호염성 세균의 Plasmid 유전자 분리 (Isolation of Plasmids from the Moderately Halophilic Bacteria)

  • 홍용기
    • 한국수산과학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.557-562
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    • 1985
  • 천일염으로 부터의 $10\%$ NaCl 농도에서 생육할 수 있는 moderate 호염성 세균들을 대상으로하여 간단한 boiling 법으로 plasmid 유전자를 함유하는 6종을 선별하여 Alkaline-Lysis 법과 고분자 plasmid 추출법인 D. Portnoy & F. White 방법에 따라 plasmid를 추출하여 agarose gel 전기영동으로 확인하였고 각 균을 동정하였다. 그중 Vibrio sp. 14는 최소 7.2kbp, Alcaligenes sp.63은 6.4 kbp, Pseudomonas sp.11은 6.35 kbp, Flavohacterium sp.38은 8.5 kbp, Bacillus sp.16은 8.75 kbp, Alcaligenes sp.52는 6.8kbp 크기의 plasmid를 가지고 있는 것으로 나타났다.

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단백질 분해효소를 생산하는 호염성 미생물 Vibrio의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of a Protease-Producing Halophilic Vibrio sp.)

  • 엄기범;윤선진;이재경;이재학;이순열
    • 한국식품영양학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.108-113
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    • 2007
  • In this study, a halophilic protease-producing bacterium was isolated from the west seaside mud flats of Korea. The 16S rDNA nucleotide sequences of the isolate showed 99.5% sequence homology with those of Vibrio vulnificus and Vibrio fluvialis; therefore, the isolate was named Vibrio sp. YH-127. Gram staining and the carbohydrate metabolism test results supported the isolate as one from the Vibrio family. Optimum condition for the cell growth and for the protease activity were obtained when the isolate was cultured at 25$^{\circ}C$ and pH 7.0, with the salt concentration of the medium similar to that of sea water. Finally, the addition of Mg$^{++}$ ions into medium increases protease activity suggesting that the protease produced by the isolate was a metalloprotease.

호염세균 Haloarcular sp. EH-1으로부터 추출한 카로테노이드 색소의 특성 (Characteristic of Carotenoid Component from Halophilic Bacteria, Haloarcular sp. EH-1)

  • 정영기;최병대;강석중;정성훈;이용규;김해윤;정명주
    • KSBB Journal
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    • 제15권6호
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    • pp.673-676
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    • 2000
  • 호염성 세균이 갖는 특성 즉, 다른 균에 의한 오염 감소, 세포벽 파괴의 수월성, 용매를 이용하지 않는 색소추출 등을 응용하기 위한 기초 자료를 얻기 위하여 호염성 세균인 Haloarcular sp. EH-1 으로부터 추출한 천연색소를 bioreactor 에서 배양한 후 색소의 함량을 조사한 결과 3 L 용량에서는 8 83.1 mg%, 5 L 용량에서는 82.7 mg%의 카로테노이드를 함 유하는 것으로 나타났다 이들의 주된 성분은 $\beta$-c따otene (8.1 %), $\beta$-hydroxyechinenone (42.0%) 및 astaxanthin(25.0% )으로 동정 되었으며, 이들 성분을 동정하기 위하여 표품과의 co- TLC, co-HPLC, 가시부 홉수스펙트럼, 화학적 변화 등을 조사하였다.

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The Diversity of Culturable Organotrophic Bacteria from Local Solar Salterns

  • Yeon, Sun-Hee;Jeong, Won-Jin;Park, Jin-Sook
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권1호
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    • pp.1-10
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    • 2005
  • We isolated and cultured bacteria inhabiting solar saltern ponds in Taean-Gun, Chungnam Province, Korea. All of the isolated 64 strains were found to be moderately halophilic bacteria, growing in a salt range of 2-20 %, with an optimal concentration of 5% salt. Bacterial diversity among the isolated halophiles was evaluated via RFLP analyses of PCR-amplified 16S rDNAs, followed by phylogenetic analysis of the partial 16S rDNA sequences. The combination of restriction enzyme digestions with HaeIII, CfoI, MspI and RsaI generated 54 distinct patterns. A neighbor-joining tree of the partial 16S rDNA sequences resulted in the division of the 64 strains into 2 major groups, 45 strains of ${\gamma}-Proteobacteria$ (70.3%) and 19 strains of Firmicutes (29.7%). The ${\alpha}-Proteobacteria$ and Cytophaga-Flavobacterium-Bacterioides groups, which were repeatedly found to exist in thalassohaline environments, were not represented in our isolates. The ${\gamma}-Proteobacteria$ group consisted of several subgroups of the Vibrionaceae (37.5%), Pseudoalteromonadaceae (10.9%), Halomonadaceae (7.8%), Alteromonadaceae (7.8%), and Idiomarinaceae (6.3%). Members of Salinivibrio costicola (29.7%) were the most predominant species among all of the isolates, followed by Halobacillus treperi (12.5%). Additionally, three new species candidates were found, based on similarities of the 16S rDNA sequences to those of previously published species.

염농도를 달리한 새우젓 발효 중 미생물 변화 (Microbial Changes in Salted and Fermented Shrimp at Different Salt Levels during Fermentation)

  • 목철균;이주연;박종현
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.444-447
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    • 2000
  • 염농도를 $3{\sim}30%$로 달리하여 새우를 $20^{\circ}C$에서 발효하면서 발효시간에 따른 미생물 변화를 조사하였다. 염농도 3, 8, 30%에서 세균과 효모는 발효기간에 따라 감소하는 경향을 보였으나 염농도 18%에서는 초기수준을 유지하거나 증가하는 경향을 보였다. 호염성 세균의 발현은 염을 18% 수준으로 첨가하여 제조한 새우젓의 후반부 발효에서 두드러졌으며, 호염성 효모도 염농도 18%에서 가장 많은 수가 검출되어 염농도 18%가 새우젓 숙성에 관련된 미생물 생육에 가장 적합한 환경을 제공하는 것으로 나타났다.

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β-Glucosidase를 생성하는 호염성 Roseivivax roseus 균주의 분리 및 분류동정 (Isolation and identification of β-glucosidase producing halophilic Roseivivax roseus)

  • 조건영;한송이
    • 미생물학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.141-147
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    • 2015
  • 소금생산을 위해 25% 이상의 함수를 저장해 놓는 염전의 해주로부터 호염성 세균 4균주를 분리하고 높은 염분농도에서도 ${\beta}$-glucosidase를 생성하는 HJS1과 HJS6 균주를 선발하였다. 이들 ${\beta}$-glucosidase 생성세균은 NaCl 1-10%에서 70-79U/mg의 최적 활성을 나타내었고, NaCl 3%에서 최대 활성을 나타내었으며 NaCl 0-20% 농도에서 최대 효소 활성대비 75%이상의 효소활성을 유지하는 내염성 ${\beta}$-glucosidase를 생성하는 것으로 확인되었다. 내염성 ${\beta}$-glucosidase 생성 HJS1과 HJS6 균주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 검토한 결과, Roseivivax roseus $BH87090^T$ (FJ897782)와 99.8%의 상동성을 나타내었고 상기 균주들의 염기서열은 NCBI GenBank에 각각 AB971835와 AB971836로 등록하였다. 계통학적으로 근연종인 Roseivivax roseus $BH87090^T$와의 DNA-DNA 상동성을 비교 검토한 결과, 90.1-90.3%를 나타내었다. 이들 균주의 주요 균체지방산은 $C_{16:0}$, $C_{18:1}$ ${\omega}7c$, $C_{19:0}$ cyclo ${\omega}8c$ 그리고 11-methyl $C_{18:1}$ ${\omega}7c$를 함유하고 Quinone종은 Q-10로 근연종 Roseivivax roseus $BH87090^T$ 균주와 동일한 특징을 나타내어 Roseivivax roseus로 동정되었다. 반면, 비교 균주 Roseivivax roseus $BH87090^T$${\beta}$-glucosidase 생성하지 않는 것으로 나타났다. 본 연구에서 분리된 Roseivivax roseus HJS1과 HJS6 균주는 내염성 ${\beta}$-glucosidase 효소 개발을 위한 유전자원으로 활용 가능하리라 사료된다.

Preservation of Marine Heterotrophic Bacteria by Using a Deep-freezing Method

  • Park, Shin-Hye;Lee, Hyun-Sang;Lee, Hong-Kum
    • Journal of Microbiology
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    • 제39권3호
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    • pp.240-243
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    • 2001
  • The effect of cryoprotectants and suspending solutions on the preservation of marine heterotophic bacteria was investigated. Six halotolerant and four halophilic bacterial isolates suspended in either distilled water or artificial seawater were preserved in glycerol and dimethylsulfoxide at -70$\^{C}$, respectively. After one year of preservation, the recovery rates on the appropriate agar plates were estimated. The survival rate was found to be dependent on the strain tested, regardless of the preservation conditions tested.

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해양미생물 Pseudomonas sp. W7이 생산하는 Extracellular Agarase의 정제 및 Gene Cloning (Purification of Extracellular Agarase from Marine Bacterium (Pseudosmonas sp. W7) and Molecular Cloning of the Agarase Gene)

  • 공재열;배승권
    • KSBB Journal
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    • 제11권1호
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    • pp.37-45
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    • 1996
  • 한국의 남해안에서 한천 분해능이 뛰어난 해양 미 생물을 분리하여 통정한 결과 Pseudomonas 속으로 판명되었으며, 본 연구에서는 이 균을 Halophilic P Pseudomonas sp. W7이라 명영하였다. 이 균주는 호염성 세균으로, 한천의 존재 하에서 높은 효소활성 을 가지는 extracellular agarase를 생산해 내었다. 이 extracellular agarase를 DEAE-Cellulose ani- on exchange chromatography와 gel filtration을 통해 정제하였으며, 정제된 agarase는 SDS-PAGE 를 통해 약 89KDa의 분자량을 지니는 single protein band염을 확인하였다. 한편 agarase의 대량생 산을 위하여 host cell Eo coli JM83과 vector pUC19를 이용하여 gene cloning을 행하였다. Pseudomonas sp. W7의 chromosomal DNA가 삽 입 된 균주 중에 서 agarase activity를 나타내는 E. coli JM83/pSWl과 Eo coli JM83/pSW3를 선멸하 였으며, 전기영통 실험결과 이들은 각각 307Kb, 3.0 K Kb의 chromosomal 단편을 지니고 있음을 확인하였 다. 또한 agarase 유전자가 압입된 변이 균주(B)는 inclusion body 형태의 interacellular agarase를 세포 내에 축적하고 있음이 확인되었다.

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The Membrane-Bound NADH:Ubiquinone Oxidoreductase in the Aerobic Respiratory Chain of Marine Bacterium Pseudomonas nautica

  • Lee, Young-Jae;Cho, Kyeung-Hee;Kim, Young-Jae
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권2호
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    • pp.225-229
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    • 2003
  • Each oxidoreductase activity of the aerobic respiratory chain-linked NADH oxidase system in the marine bacterium Pseudomonas nautica was stimulated by monovalent cations including $Na^+,\;Li^+,\;and\;K^+$. In the presence of NADH or deamino-NADH as electron donors, $GH_2$ formation was approximately 1.3-fold higher in the presense of 0.08 M of $Na^+\;than\;K^+$, Whereas the other reductase activities were not significantly higher in $Na^+\;than\;K^+$. The optimal pH of NADH (or deamino-NADH):ubiquinone-1 oxidoreductase was 9.0 in the presence of 0.08 M NaCl. The activity of NADH (or deamino-NADH):ubiquinone-1 oxidoreductase was inhibited by about 33% with $60{\mu}M$ 2-heptyl-4-hydroxyquinoline-N-oxide (HQNO). The activity of NADH (deamino-NADH): ubiquinone-1 oxidoreductase was inhibited by about 32 to 38% with $80{\mu}M$ rotenone, whereas the activity was highly resistant to capsaicin. On the other hand, electron transfer from NADH or deamino-NADH to ubiquinone-1 generated a membrane potential (${\Delta}{\psi}$) which was larger in the presence of $Na^+$ than that observed in the absence of $Na^+$. The ${\Delta}{\psi}$ was almost completely collapsed by $5{\mu}M$ carbonylcyanide m-chlorophenylhydrazone(CCCP), and approximately 50% inhibited by $100{\mu}M$ rotenone, or $60{\mu}M$ 2-heptyl-4-hydroxyquinoline (HQNO). Also, HQNO made the ${\Delta}{\psi}$ very unstable. The results suggest that the enzymatic and energetic properties of the NADH:ubiquinone oxidoreductase of P. nautica are quite different, compared with those of other marine halophilic bacteria.